Protein

View in Explore
Genbank accession
XEM82601.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,71
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIALNTHGRTLAIYTKDEADNVVQLAGKGVPFLDTAGNLNVDGTTTLKDNVTISPNKAINFEASDLSGALVRHITGKCANNDGWYIGAGGASDQGFLEIGTYDNGNEPIYFVQRTGGTTQAEVRRLALLDGFGDTSIPGDLRLTNKTVKISNGSTLTLEMGVGANDAYIKNLRGTGVLQLTNDSNLTFRNSQVYYAMNGRGPGKSGTLLTNVENNRQAWQYVISAATAGTPRWVKVATIKHPGDASSQLDLMITGGIDSGHGRHYVDFITLSGRNLTSWSTSNLDNWVEWRRVGSPNRGNAPEYYVVKNDAATDSEASFDFYAKVPRYGNGLYVTVLNTAGYNGQDSGKVIIYETGQDTGATTPSGSILVSMKQIFDSIAKPDFSDTTGTLPVNRGGTGATNVGDARNNLGLRTAAVRDVGESSGNVMEVGAFGVGGGGKSIVDITSDVDLMNRLKAIGGTTFRANVKTVNGKAEYTGSPYYSHGAGFFSRTGDTMAALNIDYSSGNVRVFAINDRGLADGKVSYNMLYGTSNKPNADDNDFVSKSRGGTFGADVTVSGDITANTVSGRVLKLSGGGAAYVPPSQGAYISWNKENGSGRTDFINHRSNTSTVPGGFDFWNYEGNTSNMRHLAQIRNTGDLVLFPSDISKAVTFQTDGNIVGGTLFGGNLNNYLSNLTGTANSKVSKSGDTMTGRLNVYQSDTNAGAQAIYIKGVQHTPVVLERNTDANLSIAFRLTGVNPILQRKLGLAKDGTLRWGTGDNQTDNALVFDQNSIGMVRVNMTGGYLGQEVAEDIGGRTLSIDDLFLNSSDVGTRRVYSCLAQGPGANITGMPPALTNLQGDFILIVEKMRSAAGVDFRNKQTFISGRNNKTYFRYGAGTGTTSAPAVNWTPWEEVITTSNTNGILPISSGGTGANTAADARNNFNLGLGQTATFGGLIVNGVGNNDPVVTFKNGAVIREAQGGSIGALIMSASTTAPAAAKYIAFRPYGDTSNSEIRVKAYGNNETMLEWAQGPAVRSNTAGAFVIYAKAGQAIHLRPNGDTASQSTVIDQTGKMTVGGEFEAQNSKITGNLNVSEDNRMIVLGKNSDIGLVKKNGMPGRMAIGKSNSFTVMVSANTNNQINPADTFSDIFKVDASGNQTVYGNAQINRQLTVTSNTNLNSDLIVKGNSRFSGVINADGNINVASGKFVIAGQAPTDNSHLTNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGNLDVTGTRLKTWQLEVDGKSTLRGGLDVSSSLKVSSGNLVAADTTNAGGLFAKNGNVYCDAGSAGTNSNYWFRDSAGNTRGVIWSNGQNGDMIIRNQSGRELVFRNDGYLQLAHLAPGNTDNANTVNGIRLQRGDTIFDSFNAWQSGEYVRAGWHFYNASGVDQWLALTDTGVKIWGSAANLRVEGVGNFWDVEIRSDRRVKSNIAKIDNALDKVSKLSGNVYDLQLPNGDTKPSAGLIAQEVQEVLPEAVTTDNDKDALLRLNYNAVIALLVESVKELKAEIEELKSK
Physico‐chemical
properties
protein length:1550 AA
molecular weight: 164451,47120 Da
isoelectric point:6,56476
aromaticity:0,07484
hydropathy:-0,33226

Domains

Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–930
DC_1942 DC_2180 DC_0246
IPR030392
CHP
1458–1513
IPR030392 Coil
IPR030392
CHP
1458–1550
IPR030392
XEM82601.1
1 1550
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 4-930 | STR 1026-1131 | RBD 1145-1550
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XEM82601.1
1 1550
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 223 223 0,1494
Central domain 224 433 211 0,3216
C-terminal 434 1550 1116 0,5944
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-223
Central
224-433
C-terminal
434-1550

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Raoultella phage vB_Rp_M21a
[NCBI] 		3242750 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XEM82601.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ154968.1 [NCBI]
CDS location
range 77437 -> 82089
strand +
CDS
ATGGCCGATCAAAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATCGCGTTGAATACACATGGGCGTACTCTTGCCATTTACACTAAAGATGAAGCCGATAACGTTGTTCAGCTTGCAGGTAAAGGGGTTCCTTTCTTAGATACTGCAGGTAATCTTAATGTTGATGGAACTACTACGTTAAAAGACAACGTTACTATTTCTCCGAATAAAGCGATCAATTTTGAAGCTTCGGATTTAAGCGGAGCATTAGTACGTCATATCACCGGTAAGTGTGCTAATAATGATGGCTGGTACATTGGAGCTGGTGGTGCATCTGACCAAGGATTTCTTGAAATCGGTACGTATGATAACGGAAATGAACCTATCTATTTTGTTCAAAGAACCGGTGGAACGACTCAAGCTGAAGTTCGTCGTTTAGCATTATTAGATGGGTTTGGCGATACCTCTATACCTGGGGACCTTCGTTTAACTAATAAAACGGTAAAAATTTCAAACGGAAGCACTCTTACTTTGGAAATGGGTGTAGGCGCTAATGACGCGTACATTAAAAACCTGAGAGGAACCGGTGTTCTTCAATTAACTAATGACAGCAATTTAACGTTCAGAAATTCCCAGGTTTATTACGCTATGAATGGAAGAGGTCCTGGTAAATCCGGTACTCTTCTAACTAATGTAGAAAACAACCGTCAGGCATGGCAATACGTAATTTCTGCTGCAACTGCTGGAACTCCACGTTGGGTTAAAGTAGCTACAATTAAACACCCAGGAGATGCGTCTTCACAGTTAGATTTAATGATTACCGGCGGCATTGATTCTGGACACGGAAGACATTATGTTGATTTTATCACGCTATCTGGTCGCAATTTAACATCCTGGAGCACTAGCAATTTAGATAACTGGGTTGAATGGCGCAGGGTTGGTTCTCCTAATAGAGGAAACGCTCCAGAATATTACGTTGTTAAAAATGATGCTGCTACAGATTCAGAGGCTTCATTTGATTTTTACGCTAAAGTTCCTCGATACGGCAATGGGCTTTATGTCACAGTGCTGAACACTGCTGGATACAACGGCCAGGATAGTGGTAAAGTAATTATCTACGAAACAGGCCAAGATACTGGTGCTACTACACCATCTGGAAGCATTCTTGTTTCAATGAAACAGATTTTTGATAGTATCGCAAAACCAGATTTCAGTGATACTACCGGTACTCTTCCGGTTAACCGCGGTGGTACAGGTGCTACTAACGTAGGAGACGCTCGAAATAACCTGGGTCTTAGAACTGCGGCTGTTCGTGATGTCGGTGAATCTAGCGGAAATGTGATGGAAGTCGGCGCTTTTGGTGTTGGCGGCGGCGGAAAATCAATTGTTGATATTACATCCGATGTCGATTTAATGAATCGCCTTAAAGCTATTGGTGGTACAACATTTAGGGCTAACGTTAAGACAGTAAATGGGAAAGCTGAGTATACCGGGTCTCCTTATTATTCGCATGGAGCAGGATTCTTTTCTAGAACCGGCGATACAATGGCTGCCCTTAATATCGATTATTCATCCGGTAATGTCAGAGTATTTGCTATAAATGACCGCGGATTGGCAGATGGTAAAGTAAGCTATAACATGCTTTACGGAACGTCAAATAAACCTAATGCCGATGATAACGACTTCGTATCTAAATCCCGTGGCGGTACTTTTGGAGCTGATGTTACAGTCAGTGGTGATATTACTGCTAATACCGTCAGTGGTAGGGTGTTAAAACTATCCGGTGGCGGTGCAGCGTATGTTCCACCTTCTCAAGGTGCATACATATCTTGGAACAAAGAAAACGGGTCAGGTCGTACTGATTTTATTAACCATCGTTCAAATACTTCAACTGTTCCTGGCGGATTTGATTTTTGGAACTATGAAGGTAATACTAGCAACATGCGTCATCTGGCGCAAATTAGAAACACTGGGGATTTAGTATTATTCCCTTCTGACATATCTAAAGCTGTGACATTCCAGACTGATGGAAACATTGTTGGTGGTACTTTATTCGGTGGAAACTTAAACAATTATTTAAGTAATTTAACCGGAACTGCTAATAGCAAAGTATCCAAATCGGGTGACACCATGACCGGTAGATTAAACGTCTACCAATCTGATACAAATGCTGGAGCCCAGGCTATATACATTAAAGGCGTTCAGCATACACCGGTAGTTCTTGAAAGAAATACCGATGCAAACTTATCAATAGCGTTCAGATTAACTGGTGTTAATCCAATTCTTCAACGTAAACTTGGTTTAGCTAAAGATGGAACTCTTCGTTGGGGAACCGGTGATAACCAGACGGATAATGCTTTAGTATTTGATCAAAACAGCATTGGAATGGTTAGAGTTAACATGACTGGAGGTTATCTTGGACAAGAAGTTGCTGAAGACATTGGCGGAAGAACGTTGTCTATTGATGATCTTTTCTTGAATTCATCCGACGTTGGTACTCGTAGGGTTTATTCATGCTTAGCTCAAGGTCCTGGAGCAAATATTACTGGAATGCCTCCTGCGTTAACTAATCTGCAAGGTGATTTCATTCTTATCGTTGAAAAGATGAGATCAGCAGCTGGTGTAGATTTCCGTAATAAACAAACATTTATATCTGGACGTAATAATAAAACCTACTTTAGATATGGTGCTGGAACAGGAACTACTTCCGCGCCGGCGGTCAATTGGACGCCGTGGGAAGAAGTAATAACTACATCAAACACTAACGGTATTTTACCAATTTCGTCTGGCGGTACTGGAGCTAATACTGCCGCCGATGCTCGTAACAATTTTAACTTAGGTTTAGGGCAAACTGCGACGTTTGGTGGATTAATTGTTAATGGTGTTGGAAATAATGACCCAGTAGTCACGTTTAAGAATGGTGCTGTAATTCGCGAGGCCCAAGGTGGTAGTATTGGCGCATTAATTATGTCAGCTTCTACTACAGCACCAGCAGCCGCGAAATATATTGCTTTTCGTCCTTACGGCGATACATCTAATTCTGAGATTAGAGTCAAAGCATATGGCAATAACGAGACGATGCTTGAATGGGCGCAAGGCCCTGCTGTTCGTTCAAACACTGCAGGTGCTTTTGTAATCTATGCAAAAGCAGGTCAAGCGATTCATTTAAGACCGAATGGCGATACTGCAAGCCAATCAACTGTTATTGACCAAACTGGTAAAATGACAGTCGGCGGTGAGTTCGAGGCCCAGAACTCGAAAATCACAGGCAACTTGAACGTTTCTGAAGATAACAGAATGATCGTTCTTGGCAAAAACTCTGATATTGGTTTAGTCAAGAAAAACGGTATGCCAGGAAGAATGGCTATCGGTAAATCTAACTCATTTACCGTTATGGTATCTGCAAATACCAACAACCAAATTAATCCTGCTGACACGTTTAGCGATATATTCAAAGTTGATGCTAGCGGAAACCAAACTGTTTACGGAAATGCCCAAATTAACAGGCAGCTTACAGTAACAAGTAATACTAACTTGAACTCAGACTTGATAGTTAAAGGCAATTCCCGCTTCAGCGGTGTGATTAATGCTGATGGAAACATCAACGTCGCTTCTGGTAAGTTTGTTATTGCAGGTCAAGCTCCTACTGATAACTCGCACCTAACCAACAAGAAATATGTTGATGATAAGGTTGCTTCTGCTATTAGTAATGCTGGTGATACTTATCTTCCGTTAGCGGGTGGTACTGTAACTGGTAACCTTGACGTAACTGGCACCAGATTAAAAACGTGGCAGTTAGAAGTTGATGGCAAAAGTACTCTAAGAGGCGGGTTAGATGTTAGTAGCAGTCTTAAAGTTTCTAGCGGAAACTTAGTCGCCGCTGACACAACCAATGCTGGTGGTCTTTTTGCTAAAAACGGTAATGTTTACTGTGATGCAGGTTCAGCTGGTACAAACTCTAACTACTGGTTCCGCGATTCAGCTGGTAACACCAGAGGCGTTATTTGGTCTAACGGCCAAAATGGTGACATGATTATCCGTAACCAAAGTGGTCGAGAGCTTGTATTCAGAAATGATGGATATCTGCAATTAGCCCACTTAGCACCAGGAAACACAGATAATGCAAATACTGTAAATGGAATACGTTTACAGCGCGGTGATACGATTTTCGATAGCTTTAACGCATGGCAGTCGGGTGAATATGTTCGCGCTGGATGGCATTTCTATAACGCCTCTGGAGTTGACCAGTGGTTAGCACTTACAGATACTGGGGTAAAAATCTGGGGTAGTGCTGCTAATCTACGCGTTGAAGGTGTTGGTAATTTCTGGGACGTTGAAATTCGTTCTGACCGTCGTGTGAAATCAAATATTGCTAAGATTGATAACGCTCTTGATAAAGTGTCGAAGCTATCTGGTAATGTTTATGATTTACAGCTTCCAAATGGTGATACTAAACCATCAGCTGGCCTTATCGCACAAGAAGTGCAGGAAGTTCTTCCTGAAGCAGTTACAACTGATAACGATAAAGATGCATTACTTCGTTTAAACTATAATGCAGTAATTGCGTTATTAGTCGAATCTGTTAAAGAGCTTAAAGCAGAAATTGAAGAACTTAAATCTAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
26622b305f8260a2fb5bceb616b3555049d0433013e768c17b87dda5f6a89eca
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6514
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50