Protein

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Genbank accession
QHR75277.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,97
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSNMTGDLGIVKLLYGGKAIFDPTGSSEITIGDVLKTFKINANDLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVNNTFRATQTIVANNEGLILKNLTQGMPLYIRGQDADGTNRWYLGNDNKGTDNLVLKNVKSGAYVAILANLISVNKSIQITGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLVGNNTFSGLNTFNQLSVFKKDGEAIRLQNANAAQPLYIKAIDSTGVNRWYIGNSNKGDNVALGNYKTSGKITVGTSVNINKTLTVTGQVQPSDWTNIDSRYVLIGSYANLAKKNEANTFTLQQNIQSDGEALRIYNKAQNNSSYIVGKNTDNTNKWFIGCGTNGSGIASFHNYLTGARLDLADEILLSKSLQITGQVKPSDWSNLDARYFTQSAANQRFMVAGSTGEATEQNADGVAWNAKTGLYNVTSPNGDYTSLVFQMYQGVSSSTACAQLKFQYKNGGMWYRTSVDSKGFEAKWSKVYTEAQKPTPSELGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLKNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKNTNTTGAHTHSVSGSTSSAGNHNHSISWIGQNSTHYSGGGGGSIGVGPGYTDANGAHTHSVSGTAASAGNHAHSVGIGAHRHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:783 AA
molecular weight: 84228,26340 Da
isoelectric point:9,08361
aromaticity:0,08685
hydropathy:-0,42069

Domains

Domains [InterPro]
DC_0032
ATT
1–268
DC_0032 G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 IPR022246 IPR051934
G3DSA:6.20.80.10
STR
159–219
G3DSA:6.20.80.10 IPR048388 IPR048388 DC_2042
IPR048388
ATT
159–248
IPR048388 DC_0026
QHR75277.1
1 783
Architecture
ATT
ATT
STR
ATT
STR
RBD
ATT 1-268 | ATT 273-363 | STR 364-380 | ATT 381-471 | STR 472-720 | RBD 721-783
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage ekra
[NCBI] 		2696394 Uroviricota > Caudoviricetes > Andersonviridae > Felixounavirus > Felixounavirus ekra
Host Escherichia coli K-12
[NCBI] 		83333 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR75277.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850644.1 [NCBI]
CDS location
range 49666 -> 52017
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGATACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTTAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTTGGTGATGAAGACCGTCGAATGACTTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTCAAACTCGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGCAATATGACGGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAATCTTTGACCCAACAGGCTCTTCTGAGATTACTATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATCAACGCAAATGACCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCGGCAACTGTTTATCATACTCTTAATAAGCCAAGCCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATGCAAGACTGGCTGTAAATAACACCTTTAGAGCCACTCAGACTATTGTTGCTAACAATGAAGGGTTAATTCTTAAGAATTTGACACAAGGGATGCCACTCTATATTCGTGGTCAAGATGCAGATGGCACTAACAGATGGTATCTAGGCAATGATAATAAAGGCACAGACAACCTTGTTTTAAAAAACGTTAAATCTGGTGCATACGTAGCGATTTTAGCTAACCTAATCTCTGTGAATAAATCAATTCAAATCACTGGTCAAGTACAACCTTCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATATTTTACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGATTTGCGCAGCTAGTTGGTAATAACACATTCAGTGGTTTAAACACATTCAACCAACTAAGTGTTTTCAAAAAAGATGGTGAAGCAATTAGGCTACAGAATGCCAATGCTGCACAACCATTGTACATTAAGGCGATTGATAGCACAGGTGTCAACAGATGGTACATTGGTAATAGTAACAAAGGTGATAACGTAGCTCTAGGAAACTACAAAACTAGTGGCAAGATTACTGTAGGGACAAGTGTTAATATCAATAAAACACTAACTGTAACTGGTCAAGTTCAACCTTCTGACTGGACTAACATTGACTCTCGTTATGTTCTTATCGGTTCATACGCAAATCTTGCTAAGAAGAATGAAGCTAACACATTCACTTTACAGCAGAATATTCAATCTGATGGTGAAGCATTAAGAATCTACAACAAGGCTCAGAATAATTCTTCTTACATTGTTGGTAAGAATACTGATAACACAAATAAGTGGTTTATCGGTTGTGGGACAAATGGTTCTGGTATTGCATCTTTCCATAACTACTTGACTGGTGCAAGACTCGATTTAGCTGACGAAATTCTTCTGTCTAAATCTCTACAGATTACTGGACAGGTAAAACCTTCTGATTGGTCTAACTTAGATGCTAGATACTTCACTCAGTCAGCAGCTAATCAGAGATTCATGGTTGCAGGTTCTACAGGAGAAGCTACAGAGCAGAATGCAGATGGTGTGGCATGGAACGCTAAAACAGGCTTATATAATGTAACATCACCAAATGGTGATTACACATCACTTGTATTTCAAATGTATCAGGGAGTGTCCTCTTCTACTGCCTGTGCGCAACTAAAGTTCCAGTATAAAAATGGTGGGATGTGGTACAGAACATCTGTAGACAGTAAAGGTTTTGAGGCTAAGTGGTCTAAGGTTTACACAGAGGCTCAGAAACCAACCCCTTCAGAGCTTGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTTAACAAAATCTATCCAGTGGGTATTGTGACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTGCCTGGCCTAACTTGGACGTATCTGAAGAATGGTGTTGGTAGGACTATTAGAATTGCAGCAGCAAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGATTCTGTAACGTTAGCTGTTGGTAACTTACCTTCGCACACGCACAGTTTTTCTGCGACTACCTCATCGTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACACTCACTCTGTAAGTGGCTCTACTTCATCTGCTGGTAACCACAACCATTCCATTTCGTGGATTGGTCAGAACTCTACACACTACTCTGGTGGTGGTGGTGGTAGTATTGGTGTAGGACCGGGTTACACCGATGCTAACGGTGCTCACACCCACTCCGTAAGTGGTACTGCCGCTTCTGCTGGTAACCATGCTCACAGTGTTGGTATTGGTGCTCACAGACATACAGTAAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTGAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
ffd2c3b10abf8cf1121c1a262d8c1c7a16ea6d3021850c99a1c86cee5bbd6f36
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6917
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. 2020 — GenBank