Protein

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Genbank accession
AAX92297.1 [GenBank]
Protein name
ORF001
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MEKELLLYNKNNEIIDRTSVSTNLGEVVARNLAPGSKYDTGEFKVSWLIKGVETTKVNVPSFTTDKQQFEQVFIVQFSDINDDNLDSLKGDSAYKIWLDQGNKGTIDEFLNSLKGDKGEKGEPGINIIDGASAYDVWLGQGNEGTKEDFLNSLKGEDGLDGKDGESITVLSSEVQEDNVKVSFSDGSVTLIPNGKQGADGLSAYQLAVKSGFEGTYNEWLESLKGANGLSSYQLAVKQGFTGTLQDYLDSGKVPQVLSKNFPKLTNDTSDVQILTRAINATEEGNTLYISAQESPIYLDSTLIINKNINLVSDAKIVYRGNRDRTAVKIDSISFSSIKIKGIYDNGSYPGWGGGYHGFENSDYVGIEFVNCKNVTTHISEIIGFTTGSKHRATEGKGHWFNNTTIEFFINNETSIELNSDGDDGKGQPSWMNSNHFYKSAFSYSGTAFNTHPETYYNIRQTLTNGNMYGGNSNIFDSFKFETAHGMSDNYIMIYLKKAVGFIFKGYRYELNNNATFAVMDLSTQDLSKYYITHSKDNKFIPDFILGLKHEITYVNNETAKLHRSGIAKIITDTNKKYTLYRNNDFSKEYRRLGSNYHTVKDIFRKPLKSTVLNDEMYYDYSTSTSLIDSNGLLTFTGSCPMVLYVNNVSEGDEITVSKLSFVGNSSGIFIKCFDYNGNYLGKQSNGKDTLMIDGIYYDTNNAWSFNTAQKDTFTVNSSDVKTVVVLISGTLQGLLLETTNPNNIVKTSNVPERNSKSVFYSHFKPTLTTDFKYGERVYNSNNTSVVGWELIGNSWQEIGTTNSTTSVVTTSSKNILNIENYPRQSNEDNDYPRFQRALDELVSKGGGTLIVPKTSTEYLFKTSSPTVQNPSRVKITGSNIHIKGEGNPTIKMTGINKAYIDSIDDVSSSGRDVFTGFSFVGCDNVLVEGLSFVGEWDGVGDFRYASPRSIAIAFKGSTNCKVYNVHGKNILGNVVNAVSTMQAVDGFYRWSEQIEIDNCSAYQCLENGFNYMGGTRNGYYTNNISQNNGSSGFESGTENVIISNNIHIGNKFSGISISGTNYTISNNVVSNNTNKGELSTKPANGITITGGSKGVISNNNISGSEGYEILIYPGVNQIDIQNNTIKQTTDTLKNVVVYYSGTSSKPIYDINLKGNTIRSYSNKAERIVFCNYLNDSNISRNHIKSDYGTDSLNIQGSCSGISITDNNMNKNLSVSINATDSYSKDNIAYNIPKVVDGTKIPTSGSWRIGDIINNTSRVLTKGSPNKWKCTSEGIACDTKWITGTSYTQGQIVYNGSYVYKATTTGVSGNTQPVHSSGVVSDGTVSWEFLSSKASFEAISQIGVTESISSTPLYKGQLAIVDSTVYIAKGTSSTSDWIPLN
Physico‐chemical
properties
protein length:1380 AA
molecular weight: 151659,17500 Da
isoelectric point:5,52653
aromaticity:0,10290
hydropathy:-0,44319

Domains

Domains [InterPro]
DC_2121
ATT
9–131
DC_2121 DC_0876
DC_1336
ATT
120–177
DC_1336 IPR012334 IPR006626 IPR012334 IPR006626
IPR011050
STR
829–1211
IPR011050
IPR006626
Unmapped
922–943
IPR006626 IPR039448 DC_0276
IPR006626
Unmapped
991–1013
IPR006626 IPR006626 IPR006626 IPR006626 IPR006626 IPR006626
AAX92297.1
1 1380
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 9-177 | STR 178-1211 | RBD 1212-1380
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
AAX92297.1
1 1380
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 271 271 0,9957
Central domain 272 605 335 0,9661
C-terminal 606 1380 774 0,2821
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-271
Central
272-605
C-terminal
606-1380

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage Twort (strain DSM 17442 / HER 48)
[NCBI] 		2908167 Uroviricota > Caudoviricetes > Herelleviridae > Twortvirus > Twortvirus twort
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AAX92297.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
AY954970 [NCBI]
CDS location
range 108565 -> 112707
strand -
CDS
TTGGAAAAAGAGTTACTATTGTATAATAAGAATAATGAAATCATAGACAGAACTAGTGTCTCAACAAATCTAGGAGAGGTAGTAGCCCGTAACCTAGCACCAGGTTCAAAATATGATACTGGTGAATTTAAAGTATCATGGTTGATAAAGGGCGTTGAAACTACAAAAGTAAACGTGCCTTCATTCACTACTGACAAACAGCAATTTGAGCAGGTATTCATTGTTCAGTTTAGTGATATAAACGATGATAATCTAGATTCTCTAAAAGGAGATTCAGCATATAAGATATGGCTAGACCAAGGTAATAAAGGGACTATTGATGAGTTCTTAAACTCACTAAAAGGTGATAAAGGGGAAAAGGGAGAACCAGGTATAAATATTATAGATGGTGCTTCAGCATACGATGTGTGGTTAGGTCAAGGTAATGAAGGAACTAAAGAAGATTTTCTTAACTCATTGAAAGGTGAAGATGGGTTGGATGGTAAAGATGGTGAATCCATAACAGTATTATCTTCAGAAGTTCAAGAAGACAATGTTAAAGTATCGTTTTCAGATGGTTCTGTAACACTTATCCCTAATGGGAAGCAAGGTGCTGATGGTCTTAGTGCGTATCAATTGGCTGTTAAGAGTGGCTTTGAAGGAACATATAATGAATGGTTAGAATCTTTAAAAGGTGCTAATGGGTTAAGTAGCTATCAACTAGCTGTAAAACAAGGATTTACTGGAACATTACAAGATTACCTAGATTCTGGTAAGGTTCCTCAAGTTTTATCTAAGAACTTCCCGAAACTTACTAATGATACTTCTGATGTTCAAATACTTACACGTGCTATTAATGCTACAGAAGAAGGAAATACCCTTTATATCTCAGCACAAGAATCACCTATCTATTTAGATAGCACGTTAATAATTAATAAAAATATTAATTTAGTGTCGGATGCTAAAATAGTTTATCGTGGTAATAGGGATAGAACAGCAGTTAAGATAGATTCAATAAGTTTTTCTAGTATTAAGATTAAAGGTATATATGATAATGGTTCATATCCAGGTTGGGGTGGAGGATACCATGGGTTTGAAAATTCAGACTACGTTGGTATTGAATTTGTAAACTGTAAAAATGTAACAACACATATTAGTGAAATAATAGGTTTTACAACTGGAAGTAAACACAGAGCTACGGAAGGTAAAGGGCATTGGTTTAACAATACTACTATAGAATTTTTTATAAATAATGAAACATCTATAGAATTAAATTCTGATGGTGACGATGGTAAAGGTCAACCATCATGGATGAATAGTAACCATTTTTATAAATCTGCATTTTCATATAGTGGAACAGCATTTAATACACACCCAGAAACATATTATAACATAAGACAAACACTTACTAATGGAAATATGTACGGCGGTAATAGTAACATTTTTGATTCGTTTAAGTTTGAAACTGCTCATGGTATGTCAGATAACTATATTATGATTTATCTTAAAAAAGCAGTAGGATTTATTTTTAAGGGTTACAGATATGAGTTAAATAATAATGCTACATTTGCTGTTATGGACTTATCAACACAAGATTTAAGTAAGTATTATATAACACATAGTAAAGATAATAAGTTTATTCCTGATTTTATTTTAGGGTTAAAACACGAAATTACGTATGTTAATAATGAAACTGCTAAATTACATAGAAGTGGTATTGCTAAGATTATTACGGATACTAACAAGAAGTACACATTATATAGAAATAATGATTTTAGTAAAGAATATAGAAGATTAGGAAGTAACTATCACACTGTTAAGGATATTTTTAGAAAGCCATTAAAGTCCACTGTTCTTAATGATGAAATGTATTACGATTACAGTACATCTACTAGCCTTATTGATTCTAACGGATTGCTAACTTTTACGGGTTCTTGCCCTATGGTATTATATGTGAATAATGTGTCAGAAGGTGACGAAATTACGGTATCTAAATTATCTTTTGTAGGTAATTCTAGTGGTATATTTATTAAATGCTTTGACTATAACGGTAATTACCTAGGAAAACAATCTAACGGAAAAGATACTTTAATGATAGACGGTATTTATTATGATACAAACAATGCTTGGTCTTTTAATACAGCACAAAAAGATACTTTTACTGTAAATAGTAGTGATGTAAAAACTGTAGTTGTTTTGATTTCTGGAACGTTACAAGGACTATTACTAGAAACAACTAACCCTAATAATATTGTGAAAACCTCTAATGTTCCTGAAAGAAACTCTAAAAGTGTTTTTTATTCACATTTTAAACCAACATTAACAACTGACTTTAAATATGGTGAAAGAGTTTATAATAGTAATAACACTTCCGTTGTTGGATGGGAATTAATTGGAAACTCATGGCAAGAAATAGGTACTACAAACTCTACAACATCTGTAGTTACTACGAGTAGCAAAAATATTTTAAATATAGAAAACTACCCTAGACAGTCAAATGAAGATAATGATTATCCTAGATTCCAAAGAGCTTTAGATGAATTAGTATCTAAAGGTGGAGGAACGCTAATAGTACCTAAAACAAGTACTGAGTACTTATTTAAAACAAGTAGTCCTACCGTCCAAAATCCATCTCGTGTAAAAATTACTGGTAGTAATATCCATATTAAAGGTGAAGGTAATCCTACTATAAAAATGACGGGAATAAACAAAGCATACATAGACTCTATAGATGACGTGTCATCTAGTGGTAGAGATGTGTTTACAGGTTTTTCATTTGTTGGATGTGATAACGTACTAGTAGAAGGATTGTCTTTTGTTGGTGAGTGGGATGGAGTAGGTGACTTTAGATATGCATCACCACGTTCTATTGCTATCGCATTCAAAGGAAGTACTAATTGTAAAGTGTATAATGTTCACGGTAAAAACATCTTAGGTAATGTGGTTAACGCTGTAAGTACTATGCAGGCTGTAGATGGCTTTTACCGTTGGTCAGAACAAATAGAAATAGATAATTGTTCAGCATACCAATGCTTAGAAAATGGCTTTAACTACATGGGAGGAACTAGAAACGGATATTACACAAACAATATCTCACAAAATAATGGTTCCAGTGGCTTTGAGTCAGGAACAGAAAATGTTATTATAAGTAATAACATACATATAGGAAATAAATTTTCAGGTATAAGTATTTCTGGAACTAATTATACAATCTCTAATAATGTAGTCTCTAATAATACTAATAAAGGTGAATTAAGTACAAAACCTGCTAACGGTATTACAATTACAGGAGGAAGTAAAGGTGTAATTAGTAATAACAATATATCAGGTAGTGAAGGATATGAGATTTTAATATACCCAGGAGTCAATCAAATAGATATACAGAATAATACGATAAAACAAACCACAGATACATTGAAGAATGTTGTCGTATACTATTCTGGAACTAGTTCCAAACCTATTTACGATATAAATCTAAAAGGTAATACTATTAGAAGTTACTCTAATAAAGCGGAAAGAATTGTATTTTGTAACTATTTAAATGACAGTAATATCAGTCGAAACCACATAAAATCTGATTATGGTACGGACTCACTAAATATTCAAGGAAGTTGTAGTGGTATCAGTATTACAGACAATAATATGAATAAAAACTTAAGTGTATCCATAAATGCTACAGATTCTTATAGTAAAGACAATATAGCTTATAATATACCTAAAGTAGTAGATGGAACAAAAATACCAACATCAGGTTCATGGAGAATAGGGGATATTATTAATAATACATCTAGAGTATTAACTAAAGGTAGTCCAAATAAATGGAAATGTACATCGGAAGGTATAGCATGTGACACTAAGTGGATTACAGGTACAAGCTATACACAAGGACAAATCGTATATAACGGTTCTTATGTATATAAAGCAACAACAACTGGTGTTAGTGGTAACACACAACCAGTACATTCATCGGGTGTAGTATCAGATGGTACTGTGTCATGGGAATTCCTTTCAAGTAAAGCATCTTTTGAAGCAATAAGTCAAATAGGTGTTACGGAAAGCATTTCTAGTACACCTTTATATAAAGGACAACTAGCTATAGTAGATTCTACTGTATATATTGCTAAAGGAACTTCAAGTACTAGTGATTGGATTCCTTTAAATTAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
41a0535d0b306493b493437009760828f31fdda5b4a495cbfc19ed5817a2b7bc
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6276
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50