Protein

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Genbank accession
YP_004934528.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fibre protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MSQTRESARFSNRALIDGKLNYQDGTLSSGKPTSSSLKTQSFFQIFKGKAVKFGGNYKLKTFLGNSIKNSSYSYIILGNLYKDIYIDGKLGIAGSNKVKISLKVVNGYVKKYTMENNENYQNSLVSVVYNGIEYLALALSNVIAAAPVIVDAVMSEDTLETLSYIIDPTQFTTIKPWAVYTDGSKKIYESFNLPLNGWIDAEAVTLTDGTVLLTGGFYNPVLVLDEYSTSQTKVVTNKSYIFNPADRTFRETSNLPYPVNNHRLCAIKNNCALQLGGGAYYSDQANTNNQWWKTVGDILLYTSDNVSGGQKWVILGQWSNYLFRSHGVTYDDVNDYLYVYIPFGTTSPDGADVAINHFGRRKIIYGSDTNNVTLGAVEVLASIPTSLMPSGSSGSNYPWRNTYLHYYNGKIYLPLQDNASNSFSAYGKWNYGLVYDVATNTWSKWINTIAAGDGSQIVRIKDKLYTTGWVSQLKEGTTATTVPLQFESDVNVADMLCFDLTKGTMTYKSPLNLTNNASVIDKNILSAGSSCAMAALKDGRIAIFGGDRGNSFSGVPEYLNTKGLVNLNRPSVGFIYYPDNDTSDTFSGIVVEREISDNTYSSFNQPFKYKGDFYYLSTGKSNDFGTPIDGSKLIKYSVSYGTETILNVDKLTKGLKGAATAVSKSGRVFILGGDKEGVLSNSFFTNDLITYSDTWAAITSLPISVAYGRAKVTPDNKVLYIGGVKSDGTFNRNVYAYDLTSTTWSILTTLPYDFIAGDITENTFNGNTYVFYGLHPDTTTNNNFSIISNTGTVTTKSLSDLSTAISNSYIVGASYLNKDVIRLVDNTGRHWDYDLVNSKITVSLTRRNNFYPQNGIVKLDSDKCCTVDKYGRIYITHLYQREFSERIDHPDRDKIISGFKTDVTGAYNDVVGWESLVDIYTAPMVIPCNEYDNTSIFFTFTVQSRAPNNTTTPQNIIGIYNRVTEKFTFYPSSQLSSVYGATCSDRDGNPIIVGGVKNKTLVQFTENGISYIDSRNVNNVFNMFVYKFDMATKTISQIATMPYQYGNGAAYFDKDTRKLYMFGGYTAQKVPYWDIASNSLSTQRCMVYDVDTNTFSLIASLPNYGIGWGNCFRKDKDKIIIFGGYIGLVDDKVDLPSLRQDLGNPNKIIYEYSISSNTYKDVSVEYSFIQNFRGLTNGKNEFCEVHFAERIPNCEKNEILFYNQLNTSKDSSSGFIHTGYTPKFLGGQLNILNLDTKEFRVVDTANMVPIASAALWSPYLSASKSLLHYGVDGKFYEMNKYIAGSASVFNSPTKIGIVRNYL
Physico‐chemical
properties
protein length:1302 AA
molecular weight: 144700,70400 Da
isoelectric point:7,41399
aromaticity:0,12826
hydropathy:-0,25760

Domains

Domains [InterPro]
IPR015915
STR
196–377
IPR015915 IPR015915 IPR037293 IPR015915
IPR015915
STR
197–562
IPR015915 IPR011043
IPR006652
STR
707–751
IPR006652
YP_004934528.1
1 1302
Architecture
STR
STR
STR 196-585 | STR 603-1170 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
YP_004934528.1
1 1302
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 151 151 0,5106
Central domain 152 572 422 0,8797
C-terminal 573 1302 729 0,1876
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-151
Central
152-572
C-terminal
573-1302

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Yersinia phage phiR1-37
[NCBI] 		331278 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Yersinia enterocolitica
[NCBI] 		630 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_004934528.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_016163 [NCBI]
CDS location
range 209700 -> 213608
strand -
CDS
ATGTCACAGACTAGAGAGTCCGCAAGATTTAGTAACAGAGCACTAATAGATGGTAAATTAAATTATCAGGACGGAACCTTATCTTCTGGTAAGCCTACTAGCTCTAGTTTAAAAACTCAATCTTTCTTCCAAATTTTTAAAGGTAAAGCTGTAAAATTTGGCGGTAACTATAAACTTAAGACATTTTTAGGTAATTCTATTAAAAATAGCTCTTATTCATATATTATTCTAGGCAACCTATACAAAGACATCTATATTGATGGTAAATTAGGTATTGCTGGAAGTAATAAAGTAAAAATCTCTTTAAAGGTAGTAAATGGGTATGTTAAAAAGTATACTATGGAAAATAATGAGAATTATCAGAATTCTCTAGTTTCAGTAGTATATAATGGCATAGAATATTTAGCATTAGCTTTATCAAACGTCATAGCTGCAGCACCTGTAATTGTGGATGCTGTAATGTCTGAAGACACATTAGAAACCCTTTCATACATTATTGATCCTACGCAATTTACTACAATTAAACCTTGGGCTGTATATACAGACGGGTCTAAGAAAATTTATGAAAGTTTCAATTTACCCTTAAATGGATGGATTGATGCTGAAGCAGTTACTCTTACAGATGGTACTGTATTACTAACTGGAGGGTTTTACAATCCAGTATTAGTATTGGATGAATATAGTACTTCTCAGACAAAAGTAGTTACCAATAAATCATACATCTTCAATCCAGCGGATAGGACTTTTAGAGAAACTTCTAATTTACCTTATCCAGTAAATAATCATAGGCTTTGTGCTATAAAAAATAACTGCGCCTTACAATTAGGAGGGGGTGCATATTATAGTGATCAAGCAAATACTAATAATCAGTGGTGGAAAACTGTTGGGGACATACTGCTTTACACTAGTGATAATGTAAGTGGTGGTCAAAAATGGGTTATTCTTGGTCAATGGAGTAATTACTTATTTAGAAGTCATGGCGTAACTTATGATGATGTAAATGATTATCTATATGTATACATTCCATTTGGGACTACATCACCTGACGGAGCTGATGTAGCAATAAACCATTTTGGTAGAAGAAAAATTATTTATGGGTCTGATACGAACAACGTAACTCTAGGAGCAGTAGAAGTCTTAGCTTCTATTCCTACCTCATTAATGCCGTCTGGTTCGTCTGGTAGTAATTATCCTTGGAGAAATACATATCTACATTATTATAATGGTAAAATTTATTTACCATTACAGGATAATGCTTCTAATTCATTTTCTGCTTATGGTAAATGGAATTATGGTTTAGTATATGACGTAGCTACTAATACTTGGTCTAAATGGATTAATACTATCGCTGCAGGTGATGGCAGTCAGATAGTAAGAATTAAGGATAAATTGTATACCACTGGTTGGGTGTCTCAGTTAAAAGAAGGTACTACTGCTACTACTGTCCCATTGCAATTTGAATCGGATGTCAACGTAGCAGATATGTTATGCTTTGATTTAACAAAAGGTACCATGACATATAAATCCCCATTAAACCTTACAAATAATGCATCGGTTATAGATAAGAACATTTTAAGTGCCGGTTCCAGTTGCGCTATGGCTGCACTTAAAGATGGTAGGATAGCAATTTTTGGCGGAGATAGAGGAAACAGTTTTTCTGGAGTACCTGAGTACTTAAATACTAAAGGATTAGTAAATCTAAATCGTCCTTCTGTTGGATTTATTTACTATCCAGATAATGATACCAGTGACACCTTCTCAGGTATTGTAGTTGAAAGAGAGATTTCTGATAATACATATTCTTCTTTCAACCAACCATTTAAGTATAAAGGTGATTTCTATTACTTAAGTACTGGTAAGAGTAATGATTTCGGTACACCAATTGATGGTTCAAAATTAATTAAATATAGTGTATCTTATGGTACTGAAACTATTTTAAATGTAGATAAACTTACAAAAGGATTAAAAGGTGCAGCTACGGCTGTTTCTAAATCTGGTAGAGTATTTATTTTAGGTGGTGATAAAGAAGGCGTTTTATCAAATAGTTTCTTCACTAATGATCTGATTACATATTCGGATACTTGGGCTGCTATAACCTCTCTACCAATATCAGTGGCATATGGTAGAGCTAAAGTAACTCCGGATAATAAGGTACTGTATATTGGTGGGGTTAAATCAGATGGAACATTTAATCGGAATGTATATGCATATGATTTGACTAGCACTACTTGGTCAATCTTAACTACATTACCATATGATTTTATTGCTGGCGATATAACTGAAAATACATTTAATGGAAATACTTATGTATTTTATGGTTTACATCCAGATACTACTACTAATAATAATTTTTCCATTATTAGTAATACTGGTACAGTAACAACTAAATCTCTAAGTGATTTATCTACAGCTATATCTAATTCTTATATTGTTGGCGCAAGCTATTTGAATAAAGATGTTATTCGCTTAGTAGATAACACTGGTAGGCATTGGGATTATGATTTAGTTAACAGTAAAATTACTGTATCTCTGACTCGTAGAAATAATTTCTATCCACAAAATGGTATAGTTAAACTTGACTCCGATAAATGTTGTACAGTAGATAAGTATGGAAGAATCTACATCACGCACTTGTATCAGCGAGAATTTTCTGAAAGGATTGACCATCCAGATAGAGATAAAATTATTTCTGGATTTAAAACTGATGTTACTGGAGCATACAATGATGTTGTAGGTTGGGAAAGTTTAGTTGATATTTATACGGCACCTATGGTTATACCATGTAATGAATATGATAATACATCAATATTCTTTACTTTTACTGTACAATCAAGAGCGCCAAATAATACAACTACTCCTCAAAATATTATAGGTATCTATAATAGAGTGACGGAGAAATTTACTTTCTATCCTAGTTCTCAATTAAGTTCTGTATATGGTGCAACTTGTTCTGATAGAGATGGAAATCCTATTATTGTTGGTGGCGTAAAGAATAAGACTTTAGTACAATTTACAGAAAATGGTATATCCTATATAGATAGTCGTAATGTAAATAATGTATTTAATATGTTTGTTTACAAATTTGATATGGCTACTAAAACCATAAGTCAGATAGCAACTATGCCTTATCAATATGGTAATGGTGCTGCATATTTTGACAAAGATACGAGAAAATTGTATATGTTTGGCGGATATACAGCTCAAAAAGTACCATATTGGGATATTGCTAGTAATTCCCTATCTACCCAACGTTGTATGGTATATGATGTAGACACCAATACTTTCTCATTAATAGCTAGCCTACCAAATTATGGGATAGGTTGGGGGAATTGTTTCAGAAAAGATAAGGATAAGATTATTATCTTTGGTGGGTATATTGGACTAGTAGACGATAAAGTAGATTTACCTTCTCTTCGCCAAGACTTAGGGAATCCTAATAAAATTATTTATGAGTATTCAATTTCTTCAAATACTTATAAAGATGTAAGTGTAGAGTACTCATTTATTCAAAATTTCCGTGGTCTTACTAATGGTAAGAATGAATTTTGTGAGGTTCACTTTGCCGAAAGAATTCCTAACTGTGAGAAGAATGAAATTCTATTCTATAATCAACTAAATACCTCTAAGGATAGTTCTTCTGGATTTATTCATACTGGTTATACTCCTAAGTTCCTAGGCGGGCAATTAAATATTCTTAATTTAGATACTAAAGAATTTAGAGTAGTAGATACAGCCAATATGGTACCTATAGCTAGTGCAGCACTTTGGTCTCCATATCTGTCGGCATCTAAATCATTACTCCATTATGGAGTTGATGGTAAATTCTATGAAATGAATAAATATATAGCTGGCTCAGCTTCAGTGTTTAATTCCCCTACCAAAATTGGTATTGTGCGTAATTATTTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
bf1ada56ed8609db77e73127c65e895879f8a873645d309d2e785632df92f89d
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5587
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50