Protein

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Genbank accession
AGF87360.1 [GenBank]
Protein name
gp58-like protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,79
Protein sequence
MLYLLDKDVKTVKWNGIPLHEASSAIVKEEINGDFTLTIRYPITDSGIYQLIKEDMLIKAPTPVLGPQLFRIKKPIENDDSLDITAYHISDDIMQRSINPVSVVGQGCAMALSQMVQNAKTDLGTFSFTSDIMDSRTFNTTDAETLYSVLLDGKHSIVGTWEGELVRDNFALTIKRSRGADRGVVITTHKNLKSYQRTKNSQSVVTRIHAKSTFKAEGAEEETTINVTVDSPLIGNYPYINEKDYENNNAKTVDELRKWAEAKFKHEGIDKVSDAIEIEAYELDGQVVHLGDTVNIKSRKHDVDLYKKAIAYEYNALTEEYISITFDDKPGVGGSGVSSGVSNVADVILNANRNAQEVAVERAIRNANQAFNTEFDKRIESINDGLEQSKAEAEAYADNIKQSIDADINAVNQSMQAQSEEHDRQVADILSKTQSVEELANQAKTDAASALARANQVKTEAIADARAQVATVSQALNTAKTDLQNQVNAVDAKAVKVQSDANALRTDLNQQAQTLLSQAQAQTALTNRVASVETLADGTRSTVTELSKTVSKATGDIASVSSRTKTVEDTLSQTRTQYEALTQTVNAQTGQIESINRKTADLQSGIDGVTERFDSLQVGGENLLLNAGFEGATDSTATFTVGGVTYIAKRIPNWYDLYNSGIANPTTSYHAIYRESFEGKGAVIEFNESDGSRNWKAISAILDTKSLTVGGNYTFSADIYATGTGTKTWFGFYYYNKNGVRNFHSGQTTINISTINKWHRVAGQIKLNEDIDLSRGTNFYIYAYNFATNSILYLTKPKLENGTVATAFSLAQETIRSEIAEYKRTVDQNYAGLQSTVSTLDGKVTQNKTEANQTATQLSNRLTSLETYKDGESTRAQAYFEASKIETAKQLTAERTAIATNYVAKSTYDENVRGTTLKLNEIKSTADTAKQNLATYQNTVDRKLTELTSSAQTLDGKINTASAKFDTVAGQIRTEISEVEGKIPTEIGGKNLLINNKMATYSGHSMSSRTTERLAGRGAWYIEYEVDFKPNTDYTLSCESIVKNNSNFNNLRIRIFDSTITVKKMDWLDFNGLLNFRTSDNIVSGDKLLIYVSYSNASDYEITKLKLEETRVKSAYSPAPEDLINELSSVKTTITQTASGVEQLSTSLATTDNKVTTAETKIRQLISDVSSKVSQSDYNTLTGRMSSAESAITQNATEISKRLTKTQVDKAITDKGYQTKSDVDSNITGRGYITNSALQPYALSTTVQNLVRETADSFSRTISETRGLIPSNVGIRNLLKGTKDLSGNDAKSFNTSDKYLDFNIARSRPTTGYSDTFSAYTTIPVTANDYIISFYAKSDVDGATLYCHFYNPNTTTKAESSTGYKGGSSDGLARVQVTTEWQRYWVKWSQSKTDTVKKVIIGRNNSADGIKIIEVAGVALYEGALNKGHFDAPEDLVTVTALHNVTDKVDSHTRTIGAVGETGSILDNVSKVTQTAAGLVQEVSGDNGLKTQVSTLAGSYAIKNLTSAGTVLNQINLLANGTNRIDGRLTHITGQTLIDNGVINNAMIGNLDAGKITTGYLASARIATNSITGSHMVFDQAFVNKMTANEALFKQLFAQSAFITSVQAVAVSAKQIAGGIAKALNGGMDVNFDESKINFYTNVAAIRRIYTGHPTQFIKFETEGNYSRTIIGSNRNGGEVFNSATFAGIVVENTNNINTEDNVRIYGDNTLLRHAQGDVGWNINSVTQRIVPANMNAESEIWSKHFVAPDKNSKPVRLDTAVAALWDIWNHIIYNNFEFNAALRTHIKARRDNWKFELNL
Physico‐chemical
properties
protein length:1800 AA
molecular weight: 197224,93150 Da
isoelectric point:5,78151
aromaticity:0,07500
hydropathy:-0,41656

Domains

Domains [InterPro]
DC_0109
STR
1–790
DC_0109 DC_0093 IPR012892
IPR007119
Unmapped
28–327
IPR007119 Coil G3DSA:1.10.287.1490 Coil G3DSA:1.20.5.340
PTHR18921
Unmapped
545–1208
PTHR18921
DC_1418
STR
1132–1795
DC_1418
AGF87360.1
1 1800
Architecture
STR
STR
STR 1-790 | STR 811-1795 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Streptococcus phage phi30c
[NCBI] 		1289596 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Streptococcus suis
[NCBI] 		1307 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGF87360.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KC348599 [NCBI]
CDS location
range 7616 -> 13018
strand -
CDS
TTGCTTTATTTACTTGATAAGGATGTCAAGACAGTTAAATGGAATGGTATTCCGCTACACGAAGCTAGCTCTGCTATTGTCAAAGAAGAAATCAATGGCGATTTTACTTTGACTATCCGCTATCCTATCACTGACTCAGGTATCTATCAGCTTATCAAAGAGGATATGCTGATAAAGGCACCGACTCCTGTCCTTGGTCCACAGCTTTTTAGGATTAAAAAACCTATAGAAAATGATGATAGTTTGGATATCACTGCCTACCATATCAGCGATGATATTATGCAACGGTCTATCAATCCTGTTAGTGTTGTTGGTCAAGGTTGTGCTATGGCTCTCTCTCAAATGGTCCAAAATGCTAAGACGGACCTTGGGACTTTTTCGTTTACAAGCGACATCATGGATAGTCGGACCTTTAACACGACAGATGCAGAGACTCTTTACTCAGTCCTATTGGACGGTAAACACAGTATTGTTGGAACGTGGGAGGGTGAGCTTGTCCGTGACAACTTTGCTCTGACTATCAAGCGTAGCCGTGGGGCTGACCGAGGGGTTGTCATCACGACACACAAGAACCTCAAGTCCTATCAGCGTACCAAAAACTCCCAAAGCGTGGTCACTAGGATACACGCTAAGTCAACTTTTAAGGCTGAAGGTGCTGAGGAAGAAACAACCATCAACGTAACAGTTGATAGTCCACTTATCGGAAATTATCCATACATCAACGAAAAAGATTATGAGAATAATAACGCTAAGACAGTGGATGAGCTGAGAAAGTGGGCAGAAGCTAAGTTTAAGCATGAGGGTATCGACAAGGTATCAGATGCTATTGAGATTGAAGCCTATGAACTTGATGGGCAAGTTGTCCATTTAGGTGATACGGTCAACATCAAGAGTAGGAAACACGATGTAGACCTCTACAAGAAAGCCATTGCTTATGAATACAACGCTTTGACGGAAGAATATATCTCTATCACGTTTGATGATAAACCTGGTGTTGGTGGCTCTGGTGTATCTAGTGGCGTGTCTAATGTTGCTGATGTGATCTTGAATGCCAATCGAAATGCTCAAGAAGTTGCAGTTGAGAGAGCTATCAGAAATGCCAACCAAGCCTTCAACACTGAATTTGACAAGCGAATTGAATCCATCAATGACGGTCTCGAGCAGTCAAAAGCGGAAGCAGAAGCTTATGCAGATAACATCAAGCAAAGTATTGATGCTGATATTAACGCAGTCAACCAATCCATGCAAGCTCAATCCGAGGAACACGACAGGCAGGTCGCAGATATATTGTCCAAAACCCAGTCTGTCGAAGAGCTCGCGAATCAAGCCAAAACGGATGCTGCTAGTGCACTAGCTAGAGCTAACCAAGTCAAGACGGAGGCAATCGCAGATGCAAGAGCGCAGGTTGCGACGGTTAGTCAAGCGTTAAATACTGCTAAGACTGATTTGCAAAATCAAGTTAATGCGGTTGATGCGAAGGCTGTCAAAGTGCAGTCGGATGCTAATGCGTTACGTACTGACCTCAATCAACAAGCTCAAACTTTATTGTCACAAGCTCAAGCACAGACGGCGTTGACCAATCGTGTGGCGTCGGTCGAGACTTTGGCTGATGGTACGAGGTCGACTGTCACAGAACTGTCTAAAACCGTTTCTAAGGCGACTGGCGACATCGCTAGTGTATCAAGTCGTACCAAGACTGTTGAGGATACTCTGAGCCAAACGAGGACCCAATACGAAGCTCTGACGCAGACTGTCAATGCTCAGACAGGGCAGATTGAGAGTATCAATCGAAAGACCGCTGACTTGCAGAGTGGAATTGATGGTGTGACGGAGCGGTTTGATAGTTTGCAGGTTGGTGGCGAGAATTTGTTGCTCAACGCAGGTTTTGAGGGGGCTACCGACTCTACTGCAACCTTTACCGTGGGTGGCGTCACTTATATTGCAAAGCGAATTCCAAATTGGTATGACCTATACAATAGTGGTATTGCAAATCCAACAACATCTTATCATGCTATCTATAGAGAGTCTTTCGAGGGAAAAGGGGCTGTAATAGAATTTAATGAATCTGATGGTAGTCGTAATTGGAAAGCAATTTCAGCTATATTAGACACGAAAAGTCTGACTGTTGGTGGAAACTATACGTTTTCGGCAGATATATATGCCACTGGTACGGGCACTAAAACTTGGTTTGGTTTCTATTATTACAATAAAAATGGTGTGCGAAATTTCCACTCAGGACAAACCACTATCAATATTAGTACGATAAACAAATGGCATAGAGTTGCTGGACAGATAAAACTAAATGAAGACATTGATCTTTCGAGAGGTACAAATTTCTATATCTATGCTTACAATTTTGCAACTAATTCGATTCTATATTTGACTAAGCCAAAACTTGAGAATGGAACAGTAGCCACGGCTTTTAGCTTAGCTCAGGAAACCATTCGCTCCGAAATAGCCGAATACAAACGCACTGTAGACCAAAACTACGCTGGCTTGCAATCAACTGTTAGCACGTTAGATGGTAAGGTCACACAAAACAAGACCGAAGCCAATCAGACAGCTACTCAGTTGTCAAACAGATTGACAAGTCTTGAGACATACAAGGACGGCGAATCAACCCGTGCTCAAGCATATTTTGAGGCATCTAAGATAGAGACGGCCAAACAGTTAACTGCCGAGCGAACTGCGATTGCTACTAACTATGTGGCCAAGTCTACATACGACGAAAATGTCAGAGGAACAACGCTAAAGCTCAATGAGATTAAGTCAACAGCTGACACTGCAAAACAAAATCTAGCTACTTATCAAAATACAGTCGACAGAAAGTTAACTGAATTGACCTCAAGTGCACAGACACTAGACGGCAAAATTAATACGGCAAGTGCAAAGTTTGATACCGTAGCTGGGCAGATACGTACTGAGATTAGCGAGGTGGAAGGGAAGATACCGACGGAAATCGGTGGCAAGAACTTACTAATCAATAATAAAATGGCTACATATTCCGGTCATTCTATGTCAAGCAGAACGACGGAAAGATTGGCCGGAAGAGGAGCTTGGTACATTGAGTATGAAGTAGATTTTAAACCCAATACAGACTATACACTATCATGCGAATCCATTGTCAAAAACAATAGTAATTTTAATAATTTAAGAATCAGAATTTTTGATTCTACCATCACTGTAAAAAAAATGGATTGGCTAGATTTTAATGGGCTATTAAATTTTAGAACCAGCGATAATATTGTTTCAGGCGATAAACTTTTGATTTACGTATCATACAGTAATGCAAGCGATTATGAGATCACTAAGTTAAAACTTGAGGAAACTCGTGTTAAATCAGCATACTCTCCAGCTCCGGAGGATTTGATTAACGAACTATCATCTGTCAAAACCACAATCACTCAGACTGCCTCCGGTGTCGAGCAGTTATCAACTAGCTTAGCTACGACTGATAACAAAGTCACGACTGCCGAGACTAAAATCCGACAGTTAATCAGCGATGTGTCAAGCAAAGTATCGCAAAGTGATTACAACACGTTAACCGGTCGTATGAGTAGCGCAGAGAGCGCTATTACTCAAAATGCGACAGAGATTAGCAAGCGATTGACAAAGACGCAGGTTGATAAAGCTATCACAGATAAAGGCTATCAGACAAAGTCTGATGTTGACAGCAACATCACAGGTCGTGGTTATATTACCAATAGCGCCCTGCAGCCTTACGCATTATCTACGACTGTCCAAAATCTCGTCAGAGAGACGGCTGATAGTTTTAGTCGGACGATTAGTGAGACAAGAGGTTTGATACCTAGCAACGTTGGAATCCGAAATCTACTAAAAGGGACAAAAGATTTAAGCGGTAATGATGCTAAAAGCTTTAACACATCAGATAAATACCTTGATTTTAACATCGCACGCTCGAGACCTACAACTGGATATTCTGACACGTTTAGCGCGTATACGACAATACCCGTAACGGCAAATGATTATATCATTAGCTTTTACGCTAAATCTGATGTTGATGGCGCAACGCTTTATTGCCATTTTTACAATCCAAACACGACTACAAAAGCCGAATCAAGCACAGGTTATAAAGGTGGTAGTTCGGACGGATTAGCGCGGGTACAGGTAACAACTGAGTGGCAACGTTACTGGGTCAAGTGGTCTCAAAGCAAAACTGATACAGTTAAAAAAGTGATTATTGGTCGAAACAATAGCGCAGACGGTATCAAAATCATAGAAGTTGCTGGTGTCGCGTTGTACGAAGGTGCATTAAATAAAGGCCATTTTGATGCTCCAGAAGACCTTGTCACTGTCACGGCTCTGCACAACGTCACAGACAAAGTCGACAGTCACACACGTACTATCGGCGCTGTCGGTGAGACAGGTAGCATTTTGGATAATGTCAGCAAGGTTACTCAGACTGCAGCAGGTCTGGTGCAGGAAGTATCTGGTGATAATGGGCTTAAGACACAGGTCAGCACACTTGCTGGGTCGTATGCAATTAAAAATCTGACCAGTGCGGGTACGGTACTCAACCAAATCAACTTGCTTGCTAACGGTACCAACAGAATCGATGGTCGACTGACGCACATCACAGGTCAAACTTTGATTGACAATGGTGTTATCAACAATGCAATGATTGGCAATTTAGACGCTGGCAAAATCACGACAGGCTATCTAGCGTCAGCTAGGATTGCTACCAATAGCATCACGGGCAGTCACATGGTCTTTGACCAAGCGTTTGTCAATAAGATGACTGCAAACGAAGCCTTGTTTAAACAATTGTTTGCCCAAAGCGCATTTATCACAAGTGTGCAAGCAGTGGCTGTGTCAGCTAAGCAGATTGCTGGTGGTATTGCTAAAGCCCTCAACGGTGGTATGGATGTCAATTTCGACGAAAGCAAAATTAACTTTTACACAAACGTAGCTGCAATAAGACGTATCTATACTGGACACCCTACTCAATTTATAAAATTTGAAACCGAAGGGAATTACTCGCGAACAATCATCGGGAGCAACCGAAACGGAGGAGAAGTTTTCAATTCGGCAACATTTGCAGGGATTGTTGTAGAAAACACAAACAACATAAACACAGAAGATAATGTGCGGATTTATGGAGATAACACGCTATTAAGACACGCACAAGGCGATGTCGGTTGGAATATCAATTCTGTCACTCAACGTATAGTCCCAGCTAACATGAACGCAGAGTCCGAAATTTGGTCTAAGCACTTTGTGGCTCCGGATAAAAATTCGAAGCCTGTCCGATTGGATACAGCAGTGGCAGCATTATGGGACATTTGGAATCACATCATCTACAACAATTTTGAGTTCAACGCAGCGCTTCGCACACACATAAAAGCCAGACGGGACAATTGGAAATTTGAATTAAATTTATAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
631d7290ece0f28ae4cfcf6dcaa1647a2d2c187053a3df0587150e7c250873ba
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6877
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50