Protein

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Genbank accession
AIX39176.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGSATQWSNSNPTLAQGELGIELDTGRIKIGDGVTAWNSLRYERPIESVSATANTLVQRDADGNFAAGTVTATLIGNASTSDRLSSTRQVSLTGDLTGSNTFDGGANLPINAELSRITTLPHYSSENTEATGTYTKVVVDSKGRITNASNPTTIQDYGLDTSIAGSGAQPYDLDLAAITNLTDGAAGFGLISRTSTGNITVRDIVTASTQRIVVNNGDGINGNPEIDLGLTTVVPDTSSFSQGLYNTESLTSVNSVGANGELLGTETVNTIKFTVDKYGRLQSATNVPIATATEGSKYANYDAGTAYSRYAIIQNASKVYQAIADIGAGVGAPTHSSGDTGSWRYLAAEATEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAAVGVDNTQLQNNRISFADGTTKEDFELDQELTATSGYRGFNYLNYIKVNDVSGNLLVGANNTGDSGAGELDVNVRSYFSDADITLDGALNQTLDKTGDGNLTFQLSQNTATDRNFNILTTNAGSGSSNIIITAEDTIQISASEAAGKVHVEDARFQDNYIATTNATMNLDPGDDRAATGTVRVWGNLQIDGTTTTVNSTTVTVDDPIITLGGDTAPATDDNLDRGIEFRYYDTEARLGFYGWDTNYTDLGGHGGGYRFLHAATNTTEVFTGTDSGIIAGNVKLTTGTNSTTNTTGDLVVAGGVGITQDVNIGGLLDVDSTFRANSTSRFDDTMVLRGASKSLQFQNGAGTVKSEIHTTTGNAEFGGILTVTGATDLNSTLNVASSVHFEATDEPTFALNSGTGIWEIQSNDYGSFRFDGGGYIAGDFMFDSDVVINGTILQKESATEVFNEQNFLRVRRKLESGSVQVLTPSYASHTTSNARIFGGAGIGTSLHIGGTSASEGLFIGKKESADTVKFSVLGASGNTDIEGTLNVEGEVTIQDSVIINAANEVFSIRNGSGVAKFDVDTDNGNTLIEGTLNVNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTVIEGTLNGKGDADFDSDLNVDGNTTLVGTLTVTNTTEFNNTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDASNELFSVRNGSAVAKFEVDTDNGNTNIIGTLTVGDATQINDTLGVSNVVTFTRNTQQTLTGSYAADGAFRLTGGAAIGKNLAVGGAARIYGGTELTGALDLNSSADISGALVTHDNVTITANNKTFAIQNGSAANKLTVDTDNGNTDIRGTLDIGGDVTAESNLTVTGNLTINGTTTTVNSTVTTLDDPIITVGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDGSAKIGFFGYDRSANQFAFVTDATNSSEVLSGTDGPLRAGSLNLTGAGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGPALVIPNTTKINNLNADLLDSMTTASAATATTVVARDSSGDFAANIVTVASGEGAAAGIQGNSLTADTLKRSRIITLDGVVDGSVSFNGSADVTISTTYNDADITALAAMAGTGLVARTAANTYAQRSVTATASSGITVTNADGVSGNITINVASASTNAANNLVLRDASGDFAANEITADLIGGVTGNVTGNLTGNVTGNSSTVSTSSSGSATEVFVGTVFNQSGTNSITTNPGFKYDRATAKILGNLQGNVTGNLTGSASQVDTVTASSANAAYHLTMVDQHNTVANNETINTDQSLTYNPSTNRLKTKLELQTDAAPASATATGTVGEIRYDTNYIYICVATDTWKRAAISTWS
Physico‐chemical
properties
protein length:1730 AA
molecular weight: 178820,12230 Da
isoelectric point:4,28114
aromaticity:0,06012
hydropathy:-0,18988

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:2.10.10.30
ATT
1–44
G3DSA:2.10.10.30 DC_1607 DC_0029
SSF69349
STR
4–245
SSF69349 DC_0574
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352
AIX39176.1
1 1730
Architecture
ATT
STR
STR
RBD
ATT 1-44 | STR 45-245 | STR 342-940 | RBD 986-1730
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014b
[NCBI] 		1493508 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Nereusvirus > Nereusvirus tusconc4
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX39176.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019133 [NCBI]
CDS location
range 89239 -> 94431
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAGTTAAGACGTGGCTCGGCTACGCAGTGGAGCAATTCAAATCCTACGCTGGCGCAAGGCGAATTAGGAATTGAACTCGATACAGGCCGTATCAAAATCGGTGATGGTGTTACTGCATGGAACTCACTTAGGTATGAAAGACCTATTGAATCAGTTTCTGCTACGGCAAATACATTGGTTCAGCGTGACGCTGATGGCAATTTTGCTGCAGGTACAGTAACAGCAACTCTTATTGGTAATGCTTCAACATCAGATCGTCTTTCTTCTACTAGACAAGTTTCACTTACGGGCGACTTAACTGGTTCTAATACCTTTGATGGTGGTGCAAACCTTCCTATCAATGCAGAACTTTCACGTATTACTACGCTACCTCATTATTCTAGTGAAAATACTGAGGCAACAGGAACTTATACTAAAGTAGTAGTTGACTCTAAAGGTAGAATTACTAATGCTTCTAATCCAACTACTATTCAAGACTATGGTTTAGATACCAGCATTGCAGGATCAGGTGCTCAACCATATGATTTAGACCTTGCTGCAATCACCAATCTTACTGACGGTGCTGCTGGTTTCGGTCTTATTTCTAGAACATCTACTGGCAATATTACTGTTAGAGATATTGTAACCGCATCTACTCAACGTATTGTTGTTAATAATGGCGATGGTATTAATGGTAATCCAGAAATTGACTTAGGTCTTACTACGGTTGTTCCAGATACATCATCATTTTCTCAGGGTTTATATAATACAGAAAGTCTTACATCTGTAAATTCTGTTGGCGCAAATGGAGAACTTCTTGGTACTGAAACTGTAAACACAATTAAATTTACAGTAGATAAGTACGGTCGTCTTCAAAGTGCAACAAATGTGCCTATCGCTACTGCTACCGAGGGCAGTAAGTATGCTAACTATGATGCAGGCACTGCTTATTCTAGATATGCAATCATTCAGAATGCATCAAAAGTCTACCAAGCGATTGCAGACATCGGTGCTGGTGTTGGTGCTCCTACTCATTCCAGTGGTGATACTGGATCATGGCGTTACCTCGCGGCTGAGGCAACGGAACAGAAGGGACTGGCTAGTTTTGCACAGGAAGATTTCGATGTTGACAGCAACGGGCATGTCACAATCGCCGCAGTAGGTGTTGATAATACACAATTACAAAATAATAGAATTTCTTTTGCTGATGGAACTACAAAAGAAGATTTTGAACTTGATCAAGAACTTACTGCAACCTCTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTATATTAAAGTTAATGACGTTAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACAGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAATGTACGGTCGTACTTCTCTGACGCTGATATTACTCTTGACGGCGCTCTTAATCAGACACTGGATAAGACTGGGGATGGTAACCTTACCTTCCAGTTAAGTCAGAATACTGCTACAGATAGAAACTTTAACATTCTGACAACTAATGCTGGTTCTGGATCCAGCAACATTATTATTACTGCTGAAGATACTATACAGATTAGTGCATCAGAAGCAGCTGGTAAGGTACATGTAGAGGATGCAAGATTCCAAGATAATTACATCGCCACAACCAATGCGACGATGAATCTGGATCCTGGTGATGATCGTGCTGCTACAGGAACAGTTAGAGTCTGGGGTAACCTTCAGATTGATGGCACTACCACCACTGTAAACTCAACAACTGTCACAGTTGATGACCCCATCATTACTCTGGGTGGAGATACTGCACCTGCAACCGATGACAATTTAGATCGTGGTATTGAGTTTAGATACTACGACACTGAAGCACGTTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAATTACACCGATTTGGGTGGTCATGGTGGCGGATATCGTTTCCTTCATGCTGCTACAAATACTACTGAGGTGTTTACTGGAACCGATTCTGGTATCATTGCAGGTAACGTAAAACTTACAACTGGCACCAACTCAACTACTAATACAACTGGTGATTTGGTAGTTGCTGGTGGTGTTGGTATTACTCAGGATGTAAACATCGGCGGTTTGTTGGATGTTGATAGTACATTCAGAGCAAATAGCACATCTCGTTTCGATGATACGATGGTGCTCCGTGGTGCTTCTAAGTCACTACAATTCCAGAATGGTGCAGGCACCGTTAAGTCCGAGATTCATACTACTACAGGTAATGCTGAGTTTGGTGGTATCTTAACAGTTACTGGTGCTACTGACCTCAATAGCACATTGAATGTTGCTAGTTCTGTCCACTTTGAAGCAACTGATGAACCCACCTTTGCATTGAATTCTGGCACTGGTATTTGGGAAATCCAATCCAATGATTATGGTTCATTCCGATTTGATGGTGGTGGATATATTGCTGGCGACTTTATGTTCGACAGTGACGTTGTTATTAACGGTACTATTCTACAGAAAGAATCTGCTACAGAGGTCTTCAACGAGCAAAACTTCCTGAGAGTTCGTCGTAAGTTAGAATCTGGATCCGTTCAGGTTCTAACCCCTAGTTATGCTTCACATACTACCTCAAACGCTAGAATCTTTGGTGGTGCTGGTATTGGTACTAGTCTCCACATTGGTGGCACATCTGCCAGCGAAGGTCTGTTTATTGGTAAGAAGGAGAGTGCCGATACGGTCAAATTCTCTGTCCTAGGTGCATCTGGTAACACTGATATTGAAGGCACTCTCAATGTTGAGGGTGAAGTTACTATTCAAGATAGTGTAATTATCAATGCTGCCAACGAAGTATTCTCTATTAGAAATGGTTCTGGTGTTGCTAAGTTTGATGTTGATACTGATAACGGCAATACCTTAATTGAAGGGACGTTAAATGTTAATGGTACTGTCGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTCAGAAACGGCACAACGGATAAATTCTTCGTTGATAATGTAACTGGCAACACCGTAATTGAAGGCACTCTGAATGGTAAGGGGGACGCTGATTTTGATAGTGATCTCAATGTTGATGGTAATACAACTCTGGTTGGCACTCTAACAGTCACTAATACCACCGAGTTTAATAACACCGTTGATGTTGATGCTAACTTTGCTGTTAGAAGTGGTAGTACGGATAAGATGACCGTCGCCTCTTCTTCAGGTAACATTGCAACTGACGGTACATTGGTTGTTCAAGGTCAAACAACTATTAATGATTCTCTGATTGTTGATGCTTCTAATGAACTCTTCTCTGTAAGAAACGGTTCTGCAGTTGCGAAGTTTGAGGTTGATACTGATAACGGCAATACAAATATCATTGGCACACTAACTGTTGGTGATGCAACTCAAATTAATGACACCCTTGGCGTCTCTAATGTTGTAACCTTCACAAGAAATACACAGCAAACTCTGACTGGTTCTTATGCTGCTGATGGTGCATTCCGTCTGACTGGTGGTGCTGCTATTGGTAAGAATCTTGCTGTTGGTGGTGCTGCAAGAATCTATGGTGGCACTGAATTAACAGGTGCTCTAGACCTTAATAGTAGTGCAGACATTTCTGGTGCTCTGGTAACTCACGATAATGTAACTATCACTGCAAATAACAAAACATTTGCTATCCAAAATGGATCTGCTGCTAACAAACTTACAGTAGATACTGATAATGGTAACACTGATATTCGTGGCACCCTAGATATTGGTGGTGATGTAACTGCTGAGTCTAATCTTACTGTTACTGGAAACCTTACTATCAATGGAACGACCACTACTGTCAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCAGCGTCTAACGATGGTAAGGATCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAATTGGTTTCTTCGGATACGACAGATCCGCCAACCAATTCGCATTCGTAACAGACGCGACTAATTCATCAGAAGTTCTTTCTGGAACTGATGGTCCTCTTCGTGCTGGTAGTCTTAATCTTACTGGTGCTGGTACATCACTTGATGTTGATGCCAATGCTAACATTGATGGCACTCTGACTGTAGATGGTCAAATCATCTCTCAAGTTTCTTCTGGTCCTGCACTGGTTATTCCTAACACGACTAAGATTAACAACCTCAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTGCAGCAACTGCAACTACTGTTGTTGCTCGTGACTCTAGTGGAGACTTTGCTGCAAATATCGTTACGGTTGCTTCTGGTGAAGGTGCTGCTGCGGGTATTCAAGGTAATTCTCTTACTGCAGATACACTTAAAAGGTCAAGGATAATCACTCTCGATGGTGTTGTTGACGGTAGTGTATCCTTTAACGGATCTGCTGATGTTACTATTAGCACTACTTACAATGATGCAGACATTACTGCACTCGCCGCTATGGCAGGCACTGGTCTAGTAGCAAGGACTGCTGCCAATACTTACGCACAACGCTCTGTAACCGCCACAGCGTCCTCTGGTATCACTGTTACCAATGCTGATGGTGTATCGGGCAATATCACCATTAACGTCGCTTCTGCAAGCACTAACGCAGCAAATAACCTTGTCCTTCGTGATGCTTCTGGTGATTTTGCTGCCAATGAAATTACTGCTGATTTGATTGGTGGTGTAACGGGTAACGTAACTGGTAACTTGACTGGTAACGTTACTGGTAATTCATCTACAGTCAGCACCTCAAGTTCTGGTTCTGCTACTGAAGTCTTTGTTGGAACAGTATTCAATCAGTCTGGTACTAATAGCATTACTACCAATCCTGGATTTAAGTATGACAGAGCAACCGCTAAAATTCTTGGCAATCTCCAAGGTAATGTCACTGGCAATCTGACTGGTAGTGCATCTCAGGTTGATACCGTCACTGCATCCAGTGCCAATGCCGCTTATCATCTGACGATGGTTGACCAACATAATACTGTTGCGAATAACGAAACCATTAA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
869d423e3169e0db9e0ee05893656e40b988243ed64d1376d6eab48cefa5aae4
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5635
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank