Protein

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Genbank accession
WPH65948.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein host specificity
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MLINILDVNLQKVAFLSNDVPGLPNYYDDEFHEYRDQGAATFKFTVKKVINNKLQSYARFLNGQSYFSFQIDGNDYLMTPASEQAIHETSEEISFFCVSLDRELMSEQANPLVNTSSHNIQWYFDQMGLISNTQITIGINEVSNLTRTINYDGQETKLARLISVIGNFDAEFEFITKLNNDGSLNSVTLNIYKENDGLNIQGVGKKRDDVRLIFGENIQAVERDVSTEGFLNATTVTGADNLNWNSASFSYINADGVEEFYKRAGSDTAFAPLSAKIYPAQLSKDKDDIWTRIDFTTEYKSVNDMWAYAVRQFKQYAYHQVSYTVTPSSKLVNAEIGDGPPLAKGDTVIIQDNNYIDIDGNVGLLLSARVSEKIVSETHPENNKLIFSNYKKLKSEVSTDIQAIVNQLVDAATPYRAELTTTNGTQFKNGTGSTTLAAHIFKGSATTETITDSYEWSKDGTVVANVQEITVDASGVSDKAVYSFKATVAGKVVASQSVTITNVDDGTNGRSVTNVSQKWRLTTTTATPTQAWSDAGWLTTQPTTTATNKYLWSITRTTFNLAPLTQDVIEQKAVYGDKGDKGDTGNDGRAGKDGVGINSTTITYAISSSGTVTPTAGWNSQVPTLVKGQYLWTKTVWNYSDGTSESGYTVSYIAKDGNNGHDGIAGKDGVGITATTITYAQSTSGTTAPSSGWTTSVPTVPAGQFLWTKTVWSYSDKTSETGYSVAMMGAKGDKGDQGVQGIQGVDGRQGIPGPKGADGKTQYTHIAYANSADGVTDFSTSDSNRAYIGMYVDFNINDSTTPSDYSWTLVKGADGTQGTPGKPGADGKTPYFHTAWSYSADGKDRFTTVYPNLNLLDGTRNFSGTWTNSSSWVTDGTYKGLTVKKRTGQWNGIYKTFTAPKDGIYTFSAYVKGSGIDSKIYRFLSVNGVVNGTVMPDTLIGNNFDWLRDSFTVTLKANDVVYAKYEIVGSGTDSILWTAGHKWEEGSTATPYMPSASEVTTADWPSYIGQYSDFTQADSTNPSDYTWSLIRGNDGKDGDMGKSVWSYPYDRGANRLGSWWSDLKPTPTTDNPPKVGDTIIDLVGKIYQITNVVVDSTIGGGGLFDYGPMLTSIKGADGSPGKDGIAGKDGVGLKSTIITYGISASDSTMPGTWSQNTPALVKGQWFWTKTQWTYTDNSTETGYQKTYISKDGNNGHDGIAGKDGTGIKTTTITYAGSTSGTTAPNTGWTTTVPTVAAGNYLWTKTVWAYTDNTSETGYSVAMMGVKGDKGDQGPTGPAGSDGNPGKVIQQNTEPTNKFLDMLWQYTGTEPLNATGITVLSNIIYVWNGTAWQIWLLNPQXIQAVNAWITNAMIGNAAIKLANIDTATITELSAVTATLGDVEAGSITNDISYGFVAQGNHHYLGNSVINYRGINISETMTLDNVLQYTQSMGFDAITGLFFQRLSENKDIISSIRLIEVGNNEMGLYVGNATEFATLTSKGLALSTDVPWTILSPMGGFSGGSIQFSVQNGVEFFSIAGLSVPQMNANQWYQATSLPAGSIAIPSINRVYPISGNNNAWDLLINSAGGVFIRCQAAVSATSNLVNGGCGFPIG
Physico‐chemical
properties
protein length:1593 AA
molecular weight: 171783,94870 Da
isoelectric point:4,85311
aromaticity:0,10427
hydropathy:-0,34045

Domains

Domains [InterPro]
DC_0690
STR
2–762
DC_0690 IPR008983 DC_1328 DC_1328
PTHR24637
Unmapped
576–828
PTHR24637 IPR008983 DC_1328
DC_1441
STR
692–1005
DC_1441
G3DSA:1.20.5.320
STR
729–782
G3DSA:1.20.5.320
WPH65948.1
1 1593
Architecture
STR
STR 2-1580 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactococcus phage D6867
[NCBI] 		3077242 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Lactococcus lactis
[NCBI] 		1358 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WPH65948.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR480986.1 [NCBI]
CDS location
range 33739 -> 38520
strand +
CDS
GTGTTAATTAATATTTTAGATGTAAATTTACAAAAAGTTGCATTTTTGAGTAATGATGTTCCTGGGCTTCCGAATTATTATGATGATGAGTTTCATGAATATCGTGATCAGGGAGCCGCTACTTTCAAATTTACAGTAAAGAAAGTTATCAATAACAAGCTACAATCATATGCTAGATTCCTAAACGGACAGTCATATTTTAGTTTTCAAATTGATGGGAATGATTATTTGATGACTCCTGCTTCTGAACAAGCAATCCACGAAACAAGTGAAGAAATTTCATTCTTTTGTGTCTCTCTTGATAGAGAACTGATGAGTGAACAAGCTAACCCTCTTGTTAATACATCAAGTCATAATATCCAGTGGTATTTTGACCAAATGGGATTAATATCAAACACTCAAATTACAATCGGAATCAATGAAGTTTCTAATCTGACACGAACCATTAACTATGATGGACAAGAAACAAAACTGGCCCGTCTAATATCTGTGATTGGAAACTTTGATGCAGAGTTTGAATTTATTACTAAGCTTAATAATGATGGTTCTCTCAATTCTGTTACACTCAATATTTATAAAGAAAATGATGGATTGAACATACAGGGTGTAGGTAAAAAAAGAGATGATGTTCGTCTAATATTTGGGGAAAACATTCAAGCAGTAGAACGTGATGTTAGTACAGAAGGATTTTTAAATGCAACAACTGTAACTGGGGCAGATAATTTAAATTGGAATAGCGCTTCATTCAGTTATATAAATGCGGATGGTGTGGAAGAATTTTATAAAAGAGCTGGTAGTGATACTGCATTTGCACCCCTCTCAGCTAAAATATATCCTGCACAATTATCAAAAGACAAAGACGATATTTGGACGAGAATAGATTTTACTACTGAATACAAGAGTGTAAATGATATGTGGGCTTATGCGGTGCGCCAATTTAAGCAGTACGCTTATCATCAAGTTAGTTATACTGTGACTCCATCATCAAAACTAGTAAATGCAGAAATTGGAGATGGTCCACCACTTGCAAAAGGCGATACGGTCATCATACAAGATAATAATTATATTGACATTGATGGCAATGTAGGGCTCTTATTATCTGCTAGGGTTTCAGAAAAAATAGTATCTGAAACACATCCTGAAAATAATAAACTTATTTTTTCAAATTATAAGAAGCTAAAGAGTGAAGTATCCACAGATATTCAAGCCATAGTTAATCAGTTGGTCGATGCAGCTACTCCATACAGAGCAGAGCTTACAACAACTAATGGCACACAGTTCAAAAACGGCACTGGATCAACAACTTTAGCAGCTCATATTTTCAAAGGCTCTGCAACAACTGAAACAATTACTGACAGCTACGAATGGTCGAAAGATGGAACGGTTGTCGCAAACGTTCAAGAAATCACAGTTGATGCCAGCGGAGTTTCGGATAAAGCAGTTTACAGCTTTAAAGCGACAGTTGCGGGTAAAGTAGTCGCAAGTCAGTCGGTTACCATCACTAATGTAGATGATGGAACAAATGGACGTTCTGTTACAAACGTTTCTCAAAAGTGGCGTTTGACAACGACTACTGCAACACCAACGCAAGCTTGGTCAGACGCAGGTTGGCTCACTACTCAACCAACAACGACAGCTACTAATAAATATCTATGGTCTATCACTCGAACAACTTTCAATTTAGCACCTTTAACGCAAGATGTTATTGAACAAAAAGCAGTTTATGGTGATAAAGGCGATAAGGGAGATACTGGAAATGATGGGAGAGCAGGTAAGGACGGTGTTGGAATTAATTCAACTACAATTACATACGCTATATCTTCAAGCGGAACAGTTACCCCAACGGCTGGATGGAATTCACAAGTCCCTACTTTAGTCAAAGGGCAATATCTCTGGACTAAAACCGTTTGGAATTACTCAGACGGAACGAGTGAATCGGGATATACAGTCTCTTACATTGCGAAAGACGGAAACAACGGTCATGACGGAATTGCTGGTAAAGACGGAGTAGGAATTACAGCAACTACAATAACTTATGCACAATCAACAAGCGGAACGACAGCGCCAAGCAGTGGATGGACTACAAGCGTTCCTACTGTTCCTGCTGGACAATTTCTTTGGACAAAAACCGTATGGAGCTATTCTGATAAAACAAGTGAAACAGGCTATTCTGTTGCAATGATGGGAGCAAAAGGCGACAAGGGAGACCAAGGCGTCCAAGGTATTCAAGGTGTTGATGGACGTCAAGGGATTCCTGGTCCTAAAGGCGCTGACGGAAAAACGCAATATACACATATCGCTTACGCAAATAGTGCCGATGGTGTAACTGATTTTTCAACTTCTGATTCTAATCGTGCCTATATCGGGATGTATGTTGATTTTAACATCAATGATTCAACCACCCCAAGCGATTACTCATGGACGCTTGTTAAAGGAGCGGACGGAACGCAAGGGACACCAGGAAAACCTGGAGCTGACGGTAAGACACCATATTTCCACACAGCATGGTCTTACAGCGCAGACGGAAAAGATAGATTCACGACTGTTTATCCGAATTTGAATTTACTAGACGGTACTAGAAATTTTAGTGGTACTTGGACAAATTCAAGTAGTTGGGTAACTGATGGAACATATAAAGGCTTAACTGTTAAAAAACGCACTGGTCAATGGAATGGTATTTATAAAACATTTACTGCACCTAAAGATGGCATTTATACTTTTTCAGCTTATGTTAAAGGTTCAGGGATTGACTCAAAGATATATAGATTTTTGAGTGTAAATGGTGTCGTCAATGGTACCGTAATGCCTGACACGTTAATAGGAAACAATTTTGATTGGTTAAGGGACAGTTTCACTGTAACTTTGAAAGCTAATGATGTTGTTTATGCCAAATATGAAATAGTTGGTTCAGGTACAGATTCAATTTTATGGACGGCTGGTCATAAATGGGAAGAAGGCTCAACCGCCACTCCTTACATGCCGTCAGCTAGCGAAGTAACAACCGCTGACTGGCCGAGCTACATTGGTCAGTATTCAGACTTTACGCAAGCTGACAGCACTAATCCATCCGACTACACTTGGAGTCTGATACGAGGAAATGACGGAAAAGATGGTGATATGGGTAAATCCGTCTGGTCTTATCCATATGACCGAGGTGCTAATAGGCTTGGAAGCTGGTGGTCAGATTTGAAACCCACGCCTACAACGGATAATCCACCTAAGGTTGGAGATACCATTATTGATTTGGTAGGTAAGATTTATCAGATTACCAATGTAGTAGTTGATAGTACAATAGGTGGCGGCGGTCTATTCGACTATGGCCCAATGCTTACAAGTATCAAAGGCGCAGATGGTTCGCCGGGTAAGGACGGTATCGCTGGAAAAGATGGTGTTGGATTAAAAAGCACTATTATTACTTATGGGATTTCAGCATCAGATAGTACCATGCCGGGGACGTGGTCTCAAAATACACCAGCATTAGTTAAGGGACAATGGTTCTGGACTAAAACACAGTGGACCTATACAGATAACAGCACTGAAACTGGTTATCAAAAAACATATATCTCTAAAGACGGAAATAACGGTCATGACGGAATTGCTGGTAAAGATGGTACTGGAATCAAAACTACGACCATTACATACGCAGGTTCAACAAGCGGAACGACAGCACCAAATACTGGTTGGACTACCACAGTTCCGACAGTTGCAGCAGGTAATTACCTGTGGACTAAGACTGTTTGGGCTTATACGGATAATACCAGTGAAACAGGATATTCAGTTGCGATGATGGGTGTTAAAGGCGATAAGGGAGACCAAGGCCCAACTGGTCCTGCTGGAAGTGATGGTAATCCCGGTAAAGTAATACAACAAAATACAGAGCCAACAAATAAATTTTTAGATATGTTATGGCAATATACTGGAACAGAACCATTGAACGCTACAGGTATCACAGTTTTATCAAATATAATCTATGTATGGAACGGTACGGCTTGGCAAATTTGGTTATTAAATCCGCAAAMCATACAAGCAGTAAATGCATGGATTACAAACGCAATGATTGGTAATGCAGCTATTAAACTAGCAAATATTGATACTGCAACAATTACAGAACTTTCTGCTGTAACTGCAACACTTGGAGATGTCGAAGCTGGAAGTATCACAAATGATATTTCTTATGGATTCGTTGCTCAAGGTAATCATCATTATCTTGGTAATAGTGTAATTAATTATCGAGGAATCAATATTTCTGAAACAATGACCTTAGATAACGTATTGCAATATACTCAATCTATGGGATTTGATGCAATTACAGGTTTATTTTTCCAACGTTTAAGTGAAAATAAAGATATTATTTCCAGTATTAGACTCATTGAGGTTGGTAATAATGAGATGGGATTATATGTTGGTAATGCTACTGAATTTGCAACTTTAACATCCAAAGGTCTTGCCCTTTCTACTGACGTTCCTTGGACAATCTTATCGCCAATGGGTGGGTTTAGTGGCGGTTCAATTCAATTTTCTGTACAAAACGGGGTTGAATTTTTCTCTATTGCAGGCTTGAGTGTCCCTCAGATGAATGCAAACCAATGGTATCAAGCCACTTCGCTTCCAGCAGGAAGTATTGCAATTCCTAGTATAAATAGAGTATATCCGATATCAGGGAATAATAATGCATGGGATTTGCTTATTAATTCGGCAGGAGGTGTTTTTATAAGGTGCCAAGCAGCAGTATCAGCAACTTCAAATTTAGTTAATGGTGGATGTGGTTTCCCAATAGGATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
913e00a47fa37f99d3985a0644d41e5338f44a1232d1054ff41cf4e43793653a
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7604
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50