Protein

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Genbank accession
YP_003856819.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical phage structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
Protein sequence
MLIIADTNYAQLGVLPSAQDIKRTRDISGTDTLEFNYAMFNVVGAEEIKDDMINVIKTQNHILTADQVYVIKEVNPSSDNLIAVECEVDTEALKSLYNNAFTRTNVPITDIANNALIGSGWVVNTDVTKLRSLAMTNSTALDILKKLAETYMCDLQFDAKNKVVNFLKSMGTSKGTFFNDKLNLVALNIKQDTHDFCTRLIPVGQNNMYITDVNGGLPYVENHQYTNQVITAYWSAGQYTDANALKEDAIAKLAIMSQPQVTFDATVLDLARISEINPDFENYSELSYNIGDTVTIMDSKKEIGQTVRIVQTVEYMDKPEQNTVQFDSMYQLMEDLFEKSLHTTDTVDSITTPDGGSVNGDTVDKIDWTKVQNVQVQTAQIANLTVTTEKVADSTITTAKIGDAQITNAKIYSLSADKLTAGTIDAGVITVTNLNADNISGGTIDAHIIGVTNLNASNIVSGTLDASKIVVENLDASAITTGTLDASQISVINLDASSITTGTFSANRISGGTIDASTISVINLDASAITTGTFSANRISGGTIDASLISVIKLNASNITTGELDGTLIKAHTIVADQMVIGTITADSGIIATSAIGTAQIADGSITDAKVVNLSANSITAGTLSVDRLIIRGSDKSIVYELNNIAGATQVLSQTTINGEALTDRTITADKVVANAITANEIATNTITANSGIIASLDATKITTGTLDAAQISVINLDASSITTGELSGDRINGGTITGVNIVGTTIKTNNTANYLTLHDQQISIFQNSNEMISLGYMVYGSNTLPLIQMFGKHLISRTGATDDGTMTIGDIKPADLTNGKVSIYNISALGAFECWGNSKFNADMEIDATLNVVGSSGSGSGTGAVSTDSLLVRTNANFLNGKVIISSSYIDMYDALWMNGNNIMMSGGNIASAGTISANNFYGIGKVPAYTSSSLSIPTGNSVTIAHNLGYHPIIRLNGTVGNLIVTTQDTDVNHTRIYCYSGGGATFSGYAYFY
Physico‐chemical
properties
protein length:996 AA
molecular weight: 105539,08680 Da
isoelectric point:4,49587
aromaticity:0,05723
hydropathy:0,04096

Domains

Domains [InterPro]
DC_1353
STR
1–509
DC_1353 DC_1258 DC_1258
IPR044051
ENZ
2–84
IPR044051 IPR010572
IPR007119
Unmapped
20–327
IPR007119
YP_003856819.1
1 996
Architecture
STR
STR
STR 1-551 | STR 625-859 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Clostridium phage phiCTP1
[NCBI] 		871584 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Clostridium tyrobutyricum
[NCBI] 		1519 Bacteria > Firmicutes > Clostridia > Clostridiales > Clostridiaceae > Clostridium

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_003856819.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_014457 [NCBI]
CDS location
range 17175 -> 20165
strand +
CDS
ATGTTAATAATTGCAGATACAAATTATGCTCAATTGGGGGTTTTACCTTCCGCCCAAGATATTAAAAGAACTAGGGATATAAGTGGCACCGATACGTTGGAGTTCAATTATGCTATGTTTAATGTTGTGGGGGCAGAAGAAATAAAAGATGATATGATTAATGTGATAAAAACACAAAATCATATTTTAACAGCAGACCAAGTATACGTAATTAAAGAGGTAAACCCAAGTTCAGATAATTTAATTGCAGTTGAATGTGAGGTAGATACAGAAGCTTTAAAAAGTTTATATAACAATGCCTTTACAAGAACCAATGTACCCATTACAGATATTGCAAACAATGCTTTAATTGGAAGTGGCTGGGTAGTTAATACTGATGTAACTAAATTGAGAAGTTTAGCAATGACTAATTCTACTGCATTAGATATATTGAAAAAATTGGCAGAAACTTATATGTGTGATTTACAGTTTGATGCTAAAAATAAAGTAGTTAACTTTTTAAAAAGCATGGGTACCAGTAAAGGTACATTTTTTAATGATAAATTAAATTTAGTTGCTTTAAATATTAAACAAGATACCCATGATTTTTGTACTAGACTAATACCAGTAGGTCAGAATAATATGTATATTACTGATGTAAATGGTGGTTTACCTTATGTAGAAAATCACCAGTACACAAATCAAGTTATAACTGCATATTGGTCAGCAGGTCAATATACAGATGCTAATGCACTTAAAGAAGATGCTATAGCTAAATTAGCAATTATGTCACAACCACAAGTTACATTTGATGCCACAGTTTTAGATTTAGCTAGAATATCAGAAATTAATCCAGATTTTGAAAATTATTCAGAATTAAGTTATAATATAGGTGATACTGTAACTATAATGGATTCAAAGAAAGAAATTGGACAAACTGTACGTATAGTGCAAACTGTAGAATATATGGATAAGCCAGAACAAAATACGGTGCAGTTTGATAGTATGTATCAGCTAATGGAAGATTTATTTGAAAAATCTTTACACACTACTGATACTGTAGATTCAATTACTACCCCCGATGGTGGTAGTGTAAATGGTGATACTGTAGATAAAATTGATTGGACTAAAGTACAAAATGTACAGGTGCAAACTGCACAAATTGCTAACCTAACAGTAACAACCGAAAAGGTAGCAGACTCAACTATAACAACTGCAAAGATAGGGGATGCACAAATAACTAATGCTAAAATATATAGTCTATCAGCAGATAAATTAACTGCTGGTACAATAGATGCTGGGGTTATTACCGTAACTAATTTGAATGCAGATAATATTAGTGGAGGTACAATTGATGCACATATTATAGGTGTTACTAATTTAAACGCTAGTAATATTGTATCGGGTACTTTAGATGCTTCCAAAATTGTGGTCGAAAATCTGGATGCATCCGCAATAACCACTGGTACGCTAGATGCCTCCCAAATATCCGTTATTAATCTAGATGCCTCATCTATTACTACAGGAACATTTAGTGCCAATAGAATATCTGGAGGTACTATAGATGCTAGTACAATTTCTGTAATTAATTTAGATGCTAGTGCAATTACAACTGGAACGTTTAGTGCTAACAGAATAAGTGGAGGTACAATTGATGCTAGTTTAATAAGTGTAATTAAACTAAATGCTAGCAATATTACAACCGGTGAATTAGACGGTACACTTATAAAAGCACATACAATTGTAGCTGACCAAATGGTTATCGGTACAATTACAGCTGATAGTGGTATTATAGCTACTTCTGCTATAGGTACAGCACAAATTGCTGATGGTAGTATCACGGATGCTAAAGTTGTTAATTTAAGTGCTAATAGTATTACTGCTGGAACTTTAAGTGTAGATAGGTTAATTATTAGGGGTAGTGATAAAAGCATTGTTTATGAATTAAATAACATTGCTGGAGCTACACAGGTATTAAGCCAAACTACAATTAATGGTGAAGCATTAACAGATAGAACTATTACTGCTGATAAAGTTGTAGCTAATGCAATCACTGCAAATGAGATAGCAACTAATACTATTACAGCAAATTCAGGAATTATTGCTTCACTTGACGCCACTAAAATAACAACTGGGACACTTGATGCGGCACAAATTAGTGTTATTAATTTAGATGCAAGTTCAATTACTACAGGTGAATTAAGTGGTGATAGAATTAATGGTGGTACAATTACAGGAGTAAATATTGTTGGTACTACTATTAAAACTAATAATACTGCAAATTATTTAACATTACATGACCAACAAATATCAATATTTCAAAATTCAAATGAAATGATTAGTTTGGGATATATGGTATATGGTTCAAATACATTACCATTAATACAAATGTTTGGTAAACATTTAATATCAAGAACCGGGGCAACTGATGATGGTACAATGACTATTGGTGATATAAAACCTGCCGACCTAACTAATGGTAAGGTATCTATTTATAACATTAGTGCATTAGGAGCTTTTGAATGTTGGGGTAATTCAAAGTTTAATGCAGATATGGAAATTGATGCAACTTTAAATGTTGTAGGCAGTAGTGGTTCCGGCAGTGGTACGGGGGCAGTAAGCACTGATTCATTATTAGTTAGAACTAACGCCAATTTCTTAAATGGTAAAGTTATAATTTCATCTAGTTATATAGATATGTATGATGCCTTATGGATGAATGGCAACAATATAATGATGAGTGGTGGAAATATTGCTAGTGCTGGAACAATATCAGCTAATAATTTTTATGGTATCGGTAAAGTACCGGCATACACATCCTCATCATTAAGTATCCCAACTGGTAATTCAGTAACTATCGCCCATAATTTAGGCTATCATCCTATAATTAGATTAAACGGAACTGTAGGAAATTTAATTGTTACCACACAAGATACTGATGTAAACCATACTAGAATTTATTGTTATAGTGGTGGTGGGGCAACATTTAGTGGATACGCCTATTTTTATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
57f6420e28e84d8e1e4cdf02431b2ff1f606368b00c57b356583a9e7ed71464d
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2982
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50