Protein

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Genbank accession
BBI90705.1 [GenBank]
Protein name
tail spike protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,55
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,97
Protein sequence
MKTQGTVESTSSIKYGKQIFQNAQFNNTVSANAVTVDFDKGNIQSIDLSASTGDVTINFTNQKIGTYILSIKQHATTVRNVIFSPTVSTSWNMMSIGVSNIVPIVIHYDGSNFISNSTTGEIKPFNALSNYGIGANVIHNGNLYTSTAQVNSGAFNNANWASLGTAVASQTTYTDTHSTGQTNTQSVIDYILTRPNIVLKKYASIDAMLVEQGTHTDSTLCLVSNSTTGNITDETRVTGGYAYYIKNRTGSGIDKYDVLGQLSAPATRTTFDNSISTLPNNPTNVQVALQELAKLIDDVSGGQKLIHTWNAETNDRFVANNAFYDSLTKNPIINVWDAGTKKATVTGTELANTIVVGMKVRIQHPTTNAKILDTTITAITVSGANKDITLADGTGVIQGHRIVTADKKANVGDYLYVNTVHATTNTTVDGNSTWTVGDKIQSNGTIWLRIAYVKPTLNASQVTYDSSGNNLISTNTQTAITEVNTKVDTKLGDAPSDGKQYARKNALWQEIDTSLPTLSQVLTAGNTAGNKSISQLASLATRNVSGNYIAMNPTDITVYSTGRNTRYRNGEIIYATSGTDTVKLAFPTATMQETPAGAKTISFKYETGTVALIADLDARVPYTGGTGHVDLGGYHLKSGSQFTTTNKARHRIYFQQSGGDQAYVLKRQEEYWTGGSWSSSTDGYGVGASALASNTGRYSNAFGAYALQNNTGQYVDAFGYNAGKNNTGVYSQFVGTGAGTGNSGSNVVAMGYNAGASNTGVTTTIVGYSAGQSNTGSSSVIIGGGSGINNMGNSTVLIGTLAGMSNTQHNVTVIGNNSGQSNTGSALTAFGRSAGASNSGNEAISIGYQAGMSNTGNYGISIGKSAGQSNSGQYTVMAGHQAGMSNTGNYGIGVGSNALSNNTQSYVIGFGHFAMAQNTGKHSSAFGHQAGLRNTGHYSHGIGSYAITDNTSPYVIGIGYYALGYSKNTIGMLTAVGYMAGQQNKGAESVFYGHETGYLNISTGNVGIGNQSLKFASHDTQTAVGFQAGATFQDDTPNAKSTAHTNVNITTDHITINGHSFGATGAYIILKYTVAGSPISGMVNNMPYQFEILDSNTIKPTFVNIGSQGLGTHTFTPQKSLMNSTSIGANSQATKPNQVVLGSNTVTEVYSNGVFKSDIAHTAITDLKHLVTKEWIDNNVSITEGSWTPTVTDAGGGATYTLGYNNGRYVKVGNTIIAQCTVTGINTSGIPTGNLLLGGFPEQIWAYGSAKVTKFYGQDQTFYFISGEVHAAPTNRISFSVTTGLQNNIGLNFLSGVTFTNGGFTVQIIYKVSV
Physico‐chemical
properties
protein length:1314 AA
molecular weight: 138207,96010 Da
isoelectric point:8,23708
aromaticity:0,08524
hydropathy:-0,23280

Domains

Domains [InterPro]
DC_0730
STR
2–547
DC_0730 DC_2098 DC_1988
DC_1890
STR
467–796
DC_1890 IPR011049
G3DSA:1.20.5.320
STR
470–517
G3DSA:1.20.5.320 DC_1422
BBI90705.1
1 1314
Architecture
STR
STR 2-1101 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
BBI90705.1
1 1314
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 312 312 0,5840
Central domain 313 559 248 0,3504
C-terminal 560 1314 754 0,4904
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-312
Central
313-559
C-terminal
560-1314

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Tenacibaculum phage PTm5
[NCBI] 		2547426 No lineage information
Host Tenacibaculum maritimum
[NCBI] 		107401 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > FCB group > Bacteroidota/Chlorobiota group > Bacteroidota

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
BBI90705.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
AP019525.1 [NCBI]
CDS location
range 4751 -> 8695
strand +
CDS
ATGAAAACACAAGGAACAGTAGAATCTACATCATCAATTAAGTACGGTAAACAGATTTTCCAAAATGCTCAGTTCAATAATACAGTATCAGCAAATGCTGTTACTGTTGATTTTGATAAGGGTAATATACAATCTATTGATTTATCTGCATCAACTGGTGATGTTACAATTAATTTCACAAATCAAAAGATAGGTACTTATATTTTATCTATCAAGCAACACGCAACCACAGTACGAAATGTTATATTTTCGCCTACTGTTTCAACCTCATGGAATATGATGTCAATTGGTGTGTCTAATATTGTACCTATTGTAATACATTATGATGGAAGTAATTTTATTTCTAATTCAACAACTGGTGAAATAAAACCATTTAATGCATTATCTAACTACGGTATAGGTGCTAATGTAATACACAATGGAAATTTATATACATCAACTGCACAAGTTAATTCAGGTGCATTTAATAATGCAAATTGGGCATCTTTAGGAACTGCTGTTGCAAGTCAAACAACATATACAGATACACATTCAACAGGACAAACAAACACACAATCGGTTATTGATTATATTTTAACAAGACCTAACATTGTATTAAAGAAATATGCATCAATTGATGCAATGCTTGTTGAACAGGGAACACATACAGACTCAACATTATGTTTGGTTAGTAATTCAACAACTGGAAACATAACTGATGAAACACGTGTTACTGGTGGGTATGCATACTATATAAAAAATAGAACTGGTAGTGGAATTGATAAATACGATGTATTAGGTCAATTGAGCGCACCAGCAACTAGAACAACATTTGATAATAGTATCAGTACATTACCAAACAACCCAACAAACGTACAGGTTGCATTACAAGAATTAGCTAAGTTGATTGATGATGTTAGTGGTGGTCAGAAGTTAATTCATACATGGAACGCTGAAACAAATGATAGATTTGTTGCTAATAATGCATTTTATGATTCATTAACAAAAAATCCTATAATTAATGTTTGGGATGCTGGTACTAAGAAAGCAACAGTTACTGGAACTGAATTAGCAAATACTATTGTGGTGGGTATGAAAGTTCGTATACAACATCCAACCACAAACGCAAAGATATTAGATACAACCATTACAGCAATTACTGTTAGTGGTGCTAATAAAGACATTACGTTGGCTGATGGTACAGGTGTTATACAAGGACATAGAATTGTAACGGCTGATAAAAAAGCTAATGTAGGTGATTATCTTTATGTAAATACAGTACATGCGACAACAAACACAACAGTAGATGGTAATAGTACATGGACAGTTGGTGATAAGATACAATCTAATGGTACAATATGGTTAAGAATTGCATATGTTAAACCAACATTAAACGCATCACAAGTAACTTATGATTCTAGTGGAAATAACTTAATATCTACCAATACACAAACTGCAATTACTGAGGTTAATACTAAGGTTGATACTAAATTAGGTGATGCGCCAAGTGATGGTAAACAATATGCTAGAAAGAATGCATTATGGCAGGAAATTGATACATCATTGCCAACATTATCACAAGTATTAACTGCTGGGAATACTGCTGGGAATAAAAGTATTTCACAATTAGCATCATTGGCTACTCGTAATGTTAGTGGTAATTATATTGCAATGAATCCAACGGATATAACTGTATATAGTACTGGTAGAAATACTAGATACCGTAATGGAGAGATAATTTATGCCACTAGTGGTACAGATACAGTAAAACTAGCATTTCCAACAGCAACCATGCAAGAAACACCAGCTGGTGCTAAAACAATATCATTTAAGTATGAAACTGGTACGGTTGCTCTTATAGCAGATTTGGATGCTCGTGTACCATATACAGGTGGTACAGGACATGTTGATTTAGGTGGTTATCATTTAAAATCAGGGTCACAATTTACCACAACAAACAAAGCAAGACATAGAATATATTTTCAACAATCAGGTGGTGACCAAGCATATGTTCTAAAACGTCAAGAGGAATATTGGACTGGTGGTTCATGGAGTTCAAGTACTGATGGATATGGTGTTGGTGCTAGTGCTTTAGCAAGTAATACTGGTAGATATTCTAATGCCTTTGGTGCATATGCTTTACAAAACAATACAGGACAATATGTTGATGCATTTGGTTATAATGCTGGTAAAAACAACACAGGTGTATATTCACAATTCGTTGGCACAGGTGCAGGAACAGGAAATAGTGGGTCGAATGTTGTTGCCATGGGTTATAATGCTGGGGCATCCAATACTGGGGTAACTACAACAATAGTTGGATATTCCGCTGGACAATCAAATACTGGTTCTAGTTCTGTTATTATAGGGGGAGGTTCTGGCATAAATAACATGGGGAATAGTACCGTGTTAATTGGCACACTTGCTGGTATGAGTAATACCCAGCACAATGTTACAGTTATAGGCAATAACTCAGGACAATCAAATACTGGTTCAGCTTTAACTGCATTTGGTAGAAGTGCTGGTGCATCTAATTCAGGTAACGAAGCAATTTCAATAGGTTACCAAGCTGGTATGAGTAATACTGGTAACTACGGAATTAGTATAGGTAAATCTGCTGGACAATCAAACTCAGGACAGTATACAGTAATGGCTGGTCACCAAGCTGGTATGAGTAATACTGGTAACTACGGAATTGGTGTAGGTTCTAACGCATTGTCTAATAATACACAATCATATGTTATTGGTTTTGGTCATTTCGCTATGGCACAAAATACTGGTAAACATTCAAGTGCATTTGGACACCAAGCTGGACTAAGAAATACTGGACATTACTCGCATGGTATTGGTAGTTATGCAATAACTGATAATACATCACCATATGTTATTGGTATAGGATATTATGCATTGGGGTATAGTAAGAATACTATTGGTATGTTAACCGCAGTTGGTTATATGGCTGGTCAGCAGAATAAGGGTGCAGAATCTGTATTCTATGGACACGAAACAGGGTATTTAAACATTTCTACAGGTAACGTAGGTATAGGTAACCAATCACTAAAGTTTGCATCACATGATACACAAACTGCGGTAGGTTTCCAAGCTGGTGCAACATTCCAAGATGATACACCAAACGCTAAATCAACAGCACACACAAATGTAAATATAACAACAGACCATATTACAATAAATGGACACAGTTTCGGTGCTACTGGTGCATATATTATTTTAAAATATACTGTTGCTGGTTCACCAATAAGTGGTATGGTTAACAATATGCCATATCAGTTTGAGATACTTGATTCAAATACGATTAAACCAACATTTGTTAATATTGGTTCACAAGGTTTGGGAACACACACATTCACACCACAAAAGAGTTTAATGAACTCTACATCTATTGGTGCAAATTCACAAGCAACTAAACCAAACCAAGTTGTTTTAGGTAGTAATACAGTTACCGAAGTTTATTCTAATGGTGTGTTTAAATCTGATATAGCACATACTGCCATAACAGATTTAAAGCATTTAGTTACAAAGGAATGGATAGATAATAATGTTTCAATTACCGAGGGTTCATGGACACCAACTGTTACAGATGCAGGTGGTGGAGCAACATACACATTAGGTTATAATAACGGTAGATATGTTAAAGTTGGTAATACAATAATTGCACAATGTACGGTTACAGGTATAAACACAAGTGGTATACCTACTGGTAATTTACTACTTGGTGGATTCCCTGAGCAAATATGGGCGTATGGTTCTGCTAAAGTTACTAAATTTTACGGACAAGACCAAACATTCTATTTCATATCAGGTGAAGTTCACGCAGCCCCAACAAACAGAATATCATTTTCAGTAACAACTGGATTGCAAAATAATATAGGACTTAACTTTTTAAGTGGTGTTACATTCACAAATGGTGGATTCACAGTACAAATTATTTATAAAGTAAGTGTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
8778f2642da918ea2f3db4e6aaf5524b396e2bf07f3093ff216f2b1ad742adb7
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6630
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50