Protein

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Genbank accession
YP_003934883.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,66
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYSVLSDGVNVDFFIEENTVQQYDATRGYKKNFAVINDNRIWVAQRDIAAPAGTFTPQYWLATRTDPKWETVASPTRQLSSGEFIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTIVIKDIGGNTGYNEIKVQSSNVPGQGNQKIVRFGNQFTEILISKPFSYNMLIFSNRLWQFWEAGNEERGIRIEPSSGKYRAQAADFIMRHYTTAEKITFVLPKYANQGDIVKSVDIDGLGPLYHLDVETFDESSSLGKQGQHSMEFRTTGDGFFVYNATEKLWVTWDGDNKTRLRVIRDNVKLLPNESIIVFGNDNNTSQTINIDLPTGVRPGDVVKIALNYLRKAQTVNIKASATDKIASSVQLLQFPKRSEYPPDTEWVFVDSLTFNGNISYTPVIELSYMEDTVNNVNYWVVAQNVPTIERVDSKDDLTRARLGVIALANQAQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIANTAQVNQDTTFAFQDDIIISPKKLNERTATETRRGLAEIATQQETDAGTDDTTIITPRKLQARQGSESLSGIVKYVPTTGTTPAASRITVGTNVYNKNTTTLVISPKALDQYKADQNNQGAVYLATQSEVNAGATNTGFSNSVVTPETLGARRATDSNHGLIEIATQVETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATESLSGIAEIATQSEFDTGTDDTRIATPLKIKTRLNNTARTSVIAASGLVETGTLWDHYTLNILEANETQRGTARLATQLEVNTGTDDKTIVTPLKLMSKKATEGTEGIVRIATRAETIAGTSSILAVSPVSLKWIAQSEPTWAATTTTRGFAKMSEGAITFVGNATAGSTQALDLYEKNSYAISPYELNKTLGNFLPRLAKAADSDKLDNLDSTQFVRRDIDQTVEGTLTLRKNIRIDGQLTTGGTGEFGGSLAANSTFTIRNTGASTRLIFEKGPQTGNNPFQTMNIRVWGNQFAGGSDTSRSTIFEVGDETSNHFYSQRNNLGNITFSINGTVQPINVNASGTLNANGVATFGRSVTAQGEFITYSANAFRAINGQYGFFIRNDNSNIYFMLTNANDQTGGFNGLRPLAISNTSGQVTIGESLIIAKGATINLGGLTVNSRIRSQGTKPADLYSRKPNADNTGFWSVEVNDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLNSLYQDWITYPNTANASTTRWTRTWQQNKNAWSGFVQVFDGGNPPQPSDIGALPADNASMSNLTIRDWLRIGNVRIVPDPVTKSVKFEWIDTP
Physico‐chemical
properties
protein length:1299 AA
molecular weight: 141981,20450 Da
isoelectric point:5,54722
aromaticity:0,08314
hydropathy:-0,41055

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
12–126
DC_1986 DC_1209 IPR048391
IPR048390
ATT
987–1100
IPR048390
DC_1209
STR
1073–1278
DC_1209
YP_003934883.1
1 1299
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 12-126 | STR 349-986 | ATT 987-1100 | STR 1101-1146 | ATT 1147-1245 | STR 1246-1278 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage SP18
[NCBI] 		645664 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Tevenvirinae > Gaprivervirus
Host Shigella sonnei
[NCBI] 		624 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_003934883.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_014595 [NCBI]
CDS location
range 151397 -> 155296
strand +
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCAGCATTCAGAGCAACATCCGGTCTCGATGCTGCTGGTGAGAAAGTCATTAATGTCGCAAAAGCTGATTACTCAGTTTTATCAGACGGCGTTAACGTAGATTTCTTTATAGAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATGCGACACGAGGATACAAAAAGAACTTTGCCGTTATTAACGATAACCGTATTTGGGTTGCTCAACGTGATATCGCGGCTCCGGCAGGGACATTTACCCCTCAGTATTGGTTAGCAACCCGTACTGACCCGAAATGGGAAACTGTTGCATCTCCAACTCGTCAGCTTAGCTCGGGTGAATTTATCGCGGTCGACTCAGCTGCAAGCTTTACCACATTTACATTGCCTCCAAACCCGACTGATGGTGATACCATCGTTATTAAAGATATCGGTGGCAATACCGGTTATAATGAAATCAAAGTTCAATCGAGCAATGTACCTGGTCAAGGTAACCAAAAGATTGTTCGTTTCGGTAACCAATTTACTGAAATATTAATCAGTAAGCCGTTCTCTTACAACATGCTTATTTTCTCCAACCGCTTATGGCAGTTCTGGGAAGCAGGTAACGAAGAACGCGGAATAAGAATTGAACCAAGCTCTGGCAAATATCGTGCACAGGCAGCAGACTTTATTATGCGCCATTACACGACCGCAGAGAAAATTACATTTGTTCTTCCTAAGTATGCTAACCAAGGCGATATTGTCAAATCAGTAGATATAGATGGATTAGGGCCATTATACCACCTGGATGTTGAAACGTTTGACGAGTCAAGTTCTCTGGGTAAACAAGGCCAACACAGTATGGAATTCCGTACTACTGGTGATGGTTTCTTCGTTTATAATGCCACCGAAAAATTGTGGGTGACCTGGGACGGTGATAATAAAACTCGTTTGCGTGTAATTCGTGACAATGTAAAATTGTTACCAAACGAAAGTATTATCGTGTTCGGTAATGATAACAACACCTCACAGACAATTAACATCGACCTTCCGACGGGTGTTCGTCCTGGTGATGTTGTTAAGATTGCTCTGAACTATCTCCGCAAGGCACAGACTGTTAATATTAAAGCTTCGGCTACTGATAAAATTGCATCTTCTGTTCAGCTGCTTCAGTTCCCGAAACGTTCGGAATATCCACCTGACACTGAATGGGTATTTGTTGACTCTTTGACTTTCAATGGTAATATAAGTTATACTCCGGTTATTGAATTAAGTTACATGGAAGATACGGTTAATAACGTTAACTACTGGGTTGTTGCTCAGAACGTTCCGACTATTGAGCGTGTTGACTCGAAGGATGATTTGACCCGTGCTCGTCTGGGTGTTATTGCATTGGCTAACCAGGCTCAGGCTAACGTTGACCATGAAAATAACCCTGAAAAAGAATTAGCAATTACCCCGCAGACTTTAGCTAACCGTGTGGCTACTGAATCACGTCGTGGTATTGCACGAATTGCTAACACTGCACAGGTGAACCAGGATACGACTTTTGCTTTCCAGGATGACATCATCATCTCTCCGAAAAAGTTAAACGAACGTACAGCTACAGAAACAAGACGTGGGCTCGCAGAAATTGCCACACAGCAAGAAACTGATGCAGGCACTGATGATACTACCATCATCACTCCGCGCAAGCTACAAGCTCGTCAGGGCTCCGAAAGCTTATCTGGTATCGTTAAGTATGTTCCTACTACCGGGACTACTCCAGCAGCAAGCCGTATAACGGTTGGGACAAACGTTTATAATAAAAATACAACCACTCTGGTAATTTCTCCGAAAGCTTTGGACCAATATAAAGCTGACCAGAATAACCAAGGTGCTGTATATCTGGCTACTCAGTCAGAAGTTAACGCGGGTGCAACAAATACAGGATTCAGTAACTCGGTCGTGACTCCGGAAACATTAGGCGCACGCAGAGCAACAGATTCAAACCATGGTTTAATCGAGATTGCAACTCAGGTTGAAACTAATGCAGGAACCGATTATACCAGAGCTGTGACTCCTAAAACGTTAAATGACCGTAAAGCAACAGAATCATTATCCGGCATAGCCGAGATTGCTACGCAATCAGAATTTGATACTGGCACTGATGATACTCGTATCGCAACGCCATTAAAAATTAAAACTAGACTTAATAATACTGCTCGTACTTCTGTTATTGCAGCAAGTGGTTTAGTAGAAACAGGGACGCTCTGGGACCATTATACGCTGAATATTCTTGAAGCAAATGAGACTCAACGTGGCACCGCACGACTGGCAACTCAACTTGAAGTTAATACCGGCACCGACGACAAAACAATCGTTACTCCGCTTAAGTTGATGTCGAAAAAAGCCACAGAAGGCACCGAAGGTATAGTTCGCATCGCTACTCGCGCAGAAACTATCGCAGGAACAAGTTCGATTCTGGCTGTTTCTCCTGTTAGTCTGAAATGGATTGCACAGTCCGAACCAACATGGGCGGCAACCACGACGACCCGCGGCTTTGCTAAGATGTCTGAAGGCGCAATTACTTTTGTCGGTAATGCAACTGCAGGTTCGACCCAGGCTCTTGACCTGTACGAGAAAAATAGCTATGCTATCTCTCCGTATGAGTTAAACAAAACCCTTGGTAACTTCCTGCCGCGTCTGGCTAAAGCAGCAGACTCGGATAAACTGGATAACCTGGATAGTACACAGTTCGTCAGGAGAGATATTGACCAGACAGTTGAAGGAACATTAACCCTTCGTAAAAACATCAGAATCGATGGCCAGTTAACTACAGGTGGTACAGGTGAGTTTGGTGGTTCTTTAGCTGCTAATTCTACATTTACTATTCGTAATACAGGTGCTTCAACTCGTTTGATATTTGAAAAAGGACCACAAACTGGAAATAACCCGTTTCAAACCATGAATATCCGAGTATGGGGTAACCAATTCGCTGGTGGTTCTGATACAAGTCGTTCTACGATATTTGAAGTTGGCGATGAAACATCCAACCATTTTTATTCTCAACGGAATAATCTTGGTAATATTACTTTTAGTATCAACGGCACAGTTCAACCGATTAACGTTAATGCATCCGGAACATTGAATGCTAATGGGGTGGCAACATTTGGACGTTCAGTGACCGCACAGGGTGAATTTATAACCTATAGTGCAAACGCATTTAGAGCTATTAATGGACAGTATGGGTTCTTTATTCGTAATGATAACTCGAACATCTATTTCATGCTTACAAATGCAAATGACCAGACTGGTGGCTTTAACGGATTAAGACCATTAGCTATTAGTAATACATCTGGCCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTTGGGTGGTTTAACGGTTAATTCAAGAATTCGTTCACAAGGTACTAAACCTGCTGACCTTTATTCGAGAAAACCTAATGCCGATAATACAGGCTTCTGGTCCGTTGAAGTTAATGATTCAGCTACATATAATCAGTTCCCGGGTTATTTCAAAATGGTCGAAAAGACTAACGAAGTAACTGGTCTGCCTTATTTGGAGCGTGGTGAAGAAGTTAAATCACCTGGCACATTGACTCAGTTTGGTAACACGCTGAATTCACTCTATCAAGACTGGATTACTTATCCGAATACTGCTAATGCAAGCACCACTCGTTGGACTCGTACATGGCAGCAGAACAAAAACGCATGGTCTGGTTTTGTTCAGGTCTTTGATGGTGGCAACCCACCTCAGCCGTCGGATATTGGTGCATTGCCTGCTGATAATGCTTCGATGAGTAACCTGACTATCAGGGATTGGTTAAGAATCGGTAACGTACGCATTGTTCCAGACCCAGTAACCAAATCCGTTAAATTTGAATGGATTGATACACCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
dc920724ff69d4c0818a48ecbdf045dfd1eea560ae79762b980ec735d86a4b62
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5572
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50