Protein

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Genbank accession
YP_010678890.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber protein H
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MSSKIKFTDQYILSSVGQTSNNIVYLQVNDDQQLVVTHPMYATEWSTLGGLRVTGDQSKFDGSLEVGYELLVGQTSTFNNDMVVNGLVTVNRDSLDAMLIHGNVTLHGNLTVVGSSSGTTPGQVTISDNIMVVNTDDVGPGVTATYSGFEVQRGIPVGETNSHGEPGQGKLPSAGLVWNEVQKSWDLNYNPILSEKLPQNPRIINLGQPVADNDASTKKYVNDSITAALDDDIYLDRLTDVTISSPANKNILQYDSSTSQWRNLPYSFIRLTDVTGVSVPRGYVRWNAAGTQLVYETTIDYAQLTGLSDVAKAGQGALSFLSDVTLSSLSNTQALFYNGTSWVNRLINYSDIQNTPTNNSYSFIGLNDTNDTVVNNGYVRWNAAGTQLVYETTIDYAQLTGLSDVAKAGQGSLDYLTDVSIGTASSGNVLRYNGTDWVNQVLSYTDLSNTPTNNSYSFIGLNDTNDTALSGGYLRWNPTGTQIVYQSTIDYAQLTGLSSVAKAGQGALSFLSDVTISSPGASNTLRYDTTSSKWVNTRLAYSDLTGQPTSANYQLVGLSDTASTSVPLGYLRWNAAGTQVTYATTIDISVISGKSTVASAGSATLSNLEDAAVTTPAAGNTLIWNASTNKWTNGILDVSNITNAVPVSRTVSAGTGLSGGGNLSSNITLSVNRTLTDTWYAAASHTHDASNITSGVIANARLPVGSTTAQGILQLTDGVASTSTTTAATPNSVKTAYDLATTKANISHTHDASNITTGTIAVARLPVSSTTAQGIVQLTDGVASTSTTTAATPNSVKTAYDLATTKANASHTHDASNITSGVIANARLPFASTTVYGIVTLLDSVASTSISTAATPNSVKTAYDLATTKANISHTHTPAQVGLSNISNNGNTITGNTTISGALSVTGNAVFNTSDIKLKDNIQPIKNPVELLSKISGYTYTRNDCNNEKQTGIIAQEVETIQPESVREIDGIKTVNHNGIIALLVSAVNELSKEIEELKQQLSYKKRD
Physico‐chemical
properties
protein length:1008 AA
molecular weight: 106451,10030 Da
isoelectric point:4,90392
aromaticity:0,06448
hydropathy:-0,18194

Domains

Domains [InterPro]
DC_0911
ATT
1–387
DC_0911 DC_0165 DC_0613
IPR005068
STR
706–745
IPR005068 IPR005068 IPR005068 IPR030392 Coil
IPR030392
CHP
914–1002
IPR030392
YP_010678890.1
1 1008
Architecture
ATT
STR
RBD
STR
RBD
STR
RBD
STR
RBD
ATT 1-387 | STR 442-542 | RBD 668-705 | STR 706-745 | RBD 746-768 | STR 769-808 | RBD 809-831 | STR 832-871 | RBD 872-1006 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pseudomonas phage vB_PaeM_PA5oct
[NCBI] 		2163605 Uroviricota > Caudoviricetes > Arenbergviridae > Wroclawvirus PA5oct >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010678890.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_071039 [NCBI]
CDS location
range 90324 -> 93350
strand +
CDS
ATGTCGAGTAAAATTAAATTCACGGATCAATATATCCTATCTAGTGTTGGGCAAACTTCTAATAATATAGTATATTTGCAAGTAAATGATGATCAGCAATTAGTTGTTACTCATCCTATGTATGCAACTGAATGGTCTACATTAGGTGGGCTTAGAGTAACAGGTGATCAGTCTAAATTTGATGGATCATTAGAAGTTGGTTATGAATTGCTAGTAGGACAAACATCTACCTTTAACAACGACATGGTAGTAAACGGTTTAGTTACAGTAAACAGAGATTCTCTAGATGCAATGCTCATTCATGGGAATGTTACATTACATGGCAACTTAACTGTAGTAGGTAGCAGCTCAGGGACTACACCCGGGCAAGTAACTATTTCCGACAACATTATGGTTGTGAATACAGATGACGTAGGTCCGGGCGTCACTGCAACATATTCTGGCTTTGAAGTCCAGCGTGGAATTCCCGTAGGCGAAACTAATAGTCACGGTGAACCCGGCCAAGGTAAATTGCCTTCTGCTGGATTAGTTTGGAATGAAGTGCAAAAATCCTGGGATCTTAATTATAACCCTATTCTTTCTGAAAAATTACCACAAAATCCTAGAATAATTAACTTAGGGCAGCCAGTTGCTGACAACGATGCTTCTACAAAAAAATATGTTAATGATAGCATAACTGCTGCACTCGATGATGATATTTATTTAGATAGACTTACTGATGTAACAATTTCTTCTCCGGCTAATAAAAATATACTACAGTACGATTCTTCTACATCGCAATGGAGAAATTTACCATATTCGTTTATACGATTAACGGATGTAACTGGTGTATCTGTCCCGAGAGGATATGTGAGATGGAATGCAGCAGGAACACAGTTAGTATATGAAACCACTATAGATTATGCACAATTAACTGGATTGTCTGATGTAGCTAAAGCAGGACAAGGGGCTCTAAGTTTTCTTAGTGATGTAACATTATCATCGTTGTCTAATACACAGGCATTATTTTATAATGGAACCTCTTGGGTTAACAGACTAATTAATTACTCTGACATTCAAAATACTCCTACTAACAATTCGTATAGTTTTATTGGATTAAATGATACTAATGATACAGTTGTTAATAACGGATATGTGAGATGGAATGCAGCAGGAACACAGTTAGTATATGAAACCACTATAGATTATGCACAATTAACTGGATTGTCTGATGTAGCTAAAGCAGGTCAAGGATCGTTAGATTATTTAACAGATGTTAGTATAGGAACTGCTAGCTCCGGTAATGTACTAAGATATAACGGAACTGATTGGGTAAACCAAGTATTATCATATACTGATCTTTCTAATACCCCTACTAACAATTCGTATAGTTTTATTGGGTTAAATGATACTAATGATACTGCACTTTCGGGTGGTTATTTACGATGGAATCCCACCGGAACACAGATAGTATATCAATCCACTATAGATTATGCACAGTTAACTGGGTTATCTTCTGTTGCTAAAGCAGGTCAAGGGGCTCTAAGTTTTCTTAGTGATGTAACTATATCGTCACCTGGCGCTAGTAATACATTGCGATACGATACTACTTCATCTAAATGGGTAAACACTAGACTTGCTTATTCCGATTTAACAGGTCAACCAACCTCTGCTAATTATCAACTAGTTGGGTTAAGTGATACTGCAAGCACATCTGTACCATTGGGATATCTTAGATGGAACGCCGCTGGAACTCAAGTAACATATGCTACTACGATAGATATATCAGTTATATCTGGTAAATCTACTGTAGCTTCTGCTGGTTCAGCAACACTATCTAATCTAGAAGATGCTGCTGTTACAACGCCTGCTGCTGGGAATACTTTAATATGGAATGCGTCTACAAATAAATGGACAAACGGAATATTAGATGTATCTAATATTACTAATGCTGTACCTGTTAGTAGAACAGTATCTGCAGGAACTGGATTATCTGGCGGAGGAAATTTATCTAGTAATATTACGTTGTCGGTTAATAGAACATTAACCGATACATGGTATGCTGCTGCATCACATACTCATGATGCATCTAATATTACGTCTGGTGTTATTGCGAATGCTAGACTGCCAGTTGGAAGCACAACAGCACAAGGTATTTTACAGTTAACAGATGGTGTTGCTAGCACATCTACAACTACTGCCGCTACACCCAATTCGGTGAAAACTGCATATGACTTAGCAACGACAAAAGCTAATATATCACATACTCATGATGCATCTAATATTACTACTGGTACTATTGCTGTAGCCAGACTTCCGGTTTCGTCTACTACTGCACAAGGTATAGTTCAGCTTACTGACGGTGTTGCCAGCACATCTACAACTACTGCTGCTACGCCTAATTCAGTAAAAACTGCATATGATTTGGCAACGACAAAAGCTAATGCTTCTCACACCCATGATGCATCTAATATTACGTCTGGTGTTATTGCGAATGCTAGATTACCGTTTGCCTCAACTACTGTATATGGTATAGTAACTCTGTTAGATTCAGTTGCCAGTACATCTATATCTACTGCTGCTACACCTAATTCAGTAAAAACTGCATATGATTTAGCAACGACAAAAGCTAATATATCACATACACATACTCCTGCTCAAGTAGGTTTATCGAATATTTCTAATAACGGAAATACTATAACGGGAAATACAACTATATCTGGTGCATTGTCGGTAACAGGAAATGCTGTTTTTAATACATCTGATATAAAATTAAAAGATAATATACAGCCTATTAAAAATCCAGTAGAACTTCTTAGCAAAATTTCAGGATATACTTATACTAGAAATGATTGTAATAACGAAAAACAAACCGGTATTATTGCGCAGGAAGTTGAAACGATACAACCTGAAAGTGTAAGAGAGATAGACGGTATAAAAACTGTAAACCATAATGGAATAATTGCACTGTTAGTTAGTGCAGTTAATGAACTTTCTAAAGAAATAGAAGAATTAAAACAACAACTTTCTTACAAAAAAAGGGACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
3ad375ad5f7b386bf96a16a0d22e67d02cf9d6f4a0cda49517cf4e52cd6b8d13
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2919
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Integrative omics analysis of Pseudomonas aeruginosa virus PA5oct highlights the molecular complexity of jumbo phages Lood,C., Danis-Wlodarczyk,K., Blasdel,B.G., Jang,H.B., Vandenheuvel,D., Briers,Y., Noben,J.-P., van Noort,V., Drulis-Kawa,Z. and Lavigne,R. 2019 — GenBank
Genomics, Transcriptomics, and structural analysis of Pseudomonas virus PA5oct highlights the molecular complexity among Jumbo phages Lood,C., Danis-Wlodarczyk,K., Blasdel,B., Jang,H.B., Vandenheuvel,D., Briers,Y., Noben,J.-P., Kawa,Z. and Lavigne,R. 2019-06-22 — GenBank