Protein

View in Explore
Genbank accession
CAR63408.1 [GenBank]
Protein name
putative short tail fibre
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,69
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,84
Protein sequence
MSRNIRSNYLTDKVTFGASTMPIGSIVPIFKADDDKVADNGVVTQLGSVVAGAGGGSGYFTDLGTISGYPTGPVELTIAPGNLSVGNDEITYPNHPFIDGDKITVVEAEQAPNIAKLGGSIQSFTVTNGGSGYTTPPNIQVTDNGSGPVSAGSFSVVINNGSVTQINVLNGGEGYQFPQVSFTGGGGGAGAAATAQLSPGGDGGVQFERGFTFYVQYVDASTFRIGRSNADILAGKYYNVTDLGSAGTFKLASTTGFGLRVGIAANLDGSVNFATIKSPGYGYEDGDVVYILQPGSDGLARVEIVSTVSDTGDNPEEQYPGFLYCDGGEYNAQDYPLLYEILSNDYGGTGGTYNPSDFGQTSAVTFKVPDYKTRKLVGAGGGVSGGGSPVSGNVISTVGATGGKWFFSKNDQEALYDIGNIVISGYDNVTDFVAGTLTGDVTIKIGPLQEKLISAVPEHEHAILTSEAPEAGAFEGAGFFADDHSAGFKNGNGQVNFFLPSGGVPLFHTHGIVDYVIPDPNASTYGNVSGIGEALTKTFNSTAIVSSGSSTTITIAAHELQTGYKIRVLDNPQSTIATVNVDGVATSFAANTEWYVIKVDNDTIKLAKSRYAALRLQELQFSTNGNSADITIETHYAAAGNFPSELITTIITPTPTSYDIDDNYVVGGKPVIIPGDTFSTTVQKQNQTTSGTYSVPAPTADELPLTSIAVTLGGAGGYGATTDSAPGGGGNTTYTFSASGYTYEVRATGGSGGTRGDSGGNGGGGGAGFIYVKQGGTTVQTVSLSTITPGTTNALTGGVEYTLVSYYAGQSGTGGSSSQGGTGGASSYIGGAGGDGSRTLFTGSNDVTQSFTSPSSSYFSYNIPNDWPLDQLQAEVKGGGGGSGGRGDGGNWFPGNGNGGKRVTANINPGNNGTLRVYVGGGGNAGGNRSGGSGGVGFASGGNGGNGTGGGGGGGGGGASAVGTPSAIIIGAGGGGGGGAAGDATQGSDQNGQLNSNDAVQNLSALFSGTGSNGGNSVCSGGGGGGGGGGVGVGSGIGGGGGGGNGSNARRDGFGGRRGQSAVKSSGTGPTASLVSEGGAGNATSVSAGNTQNGNAGSVVFVATENQTFYGNGGGGGGSGAYFELQFTEVGNGSAGTLVVGDGYSDGRGIIGYQVPQSSGDTAGTSSTIGIFDAASTSVDYVESGTGSGTTGGFVSPDGFKYLRFFGNEANRWARSIGINASASNSKGTVVEALRFNVIVGDNSNGGEAPSAPLELFASNDAGGSYTKIGTVASTSGPSVWTDVDVALPADYQEPGMLFELRQSRSSSGNPNNDNYGVSAVYLIHAEGEVTTITTSSGKVDLGVEYITEVIPPQGDPINSAGIDVNDGIFTLSSAVKLSVTSELQPEIDIPLLTRYHLVKYLIKAY
Physico‐chemical
properties
protein length:1406 AA
molecular weight: 140438,66420 Da
isoelectric point:4,43898
aromaticity:0,08464
hydropathy:-0,17802

Domains

Domains [InterPro]
DC_0507
ATT
4–256
DC_0507 IPR037053 DC_0333 G3DSA:2.60.120.260 DC_0333
IPR011083
ATT
320–352
IPR011083
SSF88874
STR
320–387
SSF88874
CAR63408.1
1 1406
Architecture
ATT
ATT
STR
STR
STR
ATT 4-256 | ATT 303-372 | STR 373-492 | STR 1172-1325 | STR 1354-1406
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
CAR63408.1
1 1406
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 367 367 0,8086
Central domain 368 566 200 0,4587
C-terminal 567 1406 839 0,4206
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-367
Central
368-566
C-terminal
567-1406

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-RSM4
[NCBI] 		555387 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Gibbetvirus > Gibbetvirus rsm4
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAR63408.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
FM207411 [NCBI]
CDS location
range 155418 -> 159638
strand -
CDS
ATGTCCAGAAATATCCGCTCTAATTATCTAACAGATAAAGTAACTTTTGGTGCATCTACTATGCCGATTGGATCTATTGTTCCAATCTTCAAAGCAGATGATGATAAGGTTGCAGATAATGGTGTTGTAACTCAACTTGGATCAGTTGTCGCTGGTGCTGGTGGGGGAAGTGGGTATTTTACTGACCTTGGAACAATCTCTGGGTATCCAACAGGACCAGTTGAGTTAACTATTGCTCCTGGCAATCTTTCGGTTGGAAATGATGAGATTACTTATCCTAATCATCCATTTATTGATGGCGATAAGATTACGGTAGTGGAAGCAGAACAAGCACCAAACATTGCTAAACTTGGTGGTTCTATTCAAAGTTTTACGGTAACCAATGGTGGATCTGGATACACAACTCCTCCAAATATTCAAGTTACTGATAATGGTAGTGGACCTGTATCCGCTGGATCTTTCTCTGTTGTAATTAACAACGGATCTGTCACCCAAATCAACGTATTGAATGGTGGTGAAGGTTATCAGTTCCCTCAGGTTTCTTTTACTGGTGGTGGCGGTGGTGCAGGCGCAGCAGCTACAGCACAATTATCTCCTGGTGGTGATGGTGGTGTGCAGTTTGAGCGTGGATTTACTTTTTATGTTCAATATGTAGATGCCAGCACTTTTAGAATCGGCAGAAGTAATGCTGACATCCTTGCTGGAAAGTATTATAACGTCACTGATCTTGGATCTGCTGGTACATTTAAACTTGCATCAACAACTGGTTTTGGATTGAGAGTTGGTATTGCCGCAAACTTAGATGGTTCTGTTAATTTTGCTACAATTAAAAGTCCTGGATATGGATATGAAGACGGTGATGTAGTCTATATTCTGCAACCTGGAAGTGATGGTCTTGCTAGAGTAGAAATTGTTTCTACAGTAAGTGATACAGGTGATAATCCAGAAGAACAATATCCTGGATTCTTATATTGTGATGGCGGTGAATATAATGCACAGGACTATCCATTATTGTACGAGATTCTGAGTAATGATTATGGTGGCACTGGAGGAACATATAATCCATCTGATTTTGGTCAGACTAGTGCAGTAACATTTAAAGTTCCTGACTATAAAACTAGAAAACTAGTTGGAGCAGGCGGTGGTGTTTCTGGGGGAGGATCTCCTGTATCAGGTAATGTCATCTCCACAGTTGGTGCTACTGGTGGTAAATGGTTCTTCTCTAAAAATGATCAGGAAGCATTATATGACATTGGTAATATTGTTATCAGTGGATATGATAATGTGACCGATTTTGTTGCTGGTACTTTGACTGGTGATGTTACCATTAAGATTGGACCTTTGCAGGAAAAATTAATTTCTGCAGTTCCAGAACACGAACATGCTATTCTTACATCAGAAGCACCAGAAGCAGGTGCATTTGAGGGTGCTGGATTCTTTGCTGATGATCACTCTGCTGGATTTAAGAATGGTAATGGACAGGTTAACTTCTTCCTGCCATCTGGTGGTGTTCCTTTGTTCCACACTCATGGTATTGTAGATTATGTTATCCCAGATCCTAATGCATCAACATATGGTAATGTTAGTGGAATTGGTGAAGCTTTAACCAAAACTTTTAATTCTACGGCAATTGTCTCTAGTGGTTCATCAACAACTATTACTATTGCTGCTCATGAACTACAGACGGGATATAAAATTAGGGTTTTAGATAATCCACAATCTACAATTGCTACAGTTAATGTAGATGGTGTAGCTACTTCATTCGCCGCAAATACTGAATGGTATGTAATTAAAGTTGATAACGATACAATTAAATTAGCAAAGAGTAGATATGCTGCTCTTCGTCTGCAAGAGTTGCAGTTCTCTACAAATGGCAACTCTGCTGATATTACTATTGAGACACACTACGCAGCTGCTGGTAATTTCCCATCGGAACTTATTACAACGATTATCACACCAACTCCAACTTCATATGATATTGATGACAACTATGTAGTTGGTGGCAAACCAGTTATCATTCCTGGTGATACATTCTCGACAACTGTTCAAAAACAAAATCAAACAACTTCTGGTACATATTCTGTTCCTGCACCTACAGCAGATGAACTCCCACTAACATCTATTGCGGTAACTCTTGGTGGTGCTGGTGGTTATGGTGCTACTACTGATTCTGCTCCTGGTGGCGGAGGAAATACAACCTACACATTTAGTGCTAGTGGATACACCTATGAAGTGAGAGCGACTGGTGGTAGTGGTGGAACTAGAGGAGATTCTGGTGGTAATGGTGGTGGAGGTGGAGCAGGTTTCATCTATGTTAAGCAAGGTGGAACTACAGTACAAACTGTTAGTCTTTCTACAATTACTCCTGGCACAACAAATGCACTTACAGGCGGTGTTGAATATACACTAGTTTCATATTATGCAGGTCAGTCTGGAACTGGTGGTAGTTCATCTCAGGGTGGTACTGGTGGTGCTTCTTCTTATATCGGTGGAGCAGGTGGTGATGGATCTAGAACATTATTTACTGGAAGTAATGATGTAACGCAGTCATTTACATCACCATCATCTTCATACTTTTCTTATAACATTCCAAACGATTGGCCACTAGATCAACTTCAGGCAGAAGTTAAAGGTGGTGGCGGTGGATCTGGTGGTCGCGGTGATGGCGGCAACTGGTTCCCTGGAAATGGTAATGGTGGTAAGAGAGTTACTGCTAACATTAACCCTGGCAACAATGGTACTTTGAGAGTATATGTTGGTGGTGGTGGTAATGCTGGTGGCAACAGATCTGGTGGTTCTGGTGGTGTAGGTTTTGCTTCTGGTGGTAATGGTGGTAATGGTACTGGCGGCGGTGGCGGCGGCGGTGGAGGTGGTGCATCTGCTGTTGGAACACCTTCTGCTATCATTATCGGTGCTGGAGGCGGTGGCGGTGGTGGTGCTGCTGGAGACGCTACCCAAGGATCTGACCAAAATGGTCAATTAAATTCTAATGATGCGGTTCAAAATCTGTCTGCATTGTTCTCTGGAACTGGTTCCAATGGTGGCAACTCAGTCTGCTCTGGAGGCGGCGGAGGCGGCGGCGGAGGCGGCGTTGGCGTAGGTTCTGGCATCGGTGGTGGTGGAGGCGGTGGAAACGGATCCAACGCCCGTAGAGATGGTTTTGGTGGCAGGAGAGGTCAGTCTGCTGTTAAGAGTAGTGGAACTGGTCCAACAGCATCTCTCGTTTCTGAGGGTGGAGCAGGAAATGCTACTAGTGTTAGTGCAGGAAATACACAAAATGGTAATGCTGGATCTGTTGTCTTTGTTGCTACTGAGAACCAAACATTCTATGGTAATGGTGGCGGCGGTGGTGGTTCGGGTGCTTACTTTGAACTGCAATTTACTGAAGTTGGAAATGGTAGTGCTGGCACACTAGTTGTTGGTGATGGATATAGTGATGGTAGAGGAATCATTGGATATCAGGTTCCACAATCTTCTGGTGATACAGCAGGAACATCTTCTACTATTGGTATCTTTGATGCTGCAAGCACTAGCGTAGATTATGTTGAGTCTGGTACTGGTAGTGGAACTACTGGTGGATTTGTTTCTCCAGATGGATTCAAATATCTAAGATTCTTTGGTAATGAAGCAAATAGATGGGCAAGAAGTATCGGTATCAATGCATCTGCTAGCAACTCAAAAGGAACTGTTGTTGAAGCATTGAGATTTAATGTAATTGTTGGTGATAATTCTAATGGTGGTGAAGCACCATCTGCTCCTCTTGAACTATTTGCAAGTAATGATGCTGGTGGAAGTTATACTAAAATTGGAACCGTTGCATCTACTTCTGGTCCATCAGTTTGGACAGATGTTGATGTTGCGTTGCCAGCAGACTATCAAGAACCAGGAATGTTGTTTGAACTAAGACAATCACGTTCATCTTCTGGCAATCCAAACAACGATAACTATGGTGTATCTGCTGTCTATTTGATTCATGCTGAGGGTGAGGTTACAACTATTACCACATCTTCTGGTAAAGTTGATCTTGGTGTAGAATACATTACAGAGGTTATTCCACCACAGGGAGATCCAATTAACTCTGCTGGTATTGATGTTAATGATGGTATTTTCACACTATCCTCTGCTGTGAAGTTAAGTGTTACATCTGAGTTGCAACCAGAGATTGACATTCCGCTCTTAACACGCTATCATCTAGTTAAGTATTTGATTAAGGCGTACTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
74f53b08c4e498273e51c6f7b57b41ed67b46553f74aca8bb4a2117b4b7808cf
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7147
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50