Protein
View in Explore- Genbank accession
- UMM76746.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber
- RBP type
-
TFTSPTF
- Protein sequence
-
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIVLNTHGRTLAIYTKDEADNVVQLAGKGVPFLDTAGNLNVDGTTTLKDNVTISPNKAINFEASDLSGALVRHITGKCANNDGWYIGAGGASDQGFLEIGTYDNGNEPIYFVQRTGGTTQAEVRRLALLDGFGDTSIPGDLRLTGKTVKISNGSTLTLEMGVGSNDAYIKNQRGTGVLQLTNDSNLTFRNSQVYYAMNGRGPGKSGTLLTNVENNRQAWQYTISAATATTPRWVKVATLKHPGMASSQLDLMITGGIDSGHGRHYVDFITLSGRNLTSWSTSNLDNWVEWRRMGSPNKGNVPEYYVVKNDAATDSEASFDFYAKVPRYGNGLYVTVLNTAGYNGQDSGKVIIYETNQDTGDTGPSGSILVSMKQIFDSLAKPDFGDTTGTLPVNRGGTGATNVGDARNNLGLRTAAVRDVGESSGNVMEVGAFGIGGHGKSLVDITSDVDLMTRLKALGGTTFRANVASGYTGAPYYSHGAGFFSRTGDTMSALNIDYATGNVRVFAINDSGLASGRVNANMLYGTANKPTKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLTAPNLHASGSGTASLYINAGSGNAHIWFRTNTNERGVIWATPNTADLGQINIRAKTTGGTSAGDFSFRSDGRFDVPVAVKVGGAAMLTKDGNITSGSMFGGNLNNYLNTIKNDIVAGDNKQVSKTGDTMTGNLTINANLKVENPNGTFVDLGSENSDKYSRLTLARKVGDGASVAMLKITPEGYVQFGYQDAVATPSPSKYIRVKSDGLDVEGDLVFNQTYRGAENAVDISDKTNDLNNMVIKGSDLGTRLLYKCTSTGGASNILNRPTSDGNFVLEVLSLRKISDTDWSCKQTFTTKNGNVEGTYVRYCQNGTWSAWKEVVAGVQPINLGGTGATSVAAARNNLGVGEWQSVAFGVLNVNGVSNADPAITFKNGAMVREAQGGSLGALILSASTASPDGAKYIAFRPFGDSSGTEIRVKANGSSESLLEWSYGPGIRSNSSGAFVIYAKTGQALHLRPNGDNSNQATVIDQNGKMTVGGEFEAQNSKITGNLNVSEDNRMIVLGKNSDIGLVKKSGMPGKMAIGKSNSFTIMVSTNTNNQINPADTFNDIFKVDADGNQTVYGNAQVNRQLTVSSSATVNGIINANGGIIVPTTKYVQIADAPTQNNQATNKQYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGNLIVTGSQLKSTSLWVTGDAAVNGVLTVDGKARFNQEFSVSTSVNVQNDGNSHVFFRKANGTEKGLLWADDPGNVSIRAGGAIGPVWNFWSSGSCQFPGAISNYNGISTTTNYPAGKPNGTYNNTAGLVTRFSNGAYASIYFQEYVGNYHQAILNVNGFGRDDNFFFRSGGDFFCTRNGSFDNVEIRSDRRAKSDIKVIENALEKVEKLTGNTYELHNTSGGTTRSAGLIAQEVQEVLPEAVTQDIEADGGLLRLNYNSVIALLVESVKELSAEVKELKSQLK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1510 AA molecular weight: 159943,48730 Da isoelectric point: 6,21912 aromaticity: 0,07616 hydropathy: -0,33371
Domains
Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–620
ATT
4–620
DC_1159
STR
448–1101
STR
448–1101
IPR030392
CHP
1415–1509
CHP
1415–1509
1
1510
Architecture
ATT 4-620 | STR 621-1101 | RBD 1124-1510
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Tail Spike Domain Segmentation
Tail Spike Domain Segmentation
This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.
Domain Layout
1
1510
| Domain | Start | End | Length (AA) | Confidence |
|---|---|---|---|---|
| N-terminal | 1 | 1092 | 1092 | 0,1059 |
| Central domain | 1093 | 1291 | 200 | 0,3967 |
| C-terminal | 1292 | 1510 | 218 | 0,8682 |
Note: Constraints were applied during segmentation.
Fixed 607 C-terminal predictions appearing before Central domain
Fixed 607 C-terminal predictions appearing before Central domain
Legend:
N-terminal
Central domain
C-terminal
3D Structure with Domain Coloring
The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).
Domain Coloring
N-terminal
1-1092
1-1092
Central
1093-1291
1093-1291
C-terminal
1292-1510
1292-1510
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Klebsiella phage UTI-K1 [NCBI] |
2920922 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Klebsiella pneumoniae [NCBI] |
573 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UMM76746.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OL870318.1
[NCBI]
CDS location
range 147555 -> 152087
strand +
strand +
CDS
ATGGCCGATCAAAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATAGTGTTGAATACACATGGGCGTACTCTCGCTATCTACACCAAAGATGAAGCCGATAACGTTGTTCAGCTTGCAGGTAAAGGTGTTCCTTTCTTAGATACTGCAGGTAATCTTAATGTTGATGGAACTACTACGTTAAAAGACAACGTTACTATTTCTCCGAATAAAGCGATCAATTTTGAAGCTTCTGATTTAAGCGGAGCATTAGTACGTCATATCACCGGTAAGTGTGCTAATAATGATGGCTGGTACATTGGAGCTGGCGGTGCATCTGACCAGGGATTTCTTGAAATCGGTACGTATGATAACGGAAATGAACCTATCTATTTTGTTCAAAGAACCGGTGGAACGACTCAAGCTGAAGTTCGTCGTTTAGCATTATTAGATGGGTTTGGCGATACCTCTATACCTGGGGACCTTCGTTTAACTGGTAAAACAGTAAAAATTTCAAACGGCAGCACTCTTACTTTGGAAATGGGTGTAGGTTCTAATGACGCTTATATTAAAAACCAAAGAGGTACTGGCGTTCTTCAATTAACTAATGACAGCAATTTAACGTTCAGAAATTCCCAGGTTTATTACGCCATGAACGGAAGAGGTCCTGGTAAATCCGGTACTCTTCTGACGAATGTAGAAAACAATCGTCAAGCCTGGCAATACACAATTTCAGCTGCAACTGCCACAACCCCGCGCTGGGTTAAAGTAGCTACATTGAAACACCCAGGAATGGCTTCTTCACAACTGGATTTAATGATTACAGGTGGCATTGATTCTGGACACGGAAGACATTATGTTGATTTTATCACGTTATCAGGACGCAATTTAACATCCTGGAGCACTAGCAATTTAGATAACTGGGTTGAATGGCGCAGGATGGGTTCTCCTAATAAAGGAAACGTTCCAGAATATTACGTTGTTAAAAACGATGCTGCTACAGATTCAGAGGCTTCATTTGATTTTTACGCTAAAGTTCCTCGATACGGCAATGGGCTTTATGTCACAGTGCTGAACACTGCTGGATACAACGGCCAGGATAGTGGTAAAGTAATTATCTATGAAACCAATCAGGACACTGGTGATACTGGACCGTCCGGAAGTATTCTTGTTTCAATGAAACAGATTTTTGATAGTTTAGCAAAACCAGATTTCGGTGATACCACAGGTACTCTTCCGGTTAACCGTGGTGGTACAGGTGCTACTAACGTAGGAGACGCTCGAAATAACCTGGGTCTTAGAACTGCGGCTGTTCGTGATGTCGGTGAATCCAGTGGAAACGTGATGGAAGTTGGTGCCTTCGGTATTGGTGGTCACGGAAAATCACTTGTAGATATTACTTCTGACGTTGATTTAATGACTCGCCTTAAGGCTCTTGGCGGTACAACGTTTAGAGCCAACGTAGCGAGTGGTTATACCGGGGCTCCTTATTATTCACATGGCGCAGGTTTCTTTTCTAGAACTGGCGATACAATGTCTGCGCTTAATATAGATTACGCAACTGGTAATGTCAGAGTATTTGCTATAAACGATAGCGGTTTAGCAAGTGGAAGAGTGAATGCTAATATGCTTTACGGTACAGCAAACAAACCAACTAAGGCTGACGTCGGACTTGGTAATCTGACAAACGATACCCAGGTTAAGAAAGCTGGCGACACCATGACCGGTGATTTAACTGCTCCTAACTTGCATGCTTCTGGATCAGGAACCGCATCGCTTTATATTAATGCGGGAAGCGGAAATGCTCATATATGGTTTAGAACAAACACCAATGAACGTGGTGTAATTTGGGCAACTCCAAATACTGCTGATTTAGGACAAATTAATATTCGTGCAAAAACTACTGGTGGTACTTCTGCTGGTGATTTTAGCTTCCGTTCTGATGGCAGATTTGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAGTTGGTGGAGCAGCAATGCTAACCAAAGACGGAAACATCACCTCTGGTTCAATGTTTGGCGGTAATCTTAATAACTATTTGAATACCATTAAAAACGACATTGTTGCCGGCGATAATAAGCAAGTAAGTAAGACTGGCGATACTATGACCGGTAACTTGACTATTAACGCTAACCTAAAAGTCGAAAATCCTAATGGAACATTTGTTGATTTGGGTTCAGAGAACTCAGACAAATACAGCAGATTGACCCTTGCACGTAAAGTTGGTGATGGCGCTTCCGTAGCAATGCTTAAAATTACTCCTGAAGGATACGTGCAATTTGGTTATCAAGATGCAGTTGCTACTCCATCTCCTAGCAAGTACATCCGAGTTAAATCTGATGGTCTTGATGTAGAAGGGGACTTGGTTTTTAATCAGACATATCGTGGTGCTGAAAATGCAGTTGATATTTCTGATAAGACTAATGACCTTAACAACATGGTTATTAAAGGCAGTGATTTAGGTACTCGTCTATTATACAAGTGTACTTCTACCGGTGGCGCTTCTAATATATTGAACAGACCTACATCTGATGGTAACTTTGTTCTTGAAGTTCTGTCTTTGCGTAAAATTTCTGATACTGACTGGTCATGTAAGCAGACCTTTACTACAAAGAATGGTAATGTTGAAGGCACATATGTTCGATACTGCCAAAACGGCACATGGTCCGCATGGAAAGAGGTTGTCGCTGGTGTTCAACCGATTAATTTAGGTGGTACTGGAGCAACTTCTGTAGCTGCCGCTCGTAATAACCTCGGTGTTGGTGAATGGCAATCTGTGGCATTTGGTGTATTGAATGTCAACGGCGTTAGTAATGCAGACCCGGCCATCACATTTAAAAATGGGGCTATGGTTCGTGAAGCCCAAGGTGGTAGTCTCGGCGCGTTAATCCTGTCGGCTTCTACTGCATCTCCAGACGGCGCGAAATATATTGCTTTTCGACCCTTCGGTGATTCGTCTGGTACTGAGATTAGAGTAAAAGCCAACGGGTCAAGTGAGTCACTACTTGAATGGTCTTATGGCCCAGGTATTCGTTCAAATTCATCTGGCGCTTTTGTTATCTACGCAAAAACAGGTCAGGCACTCCATTTAAGACCAAACGGTGATAATTCTAACCAAGCCACAGTTATTGACCAAAATGGTAAAATGACTGTCGGTGGTGAATTTGAGGCCCAGAACTCAAAAATCACTGGTAATTTGAATGTATCTGAAGATAATAGAATGATTGTTCTTGGCAAAAACTCTGATATTGGTTTAGTCAAGAAAAGTGGTATGCCAGGAAAAATGGCTATCGGTAAATCTAACTCGTTTACTATTATGGTATCAACAAATACCAACAACCAAATTAATCCTGCTGATACGTTTAATGACATATTCAAAGTAGATGCTGATGGAAACCAGACTGTTTACGGAAATGCCCAAGTCAACAGACAGTTAACTGTTTCTAGTTCAGCTACTGTTAATGGTATTATTAATGCCAACGGAGGTATTATTGTTCCTACTACCAAGTATGTACAAATTGCCGATGCTCCTACGCAGAATAACCAAGCAACAAATAAACAGTATGTTGATGATAAGGTTGCTTCTGCTATTAGTAATGCTGGCGACACGTATCTTCCATTAGCGGGTGGTACTGTAACTGGTAACTTGATTGTTACTGGAAGCCAGTTAAAAAGTACATCACTCTGGGTTACCGGTGATGCTGCCGTTAATGGTGTTTTAACTGTTGACGGAAAGGCTAGATTTAATCAAGAGTTCAGTGTATCTACTTCAGTTAACGTCCAGAACGATGGTAATAGCCATGTGTTCTTCCGTAAAGCAAATGGTACAGAAAAAGGACTTCTTTGGGCTGACGACCCTGGTAACGTTAGTATAAGAGCAGGCGGCGCCATTGGGCCGGTGTGGAATTTCTGGAGCAGCGGTTCCTGCCAATTCCCAGGAGCTATTTCTAACTATAACGGAATTAGTACCACTACTAATTATCCTGCAGGAAAACCTAATGGTACATATAACAATACCGCAGGACTAGTAACTAGATTTAGTAATGGTGCTTATGCTTCAATATACTTCCAAGAGTATGTAGGAAACTATCACCAGGCTATTCTTAATGTTAACGGATTTGGTCGAGACGACAACTTCTTTTTCCGATCCGGTGGCGACTTCTTCTGTACTCGTAATGGCTCTTTTGATAACGTTGAGATTCGTTCTGACCGTAGAGCCAAATCGGATATCAAAGTTATTGAAAATGCTTTGGAAAAAGTAGAAAAACTAACCGGTAATACTTATGAGCTTCACAACACATCCGGTGGTACTACTCGTTCTGCGGGTTTAATCGCACAGGAAGTTCAAGAAGTTCTTCCGGAAGCAGTTACTCAGGATATTGAAGCAGACGGGGGTTTATTGCGTCTGAATTACAACTCAGTAATTGCACTTCTCGTTGAATCTGTTAAAGAGCTTTCTGCTGAGGTTAAAGAGCTTAAATCTCAACTGAAATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
6f65347769ff72eee104caff162e68cb74e006f26b6756a9d458e7ce8ed16f55
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50