Protein

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Genbank accession
XYR94991.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,78
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIVLNTHGRTLAIYTKDENDAVVQLAGKGVPFLDTSGTLTVNGTTTLKDNVTISPNKAINFEATDLSGAIVRHIVGKCATNDGWYIGAGGTSNSGVLEIGTIDDGAETIQFVQRGAGNVEARKLVLLDGSGNTTLPGDLRLSTNKTVKINNGSTLVLEMGVGSNDVYIKNQRGTGVLQLTNDSNLTFRNSQVYYAMNGRGPGKSGTLLTNVENNRQAWQYTISAATASTARWVKVATIKHPGMASSQLDLMISGGIDSGQGKHYVDFITLSGRNLTSWSTNNLDNWVEWRRIGSPSKGNVPEYYVVKNDAATDADASFDFYAKVPRYSNDLYVTVLNTSGYNGQSSGSVIIYETGQDTGATGPTGSILVSMKQIFDSYAKPDFGDTTGTLPVNRGGTGATNVGDARNNLGLRTAAVRDVGESSGNVMEVGAFGVGGKGKSLVDITSDVDLMTRLKALGGTVFRANTASGYTGAPYYSHGTGFYGRASDTMAALNIDYATGNVRVFAINDSGLASGRVNSNVLYGTANKPSKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLTVPNLHASGTGTASVYVNAGSGNAHVWFRTDGNERGVIWATPNTADLGQINIRAKTTGGTSAGDFSFRSDGRLDVPVAVKVGGAAMLTKDGNITSGSMFGGNLNNYLTSIKNDIVAGDNKQVSKTGDTMTGNLTINANLKVENPNGTFVDLGSENSDKYSRLTLARKVGDGAAVAMLKITPEGYVQFGYQTAVANPSPTKYIRVKPDGLDVEGDLVFNQTYRGTEEAVDISDKTIDLNNLVIKRTDPGTRQLYKCVSSGGGSKIANKPTSDGNFVLEVLSLRKVSDNDWTCKQTFTTKNNTTVGTYVRYAQNGSWTAWKEVVAGVQPINLGGTGATSVAAARNNLGVGEGQTVSFGNLVTNDLTVNGNARLVGRLNLGSTSATGVLRANETGAVVLGSASGQNIHIRAGSPDTSSGETRFEPNGNVLVGGAITVSGSLQVNGEAAMSRSLIVSQNIKNTNDNSFILMGKDSDLGFVKKSNSGAKLVFASGKSFIVAKSSATVIANPASETYTDVFKVDADGNQTVYGNSAVSRALTVSSTATVNGVINANGGIIVPTTKYVQIADAPTQNNQATNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGNLDVTGTRLKTWKLEVDGGGAVLGGTIDVVGKANFSNELTANTSINVMNDGNSHLFFRKANGTEKGLLWADDPGNVSIRAGGASGPVWNFWASGSCQFPGAISNYNGISSTTNYPAGQPNGTYNNTAGLVSRFSNGAYASLYFQEYVGNFHQAIINVNGFGRDDSFYFRAGGDFICTRNGSFDNVEIRSDRRAKSDIKVIENALEKVETLSGNTYELHNTSGGTTRSAGLIAQEVQEVLPEAVTQDNEEDGGMLRLNYNSVIALLVESVKELSAEVKGLKAEIEELKSK
Physico‐chemical
properties
protein length:1478 AA
molecular weight: 155365,53530 Da
isoelectric point:6,36406
aromaticity:0,06969
hydropathy:-0,28471

Domains

Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–618
DC_1942 cd19958 DC_0246
DC_0468
STR
483–1003
DC_0468 IPR030392
IPR030392
CHP
1378–1433
IPR030392 Coil
XYR94991.1
1 1478
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 4-618 | STR 619-1003 | RBD 1080-1478
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XYR94991.1
1 1478
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 365 365 0,0918
Central domain 366 584 220 0,1975
C-terminal 585 1478 893 0,6393
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-365
Central
366-584
C-terminal
585-1478

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage ATCCa
[NCBI] 		3410967 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Klebsiella pneumoniae
[NCBI] 		573 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYR94991.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV239574.1 [NCBI]
CDS location
range 15224 -> 19660
strand +
CDS
ATGGCCGATCAAAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATCGTGTTGAATACACATGGGCGTACTCTTGCCATTTACACTAAAGATGAAAATGATGCCGTAGTACAGCTCGCCGGTAAAGGGGTTCCTTTCTTAGATACCTCTGGCACTCTTACCGTTAATGGAACTACTACATTAAAAGACAATGTAACTATTTCTCCGAATAAAGCAATCAATTTTGAAGCTACGGATTTAAGCGGAGCAATAGTGCGTCATATCGTCGGCAAATGCGCTACTAACGATGGCTGGTACATCGGCGCCGGTGGTACAAGCAATAGCGGTGTTCTTGAAATCGGTACTATTGACGATGGTGCTGAAACTATTCAATTCGTACAACGCGGCGCGGGCAACGTTGAAGCCCGAAAATTGGTCTTGCTTGACGGCTCGGGTAATACGACTCTTCCTGGCGATTTAAGATTATCCACCAATAAGACTGTTAAAATTAACAATGGAAGCACTCTTGTTCTTGAAATGGGTGTAGGCTCTAACGACGTTTATATTAAAAACCAAAGAGGCACCGGTGTTCTTCAATTAACTAATGACAGTAATTTAACGTTCAGAAATTCTCAGGTTTATTACGCCATGAACGGAAGAGGTCCTGGTAAATCTGGTACTCTTCTGACGAATGTAGAAAACAATCGTCAAGCCTGGCAATATACTATTTCTGCTGCAACTGCGTCAACTGCTCGCTGGGTAAAAGTAGCTACAATAAAGCATCCAGGAATGGCTTCTTCACAGCTGGATTTAATGATTAGCGGTGGTATTGATTCTGGACAGGGTAAGCATTATGTTGATTTTATTACATTATCTGGCCGTAATTTAACATCTTGGAGCACTAACAATTTAGATAACTGGGTTGAATGGCGCAGAATTGGTTCTCCTTCTAAAGGAAACGTTCCAGAGTATTACGTTGTTAAAAATGATGCCGCTACTGATGCGGATGCTTCATTTGATTTTTACGCTAAAGTTCCTCGATATTCCAATGACCTTTATGTCACAGTACTAAACACTTCTGGGTATAATGGACAAAGCTCTGGTAGTGTAATTATCTATGAAACTGGTCAAGACACCGGTGCTACTGGACCGACTGGAAGCATTCTTGTTTCAATGAAACAAATTTTTGACAGTTACGCAAAACCAGATTTCGGTGATACTACCGGTACTCTTCCGGTTAACCGTGGTGGTACAGGTGCTACTAACGTAGGAGATGCCCGAAACAACCTGGGCCTTAGAACTGCGGCTGTTCGTGATGTTGGTGAATCCAGCGGAAACGTGATGGAAGTTGGTGCCTTTGGTGTCGGTGGTAAAGGAAAATCACTAGTAGATATTACTTCTGACGTTGATTTAATGACTCGCCTTAAGGCTCTTGGTGGTACAGTGTTCAGAGCCAACACAGCGAGTGGTTATACCGGGGCTCCTTATTACTCCCATGGCACTGGGTTTTACGGAAGAGCTTCTGACACAATGGCTGCGCTTAATATAGATTATGCAACTGGCAACGTCAGAGTATTTGCTATAAACGATAGCGGTTTAGCAAGTGGAAGAGTAAATTCTAATGTTCTCTACGGCACAGCAAATAAGCCATCTAAGGCTGATGTCGGACTTGGTAATCTGACAAACGATACTCAAGTTAAGAAAGCCGGCGATACCATGACTGGTGATTTAACTGTTCCTAATTTACATGCTTCCGGCACTGGTACTGCATCAGTATATGTTAACGCAGGAAGCGGAAACGCTCATGTATGGTTTAGAACAGACGGTAACGAACGTGGTGTAATTTGGGCAACTCCAAATACAGCGGACTTAGGTCAGATTAATATTCGTGCAAAAACTACTGGAGGCACTTCTGCTGGTGATTTTAGCTTCCGTTCTGATGGCCGCCTTGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAGTTGGTGGAGCAGCAATGCTAACCAAAGACGGTAATATTACCTCTGGTTCGATGTTTGGTGGTAACCTTAACAACTATTTGACTTCTATTAAAAACGATATCGTTGCTGGCGATAATAAGCAAGTAAGCAAGACTGGTGATACCATGACTGGTAACTTGACTATTAACGCTAACTTAAAAGTTGAAAATCCTAATGGAACGTTTGTTGATTTAGGTTCAGAGAACTCTGATAAGTATAGCAGATTAACCCTTGCTCGTAAAGTTGGTGATGGCGCTGCTGTAGCAATGCTTAAAATTACTCCTGAAGGATACGTGCAATTTGGTTATCAAACTGCAGTTGCTAATCCGTCTCCCACTAAGTATATCCGAGTTAAACCTGATGGTCTTGATGTAGAAGGGGATTTGGTTTTTAATCAGACCTATCGCGGCACTGAAGAGGCAGTTGATATTTCTGATAAGACTATTGACCTTAATAATCTTGTCATTAAAAGAACCGATCCAGGTACTCGTCAGCTGTATAAATGTGTATCATCTGGTGGCGGTTCTAAGATAGCAAACAAACCCACATCTGATGGTAACTTTGTTCTCGAAGTTCTGTCTTTACGTAAAGTTTCTGATAACGATTGGACATGTAAGCAGACCTTTACTACAAAGAATAACACCACTGTTGGCACATATGTTCGCTATGCCCAAAATGGCTCATGGACTGCATGGAAAGAAGTTGTTGCTGGTGTTCAACCAATTAATTTAGGCGGTACCGGAGCAACTTCTGTAGCTGCTGCTCGTAATAACCTTGGTGTTGGTGAAGGACAAACCGTATCATTCGGTAATTTAGTTACAAACGATTTAACCGTAAATGGAAATGCTAGATTAGTTGGAAGACTGAACCTTGGTTCTACTTCTGCGACTGGCGTATTACGAGCCAATGAAACCGGCGCAGTTGTTTTAGGTTCTGCTAGTGGTCAAAACATCCACATCAGAGCAGGAAGCCCAGATACTTCTTCTGGTGAAACCCGCTTTGAGCCAAATGGAAACGTTTTAGTTGGTGGTGCGATTACAGTCTCAGGAAGCTTGCAAGTAAATGGCGAAGCCGCGATGAGCAGAAGCCTGATCGTTTCTCAAAATATAAAGAATACCAACGATAATAGTTTTATTCTGATGGGAAAAGATTCGGATTTAGGTTTCGTTAAAAAATCTAACTCTGGCGCTAAACTGGTATTTGCTTCAGGAAAATCGTTTATTGTCGCTAAATCGTCGGCAACTGTGATAGCTAATCCGGCTTCGGAAACTTACACTGATGTGTTTAAAGTTGATGCAGACGGAAACCAAACTGTTTACGGAAATTCAGCAGTTTCTAGAGCTTTGACTGTATCAAGTACAGCTACAGTTAATGGTGTTATTAATGCCAATGGCGGTATTATTGTTCCTACTACCAAGTATGTACAAATTGCTGATGCTCCTACGCAGAATAACCAAGCCACCAACAAGAAATATGTTGATGATAAGGTTGCTTCTGCTATTAGTAATGCTGGCGATACTTATCTCCCATTAGCAGGTGGTACTGTAACTGGTAACTTAGATGTTACAGGAACTCGACTCAAAACTTGGAAGCTAGAGGTTGACGGTGGAGGCGCAGTACTCGGCGGAACTATTGATGTTGTTGGTAAAGCTAATTTTTCTAATGAGCTTACGGCTAATACTTCTATTAACGTCATGAATGATGGAAATAGTCATTTGTTCTTCCGTAAAGCAAATGGTACAGAAAAAGGACTTCTTTGGGCTGATGACCCTGGTAATGTTAGTATAAGAGCCGGCGGTGCTTCTGGACCAGTATGGAATTTCTGGGCAAGTGGTTCATGCCAATTCCCTGGAGCCATTAGTAACTATAACGGAATTAGCAGCACTACTAATTATCCTGCAGGACAACCCAATGGCACATATAACAATACCGCTGGGTTAGTAAGCAGATTTAGTAATGGTGCTTATGCCTCTCTGTATTTCCAAGAATATGTTGGTAACTTCCACCAAGCTATCATTAATGTTAATGGATTCGGTCGAGATGACAGTTTCTATTTCAGAGCTGGCGGTGACTTCATCTGTACTCGCAATGGTTCATTTGATAACGTTGAGATTCGTTCTGACCGTAGAGCTAAATCTGATATTAAAGTTATTGAAAACGCTTTGGAAAAAGTAGAGACCTTAAGCGGTAATACTTATGAGCTTCATAATACTTCTGGCGGTACTACTCGTTCTGCTGGGTTGATTGCTCAAGAAGTTCAAGAAGTTCTTCCTGAAGCAGTTACTCAGGATAATGAAGAAGATGGCGGTATGCTTCGTCTGAATTATAACTCAGTAATTGCTCTTCTTGTTGAATCAGTGAAAGAACTTTCAGCTGAGGTCAAAGGTCTTAAAGCCGAAATTGAAGAACTTAAATCTAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
27525006f3d760dfc66222f2ac275e8ea3c38aa77d243eb990bb83e5e80420f4
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6657
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50