Protein

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Genbank accession
QHR74191.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHIRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKAFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYSRLAANNTFRGTQNILSDNETIIVKNITQGMPLYIRGQDADGTNRWYLGNDNKGTDNLVLKNVKSGAYVAILGSLITVNKSIQITGQVQPSDWSNLDTRYFTQTAANQRFAQLVGNNTFRGINNFVGEFNITRDNAVLVVKNATAATGLYLLGQKADGTNKFYLGTDDSDSVVNLHNYITSTTISLSNVITTTKTVKITGQVQPSDWTNIDSRYISAGTLSNLAKLSDVNTFRIAQIINQNGSLLQLKNTTQDKELYFAGHNADGVRRWYIGNGEPSNPERFIIHNDRTATTIYMQDDFLLNKTVKITGQVQPSDWSNLDARYFTQAAANQRFMYAGSTGEATEQNADGVAWNAKTGLYNVTSTNADYTALVFQMYQGVTSSTACAQLKFQYKNGGMWYRTSVASKGFEAKWSKVYTEAQKPTPSELGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKNTNTTGAHAHSVSGSTSSAGNHNHSISWIGQNSKHYSGGGGGSIGVGPGYTDANGAHTHSVSGTAASAGNHAHSVGIGAHTHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:784 AA
molecular weight: 84659,76570 Da
isoelectric point:8,74999
aromaticity:0,08801
hydropathy:-0,40179

Domains

Domains [InterPro]
DC_0032
ATT
1–270
DC_0032 G3DSA:6.20.80.10 DC_1993
G3DSA:6.20.80.10
STR
159–219
G3DSA:6.20.80.10 DC_1993 G3DSA:6.20.80.10 IPR051934
IPR048388
ATT
160–248
IPR048388 IPR048388 IPR048388 IPR022246 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003
QHR74191.1
1 784
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-361 | STR 362-381 | ATT 382-474 | STR 475-780 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage bumzen
[NCBI] 		2696388 Uroviricota > Caudoviricetes > Andersonviridae > Felixounavirus > Felixounavirus bumzen
Host Escherichia coli K-12
[NCBI] 		83333 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR74191.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850635.1 [NCBI]
CDS location
range 27945 -> 30299
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGACGACCTCCTTCATATCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCGTCTTTTAAACTAGAAAGATTTGTCCAGATTGCTGGTAGCACTATGACGGGTGACTTAGGAATTGTCAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTATTTGACCCTACAGGTTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGGCTTTTAAAATCAATGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACTGTTTATCATACTCTTAATAAGCCAAGTCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATACTCAAGATTGGCTGCAAATAACACCTTTAGAGGTACTCAAAATATTCTATCTGATAATGAAACTATTATTGTTAAGAATATTACACAAGGAATGCCGCTGTATATTCGCGGTCAAGATGCAGATGGTACTAACAGGTGGTATCTAGGTAATGATAACAAAGGTACAGACAATCTTGTTTTAAAAAATGTTAAATCTGGTGCATATGTAGCTATTTTGGGTAGCTTAATCACTGTGAACAAATCTATCCAGATTACTGGTCAAGTTCAACCTTCTGATTGGTCTAACTTAGATACTAGATACTTTACTCAGACAGCAGCTAATCAGAGATTTGCACAGCTAGTTGGTAATAACACCTTCAGGGGTATTAACAATTTTGTAGGAGAGTTCAATATCACCAGAGATAACGCTGTGCTAGTCGTTAAGAATGCCACTGCTGCAACTGGACTGTACTTGCTGGGGCAGAAGGCTGATGGGACAAACAAGTTCTACTTAGGGACTGATGACTCTGATTCTGTAGTTAATCTACATAACTACATCACAAGCACAACCATCTCTTTGTCAAATGTGATTACCACTACTAAGACTGTGAAAATCACTGGACAAGTTCAACCTTCAGATTGGACTAACATTGACTCTAGATACATCTCAGCAGGAACTTTGAGTAATCTTGCTAAGTTAAGTGATGTAAACACTTTTAGGATTGCACAGATTATTAATCAGAATGGTTCATTGTTACAGCTAAAGAATACTACACAAGACAAAGAGCTATACTTTGCTGGTCATAATGCTGATGGTGTTAGAAGGTGGTACATTGGGAATGGGGAACCATCCAACCCAGAAAGATTTATTATCCATAACGACAGAACTGCAACTACGATTTATATGCAAGATGATTTCTTGCTGAATAAAACTGTTAAAATTACTGGTCAAGTTCAACCATCTGATTGGTCTAACTTAGATGCTAGATACTTCACTCAGGCAGCAGCTAATCAGAGATTTATGTATGCAGGTTCTACAGGAGAAGCTACAGAGCAGAATGCAGATGGTGTGGCATGGAACGCTAAAACAGGCTTATATAATGTAACCTCAACAAATGCTGATTACACAGCACTTGTGTTTCAAATGTATCAGGGGGTGACCTCTTCTACTGCCTGTGCGCAATTAAAGTTCCAGTATAAAAACGGTGGAATGTGGTACAGAACATCTGTAGCTAGTAAAGGTTTTGAAGCTAAGTGGTCTAAGGTTTACACAGAGGCTCAGAAACCAACCCCTTCAGAGCTTGGTGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTTAATAAAATCTACCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTACCTTAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGAATTGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACAGGTGGTTCAGACTCTGTGACGTTAGCTGTTGGTAACTTACCATCACACACTCACAGTTTTTCTGCTACCACTTCATCTTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACGCTCACTCTGTAAGTGGCTCTACTTCATCTGCTGGTAACCACAACCATTCCATTTCGTGGATTGGTCAGAACTCTAAACACTACTCTGGTGGTGGTGGTGGTAGTATTGGTGTAGGACCGGGTTACACCGATGCTAACGGTGCTCACACCCACTCTGTAAGTGGTACTGCCGCTTCTGCTGGTAACCATGCTCACAGTGTAGGTATCGGTGCTCACACCCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
cdbab6ec7ef7ddf20023e0e3da6e677c219aff5a69bbb9bed5a364e32ca24fae
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6913
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. 2020 — GenBank