Protein

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Genbank accession
XVB83299.1 [GenBank]
Protein name
minor head protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,52
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,87
Protein sequence
MIHVLDFNSKIIDFISSDDIAVTRAEYTRNKQDKSELLNIEILSERAEHFKKRNRVIIQDKTNAYREFIINRIEESGDILEVECDPSYVEDIGKAKPIPTGNFTKTTVNEALSEILRDSGWVEGLCEYGGIKSMSWTSVRTPYEMISQLTTTYKLEPDYEIEIDGNEVVKRKVNMLEPKPLFKGKEIVYGKDLISMKRTVDMTEVKTALFAFGPEKDDGTRISTVVVDDEAQQQFNLPKRYLWGIYEPESDDQDMTIERLTTLTKIELNKRNSAALSYEIEAFDLEEDYPHEIIRFGDIIRIKNTDFTPSLYAESEVIGFTHELISGELTWTFGNIVEYEEDDLLKYFRSRLKDIEKKFNDDINNVGSIITDRIDEEVERLQRKLHRGPTPPDNPEEGDFWFDTSNPNVAVLREFVNGEWKHASAHDVEQIGGLSREVIIYRQLLEATHSMSAEIANQMERTNVALSSEYLVDLDVKGKLQKALSDMLAKLQIVKNYMDSMTEETATIGRLMEWQSALVDLRNDFYYLIVALIEAEKAIQERLKYLQSQYTEEKFNEAMQNVADKFGFEYTEDGFLVGEGSLISGAIQALREDTEEQFKQVVKSVDYETDKKGIVERLNSADSAREQLDKLIKDRVTLTEYNKMKIGTRNLLLNSKERSDLFGSSTHRRIVYHLTEPLKVGQEYTLTFDMEVTSGDNFGKTTVLPYEPSNGSIDITIDNSTHNKLTFVANVPSTLLLIYSAVNSTPENDTTEIKVTDAMLVEGNKIGDYSQAPKEQEERLETMETGIEQNGIDISLRAKETDLNKTKQTLSKIAAEILVNTTTGVTLKYDENGTVSDVTVGPGGVKINANVFEINDGDVIVKDGVTTIKDAYIDKLFSKQATINYLNSVDITAKRIEAKDNKASVNIENGTITMTRADGHKLDMGINGIEMLNPDGSKRFSMDRLLVTSAALGTSNSNVYLAAQQDFEVRAVDITQIPSDGAWDSYRYVPIRADSFIGNKVMTNGGTNLYLGSDAEVRVTSRGGYNGTDTIYRDVRALGFYGNYLDSNYVTAGQNIYIRPDRGSEVRFTVRGTTDSYVDIRGGTGWLASVSHRGSNARFYIGSDNGVRITGRSLYNGGDIIWRDLAANGLYANFLEINPNTNASNLYLRANNEVRITKRNSTNSYIPIRAASATWTSSERYKYDIENWDIDVLEHLVD
Physico‐chemical
properties
protein length:1198 AA
molecular weight: 135376,90630 Da
isoelectric point:4,82759
aromaticity:0,08431
hydropathy:-0,48406

Domains

Domains [InterPro]
DC_1353
STR
1–796
DC_1353
IPR007119
Unmapped
28–330
IPR007119
IPR010572
ENZ
94–324
IPR010572
XVB83299.1
1 1198
Architecture
STR
STR 1-796 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Mammaliicoccus phage phi6229
[NCBI] 		3414231 Viruses >
Host Mammaliicoccus sciuri
[NCBI] 		1296 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XVB83299.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV389082 [NCBI]
CDS location
range 35044 -> 38640
strand +
CDS
TTGATCCATGTATTAGATTTTAATAGTAAAATAATTGATTTTATTAGCAGTGATGATATTGCTGTGACTAGAGCTGAATACACGAGAAACAAACAAGACAAAAGTGAACTTTTAAATATAGAAATCTTAAGTGAGAGAGCTGAACACTTTAAAAAGCGTAATCGTGTCATCATACAAGATAAAACCAATGCGTATCGAGAGTTCATTATCAACAGAATTGAAGAAAGTGGCGATATATTAGAAGTTGAATGTGACCCTTCTTATGTAGAAGATATCGGAAAAGCTAAGCCAATACCTACAGGTAACTTTACAAAAACGACTGTCAACGAAGCCTTATCTGAAATATTAAGAGATTCTGGTTGGGTTGAAGGTTTATGTGAATATGGCGGAATTAAATCGATGTCATGGACGTCAGTAAGAACACCATATGAAATGATAAGCCAATTAACCACAACTTATAAATTAGAGCCAGATTATGAAATAGAGATTGATGGTAATGAAGTTGTTAAAAGAAAAGTAAATATGCTTGAACCAAAGCCATTATTTAAAGGTAAGGAGATTGTATATGGTAAAGATTTAATTTCTATGAAACGTACGGTTGATATGACAGAGGTTAAAACTGCCTTATTTGCTTTTGGGCCTGAAAAAGATGACGGAACACGTATCAGTACAGTTGTAGTAGATGATGAAGCACAACAACAATTCAATTTACCAAAGCGTTATTTATGGGGTATCTATGAACCTGAATCAGATGACCAAGATATGACAATTGAAAGATTGACGACACTTACAAAAATAGAACTAAATAAACGTAACAGTGCAGCTTTAAGTTATGAAATAGAAGCGTTTGATTTAGAAGAAGACTATCCACATGAAATTATAAGGTTTGGAGATATTATCAGAATTAAGAATACTGATTTCACACCTAGTTTATATGCTGAAAGTGAAGTGATTGGCTTCACACATGAATTGATATCAGGGGAGTTAACTTGGACGTTTGGCAATATCGTTGAGTATGAAGAAGATGATTTACTTAAATATTTTAGAAGTCGTCTAAAAGATATAGAGAAGAAATTTAATGACGATATAAACAATGTTGGCTCAATCATTACAGATCGTATTGATGAAGAAGTTGAACGTCTACAAAGGAAACTACATCGTGGGCCAACACCACCTGATAATCCTGAAGAAGGTGATTTTTGGTTTGACACATCAAATCCAAATGTAGCTGTTTTAAGAGAGTTTGTAAATGGCGAATGGAAACATGCTTCGGCACATGATGTGGAGCAAATCGGTGGTTTAAGCAGAGAAGTCATTATTTATAGACAATTATTAGAAGCTACACATTCAATGAGTGCTGAAATAGCTAATCAGATGGAAAGAACTAATGTTGCATTAAGCTCAGAGTATCTCGTTGATTTAGATGTTAAAGGTAAATTGCAAAAAGCTTTAAGTGATATGCTGGCGAAATTACAAATCGTTAAAAATTACATGGATAGCATGACTGAAGAAACTGCCACTATTGGTAGACTAATGGAATGGCAAAGCGCATTAGTAGACTTGAGAAATGACTTTTATTATCTAATCGTGGCGCTAATCGAAGCAGAGAAAGCTATTCAAGAACGTTTGAAATACTTACAATCACAATACACAGAAGAAAAATTCAATGAAGCCATGCAAAATGTAGCTGATAAATTTGGGTTTGAATATACAGAAGATGGTTTTCTTGTTGGAGAGGGTTCTTTAATCAGCGGTGCTATTCAAGCATTACGAGAAGATACCGAAGAACAATTTAAACAAGTAGTGAAAAGTGTTGATTATGAAACAGATAAGAAAGGTATTGTTGAACGTTTAAATAGTGCAGATAGCGCAAGAGAACAATTAGATAAATTGATAAAAGACCGTGTAACTTTGACCGAATACAACAAGATGAAAATAGGTACACGTAACTTATTGTTGAATAGTAAAGAACGTTCGGATTTATTTGGAAGTTCCACGCATAGAAGAATTGTTTACCATTTAACAGAGCCTTTAAAAGTTGGGCAAGAGTATACATTAACATTCGATATGGAAGTTACAAGTGGAGATAATTTTGGGAAAACAACTGTATTGCCATATGAACCGAGTAATGGATCAATAGATATAACAATTGATAATAGCACCCATAATAAACTTACTTTTGTAGCAAATGTTCCAAGTACACTTTTATTGATTTATTCAGCGGTTAATTCAACACCAGAGAATGACACAACTGAAATTAAAGTTACAGACGCAATGCTAGTTGAAGGGAATAAGATTGGCGATTATTCACAGGCACCAAAAGAACAAGAAGAACGTCTTGAAACAATGGAAACAGGCATTGAACAAAATGGTATAGACATATCCTTAAGAGCCAAAGAAACAGACTTGAACAAGACAAAACAAACGCTATCTAAAATTGCAGCCGAAATTTTAGTGAACACGACAACAGGCGTGACATTAAAGTATGACGAAAATGGTACGGTTAGTGATGTTACAGTTGGACCAGGTGGCGTTAAAATTAATGCCAATGTATTTGAAATTAATGATGGAGATGTCATTGTTAAAGATGGTGTCACAACAATTAAGGACGCTTATATAGATAAACTATTCTCTAAACAAGCGACTATCAATTACTTAAACAGTGTTGATATTACCGCAAAACGTATTGAGGCGAAAGACAATAAAGCGTCAGTAAATATTGAAAATGGCACTATAACTATGACTAGAGCAGATGGTCATAAACTTGATATGGGTATCAATGGTATTGAGATGTTAAACCCCGATGGGTCTAAACGTTTTAGTATGGATAGATTATTGGTTACAAGTGCAGCATTAGGAACATCTAATTCCAATGTGTATTTAGCAGCTCAACAAGACTTTGAAGTTCGAGCAGTTGACATTACACAAATACCAAGTGACGGTGCGTGGGATAGTTATCGCTATGTACCCATTAGAGCAGATAGTTTTATAGGTAATAAGGTTATGACTAATGGAGGTACTAATCTTTACTTGGGCAGTGATGCAGAAGTACGTGTGACATCTCGTGGTGGATATAATGGTACAGATACGATTTATAGAGATGTTAGAGCATTAGGTTTTTATGGTAATTATTTAGATTCAAACTATGTCACAGCGGGCCAAAATATTTATATTCGACCTGACAGAGGCTCAGAGGTGAGGTTTACTGTTAGAGGTACGACAGATAGCTATGTTGATATAAGAGGTGGTACGGGTTGGCTAGCATCAGTATCTCATCGAGGTTCAAACGCTCGCTTTTATATCGGAAGTGATAATGGCGTTAGAATCACTGGACGTTCTCTATATAATGGTGGGGATATTATTTGGCGCGACTTAGCTGCCAATGGACTATATGCAAATTTCTTGGAAATCAATCCGAATACAAACGCCTCTAATTTATATTTAAGAGCGAATAACGAAGTCCGTATTACAAAGCGGAATTCCACTAATTCATATATACCTATTAGAGCAGCAAGTGCAACGTGGACGTCCTCTGAACGTTATAAATATGATATTGAGAATTGGGATATAGATGTATTAGAACATTTGGTTGATTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
f8417e495d8704e3da69bc62c604ac88b456d70b72d3f8185c752df97e2fb12f
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7582
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Characterisation of phylogenetically distinct temperate phages from Kenyan Mammaliicoccus sciuri Cherbuin,J.D.R. 2025-12-01 — GenBank