Phage RBP Database

Genbank accession

UQT03345.1 [GenBank]

Protein name

tail fiber protein

RBP type

TF

Evidence Phold

Probability 1,00

Protein sequence

MASDNFDMDWGDDPFAGDIDFDMDFDMDPFKGKGFIRSLTTGFLQGAVDETLGSGAARMRTLRTILPSSYSNALDKLSFVSSRVDDLVREFKEENAESAKSLQSIASHLNQRMGSKLPGFAQNALGNFSDKDFSMWERLDPENPNFKTRIDGVNEDDVDQAIDASVMAQSSMFASLGESINSMAASVGGQLSATIGAGNRQLVNIEGGIRDLLSYQRNVQAKLDQAQLNLMARSYVQDAKFYKFMEAGIHAEVAELKRIVQYTKLSDFEKTSNLTASKAYMRNSVFNAVGKRVGGITGMLRDRFNTDSRKETYGVVGDLLGNLADGLEMGSDVGFSRGLLGNIIGKMVAGVAVDQLPYFFTRGPGKRAVDSLIRKYPEQGAFIKDQIAKVTDMGNTVSHIAMSGTGIANYMADNWQPLDEMRFYDYEEYVDSLPPGRKPLPKAVWAAKNAAENKAKQSLNRLMSETTRSRGTQYTINRRNPKDLDKPGIWKEMNNITLNEVLPGLISQTNLILEKMRTGRDDVESVGYNYTRGQFQKDSDRRISVASDLMPHSEFRSFTSAALNMVDSLDPDKMLSPGARKALAKQIVVDVDKEYGFQPLYYLGDIPGVSPENLKEIHAVMKRHFGITDSEVQQFQSGDGMTRTKMLGRLGTAEGRERLNAASSQAQDLKANIPNIAERINLLRATGNEQMLRDLGVIYTDNGIDRINIQAFHDRIGQYMDNPDNPVLKGATPSGNGPTPTLGGLRAGAGPTVNPYEDLNNTLGTLNERLSNLDQLRSSTTVNWDSQSGVFSDIKTSNQGILDKTTEMSMLLTTLLDLAKAGKLFSGAPGPREERQEETAKRSVLDRVKKLVPENILGRSAEFLMKNNPLILGGLLGGVASSFMQNPIMAASVAGLGLLGGAYLQHRQKSGAAPDGDMPSDDEDIIDESGEPILKASKLRMGDYMDMATKKIIKTWEDIRGPIMDVTTKTVIGARELAGKIFGPDGRAVALKGLRAVRDAAVGAYNLVNPMDRIRSTIQMGKEFMYQQDVYLKSDLKNPVLRASKFKAGDYFVRDDNGSFKPISGWNEIDGAVYDNQGNQLVSEEEYQSGLVTASGAAVRNVGGMAANMVGGAAGLVKSGINNLLGRFGYTQGPNAGPGGNGPNKTGPNGVERRLDKIYRLLCKQFDIPGEVDPDEPLGVTGEPSTGGMRLNSLAWKEKEAEKKEKHRVNEAIINISETLGGSKDEKGPKKEGNGLFDKLKGLIMGAGGFAVKLFKNPLGAIGDVLGGLGKFAIGTTAASIKRLGKIGTALFSGVLGLASPIYKLLKTGFVKLAQAFVMGKAAGGGLKGLLGRGSPVDDLDVEQRGQAGKRKNGKVGKAGKVARGGRLARMGRMAFGSPTTAIGSYLLADMFGDDTQDATPTSGADVGIGERDSVTGHYRTQGDAVVDTLTSWLPSGMLAKAAADSLPMDKETRESANNYGIFWSSDKKFFFKRDEMEAWEDKINGISKTADGYGELKPQYATQPRAVRFAMYGCSDQQSSFGRRIGWLEQVLYPYVTIRDNRASLKNDTPIEKILTDFLNSDTGSNRDAGAVQTWFIARFKPVFLVSNAAVSVAKMGDLESFDNAKGYEVVQVLERVQQTLNTFSPNPFTIDVRVDSKYGTMGPESTRHKIDAVLKDMEKTYPKPPMAVEKIAPTVEAQAKAQAPGTPKETGPSADIIAQDAMSKIAAKASMDDIAKRFSQPEQVKTIDISDLMPGGDQEMDPFVMTRLAVYGNIDNMPWRVEAVLRLERYVESYIMVIGDQARFTGKSSQLLELFKPAFRISNQLSEMNWLTWFRDRFLPTLMTYTVEVKKLTGVIPSRGWKQLSATNRAKIARKLTEQMVTVDQQLKTVWEIAASPFPNSTSGKWSDRADKYLKILDVKAQEARLKDPELEEEKSRGTSGDDPVQLAQAARNKQVAQSAIQEVFGGNKGIGGSSFTPSMSGVRTGGPTSVYPNPTMSIEGGGAGSAGQFMGKPDANFNPEFLKKAGEDKGIKMSPEQGEKLMLNHLLKAGITDVKTIALALAMVKKETGNYQNTVENTNWSAPTLLKYFKNIPDAATAQKVAAMSPPERAMWVYGRAPKGPQLGNQSPEDGWKYRGRGFFQLTGKANYERFKKETGIDVVNNPQLVSEDPNVMAESAVRFLKNNKAMLSIAKTGDFDTAVRGINGGNSVPATDERRQYYQEYLNKLRNGDLALDGAEAEQAASTPPAPTDQPPAAADKGAPAGSPAIDTPIATPVGQNTVPDLLKADAQKSAPSNAGTPPPMQTASTFDSGVVAGDDNDGPVNTVNSSVPSKGQPSAPTSSSGPTASKPASVKEAAKPVDKQAEVKATPAPAMPDHINTTDATAASQLAIANQTLNKIAQLLERSQSNQPTVRMN

Physico‐chemical properties

protein length:	2398 AA
molecular weight:	259824,97470 Da
isoelectric point:	8,23946
aromaticity:	0,06881
hydropathy:	-0,44908

Domains [InterPro]

Domain ID	Category	Cluster	Start	End	Layer	Name	Pref Zone	Confidence	Evidence	Support
DC_0124	STR	DC_0124	1	2352	Novel HMM	DC_0124	Central	Low	Positional only	152 proteins / 152 hits
Coil	Unmapped	-	756	776	Coils	Coil	-	-	-	-
G3DSA:1.10.530.10	RBD	G3DSA:1.10.530.10	2018	2209	Merged direct domain	G3DSA:1.10.530.10	C-terminal	Low	Positional only	95 proteins / 95 hits
IPR023346	STR	IPR023346	2032	2209	Merged direct domain	Lysozyme-like domain superfamily	Central	Low	Positional only	29 proteins / 29 hits
IPR000726	ENZ	DC_0328	2112	2165	InterPro cluster	Glycoside hydrolase, family 19, catalytic	C-terminal	High	Text match	27 proteins / 27 hits

	Name	Taxonomy ID	Lineage
Phage	Serratia phage vB_SmaM-Yubaba [NCBI]	2943838	Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host	Serratia marcescens [NCBI]	615	cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession

UQT03345.1 [NCBI]

Genbank nucleotide accession

ON287375.1 [NCBI]

CDS location

range 142155 -> 149351
strand -

CDS

ATGGCAAGCGATAATTTCGATATGGATTGGGGAGATGATCCATTTGCCGGGGATATAGATTTCGATATGGACTTCGATATGGATCCCTTTAAAGGTAAGGGTTTCATCCGCAGCCTCACCACAGGTTTCCTGCAAGGTGCTGTAGATGAGACTTTAGGTTCCGGTGCTGCTCGTATGAGAACACTGAGAACTATCTTACCAAGTTCTTACAGCAATGCCCTCGATAAACTTTCATTTGTCAGTAGTCGTGTTGACGACTTAGTCAGAGAGTTTAAAGAGGAAAATGCTGAATCCGCCAAATCCTTACAAAGCATTGCTTCCCACCTCAATCAGAGAATGGGGTCAAAGCTTCCGGGTTTCGCTCAAAATGCATTAGGTAATTTCAGCGATAAAGACTTCTCCATGTGGGAACGTTTAGATCCTGAAAATCCAAACTTCAAAACCAGAATTGATGGTGTTAATGAAGACGATGTCGACCAAGCTATTGATGCTTCAGTTATGGCTCAGTCTTCAATGTTCGCCTCTTTGGGTGAATCAATTAACAGCATGGCCGCTAGTGTTGGTGGTCAACTATCAGCTACCATTGGTGCTGGTAACCGTCAACTGGTAAATATAGAAGGTGGTATTAGAGACCTTCTGAGTTATCAAAGAAACGTCCAGGCTAAGTTAGACCAGGCCCAGTTAAACTTGATGGCTCGTTCATATGTACAAGACGCTAAGTTCTATAAGTTCATGGAGGCAGGTATCCATGCTGAAGTGGCAGAACTAAAACGCATTGTTCAATATACCAAACTTTCAGACTTCGAGAAAACTAGTAACCTCACTGCATCTAAAGCGTACATGCGTAACAGTGTTTTCAATGCTGTTGGTAAACGTGTCGGTGGTATCACTGGGATGCTCCGTGATCGTTTTAATACTGATTCTCGTAAAGAGACCTATGGTGTTGTTGGGGACCTCTTAGGGAACCTTGCAGACGGCTTGGAGATGGGTAGTGATGTTGGGTTTAGTCGCGGGTTACTCGGTAATATCATCGGTAAGATGGTTGCTGGCGTAGCTGTTGATCAACTTCCCTACTTCTTTACTCGTGGTCCAGGTAAACGAGCAGTTGATTCATTGATTAGAAAGTATCCTGAACAAGGGGCCTTCATCAAAGATCAAATTGCCAAAGTTACCGATATGGGTAATACCGTTTCCCATATTGCAATGTCTGGTACAGGTATCGCCAACTACATGGCAGATAACTGGCAGCCTTTAGATGAAATGCGTTTCTACGATTATGAGGAGTATGTTGATTCATTACCTCCTGGTCGTAAGCCACTTCCTAAAGCTGTATGGGCTGCTAAGAACGCTGCAGAGAACAAAGCTAAACAATCTCTTAACCGACTGATGAGTGAGACCACACGTTCACGTGGGACTCAATACACCATCAATCGTCGTAATCCTAAAGACTTGGATAAACCAGGTATTTGGAAAGAGATGAACAACATCACGTTGAATGAAGTCCTTCCAGGATTGATTTCTCAAACCAACCTTATCTTGGAAAAGATGAGAACTGGTCGAGATGATGTTGAGTCAGTTGGTTATAACTATACTCGTGGTCAATTCCAGAAAGACTCCGATCGTAGAATCTCTGTTGCATCTGATTTGATGCCTCATTCAGAGTTCCGTAGCTTTACATCTGCTGCTTTGAATATGGTTGACTCTTTAGACCCTGATAAAATGCTGTCACCAGGCGCTCGTAAAGCTCTGGCAAAACAGATCGTTGTCGATGTGGATAAAGAGTATGGATTCCAACCACTTTATTACTTAGGTGACATTCCAGGTGTTTCTCCAGAAAACCTGAAAGAGATCCATGCAGTAATGAAACGTCACTTTGGAATCACTGATTCTGAAGTTCAACAGTTCCAGTCTGGCGATGGAATGACCAGAACCAAGATGCTTGGTCGTTTAGGGACTGCTGAAGGTCGTGAACGTTTAAATGCTGCAAGTTCCCAAGCACAGGACTTGAAAGCTAACATTCCTAATATCGCTGAACGTATTAATCTGTTACGTGCTACTGGTAACGAACAGATGCTTCGCGACTTAGGGGTTATCTATACCGATAATGGTATCGATCGAATTAATATCCAGGCATTCCATGATCGTATTGGTCAGTACATGGATAACCCAGATAACCCTGTACTGAAAGGTGCGACCCCTAGCGGTAATGGTCCTACCCCAACACTGGGTGGATTACGAGCTGGAGCAGGTCCGACTGTTAATCCTTACGAAGATCTGAACAATACCTTAGGAACGTTGAATGAAAGACTAAGTAATCTTGACCAACTTAGATCTTCTACAACTGTTAATTGGGATTCTCAGTCTGGTGTCTTTAGTGACATCAAAACAAGTAATCAGGGTATCCTTGATAAGACGACAGAAATGTCCATGCTTCTCACTACCCTACTTGATTTAGCCAAAGCAGGTAAACTATTCTCAGGTGCTCCTGGTCCTCGTGAAGAGAGACAAGAAGAAACTGCTAAGCGTTCTGTTCTGGATAGAGTCAAGAAACTGGTTCCAGAAAACATCCTGGGTAGATCTGCCGAATTCCTCATGAAGAATAACCCACTTATTCTGGGTGGCTTATTAGGTGGTGTTGCATCATCATTCATGCAGAATCCAATCATGGCTGCTTCTGTGGCTGGATTAGGTTTACTGGGCGGTGCTTATTTACAACACCGTCAGAAGTCCGGTGCTGCTCCTGATGGGGACATGCCAAGTGATGATGAAGATATCATTGACGAGTCTGGCGAACCTATTCTGAAAGCTTCTAAGCTGAGAATGGGCGACTACATGGATATGGCTACCAAGAAGATCATTAAAACTTGGGAAGATATTCGTGGTCCAATTATGGATGTTACAACTAAGACTGTAATTGGGGCTAGAGAGCTTGCTGGTAAGATCTTTGGACCAGATGGTAGAGCAGTGGCACTTAAGGGTCTTCGTGCTGTTAGAGACGCTGCTGTGGGCGCATACAACCTCGTTAACCCGATGGATCGTATTAGATCAACTATCCAGATGGGTAAGGAGTTCATGTATCAACAGGATGTTTATCTCAAATCGGATTTAAAGAATCCTGTTCTGAGAGCATCTAAGTTTAAAGCCGGTGATTACTTCGTTCGTGATGACAATGGTAGTTTCAAACCAATCTCTGGCTGGAATGAGATTGATGGAGCTGTTTATGATAACCAAGGTAATCAACTGGTTAGTGAAGAGGAATATCAGTCCGGTCTGGTCACTGCCTCAGGTGCTGCTGTACGTAATGTGGGCGGCATGGCTGCTAATATGGTTGGCGGTGCAGCGGGGTTGGTTAAATCTGGAATCAATAACCTCCTCGGAAGGTTTGGGTATACTCAAGGCCCTAATGCAGGTCCTGGGGGAAATGGTCCAAACAAAACTGGTCCAAATGGGGTGGAGCGTCGTCTAGATAAAATCTATCGCCTATTGTGCAAACAGTTTGATATCCCAGGTGAAGTAGATCCAGATGAACCGTTAGGTGTAACTGGTGAACCTTCAACAGGTGGAATGCGTTTAAACTCCTTGGCTTGGAAAGAAAAAGAAGCTGAGAAGAAAGAGAAGCATCGTGTAAATGAAGCCATCATCAACATCTCTGAAACCCTTGGTGGAAGTAAAGATGAAAAAGGACCTAAGAAAGAAGGCAACGGTTTATTTGATAAACTGAAAGGCTTGATCATGGGTGCCGGTGGCTTTGCTGTCAAACTGTTTAAGAATCCTCTTGGCGCCATTGGGGATGTACTCGGTGGTCTTGGTAAGTTCGCAATCGGAACTACTGCGGCTTCTATTAAGCGTCTAGGTAAAATCGGCACTGCATTGTTCTCAGGTGTTCTCGGTTTAGCTTCACCTATTTATAAACTTCTGAAGACTGGCTTTGTTAAACTTGCTCAAGCATTCGTGATGGGCAAAGCAGCAGGCGGTGGTCTGAAAGGTTTACTGGGTAGAGGTTCTCCTGTAGATGATCTCGATGTAGAACAACGTGGTCAAGCCGGTAAACGTAAGAATGGTAAAGTAGGCAAAGCTGGTAAAGTTGCTCGTGGTGGTCGTTTAGCAAGAATGGGAAGAATGGCCTTTGGGTCACCTACTACTGCCATTGGTAGCTATCTGCTTGCTGATATGTTTGGTGACGATACCCAAGATGCAACACCAACCTCTGGGGCTGATGTTGGCATAGGGGAACGTGATTCAGTAACAGGACATTATCGTACTCAAGGTGATGCTGTTGTTGATACATTAACCTCTTGGCTTCCTTCCGGTATGTTGGCTAAAGCTGCTGCTGATTCTCTTCCTATGGATAAAGAAACCAGAGAGAGTGCTAACAACTACGGGATTTTCTGGTCTAGTGATAAGAAGTTCTTCTTTAAACGTGATGAGATGGAAGCTTGGGAAGATAAGATCAATGGCATCTCTAAAACAGCAGACGGCTACGGTGAACTGAAACCTCAGTACGCTACTCAACCTCGTGCTGTTCGCTTTGCTATGTATGGTTGTTCTGATCAACAATCTTCCTTTGGTAGACGTATTGGTTGGTTGGAGCAAGTCCTCTATCCTTACGTGACTATTCGTGATAATAGAGCTTCGTTGAAGAACGATACTCCGATTGAAAAGATCCTGACTGATTTCTTGAATTCGGATACAGGTTCTAATCGCGACGCAGGTGCAGTGCAAACTTGGTTTATTGCTCGTTTCAAACCAGTCTTCCTTGTTTCTAATGCGGCAGTCTCTGTTGCTAAGATGGGAGACCTGGAGTCGTTTGATAATGCCAAGGGCTATGAAGTTGTACAGGTATTGGAACGAGTTCAACAGACTCTAAATACATTCTCCCCTAATCCATTCACTATTGATGTTCGTGTGGATTCGAAGTACGGGACAATGGGTCCAGAATCTACGAGACACAAAATCGATGCAGTTCTCAAGGATATGGAGAAAACTTATCCTAAGCCACC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Protein

Domains

Domains [InterPro]

Domains [InterPro]

Taxonomy

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

Predicted Aligned Error (PAE)

Model Confidence