Protein

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Genbank accession
UVD42683.1 [GenBank]
Protein name
autotransporter adhesin
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MPHLKAYDKYGNILAIGYNVELHEEVGSVIIPNLTPHTHYPQGEFYVSWEAEKYETDKVVVPGFTTLESSFKEITLYFKDHILVNAKSAYDVAVDNGFVGSEEEWVKSIKGEKGEEGEQGKQGLSAYEVAVNNGFTGSATDWLKTGKSPYVYSNEYIKQKDDTSDVQRLRRAIKDTSEGNTLHIPSSESPIKIDDTLIIDKNINIVSDAKIVYNGSKDKPAIKLDSLSYSNVTIKGIYDDSSYPTYGGGYHGFKSQNYIGLELVNCRNVNTNINEIIGFTVGNKHKATGGKGHWFNNTIINFFINNETHIELNTDGIGSNGEQSWMNSNYFYKSAFSYSGTEFNKHPNTYYNIKQTLTNGNTYGGNSNIFDSLKFETASTTSENYVMVYIKKAVGFIFKNYRFEFNNKATFAVVDLETQDMTKSYVTHSKDIKFIPEFVLGNGHKLTFTNNNTAKIPRSSIAKIVDEYKTTLLYKNNDFSKDYRRLGGNYHTVKNVFRKPLQSTSLTDEVSYDYSTTPSLVDNKGLLTFTGSYPMALYVNNVSVGDELIINKLSFIGNSSGIFIKCFDKDGNILDKISNNYDTILLDGYYNDKYKAFTFNNTQKDTFTVNSEDVKSIVILISGTMQGLLVASTNPSNIIKSSNDSSKNKTDVFYSHVKPSSVEDFKYDEKVYNNGTTQAYGWVLKGNDWKELGKDTNSKSKVIVNIEDYPRINDEDNDYPRFQRALDYLTSTKGGTLIVPKGNEDYLFKTKTPTVQNPSRVKVTGSNIYIKGEGNPTFIMSGITKNYLDSIDDVSSSGRDMFTGFSFINCDNILVEGLTFKGEWDGKGEFRYASPRSIGIAFKGSRNCKAYNVHGYNIMGNVVNAVNTMQAVDGVYGYSDNITIDSCSATQCLENGFNFMGGTKNGYYVNNISTGNGSSGFESGTENVIISNNIHTNNKYSGLSISGTNYTITSNVIYGNSNKGELSNKPSNGIAITGGSKGIISNNNLSGNEGYELYLYPGVNNIDIQNNVLKQDTTSLKTSIIYVSGTTSKPVSEINFKNNTLRSTNTSLDKAIFLNFVMDSTITNNYIKTDKGNDSLSVQGSCSNLFVLNNNMNKNLSISSNAFNVISKDNIAYNLPKVLNGTAIPTTGSWRLGDIVVNTSRTLTSGSPEKWRCTSDGVATNMKWTSNTDYTQGQIVYNGNYVYKAVASGTSGGTQPTHNNGVISDGSILWEFISTKANFEVVSQIGVTESINSTPLYKGQIAVVGSSVYIAKGTSSNTDWIFLN
Physico‐chemical
properties
protein length:1268 AA
molecular weight: 140189,06870 Da
isoelectric point:6,20531
aromaticity:0,11120
hydropathy:-0,46412

Domains

Domains [InterPro]
DC_0876
STR
6–1075
DC_0876 G3DSA:2.10.10.20
IPR006626
Unmapped
545–566
IPR006626 IPR012334 IPR006626
IPR011050
STR
704–1097
IPR011050
IPR006626
Unmapped
810–844
IPR006626 IPR006626 IPR006626 IPR006626 IPR006626 DC_0276
IPR039448
ENZ
925–1049
IPR039448
UVD42683.1
1 1268
Architecture
STR
RBD
ATT
RBD
STR 6-1097 | RBD 1098-1165 | ATT 1166-1224 | RBD 1225-1268
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
UVD42683.1
1 1268
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 166 166 0,9856
Central domain 167 489 324 0,9703
C-terminal 490 1268 778 0,2640
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-166
Central
167-489
C-terminal
490-1268

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage vB_SauM-V1SA22
[NCBI] 		2972387 No lineage information
Host Staphylococcus aureus
[NCBI] 		1280 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UVD42683.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
ON814136 [NCBI]
CDS location
range 81922 -> 85728
strand +
CDS
ATGCCTCATTTAAAAGCATATGATAAATACGGTAATATATTGGCAATAGGTTACAATGTAGAGTTACATGAAGAAGTAGGGTCTGTAATCATACCTAACTTAACTCCTCACACACATTACCCTCAAGGTGAGTTCTATGTATCATGGGAAGCTGAAAAATATGAAACCGATAAAGTAGTAGTTCCTGGTTTTACAACCCTAGAATCATCGTTCAAAGAAATAACATTATATTTTAAAGACCATATACTTGTAAATGCTAAATCTGCTTATGATGTAGCGGTAGATAATGGTTTTGTCGGTTCTGAAGAAGAATGGGTTAAGTCTATTAAAGGAGAAAAAGGAGAGGAAGGGGAACAAGGTAAGCAAGGTTTAAGTGCTTATGAAGTAGCTGTAAATAACGGTTTTACAGGTTCAGCTACAGATTGGCTTAAAACAGGTAAAAGTCCTTATGTATACTCTAACGAGTATATAAAGCAAAAAGATGATACTTCGGATGTTCAAAGGTTAAGACGTGCTATTAAAGATACAAGTGAAGGTAATACCCTACACATTCCTTCTAGTGAATCACCTATTAAAATAGATGATACTTTGATAATAGATAAGAATATTAATATTGTATCTGATGCTAAGATTGTTTATAATGGTAGTAAGGATAAACCAGCTATTAAACTAGATAGTTTATCATATTCTAATGTTACAATTAAAGGTATTTATGATGATAGTTCTTATCCAACTTATGGTGGAGGCTATCATGGTTTTAAGAGTCAAAACTATATAGGACTAGAATTAGTTAACTGTAGAAATGTTAATACTAATATTAATGAAATTATTGGTTTTACAGTCGGTAATAAACATAAAGCTACTGGTGGTAAAGGTCATTGGTTTAATAATACTATTATTAATTTCTTTATTAATAATGAAACACATATAGAATTAAATACAGATGGTATAGGTTCTAATGGTGAGCAATCTTGGATGAATAGTAATTACTTCTATAAATCAGCTTTTTCATATAGTGGCACCGAGTTTAATAAACACCCTAACACATACTATAACATCAAACAAACTCTAACAAATGGTAATACCTATGGAGGAAATAGCAATATATTCGATTCACTTAAATTTGAAACTGCTTCCACAACATCTGAAAATTATGTTATGGTTTATATTAAGAAAGCAGTAGGATTTATATTTAAGAATTACAGATTTGAATTTAATAACAAAGCTACTTTTGCGGTTGTTGATTTAGAAACTCAAGATATGACAAAATCTTATGTAACACATAGTAAAGATATTAAGTTTATTCCTGAATTTGTTTTAGGTAATGGACATAAATTAACTTTTACAAATAATAATACTGCTAAAATACCTAGAAGTAGTATTGCTAAAATAGTAGACGAATACAAAACAACATTATTGTATAAAAATAATGATTTTAGCAAAGACTATAGAAGATTAGGAGGTAACTATCACACAGTCAAAAATGTATTTAGAAAACCATTACAGTCAACTTCTCTAACAGATGAAGTATCTTATGACTACAGTACTACACCTAGTTTAGTAGATAATAAAGGATTACTTACCTTTACAGGCTCGTACCCTATGGCTTTATATGTTAATAATGTTAGTGTTGGTGACGAGTTAATTATTAACAAGTTATCATTTATAGGTAATTCTAGTGGTATATTTATTAAATGTTTTGATAAAGACGGTAATATATTAGACAAAATATCTAATAATTATGATACAATATTACTGGATGGTTATTATAACGATAAATATAAAGCGTTCACTTTCAATAACACCCAAAAAGATACTTTTACTGTTAATAGTGAAGATGTTAAGTCTATCGTTATTTTAATATCTGGAACTATGCAAGGTTTACTTGTAGCTTCAACTAATCCATCTAATATTATTAAGTCTTCAAACGATAGTAGCAAGAATAAAACTGATGTTTTTTATTCTCATGTTAAACCTTCTAGTGTTGAAGATTTTAAATATGATGAAAAGGTATATAACAATGGTACAACACAAGCATATGGTTGGGTACTAAAAGGTAATGATTGGAAAGAACTAGGTAAAGATACTAATTCTAAGAGTAAAGTAATAGTTAATATAGAAGATTACCCAAGAATTAATGATGAAGATAATGACTACCCTAGATTCCAAAGAGCTTTAGATTATTTAACAAGTACTAAAGGTGGTACTCTTATAGTACCTAAAGGAAATGAAGATTATTTATTCAAAACTAAGACACCTACTGTACAAAACCCATCACGTGTAAAAGTAACAGGAAGTAATATATACATTAAAGGTGAAGGTAATCCTACATTTATTATGTCAGGAATCACTAAAAACTATCTAGACTCTATAGATGATGTTTCTTCTAGTGGTAGAGATATGTTTACAGGATTCTCATTTATCAACTGTGATAACATTCTTGTAGAAGGATTAACATTTAAAGGGGAATGGGATGGTAAAGGTGAATTTAGATATGCGTCACCTCGTTCTATTGGAATAGCATTTAAAGGAAGTAGAAACTGTAAAGCATATAATGTACATGGTTATAATATTATGGGTAACGTTGTAAATGCAGTAAACACTATGCAAGCGGTAGATGGTGTTTATGGTTACTCAGATAACATTACTATAGACAGTTGCTCAGCTACACAATGTTTAGAGAATGGTTTTAACTTTATGGGTGGTACTAAAAATGGATATTATGTTAATAATATATCTACAGGAAATGGTTCAAGTGGATTCGAATCAGGAACAGAAAATGTTATTATAAGTAATAACATACACACAAATAATAAGTACTCAGGACTGAGCATATCAGGTACTAATTATACAATTACTAGTAACGTAATTTATGGTAATAGTAATAAAGGAGAGTTAAGTAATAAACCATCTAATGGTATTGCTATTACAGGAGGCAGTAAAGGTATTATAAGTAATAATAACTTATCAGGTAATGAGGGTTACGAGTTGTACCTTTATCCAGGAGTTAATAACATAGATATACAAAATAATGTATTAAAACAAGATACAACAAGTTTAAAAACAAGTATTATTTATGTTTCAGGAACAACTAGTAAACCTGTGTCAGAAATTAACTTTAAAAATAATACATTAAGAAGTACAAATACTTCTTTGGATAAAGCTATATTCTTAAATTTTGTTATGGATAGTACAATTACTAATAATTATATAAAAACAGATAAAGGTAATGATTCATTAAGTGTTCAAGGTTCTTGTAGTAATTTATTCGTATTAAATAACAATATGAATAAAAACTTAAGTATTTCTAGTAATGCATTTAATGTTATAAGTAAGGATAACATAGCTTATAATTTACCTAAAGTACTGAACGGTACTGCAATACCAACGACAGGAAGTTGGAGACTGGGAGATATTGTTGTTAATACTAGTAGAACCCTAACATCAGGTAGTCCTGAGAAATGGAGATGTACTAGTGATGGAGTTGCTACTAATATGAAGTGGACATCTAACACGGATTATACACAAGGTCAAATTGTTTATAATGGGAATTATGTATATAAAGCAGTAGCTTCAGGTACAAGTGGTGGAACACAACCTACTCATAATAACGGTGTTATATCAGATGGTTCTATACTTTGGGAATTTATATCTACAAAAGCTAATTTTGAAGTTGTAAGTCAAATAGGTGTAACAGAAAGTATTAACAGCACACCTTTATACAAAGGTCAAATTGCTGTAGTAGGCTCATCTGTATATATAGCTAAAGGTACATCAAGCAATACTGATTGGATATTTTTAAATTAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
6fadcee123e09c6646877a90ce11b581fdb463df9d54ec50d37cc2d966dc4b94
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2639
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50