Protein
View in Explore- Genbank accession
- ATN94735.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MAKKVTLPKGQTGATGTTLGQAGNILDLSDIDDIFGDTPKAKKGSPVTEFFNGIKQGLFDSVKPQQALKAFMRSAAPDGFSRMFGVYEDTMSTIRDVKDSVERTSASDLLFLTREAQDLAVKLKDKVPASVFDRLNNRLESQIENYKYAEDSNRNYKEIRRRMEAERDEDELKSAIDQVTLVQRDLAIKAEQGEVKRFAIGQAERGIRDKVSADRFDWMAKAMGQTVDNLSKLASYNEQVNYSIQKKGLEIQFRSMLHLRKIAQQTEATMELLNNGFAALVRNTGIPDHKKSSMKDLVGFNAAQRVSNSFVDNAIQTLPNFLGNFGSAVTNNATRFANENIRNFADAARAGNMFGADAWENRYNIAGQFAGSYLGDWTRNSVIPVLGRMVRPGVERFSNNYLGGRHNQASYLLDNFPAWTQEYMNNYQNTYGARGILRDIMAPFIPQFTLQDRLKTGSYQTIGQDSGFNQLTQRTIVEAIPGYLSRLLQETRMIRTGRDDITREVFDLSTGSFMSVEDSAANTERRLVSRSTVRGVSGALTDVLEAFDPNKELSIDARKALTERLIRDANMNKRFDPEAYARAGGYDRSKVSGEAIKELTEYIKRQYNIGADGRMASTNENFARRQEISTLFLDVRNFSRDPIKEIERLTNAGKTDQLREMGIIITEQGIDRINYPRIWELMSSEVKYEGWGNDNPFDRYSDTPPSDNGGPEQLSPLGDQNNPHFIGPMYQSQTERKMRQAQEQVIRASKLAQEQANKGYDYAQQKVSLATDYVRDNVPNQFSELRRNVNIPASMNFGDLRDQLYGQAGDMYSRAVNYSNQLNGYSDIINQSIADLYTKANTFTPVIKGMDFLNGNLIDINTGKIVEKISDITGEIKNQAGITVVTAQEVATGLYNQRGDLLTKATDIASQLRDKAAQIAGDARERLTQGLDNVSDMAKDWYIPGREEAVILGRDLLAGEYIDTATNQIITNLKDAKGTIINRAGDVVVTAQELAKGLIRSDGFNLRRNIADTSNWIQRNVLGGGSTTQKIFNAMGTVANKAKDFTIGLGKDILSNRDAYLPGMLKPVLQKVKLKAGEYYTTAGNLLKSFDEINGPVLDRDGNIVVDEEQISELINSDGSKHTAAKSKGLFRTGLGNLARGYANMSMRYWKWLGKKSVDTAKGMAGLGYKLLGSPFKKRFSAFTGKVETQIDKKALDTTTDQLLAGIWEELRNQKPDANKPRRGSWQDLTSRVSDTLNGKNNGDEETTESKGLFGKLGDTLKNIFGKKKGDEEDEGLLEDLGLGGKKGGKWAAARQILGRGALAIGGGALSTAAAYASFGGTGASTNDKLAGAAIVTSNPIMWALKDFLIKPVLGWRGSQKFKDDLISYRMMQYGATTTDQMNKVTELEQLVSSVATRGGDASFDVRALNARDIIKIFGYGADDGPAIMRLANWIDFRFKPIFEAWLKGLSKINRSGVDISEVDSKVPNELKGQLIRSVSFPYEGNTPYLVLNNPFGEEDLSIDVASIQMKEKELLNKYSATEKTSVAPKATSSSFKESTTDVINDTITTIKSKSTDITNWFRDSTIGKAIKAVSPVESIRKMVTTTVDTIIPKANASDSLTSLQALRVHAYGMQGLDLAAVNGLLSIESLVNDKMRVANGKATYTGDIEELIKWTGQAFGMVTTSDGPDRVKVVDWLYRRFLPAFKAFIVTARSVSTSITLSQIETLTATQRLQIANAIMGATDDEGVSIWKAPSIFNIVGDMDSVEDLAKISLDEIKKEAETEVAEAPGKSKSAQIAGKNDAASGRSFASRIIDNVKSTFNSATTKVTNWMENTSARVSQVIGRAQEGITDTYYTAKYKLGAGGELTPTGQTYGQLATGNGGVWENIPMPQSNKSRDAAQATFKAVSEMTGVPVELLNIFCGIESSFNYNAKAPTSSAAGWFQFIKSTWKGMLAKYGAKFGIPADDENGSLRFDPRINALMGAMFLRDNYEYLENALGRAPTDVDLYLAHFMGPAGARKFLTRDQNSIGAEIFPDQARANRSIFFKTDGSARTLGEIYQVMENKVAKFRTGGGKNANSQSLGKPKSTEELMNDAAAAKQKDMATDKELIGGAADTSITDSSNNKIGLGKIMSGMASPLRTNAPSMMLPGAPSSAADVSSGQQPVVDTGAATQATVRASQIEEQRKVVTSQDKAMLDIASEQLSVLKQFHADMLNYIKNKAANPSAQTGQEQANTIAPSQRPGRVVDNRPLPIRLR
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2237 AA molecular weight: 245606,87260 Da isoelectric point: 8,72452 aromaticity: 0,07555 hydropathy: -0,46053
Domains
Domains [InterPro]
DC_0124
STR
1–899
STR
1–899
Coil
Unmapped
149–173
Unmapped
149–173
IPR023346
STR
1883–2015
STR
1883–2015
IPR008258
ENZ
1885–1978
ENZ
1885–1978
1
2237
Architecture
STR 1-2217 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Pseudomonas phage SL2 [NCBI] |
2041345 | Uroviricota > Caudoviricetes > Chimalliviridae > Phikzvirus SL2 > |
| Host |
Pseudomonas aeruginosa [NCBI] |
287 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Pseudomonadales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ATN94735.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MF805716.1
[NCBI]
CDS location
range 91719 -> 98432
strand -
strand -
CDS
ATGGCCAAGAAGGTAACATTGCCCAAAGGTCAAACTGGTGCAACCGGTACAACATTAGGGCAAGCCGGTAATATTCTTGACTTAAGTGATATCGATGATATTTTTGGTGATACACCGAAAGCTAAAAAGGGATCACCTGTCACTGAATTTTTTAATGGTATTAAACAAGGACTCTTTGACTCTGTTAAACCACAACAAGCTTTAAAAGCATTCATGCGGTCTGCGGCACCAGATGGCTTTTCACGTATGTTCGGTGTATATGAAGATACGATGTCAACTATTCGGGATGTCAAAGATTCTGTAGAACGTACGAGTGCTAGTGATTTACTCTTTTTAACAAGAGAAGCACAAGATTTAGCAGTTAAGTTAAAAGATAAAGTTCCAGCTTCTGTTTTTGACAGACTTAATAATCGATTAGAAAGTCAAATCGAAAACTATAAGTACGCTGAAGATTCAAATAGAAATTATAAAGAAATCCGTCGTCGCATGGAAGCTGAACGTGACGAGGATGAACTTAAATCTGCTATAGATCAAGTAACTCTTGTTCAACGGGATTTAGCTATAAAAGCTGAACAGGGTGAAGTTAAACGATTCGCTATTGGACAAGCTGAACGTGGAATACGCGATAAGGTATCAGCTGATAGATTTGACTGGATGGCTAAGGCTATGGGTCAAACAGTTGATAATTTATCTAAATTAGCTAGTTATAATGAACAAGTTAATTACAGTATTCAAAAGAAAGGATTAGAAATCCAGTTTCGTTCTATGCTGCATCTTCGGAAAATTGCACAGCAAACCGAAGCTACCATGGAATTATTAAATAATGGTTTTGCAGCACTTGTTAGAAACACAGGGATTCCCGATCATAAAAAGTCATCAATGAAGGATCTTGTTGGCTTTAATGCAGCTCAACGGGTATCGAATAGTTTTGTTGACAACGCTATTCAAACATTACCAAATTTCTTAGGTAATTTTGGATCAGCCGTAACTAATAATGCTACTCGCTTTGCGAATGAAAATATCCGTAACTTTGCCGATGCAGCTCGCGCTGGAAACATGTTTGGCGCGGATGCATGGGAGAATAGATACAATATAGCTGGTCAATTCGCTGGCTCTTATCTTGGTGATTGGACAAGGAATTCAGTTATACCTGTATTAGGTAGAATGGTTCGTCCTGGTGTGGAACGTTTTTCAAATAACTATCTAGGTGGTCGACACAATCAAGCATCTTATTTACTTGATAACTTCCCTGCCTGGACACAAGAATACATGAATAATTACCAAAACACTTATGGTGCTCGTGGTATTCTTCGTGACATTATGGCTCCATTTATTCCACAGTTCACATTACAAGATCGATTAAAGACTGGCTCCTATCAAACAATTGGTCAGGACAGTGGCTTTAATCAACTAACACAACGTACTATAGTTGAAGCTATTCCTGGATATCTATCTAGGTTACTACAAGAAACAAGAATGATCCGGACTGGTCGTGATGATATTACACGTGAAGTGTTTGATCTCTCAACTGGTTCATTCATGTCTGTAGAGGATTCAGCTGCAAATACAGAACGTCGTCTAGTTAGTCGTTCTACTGTACGAGGTGTGAGTGGTGCTCTGACCGATGTTCTTGAAGCATTTGACCCAAATAAAGAACTATCAATAGATGCTAGGAAAGCGCTAACTGAACGTTTAATTCGTGATGCCAATATGAATAAACGTTTTGACCCCGAAGCATATGCTCGTGCTGGTGGATATGATCGTTCTAAAGTATCCGGTGAGGCGATTAAAGAATTAACGGAATATATTAAACGGCAATACAACATTGGTGCTGATGGTAGGATGGCAAGCACTAATGAAAACTTTGCTAGGCGTCAAGAAATATCTACATTATTCTTAGACGTTAGAAACTTCTCACGTGATCCTATTAAAGAAATTGAGCGTTTAACCAATGCTGGTAAAACTGATCAATTACGTGAAATGGGTATTATCATAACTGAGCAAGGTATTGACCGTATTAATTACCCACGTATTTGGGAACTAATGAGTTCAGAAGTAAAATACGAAGGATGGGGTAATGATAATCCATTTGATCGTTATAGTGATACACCACCTTCTGATAATGGTGGTCCAGAGCAACTCTCCCCACTAGGTGATCAGAATAACCCGCACTTTATTGGCCCAATGTATCAGTCACAAACTGAACGAAAAATGCGTCAAGCTCAAGAGCAAGTTATTCGTGCCTCTAAACTGGCTCAAGAGCAAGCTAATAAAGGTTATGATTACGCGCAACAAAAAGTATCGCTAGCTACGGATTATGTAAGGGATAATGTACCTAATCAATTTAGCGAATTACGCAGGAATGTAAACATACCGGCGTCAATGAACTTTGGTGATTTAAGAGATCAACTATACGGCCAAGCCGGCGATATGTATAGTCGTGCTGTTAACTATAGCAATCAGCTCAATGGATATTCTGATATAATCAATCAATCAATAGCTGATCTATATACCAAAGCTAATACTTTTACTCCAGTTATCAAAGGAATGGATTTTTTAAATGGAAATTTAATTGATATTAATACTGGTAAGATAGTAGAGAAAATATCTGATATTACTGGTGAAATTAAAAACCAAGCTGGCATAACTGTAGTAACCGCTCAAGAAGTAGCTACTGGTCTCTATAATCAACGTGGTGACTTATTAACCAAGGCAACTGATATTGCTAGTCAATTACGTGATAAAGCAGCGCAGATTGCTGGCGATGCTAGAGAACGGTTAACTCAAGGTTTAGATAATGTTTCTGATATGGCTAAAGATTGGTATATACCTGGCCGTGAAGAAGCTGTTATTCTTGGACGTGATCTACTAGCCGGTGAGTATATCGACACAGCAACTAATCAAATTATAACTAATTTGAAAGATGCCAAAGGCACTATTATTAATAGGGCTGGTGATGTTGTCGTAACTGCTCAAGAACTGGCTAAAGGTTTAATACGGTCAGATGGTTTCAATCTACGAAGGAATATAGCAGATACATCTAACTGGATACAACGAAATGTACTAGGTGGTGGATCAACTACTCAGAAAATCTTTAATGCAATGGGTACAGTCGCTAATAAAGCAAAAGACTTTACTATTGGATTAGGTAAGGATATTCTAAGTAATCGAGATGCATATTTACCTGGTATGCTAAAACCAGTATTACAGAAAGTTAAACTAAAAGCAGGCGAGTATTATACAACAGCTGGTAACCTATTAAAATCATTCGATGAAATTAATGGACCAGTTTTAGATAGGGATGGTAACATTGTTGTTGATGAAGAACAAATCTCTGAGCTTATCAACTCTGATGGATCTAAACACACTGCTGCTAAGAGTAAGGGTTTATTCCGAACTGGCTTAGGTAATCTAGCCCGTGGTTATGCCAATATGTCAATGCGTTATTGGAAGTGGTTAGGTAAGAAATCTGTAGACACTGCTAAAGGAATGGCGGGTTTAGGATATAAATTGCTTGGATCACCTTTCAAGAAACGTTTTAGTGCATTCACTGGTAAAGTAGAAACACAGATAGATAAGAAAGCTCTAGATACAACCACTGATCAATTATTAGCAGGTATATGGGAAGAACTACGTAATCAGAAACCAGATGCTAATAAACCTCGTCGTGGTTCCTGGCAAGATCTAACATCACGTGTTAGCGATACTTTAAATGGTAAAAATAACGGTGATGAAGAAACCACTGAATCAAAAGGTCTTTTTGGTAAACTTGGTGATACCCTAAAGAATATCTTTGGTAAGAAGAAAGGCGATGAGGAAGATGAAGGATTATTGGAAGACCTAGGTCTTGGTGGTAAGAAAGGTGGGAAATGGGCTGCTGCCCGCCAAATACTTGGTAGAGGTGCTTTAGCTATTGGTGGTGGAGCATTATCAACAGCTGCTGCATATGCTAGTTTTGGTGGTACTGGTGCATCAACAAATGATAAATTAGCTGGTGCAGCTATTGTAACCAGTAATCCGATTATGTGGGCACTTAAAGATTTCTTAATAAAACCTGTATTAGGTTGGAGAGGAAGTCAGAAATTCAAAGATGACTTAATCAGTTATCGAATGATGCAGTACGGTGCTACAACAACTGATCAGATGAACAAGGTTACTGAATTAGAACAACTTGTATCTAGTGTAGCTACACGTGGTGGAGATGCCTCCTTTGATGTAAGGGCTCTTAATGCACGTGACATTATTAAGATATTTGGATATGGTGCTGATGATGGCCCAGCTATCATGCGTTTAGCCAATTGGATCGACTTCAGATTTAAACCGATCTTTGAGGCATGGCTTAAAGGACTATCCAAAATTAATCGTAGTGGTGTAGATATCAGTGAGGTTGATAGTAAAGTACCTAATGAACTAAAAGGACAGCTCATTAGATCAGTATCATTCCCATACGAAGGTAATACACCTTATCTAGTTCTTAATAACCCATTTGGTGAAGAGGACTTATCAATTGATGTTGCTTCTATACAGATGAAAGAAAAGGAATTATTAAACAAGTATAGCGCTACAGAGAAAACATCTGTCGCACCTAAAGCAACTTCCAGTAGTTTTAAGGAAAGTACTACTGATGTGATAAATGATACTATTACTACGATTAAGTCTAAGTCAACTGATATTACTAATTGGTTTAGGGATTCAACTATTGGAAAAGCAATTAAAGCGGTTAGTCCAGTTGAATCTATACGTAAAATGGTAACTACAACAGTAGACACAATTATTCCTAAAGCAAATGCAAGTGATTCATTAACTTCACTGCAAGCATTACGTGTACATGCTTATGGAATGCAAGGTTTAGACTTAGCTGCTGTAAATGGATTATTATCAATTGAAAGTCTTGTTAATGATAAAATGCGAGTAGCTAATGGTAAAGCTACTTATACAGGTGATATAGAGGAATTAATTAAGTGGACTGGCCAAGCATTTGGTATGGTTACAACTAGCGA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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
90faec74cacee100c612474ca7e06fdb20a108962cb78b2479c1d4a72301e1e5
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50