Protein

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Genbank accession
AIX34219.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MPLNKLENFIKNTDGRTLYVNPNDLNATDSITNQGTSLTEPFRTIQRALIESARFSYVRGDDNDLIERTTIMVYPGEHPIDNRPGFGIKTVGNSPVAVTPSGELIDPFQAFNLTDASNFDIESSNNVLYRFNSIYGGVVVPRGTSIVGMDLRKTKIRPIYVPNPTDDSVDYSAIFRITGTCYFWQFTIFDGNENGVVFTDPRDFSENNQSRPTFSHHKLTAFEYADGVNPAVESGFELTDLAMYYSKLSNAYNEASGRPIDEKYPSDPGGFSPQRPEFEIVGAFATDPINITRLISGDGFVPDAVITVDTQVPHELNTGTPIKIRGVAISDYNISTKVSAVLSPTRFTYNLSFVRPNLPAEPSVSSATVTVETDTVTGASPYIFNCSMRSVWGINGMHADGAKATGFRSMVVAQFTAISLQKDDRSFVTYNKQARRYDGINVNKTVRGAELSAQSSSTNSATVYHLDPDAIYRPDWGTTHIKMSNDAVIQIVSVFAIGFNQHFASIGGADASITNSNSNFGQFALKADGFKNDAFLKDDKGFLTSFVSPKSAYNPETDDIEIIDWINIDFDLTRSIAFANQLYLTGYTNAEDKPPVVNQGFRIGANYKESLIQRTTVGAGADVTSSVRMCDNILGPGNNQATGSSVARKVYQVLAGPINNTLSLGVHGLLNGESVRVFSSTGDLPENLERGALYYANVVDGENIRIATSESNALNNIFLNIYGGVELRVESRVNDKEAGERGHPVQYDYTNQNWFVHTDANSDIYQYIVANPTSTDGIDFVSIFKRFGDNRALEDKLYRLRYVIPKESRNAKPPTPGYVLQASATTGARNNDDFILQDIGINDYEYNRNPRYIVSCTVIANEVEVRSEIPHNLNVGDKIKIVNVASTNNTGASQIKGFNGEFLVTRVINSREFRYDITDVNGFSRNPGTFTNNINERNILLPRYERKDLQSNVFVYRIETITDFLEGERDGIYHLFLLNGSNPVTETFTDIQYNQPVEDLYPQMDPDNLIQNPPATTTFAKRAPLGDVTIDEQQNSITKESVDKIYKTLNVGIIETATDGTVGAGGTRTTTLTFQREHEFNSVYSYTTLVGGGGYTDGTFYDVKLLSEFGTVWGGASAVVTVTAGTVTAVTIMDPGSGYSAGQTLFIDGTTIGGGTNATISITQADLEDNKHSILQISGGALYNPDSYVVMTSVEDQSSVGVARTSGSPAIIPGMYAYPADSGTGISSTTYNSDTGLTTLVSTGSAGFGLQRGNTFVVFSSNYSYLGKFFVSNVPTPDTLEFYSYRDLGTVSIVGKTGLDVNDANTGSLGENVGVRATPLYDNGVFYLEQSSGTGTQLTVRAEDGGVAGNVDSKMYLGRYFQMGSEIIRVASKNFDGANNNIVTVIRGALGTVVSNLPINTKVKAIRPSALELRRPSILRASGHTFEYLGYGPGNYSTSLPQLQVKQLPDDEIYLVQAQELSCGQVVYTGMSDNGDFYIGNTKYSATSGTQSTFDVPIPTVAGQPGSSNNVVFDEVIINRRLFVSGGETNEVQSQFDGPVKFTQSVTIQNNLFVTGTTQLNRIEITSTENATSSANGGALTIRGGAAIGKDFYVGGEMYTNAYQIEDTSAVLEIGTNQSSKDISVGGSTDTDRVVFNTTKLATGEGAEEVVNADAGVVVEGGLVVRDVIIAKEFRGAGTGGGPGTILLWGGSTSALPDRYLLCNGATLNKNTYNKLFEAIGYIHGGSGNSFKLPDLRNRFIPGAGSSYAVAAKGGDDSVVLTETQMPRHTHSTSAVNAPHTHPVSFTSGAANAPHKHPAGTGGGGNHNHPSGGTGGGGNHNHPSGGSNNTGNHGHPYSAPGQSKTDVANSNEKNVTSNVNASGAGTGGGGAHSHSVSVNSTSSAHNHPVSVNSGSSAHNHPVSVNSANAPHSHPISGNAGSANAPHVHPIGNTGGTASFDNRPKYYALCYIIQSE
Physico‐chemical
properties
protein length:1955 AA
molecular weight: 209741,94010 Da
isoelectric point:5,19249
aromaticity:0,08900
hydropathy:-0,31801

Domains

Domains [InterPro]
DC_0066
STR
1–1955
DC_0066
IPR037053
ATT
1682–1737
IPR037053
SSF88874
STR
1683–1823
SSF88874
IPR011083
ATT
1684–1741
IPR011083
AIX34219.1
1 1955
Architecture
STR
ATT
STR
STR 1-1681 | ATT 1682-1741 | STR 1742-1955
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014f
[NCBI] 		1493511 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Atlauavirus > Atlauavirus tusconc8
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX34219.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019111.1 [NCBI]
CDS location
range 19185 -> 25052
strand +
CDS
TTGCCCCTTAATAAGTTAGAGAATTTCATTAAGAATACGGATGGACGTACTCTGTATGTTAATCCAAACGATCTTAATGCTACTGATAGTATTACAAACCAAGGCACTTCCCTTACAGAACCCTTCAGAACTATTCAGAGGGCGTTAATTGAGAGTGCGCGTTTCTCATATGTGCGTGGTGATGATAATGATCTCATCGAGAGAACCACCATCATGGTGTATCCCGGTGAGCATCCTATCGATAACCGTCCTGGTTTCGGTATTAAGACAGTAGGTAATAGTCCGGTAGCGGTAACTCCTTCAGGTGAATTGATTGATCCGTTCCAAGCATTTAACCTGACTGATGCTAGTAACTTTGATATTGAGTCTAGTAATAACGTTCTCTATAGATTTAACAGTATCTACGGTGGTGTTGTTGTTCCCCGTGGTACTTCTATCGTGGGTATGGACCTACGTAAGACAAAGATTCGTCCGATATATGTTCCCAACCCCACTGATGATTCAGTAGATTACTCAGCGATCTTCCGTATCACAGGTACTTGCTACTTCTGGCAGTTCACCATCTTCGATGGTAATGAGAATGGTGTAGTATTCACTGATCCAAGAGATTTCTCTGAGAATAACCAGTCCAGACCCACTTTCTCACACCACAAACTAACAGCATTTGAATACGCTGATGGTGTTAACCCAGCGGTAGAATCAGGGTTTGAACTTACTGACCTTGCTATGTATTATAGTAAGTTGTCTAACGCATATAATGAAGCATCTGGTCGTCCTATTGATGAGAAGTATCCATCAGATCCTGGTGGTTTTTCACCACAACGTCCTGAGTTTGAGATTGTTGGTGCATTCGCAACTGACCCAATCAATATCACTCGTTTAATCTCTGGTGATGGTTTTGTCCCTGATGCTGTCATCACAGTAGATACACAGGTCCCACATGAACTAAACACTGGAACACCAATTAAGATTCGTGGTGTTGCCATCAGTGACTATAATATCTCTACAAAAGTATCTGCAGTTCTTAGTCCTACTAGGTTTACGTATAACCTATCATTCGTAAGACCTAACCTACCAGCAGAACCTTCAGTATCCTCTGCAACTGTAACCGTTGAGACTGATACTGTAACAGGTGCTTCACCATACATCTTTAACTGTTCGATGAGATCAGTTTGGGGTATCAATGGAATGCATGCCGATGGTGCCAAAGCAACTGGATTCCGTTCCATGGTTGTTGCTCAGTTCACCGCGATCTCCCTTCAAAAAGATGATAGATCCTTCGTTACTTATAATAAACAGGCACGTAGATACGATGGTATCAATGTCAATAAGACTGTAAGGGGTGCTGAACTATCTGCACAGTCATCTTCTACCAACTCGGCAACTGTATACCACCTAGATCCTGACGCTATCTATCGTCCTGACTGGGGTACAACTCACATCAAGATGAGTAATGATGCAGTCATTCAGATTGTGTCTGTATTCGCTATTGGTTTCAATCAACACTTTGCTTCTATTGGTGGAGCTGATGCATCAATCACAAACTCTAACTCCAACTTTGGTCAGTTTGCACTGAAAGCTGATGGATTCAAGAATGATGCTTTCCTCAAAGATGATAAAGGTTTCCTAACATCATTTGTTTCTCCTAAGAGTGCGTATAACCCAGAAACTGATGATATTGAGATCATTGACTGGATCAACATTGACTTTGATCTAACTCGTAGTATTGCCTTTGCTAATCAACTCTATCTAACTGGTTATACTAACGCGGAAGATAAACCACCAGTAGTTAATCAGGGTTTCCGAATTGGTGCCAACTACAAAGAGAGTCTCATTCAGAGAACAACAGTTGGTGCTGGTGCAGATGTAACCTCATCAGTAAGAATGTGTGATAATATTCTCGGTCCTGGTAACAATCAAGCAACTGGTAGTAGTGTCGCTAGAAAGGTATATCAAGTTCTAGCTGGACCTATCAACAATACCCTTTCATTGGGTGTTCATGGACTACTTAATGGTGAGAGTGTAAGAGTATTCTCATCAACAGGTGACCTACCTGAGAACCTAGAAAGAGGTGCCCTATACTACGCAAATGTGGTTGATGGTGAGAATATTCGTATTGCTACTTCCGAGTCTAATGCACTCAACAACATCTTCCTCAACATCTATGGTGGTGTTGAACTTCGTGTTGAGTCTAGAGTTAATGATAAGGAAGCAGGTGAAAGAGGTCATCCCGTTCAGTATGACTACACTAACCAGAACTGGTTTGTTCATACTGATGCCAATAGTGATATCTATCAGTATATTGTAGCCAACCCAACCTCTACAGATGGTATTGACTTTGTATCCATATTCAAGAGATTTGGTGATAACAGGGCACTAGAAGACAAACTATATCGCCTCAGGTATGTTATTCCTAAGGAGTCAAGGAACGCAAAACCACCTACCCCTGGTTATGTTCTACAAGCATCAGCAACAACAGGTGCTAGGAATAACGATGACTTTATCCTACAGGATATTGGTATCAATGACTATGAATATAACAGAAACCCACGTTATATTGTAAGTTGTACTGTTATTGCTAATGAAGTTGAGGTTCGTAGTGAGATTCCACACAACTTGAATGTTGGTGATAAGATTAAAATAGTGAATGTTGCCAGTACAAATAACACTGGCGCATCACAAATCAAAGGTTTCAATGGTGAGTTCCTAGTTACTAGAGTTATCAACTCTCGTGAGTTTAGGTATGATATTACTGATGTAAATGGTTTTAGTAGAAATCCTGGTACCTTCACCAACAACATCAATGAAAGAAACATTCTTCTACCTCGTTATGAGAGAAAGGATCTACAGAGTAATGTATTCGTATATCGTATTGAAACTATCACTGATTTCCTAGAAGGTGAGAGGGATGGTATCTACCACTTATTCCTTCTTAATGGTTCTAACCCAGTAACAGAGACATTCACTGATATCCAATACAATCAACCTGTGGAAGATTTATATCCACAGATGGATCCTGATAACCTTATTCAGAACCCCCCTGCAACCACAACGTTTGCTAAGAGGGCACCCCTAGGTGATGTTACTATTGATGAACAACAGAACTCCATTACTAAAGAGTCTGTTGATAAAATATACAAGACACTTAATGTTGGTATCATTGAGACTGCTACTGATGGCACTGTTGGTGCTGGTGGAACACGTACAACCACACTAACATTCCAAAGAGAGCACGAGTTCAACTCTGTGTATAGTTACACCACACTAGTTGGTGGTGGTGGATATACTGATGGTACTTTCTATGATGTTAAACTACTCAGTGAGTTTGGCACAGTATGGGGAGGTGCTTCTGCTGTTGTTACTGTTACTGCTGGTACAGTTACCGCAGTTACTATCATGGATCCTGGTTCAGGTTATTCTGCAGGTCAGACACTATTCATCGATGGAACTACAATTGGTGGTGGTACTAACGCTACTATTAGTATTACTCAGGCAGACTTAGAGGATAACAAGCATAGTATCCTACAGATTTCTGGTGGTGCTTTGTATAACCCAGATTCATATGTAGTGATGACCAGTGTTGAGGATCAGTCTTCAGTTGGTGTTGCTAGAACTTCTGGAAGTCCTGCTATTATTCCTGGTATGTACGCATATCCAGCAGATAGTGGAACAGGTATTTCTTCAACTACATATAACTCCGATACAGGTTTAACAACACTAGTATCTACAGGTAGTGCTGGTTTTGGTCTTCAGAGGGGTAACACTTTCGTTGTATTCAGTAGTAACTATAGCTATCTCGGTAAGTTCTTTGTATCTAATGTTCCAACTCCAGATACATTGGAGTTCTACTCATACCGAGATCTAGGAACTGTATCTATTGTAGGTAAGACAGGTTTAGATGTAAATGATGCTAACACTGGTTCCTTAGGTGAGAACGTGGGTGTTAGAGCTACACCACTATATGATAACGGTGTATTCTATCTTGAACAGTCTTCAGGTACTGGAACACAACTAACAGTTAGGGCTGAAGATGGTGGTGTGGCTGGTAATGTAGACTCTAAGATGTACCTAGGAAGATACTTCCAAATGGGTTCTGAGATTATCAGAGTTGCTAGTAAGAACTTTGATGGAGCCAATAACAATATCGTAACTGTTATCCGTGGTGCTCTTGGTACCGTTGTTAGCAACCTTCCCATTAATACTAAGGTGAAGGCAATCAGACCTTCCGCACTAGAACTTAGAAGACCTTCTATTCTACGTGCCTCAGGTCACACCTTTGAATATCTTGGTTATGGTCCTGGTAACTATTCCACTTCATTACCACAACTACAGGTTAAGCAACTCCCAGATGATGAAATTTACCTAGTACAGGCTCAGGAACTATCCTGTGGTCAGGTTGTTTATACTGGTATGAGTGATAATGGTGACTTCTATATCGGTAATACCAAGTATTCCGCAACCTCAGGAACACAATCAACCTTTGATGTTCCCATCCCAACTGTTGCTGGTCAACCAGGTAGTTCTAATAATGTTGTGTTTGATGAAGTTATCATCAACCGTCGTCTATTCGTATCTGGTGGTGAAACTAATGAGGTTCAGTCACAGTTTGATGGTCCTGTTAAGTTTACCCAGTCTGTTACTATTCAGAACAATCTTTTCGTAACTGGTACAACTCAACTCAATAGAATTGAGATCACCAGTACAGAGAACGCAACCAGTTCTGCTAATGGTGGAGCACTAACTATCAGAGGTGGTGCTGCTATTGGTAAAGACTTCTATGTTGGTGGTGAAATGTACACCAACGCATATCAAATAGAAGATACAAGTGCAGTTCTTGAAATTGGTACTAACCAGTCATCTAAGGATATCTCTGTTGGTGGTTCAACTGATACAGATAGAGTTGTTTTTAATACAACTAAACTAGCAACAGGTGAAGGTGCTGAAGAGGTAGTTAACGCAGACGCTGGTGTTGTTGTTGAGGGTGGATTAGTTGTTCGTGATGTTATTATCGCGAAAGAGTTTAGAGGTGCTGGAACTGGTGGTGGTCCTGGTACTATCCTACTCTGGGGTGGTTCTACTAGTGCTCTCCCTGACAGATATCTACTCTGCAACGGAGCTACTCTCAATAAAAACACATATAACAAACTATTCGAAGCCATTGGTTATATCCATGGTGGTAGTGGTAATAGTTTTAAGTTACCAGATTTGAGAAATAGGTTTATCCCTGGTGCTGGTAGTTCTTATGCGGTAGCTGCAAAAGGTGGGGATGATTCAGTTGTACTAACTGAAACGCAGATGCCACGCCACACGCACTCAACTTCAGCAGTCAACGCACCACATACTCACCCAGTATCGTTTACTAGTGGAGCGGCAAATGCACCACATAAACACCCAGCTGGCACAGGTGGCGGTGGAAATCATAACCACCCATCAGGTGGCACAGGTGGTGGTGGTAATCACAATCACCCATCAGGTGGCTCTAACAATACAGGCAACCATGGACACCCGTATAGTGCTCCGGGGCAATCCAAAACTGATGTTGCTAATTCTAACGAGAAGAATGTAACTAGCAACGTCAATGCCTCAGGTGCAGGAACCGGTGGTGGTGGAGCACACTCCCACTCTGTTTCAGTTAACAGTACATCCTCAGCTCATAATCACCCAGTAAGTGTCAACTCTGGATCTTCAGCTCATAATCACCCTGTTAGTGTTAATTCAGCTAATGCACCACATTCCCACCCAATTAGTGGTAATGCAGGTTCTGCAAACGCACCTCACGTTCACCCAATTGGTAATACTGGTGGTACTGCTTCCTTTGACAATAGACCCAAATACTACGCTCTCTGCTATATTATCCAATCAGAGTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
6997a48af4599bf4460f75d9757d71f13477d6b94e1a814309319103353d3def
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7959
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank