Protein

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Genbank accession
WMM95802.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 0,99
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,65
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MANSFVRYTGNGSTTTYAIPFSYRDTADLSATVAGVNVTAYTLDAAGTNLTFTTAPSNGAAIEIRRTTSQTTKLVDYVSGSVLTENDLDTDSDQAFFMSQEAIDDANDVISLDNADFQWDTQNKRLKNVADPTAAQDAATKNYLENTWLTPANKTALTTVNANIANINAVNSNEANINSVNSNETNINTVATNIGSVNTVATDITKVIAVANDLAEAVSEVETVADDLNEATSEIDTVASSISNVDTVGTNIANVNTVAGINSDVSTVAGISSDITTVRGINLAISNVSGISNDVTAVNSNSSNINTVAGNNTNVSTVAGISGNVTTVAGISSDVTSVANDATDIGTVAGISSDVTSVAGISSAVSAVNSNSSNINAVNSNSANINTVAGNNTNINTVAGVSSDVTTVAGISSDVQAVENIASNVTTVAGMSTAINTVNSNSSNVNTVAGAITNVNNVGGSIANVNTVATNLASVNAFGETYRIASSAPTTSLNSGDLYFNTSTNVLNVYGASGWQNAGSSVNGTSQRYNYTATNGQTTFTGSDNNSNTLAYDAGYIDVYLNGVKLLNGTDVTVTSGTSVVLASGATTGDVVDIVAYGTFSVASLNADNLDSGTVPDARITGTYTGLTGLDLTDNSKIRLGTGNDLEIYHDGSSSIISDVGTGRLIIRSDGDGVDINKGTSENIAKFRSDAGVELYYDNSKKFETTSAGATITGDLTVDTNTLCVKSSNDRVGIGNGNPQNKLDISALTWDDGILIKNTGNFNVGIIADANRTVAGGGLFNLQGRWDGTEVASVIFQTGSDTTNKDDGEIVFRTASAGTPTERGRITSAGDILIGKTSDAFAGEGLVFSPGSASTITRDDGNVISLRRDTSDGDIIKFYKDTTNVGNIGVAGSNPFLANSSSRGISLGSNLVPCNSSGTAVDNLSDIGTSSARWNDLYLGGGLYVGGTDTAHKLDDYEEGDWTPTIIGASGFDTTITSSYSGTGGAYYTKIGNLVCVTGKFQLGNSSGNVAVNDYVEVGGLPFTTATQVPTPVTEYRYSNSMALTTLMWWTTTSIRAYVRVVNGTPLRNGGSIRIYMTYKV
Physico‐chemical
properties
protein length:1081 AA
molecular weight: 111269,58390 Da
isoelectric point:4,18093
aromaticity:0,05920
hydropathy:-0,10944

Domains

Domains [InterPro]
DC_1263
ATT
1–359
DC_1263 DC_0265
IPR005604
ATT
3–120
IPR005604 Coil DC_0265
WMM95802.1
1 1081
Architecture
ATT
STR
ATT 1-359 | STR 360-1062 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
WMM95802.1
1 1081
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 448 448 0,8400
Central domain 449 647 200 0,1551
C-terminal 648 1081 433 0,8767
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-448
Central
449-647
C-terminal
648-1081

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage HTVC142P
[NCBI] 		3072837 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Candidatus Pelagibacter sp. HTCC7211
[NCBI] 		439493 Pseudomonadota > Alphaproteobacteria > Candidatus Pelagibacterales > Candidatus Pelagibacteraceae > Candidatus Pelagibacter >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WMM95802.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR420754.1 [NCBI]
CDS location
range 28043 -> 31288
strand +
CDS
ATGGCAAATTCATTCGTAAGATACACCGGAAACGGTTCAACTACTACATACGCTATTCCTTTTAGTTACAGAGATACAGCCGATTTATCAGCTACAGTAGCAGGTGTAAATGTCACAGCTTACACTTTGGATGCCGCAGGCACTAATCTTACATTTACTACAGCACCGTCTAATGGTGCCGCTATTGAAATAAGAAGAACAACAAGTCAAACAACTAAACTTGTAGACTATGTATCAGGTTCAGTACTAACCGAAAATGACCTAGATACAGATAGTGACCAAGCGTTCTTTATGTCACAAGAAGCTATTGATGATGCAAATGATGTAATATCACTAGATAATGCTGACTTTCAATGGGACACTCAAAATAAAAGATTAAAAAATGTTGCAGACCCTACAGCAGCTCAAGATGCTGCTACTAAAAACTATTTAGAAAACACTTGGTTAACTCCTGCAAACAAAACAGCTTTAACTACAGTAAATGCAAACATAGCTAATATTAATGCAGTTAATTCTAATGAAGCAAATATTAATTCAGTAAATTCTAACGAAACAAATATTAACACAGTAGCTACTAACATTGGTTCAGTAAATACTGTTGCTACAGATATAACAAAAGTAATTGCAGTAGCTAATGATTTAGCTGAAGCAGTTTCAGAAGTAGAAACAGTTGCAGATGATTTAAACGAAGCAACTTCAGAGATTGATACAGTTGCAAGTTCTATATCTAACGTAGATACAGTTGGTACAAATATTGCTAACGTAAATACAGTTGCAGGAATAAATTCAGATGTATCAACAGTTGCAGGAATATCGTCAGACATTACTACTGTAAGAGGTATAAATTTAGCAATAAGTAATGTTTCAGGTATTTCAAATGATGTAACTGCTGTAAACAGTAATAGTTCTAACATCAACACTGTTGCAGGTAACAATACTAATGTTTCAACAGTTGCAGGTATATCTGGTAATGTTACTACAGTAGCAGGAATTTCATCAGATGTAACTTCGGTTGCTAATGATGCAACAGATATTGGAACAGTTGCAGGAATTAGTTCTGATGTAACATCAGTTGCAGGTATCTCAAGTGCAGTATCAGCAGTAAATTCTAATTCATCAAATATTAATGCAGTTAATTCTAACTCAGCAAACATCAACACAGTTGCAGGAAACAATACAAATATTAATACAGTTGCAGGTGTATCTTCAGACGTTACAACAGTTGCAGGTATATCTAGTGACGTACAAGCAGTAGAAAATATTGCTTCAAATGTAACTACAGTTGCAGGTATGTCTACTGCAATTAATACAGTAAATTCTAATTCATCAAATGTTAATACAGTAGCAGGAGCAATAACTAACGTAAATAATGTTGGTGGCTCTATAGCTAATGTAAATACAGTTGCAACAAATTTAGCTTCAGTAAATGCTTTTGGAGAAACTTACAGAATAGCTTCTTCAGCTCCTACAACTTCTTTAAATTCTGGAGATTTATATTTTAATACCTCAACTAATGTACTTAATGTTTATGGTGCTAGTGGTTGGCAGAACGCAGGTTCATCAGTTAATGGAACTTCACAAAGATACAATTACACAGCAACCAATGGTCAAACAACTTTCACAGGTTCAGATAACAATTCAAACACACTTGCATATGACGCAGGTTACATTGACGTATATTTGAATGGTGTAAAATTATTAAATGGAACAGATGTAACAGTAACTTCTGGTACATCAGTAGTCTTAGCTAGTGGTGCAACTACAGGAGACGTAGTTGATATTGTTGCTTATGGAACTTTCTCTGTTGCAAGTCTTAACGCAGACAACCTAGATAGTGGTACAGTACCAGATGCTAGAATTACTGGAACATATACTGGTCTTACAGGATTAGATTTAACTGATAACAGCAAGATAAGATTAGGAACTGGAAACGATTTAGAAATTTATCATGATGGAAGTTCTAGTATTATTTCAGATGTTGGAACAGGAAGATTAATTATTAGGTCAGATGGAGATGGTGTAGATATTAACAAAGGTACAAGTGAAAATATTGCTAAATTTAGGTCAGACGCAGGAGTTGAACTTTACTATGACAACTCTAAGAAATTTGAAACAACATCTGCTGGTGCAACAATTACAGGCGACTTAACAGTTGATACAAATACTTTATGTGTAAAAAGTAGTAATGATAGAGTTGGCATTGGTAATGGAAATCCACAAAATAAATTAGATATTTCTGCATTAACTTGGGACGATGGAATATTAATAAAAAATACTGGAAATTTTAATGTTGGAATAATTGCTGATGCTAATAGAACAGTTGCAGGTGGTGGATTATTTAATTTACAAGGAAGATGGGACGGAACAGAAGTTGCAAGTGTTATTTTTCAAACAGGTTCAGACACAACTAATAAAGATGATGGCGAAATAGTTTTTAGAACTGCATCAGCAGGAACACCTACAGAAAGAGGTCGTATCACTTCAGCAGGAGATATATTAATAGGAAAAACTTCAGATGCTTTTGCAGGAGAAGGTTTAGTTTTTAGTCCAGGTAGTGCTTCTACAATTACTAGAGATGATGGAAATGTAATTTCTTTAAGGAGAGATACAAGTGATGGAGATATAATTAAGTTTTATAAAGACACAACTAATGTTGGTAATATTGGTGTAGCAGGTTCTAATCCTTTTTTAGCAAATTCAAGCTCAAGAGGTATTTCACTTGGTAGCAATCTTGTTCCATGTAATAGTTCAGGTACAGCAGTAGATAATCTTTCTGATATAGGAACATCTAGTGCAAGATGGAACGACCTATACTTAGGTGGTGGTCTATATGTTGGTGGCACAGACACAGCACACAAATTAGACGATTACGAAGAAGGAGATTGGACACCAACTATAATAGGTGCATCAGGATTTGACACTACAATAACAAGTAGTTATTCAGGAACAGGTGGTGCATATTATACAAAAATTGGCAACCTAGTATGTGTAACAGGTAAATTCCAACTAGGAAATTCAAGTGGAAATGTTGCAGTTAATGATTATGTTGAGGTAGGTGGATTACCTTTTACCACTGCAACTCAAGTACCTACTCCTGTTACTGAATATAGATATAGTAACAGTATGGCTTTAACCACATTGATGTGGTGGACTACAACTTCTATCAGAGCTTATGTAAGAGTGGTTAATGGAACTCCATTAAGAAATGGTGGGTCAATTCGAATTTATATGACTTATAAAGTTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
9108c2f1c3cb637958a31446be5459ad52da80a4e2c3f07c78e7bb953ab93c8a
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6472
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50