Protein

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Genbank accession
XEN38916.1 [GenBank]
Protein name
side tail fiber protein Stf
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,68
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTQNGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHLNKAPIFTDLSSTTATSEYHPLFKQRYKDGTFSLGTLVNEGSMKMHYIDETGTSKYWTFNRNGNFQVDSGNLLVSNGYLVTQSNIETKAGSLIGPKVITKNINVSTKSWDTNIDTAYDLVSLPTWQYTPTETDLDTNGINYLRKFRGHVSSAIFHEIADARSGKPQNISYWTGRNAEVYQWSYTTDGRMSVANSIGVGLADVGSQGRYPLATFGKGIAIGDNDTGVKWVRDGVIDLVANGISAGTILNNGINSTKKLMVGYSRDSGSTWDYPNNNQAMFTARTDVDGNNNGDGQTHIGYNSNSKMYHYFRGTGRMAVGMSQGLLVEPGILDISTGSNTLSLRADGTVASVQTLKLNNGLYFNGDGTNASLVFKAASGIDGTKQIMWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNVSGDRNRETVFEVADGQGYYFYSQRVAPTGSETVGPVVTQINGQLNARGSIITDGSLRVNGLSTLSGQVTMDNGLVLSGGGSITGQVKIGNTADAFRIYNAEYGAIFRRSEASLHIIPTLKDAGESGGISNLRPLSISLNNGMVQMRHSVTLGDDGAGGNMITVDNDNKLVVVTSNSRISPNFRMQIGQSAYIDAECTDAVRPAGAGSFASQNNENVRAPFYMNIDRTDTSTYVPIVKQRYVQNNSCYSIGTLINGGNFRVHYHEGGDGVSTGAIIKDLGWEFNKNGDFYSPGKLGAGNVRIGTDGNITGGSGNFANLNTTINNLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPEGYAIMEGQTFDVGLYPKLAAVYPSGSLPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEADGVKSHSHSASASSTDLGTKTTSSFDYGTKTTSSFDYGTKTSNNTGAHTHSLSGSTNTAGAHSHTSALYAGSNNAPGTGSIRGSAGGGNTLGTSSSGAHSHSISGTAASAGAHAHTVGIGAHSHTVGIGAHSHTVAIGSHGHTITVNATGNTENTVKNVAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1078 AA
molecular weight: 114014,52670 Da
isoelectric point:8,09022
aromaticity:0,08163
hydropathy:-0,36939

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–1076
DC_0538
IPR051934
Unmapped
733–1078
IPR051934
SSF88874
STR
837–1077
SSF88874
IPR037053
ATT
844–897
IPR037053 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003
IPR011083
ATT
849–896
IPR011083
XEN38916.1
1 1078
Architecture
STR
ATT
STR
STR 1-843 | ATT 844-897 | STR 898-1077 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XEN38916.1
1 1078
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 298 298 0,1964
Central domain 299 497 200 0,4801
C-terminal 498 1078 580 0,7683
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-298
Central
299-497
C-terminal
498-1078

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage PNJ-9
[NCBI] 		3239045 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XEN38916.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ100635.1 [NCBI]
CDS location
range 7523 -> 10759
strand -
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTGGCAGGAGTTAATCCTACTGCAGCACAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGATCGAACTCTTTTTACTAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGTGGGGATATTAACGGTAATGTAACCCAAAATGGTGATTATTTACAAAACGGCACATATAATCTTAATGGAAATCAGTTTGTTTATGCAGGAAAATATATTGAATTTTTACCTAAAACAGCCGGTAATGGTGCGTGGGCAAATCAACACCTAAATAAAGCTCCTATTTTTACCGACTTAAGTTCTACTACTGCTACTTCTGAATACCATCCGCTGTTTAAGCAGCGTTATAAAGACGGTACTTTCTCATTAGGGACCTTGGTAAATGAAGGCTCAATGAAGATGCATTATATCGATGAAACAGGCACTTCGAAATATTGGACCTTTAACCGTAATGGTAATTTTCAAGTTGATTCCGGAAATTTATTAGTATCTAATGGATATTTAGTTACTCAAAGTAATATTGAAACTAAAGCTGGTTCTTTAATTGGTCCTAAAGTTATTACCAAAAATATCAATGTGAGCACTAAATCTTGGGACACTAATATTGATACTGCATATGATTTAGTTTCATTACCGACTTGGCAATATACTCCAACCGAAACAGATTTGGATACTAATGGTATAAACTACCTTCGTAAATTCCGCGGACATGTTTCTTCTGCTATTTTCCATGAAATTGCTGATGCTCGTTCAGGTAAACCACAGAATATTTCATATTGGACTGGGCGCAATGCTGAAGTTTATCAATGGTCTTATACCACCGACGGGCGTATGTCTGTTGCTAATTCGATAGGTGTAGGTCTTGCCGATGTCGGCTCCCAAGGGCGTTATCCTTTGGCCACATTTGGTAAAGGTATTGCAATTGGTGATAATGACACTGGTGTTAAATGGGTTCGTGACGGTGTTATTGATTTGGTTGCGAATGGTATTTCTGCCGGCACTATTCTTAATAATGGTATTAACAGTACTAAAAAATTGATGGTTGGTTATAGTCGAGATTCTGGTTCTACTTGGGATTACCCAAATAACAACCAAGCAATGTTTACTGCGCGTACCGATGTTGATGGTAATAATAACGGTGACGGTCAGACTCATATCGGTTATAACAGTAATTCTAAAATGTATCACTATTTCCGTGGTACAGGTCGTATGGCTGTTGGTATGTCCCAAGGTCTCCTTGTTGAACCAGGAATTTTAGATATTAGCACTGGTTCAAATACATTAAGTTTGCGTGCTGATGGTACCGTCGCTTCTGTTCAAACATTAAAGCTTAATAATGGATTATATTTTAATGGTGATGGAACTAATGCTTCTCTAGTTTTTAAAGCAGCTTCAGGTATTGACGGCACTAAGCAAATCATGTGGGAAGGCGGTACTCGAGCAGGTCAGAATAAGAGTTATGTAACTGTTAAAGCATGGGGTAATTCATTTAACGTATCCGGCGATCGTAATCGTGAAACAGTTTTTGAAGTAGCTGACGGACAAGGATATTATTTTTATTCTCAGCGCGTAGCTCCAACCGGTTCAGAAACTGTGGGACCTGTTGTAACACAAATTAATGGACAACTGAATGCAAGAGGGAGCATTATCACCGATGGAAGTCTTAGAGTTAATGGATTAAGTACATTATCCGGACAAGTTACTATGGATAACGGGCTTGTTTTATCCGGTGGTGGTTCTATTACCGGTCAAGTTAAAATCGGTAATACCGCAGATGCTTTCCGTATTTACAATGCTGAATATGGAGCTATTTTCCGTCGTTCTGAAGCGTCTTTGCATATTATACCTACACTTAAAGATGCAGGTGAAAGTGGTGGAATAAGTAATCTCCGCCCGCTTAGTATTAGCCTTAATAATGGTATGGTGCAAATGCGTCATTCTGTTACGTTAGGCGATGATGGTGCTGGTGGTAATATGATTACTGTGGACAACGATAACAAACTTGTTGTTGTTACTAGTAATAGTCGCATTTCTCCTAATTTCAGAATGCAGATAGGTCAGTCGGCGTACATCGATGCAGAATGTACTGATGCTGTTCGCCCAGCCGGAGCGGGTTCATTTGCTTCCCAGAATAATGAAAACGTTCGTGCTCCTTTCTATATGAATATTGATAGAACAGATACAAGCACTTATGTTCCTATTGTGAAACAAAGATACGTTCAAAATAATAGTTGCTATTCTATTGGTACTTTAATTAATGGTGGTAACTTTAGAGTTCATTATCACGAAGGTGGCGATGGCGTTTCTACTGGCGCAATTATAAAGGATTTAGGTTGGGAATTTAATAAAAACGGTGATTTTTACTCTCCTGGTAAATTAGGCGCTGGTAATGTTCGTATTGGTACTGATGGTAATATCACCGGTGGTTCTGGCAATTTTGCTAACTTGAATACCACAATAAATAACCTTAAGACGGATATTGTCTCAAGTTATCCAATTGGTGCTCCGATTCCTTGGCCTACTGATACACCTCCTGAAGGTTATGCCATAATGGAAGGTCAAACATTTGATGTTGGCTTGTATCCTAAGTTAGCTGCGGTGTATCCTTCCGGCTCTCTGCCTGATATGCGCGGGCAAACTATCAAGGGTAAACCATCTGGGCGTGCTGTATTAAGTACAGAAGCAGACGGTGTTAAGTCACATAGTCATAGTGCAAGTGCATCAAGCACGGATTTGGGTACTAAGACCACATCAAGCTTTGACTATGGTACTAAGACGACAAGTAGTTTCGACTATGGTACTAAGACCAGTAATAATACTGGTGCTCATACGCATAGTTTGAGCGGTTCCACAAACACCGCCGGTGCGCACAGCCACACAAGCGCTCTTTATGCGGGAAGTAACAACGCTCCTGGTACTGGTTCTATAAGAGGATCCGCCGGTGGTGGTAATACGCTTGGAACTTCTTCTTCTGGGGCACATTCGCACTCTATATCTGGTACTGCTGCAAGCGCAGGCGCTCACGCACATACTGTGGGTATTGGTGCCCACTCCCATACTGTTGGTATTGGTGCTCATTCTCATACTGTTGCAATCGGTTCCCATGGACATACAATAACTGTAAATGCCACAGGAAATACAGAAAACACAGTTAAAAACGTTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
ae145762656efd5bbecf16dcfcda86ede71ad3fa0629f645ccc5ff86fc74a556
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4967
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence analysis of novel Escherichia coli phage PNJ-9 Fu,K.L., Cui,J.Q. and Tang,F. 2019-10-08 — GenBank