Protein
View in Explore- Genbank accession
- XBS49029.1 [GenBank]
- Protein name
- tail protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MIKFHDPSGTPHFGQATITRTTSVNGGLSLTGEVFAGDDVLNGLDYGWWLNFDNEKYVITYKKLSDDTNTVVFDAVQQFFWDFAKVALHAQYTGSHEYTFYLGQLFDKSGYTYKNDVTVPAFEKENWGYKNKLDLFNDIIDQAGVEFEVHNETVHIAKQIGSDLTSFARKGINLSNLTEEMKISDFATYAKGYGAFKDTEDQSKGRLEVEYRSELAKQFGDLEMDPIVDERYTIADNLIAALKKQVDATYTVSMTMNIYDLENAGYPNYEAPKVGDWILAIDEALNFKRKIRIIQLEEQFDVTGKRIGYTATCGDLSIVDQYTHLQSSLDSKVQRIQESVDNVAISANGKSKNYYGVKEPMSANEGDLWFDQSNSDPDKWSIKQWVNGRWEQITLNPGEVDAKVDVAKKEAETAVENAKSASDKADQLAAKYDDTNALANQAMDKAVGAQSDASSAAATANSTASEFGKVDQKADSALSAALNAQNDASSAVNQASSAAADSKDAKQIAGAVSQSYKTLTDGSTMTIAELQNGLGAKLTKSDLDGYATQTWAQNQIKMTADGINGTISSVKGTVDSQTTSINDLKADSSSFKGQFTTVNNTLGKQTTDISTLQASSKELTTGFNTLTTDNTTNKNDISQLKQTATEVSSTLETVQTQVQNSAVGTNLYTDTKNFDNPASWYASIVWTKTTDTYKGLVVIQTTDDWNGLSQYIQVKKGDILTYSVYAKYANGSGTSSIFFPLNNPTEGNYSAAAASVWGSNVTITDSWQRLSATTVVTSDGYLRPRLERTNGNTNTLQIAGIKVEKGSLATDWCANPADNATVTAVSKISQTVDGMKTDISKKIEQKDLNGYATQTWAQNQINTTANGINGTISSVKSTVDGHTTSINDLKADSSGFKAQFTTVNNTLGKQTTDIGSLQATSNELTTRFNTLTSDNTTNKNDISQLKQTATEVSSTLETVQTQVKDSAVGTNLIIQSDLKYGCIFPDGSLGSNTVDFHSDNYIPTNGATVFTFSSPDYAFKGNGNDDRIAMYDSDKNYLGYQSLDSPTQTLSQSNVAYIRFSINSADEGNTTGNSSDWLANHRYKLEKGSVATDWCPNPADNATVTAVSSISQTVDSIKTTVRGKVDNETYQTKVTQLSGQITSVVKKADDNFTAIQQTASDINLKVSKDGVINAINVSNEGTSIYGNKLHITADTYIDNATIKSAMIDYIEAEKIRTGTLDATNVKVVHLNADSITSGAIRGANLLIDLDVGNVEFQKGRIHNTSNTIDINIDAGYMSVANGSNRAMLKNGEMQFVEPGTYDTSNNPYLRISNTFGGQSTEGAAFIGRSYAALTNSANLTGSGIFDIGMGTETFSGIATGYGSGFLNKGWHMTKVGGAERGVVISGGKATSYRQYWSASPSIMVGATSNSTSSGGMHGSNIIMDCDYLYNFSTYMRTTSHAANVYVADDGAIVRASSASKYKTNIERSFDIGMGERILEVPTAHWFDKAEVRKKTLDPQAPDPRRYFGMIADDLDDAGLTELVEYNEKGEVEGIMYDRVALTLIPIVRNYRDRITKLESEIKQLKEG
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1567 AA molecular weight: 170192,62830 Da isoelectric point: 4,88374 aromaticity: 0,08424 hydropathy: -0,46324
Domains
Domains [InterPro]
DC_0366
ATT
1–76
ATT
1–76
DC_1274
ATT
93–552
ATT
93–552
IPR010572
ENZ
105–299
ENZ
105–299
1
1567
Architecture
ATT 1-76 | STR 79-92 | ATT 93-552 | STR 553-968 | RBD 986-1543 | CHP 1544-1561 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Lactiplantibacillus phage H1-Guo [NCBI] |
3155565 | Viruses > |
| Host |
Lactiplantibacillus plantarum [NCBI] |
1590 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XBS49029.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP779551
[NCBI]
CDS location
range 200 -> 4903
strand -
strand -
CDS
TTGATTAAATTTCATGATCCGTCTGGGACGCCCCATTTCGGCCAAGCTACCATTACAAGAACTACTAGCGTCAATGGCGGACTGTCACTGACTGGTGAAGTGTTTGCTGGTGATGACGTATTGAACGGTTTAGACTACGGCTGGTGGTTAAACTTCGATAACGAAAAGTACGTCATTACGTATAAGAAGCTGAGTGATGATACCAATACCGTTGTCTTTGATGCGGTACAACAGTTCTTTTGGGACTTTGCCAAAGTAGCATTGCACGCACAATACACGGGTAGTCATGAGTATACATTCTATCTAGGACAACTCTTTGATAAATCCGGGTATACCTACAAGAATGACGTTACCGTACCAGCATTTGAAAAAGAAAATTGGGGTTATAAAAATAAGTTAGATTTATTTAACGACATTATTGATCAGGCTGGCGTTGAATTTGAAGTGCATAATGAGACGGTTCACATTGCTAAACAGATTGGTAGTGACCTGACCAGTTTTGCCCGTAAAGGGATTAACCTTAGTAATCTCACGGAAGAAATGAAAATATCCGATTTTGCGACGTATGCTAAGGGCTATGGTGCTTTCAAAGATACTGAAGACCAAAGTAAGGGTCGATTAGAAGTTGAGTATCGCAGTGAGTTAGCCAAGCAGTTTGGCGACTTAGAAATGGATCCGATTGTCGATGAACGATACACAATTGCAGATAACTTGATTGCCGCCTTAAAAAAGCAGGTTGATGCGACCTATACCGTGTCAATGACTATGAACATCTATGACTTAGAGAACGCTGGTTATCCTAATTATGAAGCACCTAAAGTCGGGGACTGGATTCTAGCGATTGATGAAGCATTAAATTTCAAGCGTAAGATTCGCATTATTCAGCTTGAAGAACAGTTTGACGTGACCGGTAAGCGTATCGGGTATACGGCCACTTGTGGTGATTTGAGTATTGTGGATCAGTACACACATCTACAAAGTAGTTTGGATAGCAAGGTACAGCGTATTCAAGAAAGTGTTGATAATGTAGCTATCAGTGCTAACGGCAAGAGTAAAAACTACTATGGTGTAAAAGAACCTATGAGTGCCAATGAAGGTGACTTATGGTTTGACCAAAGTAATAGTGATCCAGACAAGTGGTCTATCAAACAATGGGTCAACGGGCGTTGGGAGCAGATTACGTTGAACCCTGGCGAGGTAGACGCCAAAGTTGATGTAGCTAAAAAGGAAGCTGAAACCGCGGTTGAAAATGCTAAAAGTGCATCAGATAAAGCTGACCAGCTTGCGGCTAAGTACGATGATACAAATGCATTAGCTAATCAAGCTATGGATAAAGCAGTAGGTGCACAAAGCGACGCTAGTTCCGCAGCTGCTACAGCAAACTCTACAGCTTCGGAGTTCGGTAAAGTTGACCAAAAGGCAGATAGTGCCTTATCTGCTGCTTTAAATGCTCAAAATGATGCTAGTTCTGCAGTAAACCAAGCATCGTCCGCTGCAGCTGACTCTAAAGATGCTAAGCAAATTGCTGGAGCAGTTAGCCAGAGTTATAAGACGTTAACCGATGGGTCAACTATGACCATTGCTGAATTACAAAATGGTCTAGGTGCTAAGTTGACTAAGTCTGATTTGGATGGATATGCTACTCAGACATGGGCACAAAATCAGATTAAAATGACTGCTGATGGTATTAATGGCACCATATCTAGTGTTAAGGGCACCGTCGACAGTCAGACAACTAGTATTAATGACCTTAAGGCGGATTCGAGTTCGTTTAAAGGCCAGTTTACGACCGTTAACAATACTCTTGGTAAGCAAACTACAGATATTAGTACACTTCAAGCATCATCTAAAGAACTGACTACTGGGTTTAATACGTTAACGACTGATAATACGACTAACAAGAACGATATTAGTCAGCTTAAACAGACCGCCACGGAAGTCAGTAGCACCTTGGAAACTGTTCAAACACAGGTCCAAAATAGTGCAGTGGGAACTAACTTGTACACTGATACCAAGAATTTTGACAACCCAGCATCATGGTATGCATCCATTGTGTGGACAAAAACTACGGATACCTATAAAGGATTAGTTGTAATACAGACAACAGACGATTGGAATGGGCTGAGCCAATATATCCAAGTTAAAAAAGGTGATATTTTAACTTATAGTGTATATGCAAAATATGCAAATGGTAGTGGAACAAGCAGCATCTTCTTCCCACTCAACAATCCAACTGAAGGTAATTACAGCGCTGCTGCAGCAAGCGTATGGGGTAGCAACGTAACTATAACAGATTCATGGCAGCGGTTGTCAGCGACAACGGTTGTCACTAGTGACGGTTATTTACGCCCTCGACTTGAACGAACTAATGGAAACACCAATACTCTTCAGATTGCCGGAATCAAGGTAGAAAAAGGTAGTCTAGCTACTGATTGGTGCGCTAATCCAGCAGATAATGCAACCGTTACAGCTGTATCCAAGATTTCTCAAACTGTTGATGGTATGAAGACTGACATTTCTAAGAAAATTGAGCAGAAAGATCTTAATGGTTATGCTACCCAGACTTGGGCGCAGAATCAGATTAATACTACTGCCAATGGTATTAACGGAACCATATCCAGTGTTAAGAGTACCGTCGATGGGCATACAACCAGTATCAATGATCTTAAGGCTGATTCCAGTGGGTTTAAAGCTCAGTTTACGACGGTTAATAATACTCTCGGCAAACAAACAACTGATATTGGAAGTCTGCAAGCCACGTCTAACGAATTAACTACCAGGTTTAATACGTTAACAAGTGATAATACGACTAATAAGAATGATATTAGCCAGCTTAAACAGACTGCTACGGAAGTCAGCAGCACTTTAGAAACTGTTCAAACGCAGGTTAAAGATAGTGCCGTTGGGACTAACTTAATCATTCAATCAGACTTAAAATATGGGTGTATTTTTCCAGATGGTAGTTTAGGCAGCAATACCGTTGATTTTCATTCAGATAATTATATACCTACTAATGGAGCAACTGTGTTTACGTTCAGTTCACCAGATTATGCATTCAAAGGAAATGGTAATGATGATCGTATTGCAATGTATGATAGCGATAAAAATTATCTGGGTTATCAATCTTTAGATTCACCAACCCAAACATTAAGCCAATCTAATGTTGCATATATTAGATTCTCTATTAACTCTGCGGACGAAGGTAACACTACTGGCAATTCATCTGATTGGTTAGCTAATCATAGATACAAGCTGGAAAAAGGCTCCGTAGCTACCGATTGGTGTCCTAATCCAGCTGATAACGCCACAGTCACAGCTGTATCAAGCATCTCTCAAACTGTGGATTCCATTAAAACAACTGTACGCGGAAAGGTTGATAATGAAACTTATCAGACCAAGGTAACCCAATTAAGCGGCCAGATAACATCGGTTGTAAAGAAAGCTGATGATAATTTTACTGCAATTCAACAAACTGCGTCAGACATCAATCTTAAAGTTTCCAAAGATGGCGTTATAAATGCAATTAACGTATCGAATGAAGGAACATCAATATACGGTAACAAACTGCATATAACGGCTGATACCTATATTGATAATGCAACTATTAAGTCCGCCATGATAGATTACATCGAAGCAGAAAAAATCCGAACTGGTACACTCGATGCTACCAATGTTAAAGTGGTCCATTTGAATGCGGACAGTATTACATCTGGTGCGATTAGAGGCGCCAACCTATTAATTGACCTTGATGTTGGTAATGTTGAGTTCCAAAAGGGTCGTATTCACAACACTAGTAACACAATTGATATTAATATTGACGCAGGGTATATGTCAGTAGCAAACGGCAGTAATCGTGCAATGTTAAAAAATGGTGAAATGCAATTTGTAGAACCTGGAACTTATGACACATCTAATAATCCCTATCTACGTATCTCAAATACGTTTGGCGGGCAATCAACTGAAGGCGCTGCTTTTATTGGTCGTAGCTACGCAGCCTTGACAAATTCGGCTAACTTAACTGGAAGCGGAATATTTGACATAGGAATGGGAACAGAAACATTTAGTGGTATTGCGACTGGATATGGTTCTGGCTTTTTGAATAAAGGGTGGCACATGACCAAAGTTGGTGGAGCTGAGCGTGGCGTGGTTATATCTGGAGGTAAAGCCACATCATACCGTCAATACTGGTCAGCCAGTCCTTCAATTATGGTTGGTGCTACAAGTAATAGCACTAGTTCTGGAGGTATGCATGGGTCAAACATTATTATGGATTGTGACTACTTGTACAACTTTAGCACATACATGCGAACCACCAGTCATGCGGCTAACGTATATGTTGCTGATGATGGCGCCATTGTTAGAGCTAGTTCGGCTTCTAAGTATAAAACAAATATCGAACGATCATTTGATATTGGGATGGGTGAACGTATCCTAGAGGTTCCAACGGCGCATTGGTTTGATAAAGCAGAAGTTCGTAAAAAAACATTAGACCCTCAAGCTCCAGATCCTCGCCGCTATTTCGGTATGATTGCTGATGATTTAGACGATGCTGGATTAACTGAATTAGTAGAATACAACGAAAAAGGCGAAGTAGAAGGGATCATGTATGACCGGGTTGCATTGACTCTTATCCCAATCGTTCGTAACTACCGAGACCGAATTACCAAATTAGAATCAGAAATTAAACAATTGAAAGAAGGATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
2401c1ba763b00a3c316843c331ac5f3556f6bf614d3522e8ba4e6d0f11b1cf9
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50