Protein

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Genbank accession
QZI80046.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,76
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTHVGNYTQTGTFNLIGSQNVASGGYIEFAYKATGVGSWAGQHTAKAPIFMDISATTATSEYNPLIKQRYKDGTFSAGTLVAEGSFKFHYIDETGTSKYWTFNRNGNFQVDTGDLFVSKGNISASGNINSATGVVSAPQINTKTIVFDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGEENGINYLRKVRAKSGGTIYHEIASAQTGKNDEISWWNGNTPTTKLMGLRNDGAMVLRRSLAIGTITADENTNNYGSPTPMGERYIALGDAATGLKYVKQGVYDLVGNWNSIASITPDSFRSTRKGLFGRSEDQGATWIMPGTNAALLSVQTQADVNNAGDGQTHIGYNSGGKLSHYFRGKGQTNINTQEGMEVNPGILKLVTGSNNVRFYANGTVSSIQRIKFDNGLVLTGARPDGIQLDAPTAADGTKTILWAGGTREGQNKSYVSIKAWGNSFNASGDRTRETVFEVADGHGYYFYAQRTNPASGQTVGPVNFKFNGTVETGHIIGLGNISASGTGSFGGNVTMSNGLFVQGGSSITGQVKIGGTADALRIWNAEYGAIFRRSEDKLYIIPTPQNAGESGGISNLRPFYITLSTGKVSMDHDVDIGGGRFKVETSGTTSGQAITINANNAALIINSASLTNAVYIQGKKANTVKWYVGNGSGSSDELNLYNNALGHGVAFRTDDVLFSKPLKVGNAQFGTDGNITGGSGNFANLNTTINNLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPDGYAIMEGQTFDVGLYPKLAAVYPSGALPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEADGVKSHSHSASASSTDLGTKTTSSFDYGTKTSSSFDYGTKTSNTTGNHNHTVSGTTGAAGNHQHSQTGPRGPNNQPTGIYPNGSTQISGTQVVGFGLSNGVVPGTSQYIAKSSTEGNHTHSWSGTTSSTGNHAHTVGIGAHTHTVGIGAHSHSVAIGSHGHTITVNATGNTENTVKNVAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1033 AA
molecular weight: 108642,56760 Da
isoelectric point:8,94294
aromaticity:0,08519
hydropathy:-0,37357

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–1031
DC_0538
IPR051934
Unmapped
667–1033
IPR051934
G3DSA:6.20.80.10
STR
682–742
G3DSA:6.20.80.10 SSF88874 SSF88874
IPR048388
ATT
684–759
IPR048388 IPR037053
IPR011083
ATT
785–832
IPR011083
QZI80046.1
1 1033
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 1-683 | ATT 684-759 | STR 760-779 | ATT 780-833 | STR 834-1032 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM-172859UKE1
[NCBI] 		2865802 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QZI80046.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ234025.1 [NCBI]
CDS location
range 64023 -> 67124
strand -
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTGGCAGGAGTTAATCCTACTGCAGCACAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGATCGAACTCTTTTTACTAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGCGGGGATATTAACGGTAATGTAACTCATGTAGGTAACTATACTCAGACAGGTACATTTAATTTAATAGGCTCACAAAATGTTGCATCTGGTGGATATATCGAATTTGCTTATAAGGCCACCGGAGTTGGTTCTTGGGCTGGTCAACACACAGCAAAAGCCCCTATTTTCATGGATATTTCCGCAACAACCGCTACTTCAGAATATAACCCGTTAATTAAGCAACGTTATAAAGATGGTACTTTTTCAGCGGGTACATTGGTTGCTGAAGGCAGTTTTAAGTTCCATTATATCGATGAAACTGGGACTTCAAAATACTGGACTTTTAATAGAAATGGTAATTTCCAAGTTGACACGGGCGATTTATTTGTCAGCAAAGGTAATATTTCTGCTTCTGGTAATATTAATTCAGCTACTGGGGTAGTTTCTGCTCCGCAGATTAATACAAAAACTATAGTTTTTGATACAAAAGCATTTGGACAATACGATTCGCAATCATTAGTTCAATATGTTTATCCTGGAACAGGCGAAGAAAATGGTATAAATTATCTTCGTAAAGTTCGAGCTAAATCAGGCGGAACCATTTACCATGAAATCGCTTCAGCTCAAACTGGTAAGAATGATGAAATTTCTTGGTGGAATGGAAATACACCTACTACTAAATTAATGGGTCTTCGTAATGATGGCGCCATGGTATTACGTCGTTCACTTGCTATTGGCACAATTACTGCTGACGAAAATACTAACAACTACGGTTCTCCTACTCCAATGGGAGAAAGATATATTGCTTTGGGCGATGCCGCCACTGGTTTAAAATACGTTAAGCAGGGTGTTTATGATTTAGTAGGTAATTGGAATTCTATTGCATCTATTACACCTGACAGTTTCCGCAGTACACGCAAAGGATTATTTGGTCGTTCAGAAGACCAGGGCGCTACATGGATTATGCCCGGTACTAATGCCGCTCTTTTATCAGTCCAAACTCAGGCTGATGTGAATAACGCAGGTGATGGGCAAACTCATATCGGTTATAACTCCGGCGGGAAATTGTCCCACTATTTCCGCGGTAAAGGCCAAACTAATATTAATACTCAAGAAGGCATGGAAGTTAACCCTGGTATTTTAAAATTGGTAACTGGCTCTAATAACGTACGGTTTTATGCTAACGGAACAGTATCTTCAATACAAAGAATTAAATTTGATAACGGATTAGTTCTTACTGGTGCTAGACCCGACGGTATTCAACTTGACGCTCCTACAGCAGCAGATGGCACTAAAACTATACTGTGGGCTGGTGGTACTCGTGAAGGTCAGAATAAAAGTTATGTATCTATTAAAGCGTGGGGTAATTCATTTAACGCATCTGGCGATCGTACTCGTGAAACAGTTTTTGAAGTAGCTGACGGACATGGATATTATTTTTATGCACAACGCACTAATCCTGCGTCAGGTCAAACAGTAGGTCCGGTTAACTTTAAATTTAACGGAACTGTCGAAACAGGCCATATTATAGGCCTTGGTAATATAAGTGCCTCCGGTACAGGTTCTTTTGGTGGCAATGTTACTATGTCTAACGGTTTGTTTGTCCAAGGTGGTTCTTCTATTACTGGACAAGTTAAAATTGGCGGAACTGCTGATGCATTAAGAATTTGGAATGCCGAATACGGTGCTATTTTCCGTCGTTCTGAAGATAAGCTTTATATTATTCCAACTCCACAGAATGCTGGTGAATCAGGTGGTATTTCTAATTTACGTCCGTTCTATATTACATTAAGTACTGGTAAAGTTTCCATGGATCATGATGTTGATATCGGTGGTGGAAGATTTAAAGTAGAAACTAGTGGAACAACATCAGGGCAAGCTATCACAATTAACGCTAATAACGCCGCGCTTATTATTAACTCGGCTTCATTGACCAACGCTGTTTATATTCAGGGTAAAAAAGCTAATACGGTTAAATGGTACGTTGGTAATGGGAGTGGTAGTTCAGATGAACTTAACTTATATAATAATGCATTAGGTCATGGGGTTGCATTTAGAACCGACGATGTTCTTTTTTCAAAACCATTAAAAGTTGGTAATGCTCAATTCGGTACTGATGGTAATATCACCGGTGGTTCTGGCAACTTTGCTAACTTGAATACCACAATAAATAACCTTAAGACGGATATTGTGTCGAGTTACCCAATTGGTGCTCCGATTCCTTGGCCAACGGATACTCCTCCTGACGGTTACGCTATTATGGAAGGTCAAACCTTTGATGTTGGCTTGTATCCTAAGTTAGCTGCGGTGTATCCTTCCGGCGCTCTGCCTGATATGCGTGGTCAAACTATCAAGGGTAAACCATCGGGGCGTGCTGTATTGAGTACAGAAGCAGACGGTGTTAAGTCACATAGCCATAGTGCAAGTGCATCAAGCACAGATTTGGGTACTAAAACCACTTCTAGTTTTGATTACGGTACTAAAACATCTTCAAGTTTTGATTATGGTACGAAGACTAGCAATACAACGGGTAACCATAACCATACAGTAAGCGGTACTACTGGCGCAGCAGGGAACCACCAACACTCACAGACCGGCCCAAGGGGTCCTAATAATCAACCAACAGGAATATATCCTAATGGATCTACTCAAATTAGCGGAACCCAGGTTGTTGGTTTTGGCCTAAGCAACGGTGTCGTGCCTGGTACAAGCCAATATATTGCAAAGTCGTCAACAGAAGGTAACCATACACACTCTTGGTCTGGTACTACTAGCTCTACGGGTAACCATGCCCACACCGTTGGTATTGGTGCCCATACACATACTGTAGGTATTGGTGCCCACTCTCATTCGGTAGCGATTGGTTCTCATGGTCATACAATAACTGTAAATGCCACAGGAAATACAGAAAACACGGTTAAAAACGTTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
6767ed51c0c99bf4f6622275da45500db3d9ea5ee75d41e4917e875cf987226f
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5304
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Naturally bred epsilon2 phages have an improved host range and effectivity in uropathogenic E. coli over their ancestor phages Saez,D., Loose,M., Mutti,M., Visram,Z., Hitzenhammer,E., Dippel,D., Tisakova,L., Schertler,S., Wittmann,J., Corsini,L. and Wagenlehner,F. 2020-05-19 — GenBank