Protein

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Genbank accession
YP_010111948.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 0,59
Protein sequence
MEIKGLNLDSAPLISENKSLRFAKNISVHSSLQSYINEAGFKPIGNIYSNTTDILCGIITTNIGFVAFIKRNTLGYINYYEVTNDEVVLKKSIYAYNLNFDENRPITGDYTYNYKNELIITFTEGISEEANETRIININNPTSRVESSEIHVQLNTSEVSLLNIIPDVTYPTLNFRVLNSGSLKAGAYQVAIKYCLEDGTYTNYSILHRSIIISGNYLDSVKVGDYVTKSIEVKFANVEIKYKYYKLAIVYIDEESQLAYETDNIKLEGNNTYIISNLENNTSISLEDIFVNKIGYIKDTCHVNFNNRLLRGNVKTIDYSSLDNILKNAANNAKVDLISYNKQSELDKSTTSTDVEDYNTPYYMGYEVYSIYIGFFDYKGSLINIYKCPYKEGDATTNFNTNHLIPYSDRDVVYRLSVSFPTNIISTIPNTVKSFCVFNVEHNFNNSRILSQAIALRDTDINIFSNGQKYSGQFDSETKVRIYPFEFLFNNKESISANILTYAQIDDTHISHDGNNLPDEYKCVTDTEVATSSMNLNLNDLYTTGIIGDTRQDKLEYIAANNSQVDNIAGDSYYRVVHNNAVEGSNWLTGTNKFALILLANTTDNLYVDEYNQTLQIASSIYPINENVNAICYGDTRISYLTLRATTPGTGFKIGGTSEEQSNAHVWRWIFTVPIESKFNIRARYDITTVDKAYKLHYATDIKDLYPLYGLSYEVDNAINTSIGKGYSLIFNENGIQDYVYWDEIPGIFEYPSRIIRSDILNPESEILSWRYYNANEYNDLPNNREGIVSLKTDNKNLYIQQRYGLRLAKLRDTLSVTGDGTSYLGSTDIFNIEPYEILYSPSGYIGCINSFDTAINVAGYFVYDNDKGKLFNIFGDSVSEISNINTKEWFYKNKSNDYINNPFIHNGRYFNYNEDTNVLTFVNNKDNNKFTISFNNNVKKWISFHDYIPLYGLTNRLGTIWIFDDSKIINSIYKVDENIKGYFNDKYYPSTIKILFNENPIINKELQNILWKDRVTYIDDNSKLKVTLWDKTIDNIFVHNDTQCSDIKVVKFNKEWYNGNTGVNKINIWRFNDIKDYAKTPNFLANEISIKDNALHTNLKWYNRNEIVSQFVYVIMTFNNTSNNYEYELQEADAQWIVDNRNN
Physico‐chemical
properties
protein length:1144 AA
molecular weight: 131597,12760 Da
isoelectric point:5,02101
aromaticity:0,13199
hydropathy:-0,42045

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
YP_010111948.1
1 1144
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 463 463 0,6928
Central domain 464 757 295 0,6545
C-terminal 758 1144 386 0,2837
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-463
Central
464-757
C-terminal
758-1144

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage uncultured phage cr127_1
[NCBI] 		2772077 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010111948.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_055886 [NCBI]
CDS location
range 54230 -> 57664
strand -
CDS
ATGGAAATAAAAGGTTTAAACTTAGATTCAGCACCTCTTATCTCTGAAAATAAGTCTCTTAGATTTGCTAAAAATATTTCAGTTCATTCTTCTCTACAATCGTATATTAACGAAGCTGGTTTTAAACCAATAGGTAATATATATAGTAATACAACAGATATTCTATGTGGTATTATAACTACTAATATAGGATTTGTAGCTTTTATTAAACGTAATACTTTAGGTTATATAAATTATTATGAAGTAACAAATGATGAAGTTGTATTAAAAAAGAGTATATATGCTTACAATTTAAATTTCGATGAAAATAGACCTATAACAGGTGACTATACATATAATTATAAAAATGAATTAATTATTACATTTACAGAAGGTATTTCAGAGGAAGCTAATGAGACAAGAATTATTAATATAAATAATCCTACTTCTCGTGTTGAATCTTCAGAAATACATGTTCAATTAAATACGTCCGAAGTTTCTTTATTAAATATAATTCCAGATGTAACATATCCTACTTTAAATTTTAGAGTATTAAATAGTGGAAGTTTAAAAGCTGGAGCTTATCAAGTAGCTATTAAATATTGTCTTGAAGACGGAACTTATACAAATTATAGTATATTACACAGAAGTATTATTATATCTGGTAATTATTTAGATAGTGTAAAAGTAGGAGATTATGTTACTAAATCAATAGAAGTAAAATTTGCAAATGTAGAAATTAAATATAAATATTATAAATTAGCTATTGTATATATTGATGAAGAAAGTCAATTAGCTTATGAAACAGATAATATAAAATTAGAAGGAAATAATACTTATATTATTAGTAATTTAGAAAATAATACTTCTATATCTTTAGAAGATATATTTGTCAATAAAATAGGATATATAAAAGATACTTGTCATGTTAATTTTAATAATAGACTTTTAAGAGGTAATGTAAAAACTATAGATTATTCATCATTAGATAATATATTAAAAAATGCAGCAAATAATGCAAAAGTAGATTTAATAAGTTATAATAAACAAAGCGAGTTAGATAAGTCTACTACAAGTACTGATGTAGAAGATTATAATACTCCTTATTATATGGGTTATGAAGTTTATTCCATTTATATAGGATTTTTCGATTATAAAGGTTCTTTAATTAATATATATAAATGCCCATATAAAGAAGGAGATGCTACTACAAATTTTAATACAAATCATCTTATACCTTATTCAGATAGAGATGTTGTATATAGATTGAGTGTAAGTTTTCCTACTAATATTATATCTACTATACCCAATACAGTTAAAAGTTTTTGTGTATTTAATGTTGAACATAATTTTAATAACAGTAGGATATTAAGTCAGGCTATTGCTTTACGAGATACTGATATTAATATATTTTCAAATGGTCAAAAATATAGTGGACAATTTGATTCCGAAACTAAAGTAAGAATATATCCTTTTGAATTTCTATTTAATAATAAAGAATCTATATCTGCTAATATTCTTACTTATGCTCAAATAGATGATACACATATAAGTCATGATGGTAATAACTTACCAGATGAATATAAATGTGTTACAGATACTGAAGTAGCTACTTCAAGTATGAATTTAAATCTTAATGATTTATATACTACTGGAATTATAGGTGATACTCGACAAGATAAATTAGAATATATAGCTGCAAATAATAGTCAAGTAGATAATATAGCTGGTGATTCATATTATAGAGTTGTACATAATAATGCTGTTGAAGGTAGTAATTGGCTTACTGGTACTAATAAATTCGCACTTATATTGTTAGCAAATACTACTGATAATTTATATGTAGATGAATATAATCAAACTCTACAAATAGCGAGTTCAATATATCCTATAAATGAAAATGTTAATGCTATTTGTTACGGTGATACAAGAATATCATATTTAACTCTTAGAGCTACTACTCCAGGAACTGGATTTAAAATAGGTGGTACTTCTGAAGAACAAAGTAACGCACATGTTTGGAGGTGGATATTTACAGTACCTATTGAAAGTAAATTTAATATAAGAGCGAGATATGATATAACAACTGTTGATAAAGCATATAAATTACATTATGCTACAGATATTAAAGATTTATATCCTTTATATGGTCTTAGTTATGAAGTTGATAATGCTATAAATACAAGTATTGGAAAAGGATATTCTTTAATATTTAATGAAAATGGTATTCAAGATTACGTATATTGGGATGAAATACCGGGTATATTTGAATATCCATCTCGTATTATAAGAAGTGATATATTAAATCCTGAAAGTGAAATTCTAAGTTGGAGATATTATAATGCTAATGAATATAATGATTTACCTAATAATAGAGAAGGTATAGTTAGTCTTAAAACAGATAATAAAAATCTTTATATTCAACAACGTTATGGACTTAGATTAGCAAAACTTAGAGATACTCTTAGTGTTACTGGAGATGGAACTTCTTATTTAGGTAGTACAGATATATTTAATATTGAACCTTATGAAATATTATATTCTCCGAGTGGATATATTGGATGTATAAATAGTTTCGATACAGCTATAAACGTAGCTGGATATTTTGTTTATGATAACGATAAGGGTAAACTATTTAATATATTTGGAGATTCTGTTTCAGAAATTAGTAATATTAATACTAAAGAATGGTTTTATAAAAATAAATCAAATGATTATATAAATAATCCTTTTATTCATAATGGTCGATACTTTAATTATAATGAAGATACTAATGTTTTAACATTTGTAAATAATAAGGATAATAATAAGTTTACAATATCTTTTAATAATAATGTTAAAAAATGGATTTCATTTCATGATTATATTCCTTTGTACGGATTGACAAATCGACTCGGAACAATATGGATATTTGATGATAGTAAAATTATTAATAGTATTTATAAAGTAGATGAGAATATAAAAGGATATTTTAATGATAAATATTATCCTTCAACAATTAAGATATTATTTAATGAAAATCCTATTATAAATAAAGAGCTTCAAAATATATTATGGAAAGATAGAGTTACTTATATAGATGATAATAGTAAATTAAAAGTTACTCTTTGGGATAAAACTATTGATAATATATTTGTTCATAATGATACACAATGTTCTGATATAAAAGTCGTAAAATTTAATAAAGAATGGTATAATGGAAATACTGGTGTTAATAAGATAAATATATGGAGATTCAATGATATAAAAGATTATGCAAAAACTCCTAATTTTTTAGCTAATGAAATTTCTATAAAAGATAATGCGTTACATACTAATCTTAAATGGTATAATAGAAACGAAATAGTTAGTCAATTTGTATATGTTATAATGACTTTCAATAATACAAGTAATAATTATGAATATGAATTACAAGAAGCTGATGCACAGTGGATTGTTGATAATAGGAATAATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
afd57717a5dcc13e2ea942ea46bf5d0840a28b81f1687bb4fe0b536532725219
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2417
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Taxonomic proposal: Crassvirales, a new order of highly abundant and diverse bacterial viruses Shkoporov,A.N., Stockdale,S.R., Guerin,E., Ross,R.P. and Hill,C. 2023-03-24 — GenBank