Protein

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Genbank accession
QQM14578.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,84
Protein sequence
MEDKEKNLLQINEEINSIKSKFNSLLQEQDSIKNLSEDNKNRINVLNTNIDSLDKENDNLVEKLRNLDGSHDIDLDLSNYATLDTLKTELRKYQKLSIDYIDSVVEGGWDSDIKGNLDSLNGRVSSNEESLSVTMSKVNKYESSIQYLSTKVEQTAESIKSIATDYTLNEINDSITKLESFREQTARVLQDTVTRADIDTVNNKVTEFESQISQFADLIEQTVSKSEIDGIVIGGKNLLENSLAVSGNWLLKPDTLNSSKPNALTFGQDSNGKSYFTINTEGIEGQVGAQSYNGFKLEYNETYTISFDFRSDTFNRLDYCYFIDPSGNYSTPIAEKYLDIDEEWHRYSFVYEQTLTGRNNTKLLLGVDTDLNGLSGTFDIARVKVERGNVSSDWTAAPEDYDNMLENYNKTINGKITNIEKNAVGLGDTVTEAFKDGIISNAERIAIDKQKNVIDKDKAEIDKIFNTLYPNKMMANSVKTDLKNKYDLFNEKYNILIQDITNTISDGVATQEEIAQFNTNYLRYNEAQSNIKDAIQKAIDSISNGYAVTEAGKITVGGMNLISIANITPIGSATLTKTNYLEYGELNAALTANSQGIKFKLDKVRSRREHILSFNLEKKTGTLTNVDVSIPNSTITNTFVNGVAKGQDSRNITFDDTSALTLIEVVFIPNDSFTVDTLINMIINKNGTFPMSVDIEGLKVEEGNKSTAWQPSIKDSNARITNMESRISQTENNIALSVTKETYNADKTRMEKMGSALSILADGITMSSSSNDKLSSFDIDPNSIKLKSKMVDINDGDVVISNGRATIKEAAITNLMSKNIVVQTMLDAMGEVKGGITIKRPDGGYLVYNGMPRFTTAYVRSEPGVQDLMSNGTPRFKNVGNAFMFSDKTTGSYFRRAMTLYGQHETRWLHIGIWYATPQCGIDIKVDSFNDQNGVFFDKTISIPKDTSTSVTKTKHKEIIVDMGVPAQSIASIAIRARVKPGQKGNAWILNSYIYGRN
Physico‐chemical
properties
protein length:998 AA
molecular weight: 111116,99230 Da
isoelectric point:4,98338
aromaticity:0,07615
hydropathy:-0,47194

Domains

Domains [InterPro]
Coil
Unmapped
1–28
Coil Coil G3DSA:2.60.120.260 Coil
DC_0899
STR
2–318
DC_0899
DC_1272
STR
252–795
DC_1272
IPR008979
STR
270–386
IPR008979
QQM14578.1
1 998
Architecture
STR
STR 2-795 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage MarsHill
[NCBI] 		2796499 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Staphylococcus aureus
[NCBI] 		1280 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QQM14578.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW248466 [NCBI]
CDS location
range 25652 -> 28648
strand -
CDS
ATGGAAGATAAAGAAAAGAATCTTCTTCAAATAAATGAAGAAATAAATTCTATTAAATCGAAATTCAATTCTTTATTACAAGAACAAGATAGCATTAAAAATCTATCAGAAGATAATAAAAATAGAATTAATGTATTAAATACAAATATTGATTCTTTAGATAAAGAAAATGATAATTTAGTAGAAAAATTAAGAAATTTAGATGGTAGTCACGATATTGATTTAGATTTATCTAACTATGCTACACTTGATACATTAAAAACTGAATTAAGAAAATACCAAAAACTAAGTATCGACTATATTGATAGCGTTGTTGAAGGTGGATGGGATTCTGATATTAAAGGTAATCTAGATTCTTTAAACGGAAGAGTTTCATCTAATGAGGAATCTCTATCAGTAACAATGTCTAAAGTTAATAAGTATGAATCATCTATACAATATTTAAGTACTAAAGTAGAACAAACTGCAGAATCAATTAAGAGTATAGCTACTGATTATACTCTTAATGAAATTAATGATAGTATTACTAAATTAGAGTCATTTAGAGAACAAACAGCTAGAGTTTTACAAGATACAGTTACTAGAGCTGATATAGATACAGTTAATAATAAAGTAACTGAATTTGAAAGTCAGATATCTCAATTTGCAGACTTAATAGAACAAACAGTTTCTAAATCTGAAATTGACGGTATTGTTATTGGTGGTAAAAACTTATTAGAAAATTCTTTAGCAGTTTCAGGTAATTGGTTATTAAAACCAGATACTTTAAATTCATCAAAACCAAATGCTTTAACTTTTGGACAAGATAGTAACGGTAAAAGTTATTTTACAATTAATACTGAAGGTATTGAAGGTCAAGTAGGTGCTCAAAGTTATAATGGATTTAAACTAGAATACAATGAGACTTATACTATTTCATTTGATTTTAGATCAGATACATTTAATAGACTTGATTATTGTTACTTCATTGATCCTTCTGGTAATTATTCTACACCAATTGCTGAAAAGTATTTAGATATTGATGAAGAATGGCATAGATATTCATTTGTATACGAACAAACACTTACTGGAAGAAATAATACTAAATTACTTCTTGGCGTAGATACTGATCTTAATGGTTTAAGTGGTACATTTGATATCGCTAGGGTTAAAGTTGAAAGAGGTAATGTATCTTCTGACTGGACAGCAGCTCCTGAAGATTATGACAATATGTTAGAAAACTATAATAAAACTATTAATGGTAAAATAACTAATATCGAAAAGAATGCTGTAGGTTTAGGTGATACAGTTACTGAAGCTTTTAAAGATGGTATTATCTCTAATGCTGAAAGAATTGCTATTGATAAACAAAAAAATGTTATTGATAAGGATAAAGCTGAGATAGATAAAATCTTTAATACACTTTATCCTAATAAAATGATGGCTAATTCAGTAAAAACAGATTTAAAAAATAAATATGATTTATTTAATGAAAAATATAATATATTGATACAAGATATAACTAATACAATTAGCGATGGTGTAGCTACTCAAGAAGAAATAGCTCAATTTAATACTAACTACTTGAGATATAATGAAGCTCAATCAAATATTAAAGATGCTATTCAAAAAGCTATTGACAGTATTTCTAACGGTTATGCGGTTACAGAAGCTGGTAAAATTACAGTTGGTGGTATGAACTTAATTAGTATCGCTAATATTACACCAATTGGTTCTGCAACTTTAACTAAAACTAATTATTTAGAATATGGAGAACTTAATGCAGCTTTAACTGCTAACAGTCAAGGTATTAAATTTAAATTAGATAAAGTTAGAAGTAGACGTGAACACATATTAAGTTTTAACTTAGAAAAGAAAACTGGTACATTAACTAACGTTGATGTTAGTATACCTAATTCAACTATAACTAATACTTTTGTTAACGGTGTTGCTAAAGGTCAAGATTCACGTAATATTACGTTTGATGATACTTCAGCTTTAACATTAATAGAAGTAGTATTTATTCCTAATGATTCATTTACAGTTGATACATTAATTAATATGATTATTAATAAAAATGGAACTTTCCCAATGTCTGTTGATATTGAAGGATTAAAAGTTGAAGAAGGTAATAAATCTACTGCTTGGCAACCGTCTATTAAAGACAGTAATGCTAGAATTACTAATATGGAAAGTAGAATTAGTCAAACAGAAAATAATATCGCTTTAAGCGTTACTAAAGAAACTTACAATGCTGATAAAACTAGAATGGAAAAAATGGGTTCTGCTTTATCTATCTTAGCAGATGGTATAACTATGTCATCTTCATCTAATGACAAATTATCTTCTTTTGATATTGATCCTAATAGTATTAAATTAAAATCTAAAATGGTAGATATTAATGATGGTGATGTAGTAATTTCTAATGGCAGAGCTACTATTAAAGAAGCCGCTATTACTAATTTAATGTCTAAAAATATTGTTGTTCAAACAATGTTAGATGCTATGGGAGAAGTTAAGGGTGGAATTACAATTAAACGTCCAGATGGTGGATATCTAGTTTATAACGGTATGCCTCGATTTACTACAGCGTATGTACGTTCAGAACCAGGTGTGCAAGATCTTATGTCTAATGGTACTCCTAGATTTAAAAACGTTGGTAACGCATTTATGTTTAGTGATAAAACTACAGGTAGCTATTTTAGACGTGCTATGACTCTTTACGGTCAACATGAAACTAGATGGTTGCATATAGGTATTTGGTATGCTACACCTCAATGTGGTATTGATATTAAAGTGGACTCTTTTAATGATCAAAATGGAGTATTCTTTGATAAAACTATATCTATACCTAAAGATACATCAACTAGTGTAACTAAGACAAAACATAAAGAAATTATTGTAGATATGGGTGTTCCGGCACAATCTATAGCTTCTATAGCAATTCGTGCAAGAGTTAAACCAGGTCAAAAAGGTAATGCTTGGATACTCAACTCTTATATTTATGGTAGAAACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7c40f6acfe03345bf82cf7fc524211bd90228d1932165830c5e9aab0f6856efa
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,3309
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Staphylococcus phage MarsHill Korn,A., Hillhouse,A. and Gill,J.J. 2019-07-18 — GenBank