Protein
View in Explore- Genbank accession
- YP_009008310.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTFTF
- Protein sequence
-
MSKILANQIANYLDNAPIEIKEGFNIPTGKPLQVNGSIGTNGQVLSTDGTGLVWATAPYFDGNYLSLSNLPTIPAAQVNSDWGSNSGVSQILNKPIVPPVPSVTIASSPSGNGSLTYNSTNGEFTLTQADLSSYLTVETDPVFAASDAAAVTTAKITNWDSAYSWGNHATQNYITLTNISAATAAASGAGTLTYNNSTGVFTLAPPDLSSYLTAESDTLATVAARGATTTADVTVNDMTVNGNLTVVGTTTSTAQSTLNVAATEIVINDGQTGAPALNGSLKIDRGSGTDTAIRWNEGTDIWEFSNDGTTYNPIPTNNNQLTNGAGYLTSYTETDPVFSASPAGTVTNTNITNWNTAYGWGDHSTQGYLTAEADTLDTITARGSTTNNGITVGGITVNGNMTVNGTQTVINTTTLKVSDNEITLNNDVTGTPTENAGIEVERGLSANTRIRWDETSDRWQFTNNGSNYVNLAVNISDLPNDSGFISSYTETDPVFSASAASGITTQNLTNWNASYNWGDHSTQGYLTSLGDAAGVTTAKITDWDTAHGWGDHAQAGYLTSFTEADTLDSVTGRGATTTNDITLTGATLDLSGSTSNLYIGASSNRIEMSHNTSNGNLTCTTGYQYIRAASGFRVQKEGDGFDDIIKAVADGAVELYYDDVKKFETTSTGVTISGDIALGSGDLTTTGKLFYSNNFATTGDLPSATTYHGMFAHVHGEGHGYFAHAGLWTQLLDTGSSLSELADVATTAPSSNDVLTWNGSGWAPAAAQGGGGGGGPSTDTLDDVTSRGATTSNDIFLGDSTKLGFGANGSRGDVEVYYDQANLRYTFEDVSGCEFRFENNVGGNATAFNFLKGGSTLARMSAVSVDLWAGGTQRLQTTSTGVTITGALTVTSIVKSGGTNTQFLKADGSVDSTSYLTSYTETDPVFSASEAANILSTDTTNWNTAYGWGNHAGQGYLTSVGGINTLTDVNLTTPLTNQTLVYNGSQWVNSYGASGLQSRTTAQGSTGTIADGSAGDVTIGASKSYLLMKVQTSAAAWVTLYTDTGSRSSDSSRLETTDPSPGSGVIAEVITSAASTQIITPGVMGWNDDGTPGTNVYAKVVNKSGASANITVTITYVALEI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1121 AA molecular weight: 116340,69090 Da isoelectric point: 4,22612 aromaticity: 0,08029 hydropathy: -0,23836
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage ACG-2014h [NCBI] |
1340810 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Sedonavirus > Sedonavirus tusconh |
| Host |
Synechococcus sp. [NCBI] |
1131 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae |
| Host |
Synechococcus sp. WH 7803 [NCBI] |
32051 | Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009008310.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_023587
[NCBI]
CDS location
range 155388 -> 158753
strand +
strand +
CDS
ATGTCAAAAATTCTTGCAAATCAAATTGCAAACTACCTTGATAACGCACCGATTGAAATTAAGGAAGGTTTCAACATACCAACTGGTAAACCATTACAGGTTAATGGTTCTATTGGTACAAATGGACAAGTCCTTAGCACGGATGGAACTGGTCTTGTATGGGCAACTGCTCCATACTTTGATGGGAATTACCTTAGTCTGAGTAATTTACCAACAATTCCTGCAGCGCAGGTAAACTCTGACTGGGGTTCTAACAGTGGAGTATCACAGATTTTAAACAAACCAATTGTTCCACCAGTTCCTTCGGTCACAATTGCTAGTTCTCCATCTGGTAACGGATCTCTTACTTACAACTCTACTAACGGTGAATTTACTTTAACTCAGGCAGATCTAAGTTCGTATCTAACAGTAGAAACTGACCCTGTATTTGCTGCTTCTGATGCTGCTGCTGTAACTACTGCTAAGATCACTAACTGGGACTCGGCATATTCCTGGGGCAACCATGCCACACAAAATTATATTACTCTTACTAACATCAGTGCTGCTACAGCAGCAGCATCTGGTGCTGGAACATTAACATACAATAATTCCACTGGTGTTTTCACTCTTGCACCACCAGATCTTTCTAGTTATCTAACTGCCGAATCCGACACGTTAGCAACAGTAGCAGCGAGAGGAGCAACAACAACCGCTGATGTAACTGTCAATGATATGACAGTCAATGGTAACCTTACTGTTGTTGGAACAACTACATCTACAGCTCAGTCAACACTAAACGTTGCTGCAACTGAAATTGTTATTAATGATGGACAGACTGGAGCTCCAGCACTTAACGGATCTCTGAAAATTGATAGAGGAAGTGGAACAGACACAGCAATTAGATGGAATGAAGGTACAGACATCTGGGAATTTAGTAATGATGGAACTACCTACAATCCAATCCCAACAAACAATAACCAACTAACAAATGGCGCTGGTTATTTAACCTCATACACTGAGACAGACCCTGTATTCAGTGCTTCTCCTGCAGGCACTGTTACAAATACAAACATCACTAACTGGAACACAGCATATGGATGGGGTGATCACTCAACTCAAGGATATCTGACAGCAGAAGCAGACACTCTAGACACTATTACTGCTAGAGGATCTACTACAAATAACGGTATTACAGTTGGTGGTATAACAGTCAATGGAAACATGACTGTCAATGGAACACAAACAGTAATTAATACAACAACCCTCAAGGTCTCGGACAATGAGATCACACTAAACAATGATGTTACTGGCACACCAACGGAGAATGCTGGTATTGAGGTTGAGCGTGGATTATCTGCTAACACACGAATCAGATGGGATGAAACTTCTGATCGCTGGCAGTTCACAAACAATGGCAGCAACTATGTAAATCTTGCTGTCAATATCAGCGATCTTCCAAACGATAGTGGATTCATTAGCAGCTATACTGAGACTGACCCTGTATTCAGTGCGTCTGCTGCGTCTGGTATTACTACTCAGAACCTAACCAACTGGAACGCTTCATATAACTGGGGTGATCACTCAACTCAAGGTTATCTAACATCTCTTGGCGATGCTGCAGGAGTTACAACTGCTAAGATCACTGACTGGGATACAGCACATGGTTGGGGTGATCATGCACAAGCAGGTTACCTAACTTCTTTCACTGAAGCAGATACTCTTGATAGTGTAACTGGTAGAGGTGCTACAACTACTAATGATATTACACTAACTGGGGCTACTCTAGATCTTTCTGGTTCTACTTCTAATCTTTATATTGGAGCAAGCAGTAATAGAATTGAGATGTCCCACAACACATCAAATGGTAATCTAACTTGTACTACTGGATATCAATACATTCGTGCTGCCAGTGGATTTAGGGTTCAAAAAGAGGGTGATGGATTTGATGACATTATCAAAGCAGTTGCTGATGGTGCAGTAGAACTTTACTATGATGATGTCAAAAAATTTGAAACCACATCTACTGGTGTAACTATCAGTGGAGACATCGCACTTGGTAGTGGAGATCTTACAACTACAGGTAAGTTATTCTACTCTAATAACTTTGCCACGACTGGAGATCTTCCAAGTGCAACTACCTATCATGGTATGTTCGCTCACGTTCATGGTGAAGGTCATGGATACTTCGCACATGCTGGTCTTTGGACGCAACTATTAGACACTGGTTCTTCACTTAGTGAACTTGCTGATGTTGCTACTACAGCACCTTCTAGTAACGATGTCCTTACTTGGAATGGATCTGGATGGGCACCAGCTGCTGCTCAAGGTGGCGGTGGTGGTGGTGGTCCATCTACAGACACTCTCGACGATGTAACTTCTAGAGGTGCTACTACTTCAAATGATATTTTCTTGGGGGATTCTACCAAACTAGGTTTTGGTGCTAATGGTTCTCGTGGCGATGTTGAAGTATATTATGATCAAGCGAACCTTAGATATACCTTTGAAGACGTTTCTGGATGTGAATTTAGATTTGAAAATAATGTTGGTGGTAATGCTACTGCTTTCAACTTCCTCAAGGGTGGATCTACTTTGGCAAGAATGTCAGCAGTAAGTGTTGACTTGTGGGCTGGTGGAACTCAAAGATTACAAACAACATCAACTGGTGTAACAATCACAGGTGCTCTTACTGTGACATCAATTGTTAAATCTGGTGGCACAAATACTCAGTTCTTGAAGGCAGATGGTAGTGTTGACAGCACTTCATACCTGACTTCTTACACAGAGACTGACCCTGTATTCTCTGCTTCTGAAGCAGCAAACATTCTTTCTACTGACACTACTAACTGGAACACAGCATATGGTTGGGGTAACCATGCTGGACAGGGTTACTTAACTAGCGTAGGAGGTATCAATACTCTCACTGATGTAAACCTTACCACACCCCTTACCAACCAGACTCTTGTATACAATGGATCCCAGTGGGTTAACTCTTATGGTGCATCTGGTCTACAGAGTAGAACAACAGCACAAGGATCTACAGGAACAATTGCAGATGGTTCTGCAGGAGATGTAACTATTGGAGCATCTAAATCTTATCTTCTTATGAAGGTACAGACTTCTGCTGCTGCATGGGTCACACTATATACAGATACAGGTAGCAGATCGAGTGATTCTAGTAGATTAGAAACAACTGATCCATCACCAGGATCGGGTGTTATTGCTGAAGTTATTACCAGTGCTGCTAGTACACAAATCATCACCCCAGGCGTAATGGGATGGAATGATGATGGAACACCAGGCACTAATGTTTATGCTAAAGTGGTCAATAAGTCTGGTGCTTCTGCAAATATCACAGTAACAATCACATACGTAGCCCTAGAGATCTGA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
414dd30d4d648ed313958eece1e7e3526a64bf451b6dc5e1a509cfcbab1a917c
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50