Protein

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UniProt accession
A0A1D7RQF8 [UniProt]
Protein name
Uncharacterized protein
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
Protein sequence
MSKLSISRLAGIAQTLGQVTVPAGHILDIEGSLLNSDHTGAFQLPRGTTAQRPSTALAGYTRFNTSDNKIEIYTGTQWKQFDAGGGIGGAGVDQIGKTEANAASSAAAILAANPNAADGPYWLNHGTGAYRTWCMMDAGGYHLVAKINNTPADTSNPWSFSGARWNQQSTTNEGSSVDLSNGDVLNRGYYGYTLTTGFLMAMENGYNWLHADGNRNIPRTGVTARQAFNTRQDLSQPDREDFLQWMMSVGVHRNNWDNQPYCNRVGFYRQDSSSTGMRFGITMNNENECNSNDSSIGFGVYTNNQNSSGDRNAAAGGFRWNGTTRYPRSGFIFVK
Physico‐chemical
properties
protein length:335 AA
molecular weight: 36400,47550 Da
isoelectric point:7,00918
aromaticity:0,10448
hydropathy:-0,58597

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-RIM2
[NCBI] 		687800 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Nerrivikvirus > Nerrivikvirus srim2
Host Synechococcus
[NCBI] 		1129 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AON97766.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349227 [NCBI]
CDS location
range 28677 -> 29684
strand +
CDS
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Genbank protein accession
AON97980.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349228 [NCBI]
CDS location
range 28677 -> 29684
strand +
CDS
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Genbank protein accession
AON98410.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349230 [NCBI]
CDS location
range 29021 -> 30028
strand +
CDS
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Genbank protein accession
AON98840.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349232 [NCBI]
CDS location
range 28668 -> 29675
strand +
CDS
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Genbank protein accession
AON99054.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349233 [NCBI]
CDS location
range 28689 -> 29696
strand +
CDS
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Genbank protein accession
AON99483.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349235 [NCBI]
CDS location
range 28680 -> 29687
strand +
CDS
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Genbank protein accession
AON99697.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349236 [NCBI]
CDS location
range 28674 -> 29681
strand +
CDS
ATGAGTAAACTTTCTATTAGCAGATTAGCGGGAATCGCCCAGACCTTAGGTCAGGTGACGGTTCCCGCTGGTCACATACTTGATATTGAAGGTAGTTTACTTAATAGTGATCATACTGGAGCATTCCAGTTACCTAGAGGTACAACTGCTCAGCGTCCTTCTACAGCATTAGCAGGATATACTAGATTTAACACTAGCGACAATAAGATTGAGATTTACACTGGTACTCAGTGGAAACAGTTTGATGCTGGTGGTGGCATTGGTGGTGCTGGCGTTGATCAAATCGGTAAAACTGAGGCAAATGCTGCATCTTCTGCTGCTGCAATCCTTGCTGCTAATCCGAATGCTGCTGATGGACCTTACTGGTTAAATCATGGTACTGGTGCATATAGAACCTGGTGTATGATGGATGCTGGTGGGTATCATCTTGTTGCCAAGATCAATAACACTCCTGCTGATACATCTAATCCCTGGTCATTCAGTGGTGCTAGATGGAACCAGCAAAGTACAACTAATGAGGGTTCAAGTGTGGACCTGAGTAATGGTGACGTTTTGAATAGAGGATACTATGGTTACACTCTGACAACAGGATTCCTCATGGCAATGGAGAATGGATATAACTGGTTACATGCTGATGGTAATCGAAACATTCCTAGGACTGGTGTTACTGCTAGACAAGCATTTAATACTAGACAGGATTTGAGTCAACCAGATCGTGAGGACTTTTTGCAATGGATGATGAGTGTTGGTGTTCATAGAAACAACTGGGATAACCAACCTTATTGTAACAGAGTGGGATTCTATAGACAGGATTCTAGTTCTACTGGTATGAGATTTGGTATTACTATGAACAACGAGAACGAGTGTAACTCTAACGACTCTTCAATCGGATTCGGCGTTTACACCAACAATCAAAATTCTAGCGGTGACAGAAATGCTGCTGCTGGCGGATTCCGCTGGAACGGCACTACTCGTTATCCCAGATCTGGATTTATTTTTGTCAAATAA
Genbank protein accession
AON99910.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349237 [NCBI]
CDS location
range 28677 -> 29684
strand +
CDS
ATGAGTAAACTTTCTATTAGCAGATTAGCGGGAATCGCCCAGACCTTAGGTCAGGTGACGGTTCCCGCTGGTCACATACTTGATATTGAAGGTAGTTTACTTAATAGTGATCATACTGGAGCATTCCAGTTACCTAGAGGTACAACTGCTCAGCGTCCTTCTACAGCATTAGCAGGATATACTAGATTTAACACTAGCGACAATAAGATTGAGATTTACACTGGTACTCAGTGGAAACAGTTTGATGCTGGTGGTGGCATTGGTGGTGCTGGCGTTGATCAAATCGGTAAAACTGAGGCAAATGCTGCATCTTCTGCTGCTGCAATCCTTGCTGCTAATCCGAATGCTGCTGATGGACCTTACTGGTTAAATCATGGTACTGGTGCATATAGAACCTGGTGTATGATGGATGCTGGTGGGTATCATCTTGTTGCCAAGATCAATAACACTCCTGCTGATACATCTAATCCCTGGTCATTCAGTGGTGCTAGATGGAACCAGCAAAGTACAACTAATGAGGGTTCAAGTGTGGACCTGAGTAATGGTGACGTTTTGAATAGAGGATATTATGGTTACACTCTGACAACAGGATTCCTTATGGCAATGGAGAATGGATATAACTGGTTACATGCTGATGGTAATCGAAACATTCCTAGGACTGGTGTTACTGCTAGACAAGCATTTAATACTAGACAGGATTTGAGTCAACCAGATCGTGAGGACTTTTTGCAATGGATGATGAGTGTTGGTGTTCATAGAAACAACTGGGATAACCAACCTTATTGTAACAGAGTGGGATTCTATAGACAGGATTCTAGTTCTACTGGTATGAGATTTGGTATTACTATGAACAACGAGAACGAGTGTAACTCTAACGACTCTTCAATCGGATTCGGCGTTTACACCAACAATCAAAATTCTAGCGGTGACAGAAATGCTGCTGCTGGCGGATTCCGCTGGAACGGCACTACTCGTTATCCCAGATCTGGATTTATTTTTGTCAAATAA
Genbank protein accession
AOO00125.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349238 [NCBI]
CDS location
range 28677 -> 29684
strand +
CDS
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Genbank protein accession
AOO00339.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349239 [NCBI]
CDS location
range 28677 -> 29684
strand +
CDS
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Genbank protein accession
AOO00553.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349240 [NCBI]
CDS location
range 28668 -> 29675
strand +
CDS
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Genbank protein accession
AOO00766.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349241 [NCBI]
CDS location
range 28680 -> 29687
strand +
CDS
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Genbank protein accession
AOO00980.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349242 [NCBI]
CDS location
range 28682 -> 29689
strand +
CDS
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Genbank protein accession
AOO01194.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349243 [NCBI]
CDS location
range 28683 -> 29690
strand +
CDS
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Genbank protein accession
AOO01622.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349245 [NCBI]
CDS location
range 28665 -> 29672
strand +
CDS
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Genbank protein accession
AOO01836.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349246 [NCBI]
CDS location
range 28692 -> 29699
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CDS
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range 28677 -> 29684
strand +
CDS
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Genbank protein accession
AOO06327.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349267 [NCBI]
CDS location
range 28680 -> 29687
strand +
CDS
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Genbank protein accession
AOO06541.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349268 [NCBI]
CDS location
range 28680 -> 29687
strand +
CDS
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Genbank protein accession
AOO06755.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349269 [NCBI]
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range 28679 -> 29686
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CDS
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Genbank protein accession
AOO08257.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349276 [NCBI]
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range 28677 -> 29684
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Genbank protein accession
AOO08901.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349279 [NCBI]
CDS location
range 28680 -> 29687
strand +
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Genbank protein accession
AOO09330.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349281 [NCBI]
CDS location
range 28677 -> 29684
strand +
CDS
ATGAGTAAACTTTCTATTAGCAGATTAGCGGGAATCGCCCAGACCTTAGGTCAGGTGACGGTTCCCGCTGGTCACATACTTGATATTGAAGGTAGTTTACTTAATAGTGATCATACTGGAGCATTCCAGTTACCTAGAGGTACAACTGCTCAGCGTCCTTCTACAGCATTAGCAGGATATACTAGATTTAACACTAGCGACAATAAGATTGAGATTTACACTGGTACTCAGTGGAAACAGTTTGATGCTGGTGGTGGCATTGGTGGTGCTGGCGTTGATCAAATCGGTAAAACTGAGGCAAATGCTGCATCTTCTGCTGCTGCAATCCTTGCTGCTAATCCGAATGCTGCTGATGGACCTTACTGGTTAAATCATGGTACTGGTGCATATAGAACCTGGTGTATGATGGATGCTGGTGGGTATCATCTTGTTGCCAAGATCAATAACACTCCTGCTGATACATCTAATCCCTGGTCATTCAGTGGTGCTAGATGGAACCAGCAAAGTACAACTAATGAGGGTTCAAGTGTGGACCTGAGTAATGGTGACGTTTTGAATAGAGGATACTATGGTTACACTCTGACAACAGGATTCCTTATGGCAATGGAGAATGGATATAACTGGTTACATGCTGATGGTAATCGAAACATTCCTAGGACTGGTGTTACTGCTAGACAAGCATTTAATACTAGACAGGATTTGAGTCAACCAGATCGTGAGGACTTTTTGCAATGGATGATGAGTGTTGGTGTTCATAGAAACAACTGGGATAACCAACCTTATTGTAACAGAGTGGGATTCTATAGACAGGATTCTAGTTCTACTGGTATGAGATTTGGTATTACTATGAACAACGAGAACGAGTGTAACTCTAACGACTCTTCAATCGGATTCGGCGTTTACACCAACAATCAAAATTCTAGCGGTGACAGAAATGCTGCTGCTGGCGGATTCCGCTGGAACGGCACTACTCGTTATCCCAGATCTGGATTTATTTTTGTCAAATAA
Genbank protein accession
AOO09544.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349282 [NCBI]
CDS location
range 28686 -> 29693
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CDS
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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
f3bc42780f73d0f22d764beb41dfca0d36bb91bc9db315413ebcc66bde23a715
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5725
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50