Protein
View in Explore- Genbank accession
- YP_010355702.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTFTF
- Protein sequence
-
MSFHINSDKEKIRGVNPKLIGDNEATIRVGTGANEQEIMRLQKDPVSGLPRVGINRTGQRVNNIDIDQGGTGYNQVPIIEIDPPPTGGVQARASASIFNGRVTSVSVNEPGSGYTSVPGVAFIGGNGQGASATAFLDTVEFELDINGAIRTSTSIISDTARILNLDIENFITPDLNLRAPNLKTYMNGTGTPWASNVIVQKGQYRYAVSNVYQALNTGTTGILTPEHKDGVVTNGTVDFKHIGFRVSNPTDFDYLETGEAGAFPRSITPLLGDRSDKIATTEYVLNLATNDVGGRIYVSQQIGSDLNDGRSAVNPVRTIKKAAQEAWKTPGVKETLIVSGGNYVEDNPISLPPDCSVVGDNLRLVIIRPGNVGKHIFKFGDKNYVTGVTYRDKVDSNGDATGTWDFAMVFDDKQRIIIDNEVNGDFGVEFPVGHQVFGPDRFRISFQNNTGLALLQSGVQLLGLNTGARADSSGVSFNSTTGSNAFVAGTIDVTLTSGSFIEGDQYSYITSAAVGGALSQTISGTSGENTLRFTTDPSTDLPVSDVVFLDDTDNSSFTSGFYQVSVVNNGNAPTYWDVTFVPILGAIGWDSTLSDSTITVSSATPTTNTIDSTNLKSIRAEGEVVSYDEDIISTLPITRLDFSLQGDPSIATGGFQSDIYGDAEDIGGVVVYTSALVGRTNFHEFKEGQEIVLENLPTSGPDLSFLNGKQRIYKVLEDADGRCRRFVIPKKIPSLTTANFSPSEFAVVKSYSKSVTLSLLNSPNKFALATPTERRYQDACQLIRNNRDYIAEEVVGIINDQFKSDYYSVYNLDAVNNTFDIYLGPLDHANTYVSGGTVAFGGNSYAISDFVYDTLVTGVATITTTAAGISALSEDDTVQLADILISCTAGQKIYPSYSSPTNVNNGSNGDEQCKQDVIHFLNALVRDLEFGSNHNIIEAASKYIVNGKITYIEDEIIQNVRAIEYARELAIYAMCNWRIKNRTVSDPLYTTKYATSVRYTDPTIVNTTAGTPACDDVRSAIDTLAYLWADVITNDASGTYLDAAYLIAKNADLIADQALIDTEVAYPTLGLSNIRQRKCLRDIRLVIEGLVRDLVLGGNHGIVSAAESYFSGTVLSGIPEAQLDETRYAFQQVKDLAIAAMRNWSDGDVVPTTPTGSTYAPTTGILTVTFPNLAIIPSLQDRVAFAEGAITYSCAANGGGNDASPYRTDLNFGQSFALTNVSSSGGNTTITANVGVAGSNADVHTFVSALTGGTKIIYAPFATTSLIPKFEDWSILEDSANPSCAAIASAITTALTTFDSILEYASDPVNGAAPGSITQTFGTLYETNSLLTYPTSFINDFSNKRMAVRGVYDDYPIIEASPYTQNASVISFRGGGGAEIDGDKVKQPNCPFPGLEPDGTASFPNQGKSMVAAAFTIVSFGGTGYKVINDGYTQLVSVFVIFCQDGVLCETGGYASITNSATNFGTFALRGTGFRKDAYEFDAGVVNVVSQTPTGRTILTVGNIGREPLEHYIVKIDGYRNADPDKEFFIESVSGVTVGPPFTAILTIDDGIGNGLTLIRESDGATVSGLTALQQALTPSNAANAAIKLHRPSIVNSSSHTWEFAGSGTNYLALPENGGTKVEANEQVSENYGRVYVSGTDELGDFKVGTFARIENRTGNITFTGTVTISEVEFLKLKGGDVVVTGFDNSNTLGGANATDSKLPTQKAVKDYITNSLGPYINKPYSTNAVPRALVELTDSGKISLDQIPALRPFSIFTVVNEAERLSIEGALAGDIAIQDNSDVVDGSPQSFILNNDLSSLFLGFAVDPSLVFNIGEVFVGTPSTGRIQSTEYREGVLHKINITNGGSGYTVPPTVSITGGNPSAGAVPATATCTIANGEVVTVTITENAGFVGGFGYTTQPSIDIPAPPGAGTQATADGFIESRLYGNIVNAIKILDTDTFTDNDSPTNTINILRVVNTSSNIVSNWVSLSSEAVGVGSLTGPGVISTTLLGSEAANSFTFLRGDQRYAKTVQSLKGAETRYFARLFAQASLGSNSFIFQGLSGVLKGNTISDNVAGVVADTTVNGVTVVAGLTTVSFNNPIDANIPAGTVIEFGRGASPLVFDSTNTGGEFIDSVVIANPGTGFTDGQYFDVALDAPAGINGNDLRVNIIVGEDGRSGEVTTVTVTNAGNGFTQDFQITPNPSVIGSGSNLVLLAKVATTQKQFANISLDIQRVSDLTISQDLFGTIGVSRYKKSQFNIGTEGNGSVSIKMGPDSGLDADLLDGQQGSYYLNGAFFVDSSINPDKLASGTYGIDISGRSTNTLRVDTGISNPNANPSPSESIQGLTLQTLFNSSNGLLSAYPSVDTGNQNSAKHLVMTLRNGETGGDATYGGVRQLAFANDDRIYFRGSGDGVSNYNSWFEVWTSGNQGVSSGMDSDKLDNKEGVWYQDGWNIKENTIFETRLPTWRSSTKFRDKIEVASYGGTDTFYRIFVRQNLDTSAGGDFETTKTIDLYNVNKLSVGDFTITATDRNIDLNDSSNTYTMLTGRLSSGGNIEAAIYLGYAGDEREFEQYEIFDDNTVQYAELGNNSGTGYLRLGRYDGISATDPYVYFNSSQAQAVDNNGDPTYNSAIIATGGTATEGSGSIEIKVLNENELTVNSNIIWNAGNVAFNSSNVVSTASLKSAVMRDTSGNFTAGTITAGIIGAASLNVLKTGDTMTGGLTITGNNNLAIQGTGALNVGGNATLGADLTVDSGTLYVNSTNNRVLIGQTTESNPVKFNVYTASGDTEFATGSALSSQTTLYQSSVFNQVDTGESGIVLQHGASAAAQWGITTHRTGANVGELIIRTRTATATSATRLTISNGGSILPGADSDQDLGSDTVRWQNIYSDITHALNSVRIAKGVSNQEADIQFLGGGTGNGGGRGFRIGNNIGGGADVFEIYSSETNGADDWKSLATPDPLPPALAIQGTNNRVGINTNSFSGTDTTVTPNENRDYILNINGNMNIDGQLFQDNAEFVTSRWTKSTNDSGANIYRNSKVGIGDVASPAYQLHVKGGLNIEGSTYSSGQNQDVLWANGQAQWVDSYGIIKIQRTNINEDVTIPANVVSSSIGDIEIASGKTVTIASGGEWYIMD
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 3114 AA molecular weight: 329981,58850 Da isoelectric point: 4,52122 aromaticity: 0,08349 hydropathy: -0,15443
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage ACG-2014e [NCBI] |
1493510 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Chalconvirus > Chalconvirus acg2014e |
| Host |
Synechococcus sp. WH 7803 [NCBI] |
32051 | Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010355702.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_062736.1
[NCBI]
CDS location
range 92101 -> 101445
strand +
strand +
CDS
ATGAGTTTTCATATTAATTCCGATAAAGAAAAAATTAGGGGCGTAAACCCTAAACTCATCGGTGATAATGAAGCTACAATTAGGGTAGGCACTGGGGCAAATGAACAGGAAATCATGCGCCTACAGAAAGATCCTGTTAGTGGTCTTCCCCGTGTAGGTATCAATAGAACAGGTCAAAGAGTCAATAATATTGATATCGATCAAGGAGGAACTGGATACAATCAGGTTCCTATAATTGAAATTGATCCACCACCAACTGGTGGAGTTCAAGCTCGAGCGTCTGCTTCTATTTTTAATGGTAGAGTTACATCTGTTTCGGTTAATGAACCTGGATCTGGTTATACATCTGTTCCTGGTGTTGCATTTATAGGAGGAAATGGTCAAGGTGCTTCAGCAACTGCCTTTCTTGATACTGTTGAGTTTGAACTTGATATCAATGGTGCTATCAGAACATCAACATCTATCATTTCTGATACTGCGCGAATTTTAAATCTGGATATTGAGAACTTTATTACTCCAGATTTGAACCTGAGGGCACCAAACCTCAAAACATATATGAATGGCACTGGTACGCCATGGGCTTCCAATGTTATTGTACAAAAAGGTCAGTATAGGTATGCGGTTAGTAATGTATATCAAGCATTAAACACAGGAACTACAGGAATTCTTACACCAGAACATAAAGATGGTGTTGTAACAAATGGAACTGTAGATTTTAAACATATTGGTTTTAGAGTAAGCAACCCAACCGATTTTGATTATTTAGAAACCGGAGAAGCAGGAGCATTCCCGCGTTCTATTACTCCATTGTTGGGTGATAGATCAGATAAGATTGCTACTACAGAATACGTCCTCAACCTAGCAACGAATGACGTTGGTGGTCGTATCTACGTTTCACAGCAGATTGGTTCTGACCTAAACGATGGTCGTTCTGCCGTAAACCCTGTCAGAACAATTAAGAAGGCAGCACAAGAGGCATGGAAAACTCCTGGTGTCAAAGAAACACTAATTGTTTCTGGTGGTAATTACGTAGAAGATAACCCAATCTCACTACCACCTGATTGTTCTGTTGTTGGTGATAACCTTCGTTTGGTAATTATCAGACCTGGTAATGTTGGTAAGCACATCTTCAAGTTTGGTGATAAAAATTATGTTACTGGTGTAACTTATAGAGATAAAGTTGACTCCAATGGAGATGCCACTGGAACGTGGGACTTTGCTATGGTCTTTGATGACAAGCAAAGAATTATTATCGATAATGAAGTTAATGGAGACTTTGGTGTTGAGTTCCCAGTTGGACATCAAGTTTTTGGACCAGATAGATTTCGTATCTCTTTCCAAAATAACACAGGATTAGCATTACTACAATCAGGAGTTCAACTTCTAGGTCTGAACACTGGTGCTAGAGCAGATAGTTCTGGTGTATCTTTTAACTCAACAACTGGATCGAATGCATTTGTTGCTGGCACAATTGATGTGACACTAACATCTGGTTCTTTTATTGAAGGAGACCAGTATAGTTATATTACATCAGCTGCGGTTGGTGGTGCATTATCACAAACAATTAGTGGCACTTCTGGAGAAAATACTTTAAGGTTTACTACAGATCCATCAACAGATCTTCCAGTAAGCGATGTTGTTTTCTTAGACGATACCGACAACTCATCATTCACTTCAGGTTTTTATCAAGTATCAGTTGTTAATAATGGTAATGCACCCACTTACTGGGATGTTACTTTTGTTCCTATTCTGGGTGCAATAGGATGGGACAGCACTTTATCCGATTCAACGATCACGGTTAGTTCTGCAACACCAACAACAAATACTATTGATAGCACAAACCTCAAGTCAATTAGAGCTGAAGGTGAAGTTGTTTCTTATGATGAAGATATTATATCAACTTTGCCAATCACTAGATTAGATTTCTCTCTACAAGGAGATCCTAGTATTGCTACTGGCGGTTTCCAATCTGATATTTACGGAGACGCAGAAGATATTGGTGGTGTTGTTGTTTATACGAGTGCTCTTGTAGGTAGAACTAACTTCCACGAATTTAAAGAAGGTCAAGAAATTGTTCTTGAAAACCTCCCAACTTCTGGACCAGACTTATCTTTCTTAAATGGAAAGCAAAGAATTTACAAAGTTTTGGAAGATGCTGATGGTCGCTGTAGACGATTTGTAATTCCCAAAAAAATTCCATCTTTAACAACTGCAAATTTCTCCCCAAGTGAATTTGCTGTAGTAAAATCCTATTCCAAGTCCGTCACACTTTCATTATTAAACTCACCAAACAAATTTGCTCTAGCAACTCCTACTGAAAGAAGATATCAGGATGCTTGTCAATTAATTAGAAATAACAGAGACTACATCGCAGAAGAAGTAGTTGGTATTATTAATGATCAATTTAAATCCGATTATTATTCTGTATATAACTTAGATGCGGTCAATAATACATTTGATATTTACTTAGGTCCATTAGATCATGCAAACACATATGTCAGTGGTGGTACTGTAGCATTTGGAGGAAATTCCTATGCTATCAGTGATTTTGTATACGACACTCTAGTAACTGGTGTAGCTACTATTACAACCACGGCAGCTGGCATCTCTGCGTTGTCTGAAGATGATACTGTTCAGTTAGCAGATATTTTAATCTCTTGCACTGCTGGTCAGAAAATTTACCCATCATATAGTTCACCAACAAATGTAAATAATGGGTCTAACGGAGATGAGCAATGTAAGCAAGACGTTATTCACTTCCTAAATGCTCTTGTAAGAGATCTTGAGTTTGGGTCCAACCACAATATTATCGAAGCTGCTTCTAAGTATATTGTAAATGGAAAGATTACTTATATTGAAGATGAAATTATTCAAAATGTGCGTGCAATTGAATATGCTAGAGAATTAGCAATTTATGCAATGTGTAATTGGAGGATTAAGAACAGAACAGTTTCGGATCCTTTATATACCACGAAGTATGCTACATCAGTAAGGTATACAGATCCCACTATTGTTAATACAACAGCAGGAACTCCTGCTTGTGATGATGTAAGATCTGCTATTGATACACTAGCATACCTTTGGGCTGATGTTATTACTAATGATGCATCTGGAACATATCTTGATGCTGCTTATCTAATTGCCAAGAATGCTGATCTAATTGCAGACCAAGCACTTATTGATACCGAGGTAGCATATCCAACTTTAGGTCTTTCAAATATTCGCCAAAGAAAATGTCTTAGAGACATTAGACTTGTAATTGAAGGTCTTGTAAGAGACTTAGTTCTTGGAGGAAACCATGGTATTGTTTCTGCTGCAGAATCGTATTTTAGTGGAACTGTTCTTTCTGGAATTCCAGAAGCGCAATTGGATGAAACCAGATATGCATTCCAGCAAGTAAAAGATCTTGCTATTGCGGCAATGCGTAATTGGTCTGATGGTGATGTTGTACCAACAACACCAACAGGATCTACATATGCTCCAACTACTGGAATACTTACAGTAACTTTCCCCAATCTTGCTATCATACCATCCCTTCAGGATAGGGTTGCTTTTGCTGAAGGAGCTATTACATATAGTTGTGCTGCTAACGGTGGTGGTAATGACGCAAGTCCCTATAGAACTGATCTAAATTTTGGACAAAGTTTCGCGCTTACAAATGTTTCATCTTCTGGAGGAAATACTACAATTACTGCTAATGTTGGAGTTGCTGGATCTAACGCAGATGTACACACGTTTGTAAGTGCTTTAACAGGCGGAACTAAAATTATCTATGCTCCATTTGCAACAACTTCACTTATTCCAAAATTTGAAGATTGGAGTATTCTAGAAGATAGTGCAAACCCATCATGTGCTGCTATTGCTTCTGCTATCACAACAGCATTAACAACCTTTGATAGTATTTTAGAATATGCTTCTGATCCTGTAAATGGTGCTGCTCCTGGATCTATTACACAAACCTTCGGAACTTTATATGAAACTAATAGTCTTCTGACTTATCCTACTAGTTTCATTAATGATTTTAGTAATAAAAGAATGGCAGTTCGTGGTGTATATGACGATTATCCAATTATTGAGGCATCTCCATATACCCAGAATGCATCGGTTATATCCTTTAGAGGTGGTGGCGGTGCAGAAATTGATGGTGATAAGGTCAAGCAACCTAACTGTCCTTTCCCTGGTCTAGAACCAGACGGTACAGCATCATTCCCCAATCAGGGTAAATCGATGGTTGCTGCGGCATTCACGATTGTCTCCTTTGGTGGCACAGGATATAAAGTTATCAATGATGGTTATACACAGTTAGTTTCTGTCTTCGTTATCTTCTGTCAAGATGGTGTTCTTTGTGAGACTGGTGGTTATGCATCTATCACCAACTCCGCAACTAACTTTGGTACATTTGCTCTAAGAGGAACAGGTTTCCGTAAAGATGCATATGAATTTGATGCTGGCGTAGTTAATGTTGTTTCTCAAACACCAACTGGTAGAACTATTCTTACTGTTGGTAATATTGGAAGAGAACCACTAGAACATTACATTGTTAAAATTGATGGTTATAGAAATGCAGATCCAGACAAAGAATTCTTTATTGAATCTGTAAGTGGAGTCACTGTTGGTCCTCCTTTTACAGCAATACTTACGATTGATGATGGTATTGGAAATGGTTTAACTCTAATTAGAGAGTCTGATGGTGCTACTGTTTCTGGTCTAACAGCACTACAGCAAGCATTAACACCATCTAATGCAGCAAATGCTGCAATTAAATTGCATAGACCATCTATTGTTAACTCTTCTTCCCATACTTGGGAATTTGCAGGTTCTGGAACTAACTACTTAGCTCTTCCTGAGAACGGTGGAACTAAAGTTGAGGCAAACGAGCAGGTATCTGAAAACTATGGTCGTGTATATGTTTCAGGTACTGACGAACTAGGCGACTTTAAAGTTGGAACATTTGCGAGAATTGAAAACAGAACTGGTAATATTACCTTCACGGGTACAGT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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
efcb1487686eeeb96f28f51e4a8a650f84951e3d89e0b4a87e056cb9f23b055f
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community | Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. | 2015-03-20 | — | GenBank |