Genbank accession
XYR95944.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MAVDRVKFQEIVASQLPRYVREDFPLLSDFLEQYYVSQEYQSGPVDIINNIDQYVKVEELYDIVESTTLAEILDYNDRFVTVVSTEGFSETNGIIQIDNEIIFYETKTDTEFQNCRRGFSGITTYVTTGAPDELTFSQTEADTHLLGTEVVNLNVLFLKQFFKKIKGQFTPGFADRNFYSGLNSKNFIYNSDSFYSSKGTDQSFEILFRALYGEDVEILKPSQFLLTPSNANYRVTQDFVVEKLQGDPLDLQNLTIFQKRTNARGSVTNVQQIPYDDYQFYQISIDAGFARDTDVTGSIFGEFEPNPLTKLLTSVSFGSTVLDVDSTVDFPEYGKLVVNDVDGNAIGVAYSGKTTNQFFNVSGLTNSLNKKSDVKLDSFSYAYVGIDTSQEIRVRFTSTLKDFVQNDPTYYFKKNDTIEIKSFGYEAPGKKANNYVLNVQTKFKIAESSVIDADAFVYNFKLYNDHFFQEGYELRYENEDGTVSNLGTVTRIVSENEINVRFGQQINLSGTFYLENQLLKGSSTSHSYIKNFVANVQNTYAKFNGDVLISSNSLPKYNDIETNTYDKKVTFSASLLSTDILPLPTNPTSLPDHGFYTGDSVYFQSAGNGFDGVTTGSYFVYRVNESEIKLARSNADLTRESYITFNGSVVNASLSYLDFYGKTIQPQGIYRKILSPTNRKRIEKTTSGYTGIFVNGLELLNYKSSSSVYYGDILDFTMTSGGTGYDIINPPVVKIVDEVGTGATGVANVKGQLVKLDVTDPGMGYYAPPTITIKGGNGSGAQAEPRMTSIKLENSFVANFPSDVNLTTNEITFETDHKFLDGESVIYEPRNTSGIVGLNTGGEYFVFVTGQKSIQLHTTKGDVFAGINTVDLAGYGDGVQYLVAKELKQVVSSVVVTNPGVGYENKKRTISTAGINTVSDRVEILNHGYKSKEVVRYTRGTPRVEGLSEDKDYFVKKINDDAFALTEVGTGSVERDYYYDRGICINFTKQGVGSFNYPPITVEVEGAAASFDKTFVEDFQELYIIESPIEENIITPVSVLAWTDTEAEITNPYYVLVSADANWLISDDPFIGNILLYEAKLQPVFRGEILSIDLTNGGVGYGASTIVDFRRQPEITFESGSKAKLTPIINNGKIVEVIVNSGGSGYNAPPDLNIVSETGNFAILVPIINNGEIESVYVQKGGAGYVTGKTTIDVIPAGSGAKTQANIRGWNINLFERNFSNFKDDDCIIEENISNKSLQYAAVYAPRPLRESLNSLNGFGEDNIKYGIFDLTLSVGGEEIDSLYHSPIVGWAYDGNPIYGPYGFDNIDGTGNIRRMVTSYKLKNTPVNRPSYNAFPNGFFVDDYIYAGDGDLDEHNGRFCVTPDYPNGVYAYFCTISDTVDSSGPFNNYRRPLFPYVIGNDYNSLPIPFNFKSASNQTHYNIVGDGWFRNTKNYFTNGGNSQYDYIYNSDKLRNQSLDITATSSGSVDGMAILDPGDGYKIGDRVELNSTNTGGRNANFRVSQLKGKNVNSVSLATTSYENVEFTSTGSANGFVGITSAPHNFLPLDTIFIDGLSSYYKGFAGSYSVGVSSERWYVSLGIGTDTVTGIVTYVYMNGPFGEDSIRANDILRIEREKLKVLNIDEKSGRVRVLRGVDGTLAVAHSAGTIVRDDPRKLRFLSTGINTQRNLTINKQLYFTPNEAVGVGTSTVGTATTITFSNPGVGLTQVRVDQRQIYLPDHKLSLNTPMIYYTNGGTSIACWSGITSTPIFNLDETRNIFAIPLSKDIIGIATQRVGVNSVGQYVGINSEKGGLLYFESAVGLGSYHSFNTNITSVIKGRVSQNVVTVSTAQTHGMKRGDIITVDVNPTTTTTIQVKYDDFNRRIVFDPDTIQPTGINTNNNSFHVPENKYFTGDKVIYTSGDPSENLTASGMYYVYSYMNNKIKLVEYLSELSSENPTFVNVGSATTGTLSKINPGVRAQKNQYIKFDLSDTSLSFVDKGITYSAFDMFIYSDSQEVNEFWTTRTDRNFEVTKSGVVGVDTTANLTLFMSDNIPNNLYYGFSPDNLDIIPPVKLRLFKDDTVINNNSINLTKNKFDGIYNVVGVTSDTFEYNIPFDYDTVVSYGTTNATMKYDTSSLTANGPINKINALNKGVGYKSLPGFSSVTSKNGTGALIQPSSTTIGSVLGTKFNYIGFGYPSDKTLNVVGNLPQVLRVDPLGSFESIGISSGGVNYSQAPDLIVIDGFTNQVITDIELDYELGDNEVNIIENTKSLNNVPPTFIPTQNTNGFSISSVSYNSTNKIVRLTFSKQFSEVKDWPFKVGEKVIVENVAIGFNTTGRGYNSEDYNYSLFEVTALDSQIGGANAYIEYNLTDYLAPGEFPGQVTSSISGSVTPESFFPIFDSKLVTTNFFEGERVTNIGYVGRVERFDATSGYLFVSSEDDFEVGTILESQSSGNKANIISNIDFDSTIRLGVGATFVDGWQTNSGFLNDNLQVIPNNEYYQNFSYSLKSRVPYETWDDAVSSLNHTAGFEKFADLVIDNNAAGIASAVDFQIETVVDLIGEGMLNCFPDFDGATELTLDINGGKTISNEIVFENKILVDYFESRGNRVLKIDDFSGEFNSNPRETKYSIVDFFDNKYAWNKFFTLVQDRELRSRKQFGVVTVLQDGTTGYVNQYGTIDTGKSLGSFDYIGAGTSEWGLTFFPNLFEYNNYDISYFTFSGVESLTSVGSTQVGDIVSIASSSVTVPVSTTTTLVKVPTVSRSAKLHVQLEDAEDNYFYTELNVLHDGTNVQLLQYGDVDSTEGISSGFGTYTANISGGFIDVNIVPTVGTAVTANIISIETNITAVGVNTTEMSVTNLSSYYKSISASGSPVANEIAAYEDPFAGEYFMVTVHDTTNNEYEMFECHVLDSNNQNIVKYGRIGTNSGLGTVGAVTSGTSVSLVFTPNPSIDVAVRTFGIGLKNFNNIVGIASISALQNNILFSDYGTYTGTEFDKKRAFNLKHNTLPIFQRAFLGNDSSIVNLSTNQVTIPDHFFVTGEKVNYSYENSQLSTANAIGIATTTVSGVSTDKLPSELYIIKYSNKSVGFAKSATDALAGSPIALDLTSVGVGTFHKLTATNQNARALVAVDNMIQAPVTEVNVSTRLDQNVVFDVDFDVVGIQSFKANDIIKIDSEIMLLQDVGVGATNKFRVLRGQMGTGVATHNIGTSVELLGGNYNIVDNTLHFVEAPFGATPLSTTTQGPDNIDWSGITTYSTFQGRTFMRSGITDDSVDTYSTNYTFDNIQSQFNGQTKFFSLVQNGNNVTGFATNQAIILNSNILQEPQGAQNTTGDFTLLETAGITSITYLGDSVSSESDPNMATIPRGGTIISVASTPGLGYQPLISAGASCFVSGGGTITSVEIGNPGSGYRVGVQTVNVGYAVSSTGITTVVNIGTATVQNGQVVAITTSYFGANLDQNNPPLIVIDAPLPYSNIPLVYADGQTGMGTGARVDITVGQGSSVVNFDIVSGGFGYGDGEVLRLSIGGTTGIQTDTSYTYDEFQLTVSTTYRDTFNGFTVGELDVFDKLDTLFDGVEKRFPLTIAGAGFAIETADGSDINIAQCLIVTINDILQVPNQSYKFNGGSIIEFTEAPKKGDTSKIIFYKGTPDVDVVLVDILETVKVGDSLQLKNDSSKGQGFGLYQEPRTVVGITTLDTVRTFPYDGPGITTNQALVRPLTWCKQTDDITINGDFVTKDRVEYEPSIYPAAYLTSYVGTSSAVAYTDTVRPFFNSTNETSLLDYQDRIVIIDQSPIASAIATASTGSGVDPEYNNGPIINLVGDGSDLFKREVTVNGVRIVSAGTTGGQIAVPDVWVEKVARMVELFTDVNGAGINETSQRNLIKTLSGDSGTYHAGKPTIQRVARGAGADYTPNFLTDQGIIDWNLTNLFDTTVQNDMVWYLNSTGSGYGDGDQDAQEVIEHVFHTLHMHGLPADTIKLYSYLASDWQTGDLYAAMEEAYDGGFWDSSGYGGNTWKTDADAFEVAAKEYLYLLNFCMFEYTSLWENGSLSPEWSDSMRTQAGIQANNPLGYAFHNTYIAPVISKPSLVTIRSIFQDGNTPAQDDPSLAGASGYVVDNDYGGIITSFTVSNVGAGYSYLTTPSVSVSLPDNPNGTRATGIASVTGDGVVSISVSNAGTGYTQAPSVLIQQPSVRREQIGVSSYFGDLGQIVGYAQSTGALGTLELYIPENSYMRDPNIVGTAVTISQLNTGDYFVVNLSNFGLSTSTSDNIYQVSAAYNSTVDLTSVGLGTTAIRRVEVANVGFGTTVAGFIRGRNLGEYTWGKIQFLNRATTDALEFTPNSYTGITSSPLVQRFRPLKFNNYQT
Physico‐chemical
properties
protein length:4337 AA
molecular weight: 472826,86470 Da
isoelectric point:4,57050
aromaticity:0,11137
hydropathy:-0,19062

Domains

Domains [InterPro]
DC_0146
STR
1105–1462
XYR95944.1
1 4337
Architecture
ATT
ATT
ATT
STR
RBD
ATT
STR
ATT
ATT 7-224 | ATT 388-888 | ATT 917-1160 | STR 1161-1462 | RBD 1484-1863 | ATT 3094-3205 | STR 3338-4010 | ATT 4011-4336 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage RB11-B
[NCBI]
3412546 Viruses >
Host Synechococcus sp. MW02
[NCBI]
1620844 Cyanobacteriota > Cyanophyceae > Synechococcales > Synechococcaceae > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYR95944.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV261925.1 [NCBI]
CDS location
range 140127 -> 153140
strand -
CDS
ATGGCAGTAGATAGAGTCAAATTCCAGGAAATTGTAGCTAGTCAACTTCCCAGATACGTTAGAGAAGACTTTCCTCTCCTATCGGATTTTTTAGAGCAGTATTACGTATCACAAGAATACCAAAGTGGTCCTGTTGATATCATCAACAATATTGACCAGTATGTAAAGGTAGAAGAATTATACGATATTGTCGAATCAACGACTCTTGCCGAAATTTTAGATTATAATGATAGATTTGTTACTGTAGTATCGACAGAAGGTTTCTCTGAGACTAACGGTATCATTCAGATTGATAATGAAATTATATTCTACGAAACAAAGACTGACACTGAGTTTCAGAACTGTAGAAGAGGATTCAGTGGTATCACCACCTATGTCACCACAGGTGCACCAGATGAATTAACATTCTCTCAGACTGAAGCAGATACTCATTTACTTGGAACAGAAGTTGTCAACCTGAACGTTCTTTTCCTCAAACAGTTCTTTAAGAAGATTAAGGGACAGTTTACTCCTGGTTTTGCTGATCGCAACTTTTATAGTGGATTAAACTCCAAAAACTTTATCTACAACTCAGATAGTTTTTATTCTTCAAAGGGCACTGATCAGTCCTTTGAAATCTTGTTTAGAGCACTGTATGGTGAAGATGTAGAGATTCTCAAACCATCACAGTTCCTTCTGACTCCCTCTAATGCAAACTATAGAGTAACTCAAGACTTTGTAGTTGAGAAACTTCAGGGTGATCCATTAGATCTTCAGAACCTTACAATCTTCCAAAAGAGAACGAATGCAAGAGGATCTGTAACTAATGTACAACAGATTCCTTATGATGATTATCAATTCTATCAGATTAGTATTGATGCTGGATTTGCAAGAGATACTGACGTAACAGGTTCTATTTTTGGTGAGTTTGAACCTAACCCCCTTACAAAACTCCTTACCTCTGTAAGTTTTGGTTCAACGGTTCTTGATGTTGATTCAACCGTTGACTTTCCTGAATATGGTAAATTAGTCGTCAATGATGTTGATGGTAATGCGATTGGTGTTGCATATAGTGGAAAGACCACAAACCAGTTCTTTAACGTATCTGGTCTGACCAATTCATTGAATAAGAAGTCTGACGTTAAGTTAGATTCTTTCTCATATGCCTATGTTGGTATTGATACCTCACAAGAAATCAGGGTTAGATTTACATCTACCCTGAAGGATTTTGTACAGAACGATCCAACATATTACTTCAAAAAGAATGACACTATTGAGATTAAATCATTTGGATATGAGGCACCTGGAAAGAAAGCAAATAACTATGTCCTTAACGTCCAAACAAAATTTAAAATTGCTGAAAGTTCTGTAATTGATGCTGATGCATTCGTATATAACTTTAAACTTTATAATGATCACTTCTTCCAAGAGGGGTATGAACTCAGATATGAAAACGAAGATGGCACTGTATCAAACCTCGGAACAGTCACTAGAATTGTATCAGAGAATGAGATTAATGTAAGGTTCGGACAACAGATCAATCTTTCAGGTACATTCTATCTTGAGAATCAATTACTCAAGGGTTCGTCTACAAGTCATTCTTATATCAAGAATTTTGTTGCCAATGTACAGAATACATATGCAAAGTTTAATGGTGATGTTCTTATATCATCTAACTCATTACCAAAATATAATGACATTGAGACAAATACTTACGATAAGAAAGTAACTTTCTCTGCATCATTACTGAGCACCGACATTTTACCATTACCAACTAACCCAACATCATTACCCGATCACGGTTTCTACACAGGTGACTCAGTATATTTCCAATCTGCAGGTAATGGTTTTGATGGAGTTACCACTGGTTCTTACTTTGTCTACAGAGTAAATGAAAGTGAAATCAAACTTGCAAGAAGTAATGCAGACCTTACAAGAGAATCATATATTACATTTAATGGGTCTGTAGTAAATGCTTCTTTAAGTTACCTTGATTTTTATGGTAAAACGATTCAACCACAGGGTATCTACAGAAAGATTCTAAGTCCTACTAATAGAAAGAGAATAGAGAAAACAACTTCAGGATATACAGGTATTTTTGTTAATGGTCTTGAGTTGTTAAACTATAAGTCATCCAGTAGTGTTTATTATGGTGATATTCTTGACTTCACTATGACAAGTGGTGGAACTGGATACGATATTATCAATCCACCAGTAGTAAAGATTGTCGATGAGGTAGGAACTGGTGCAACAGGTGTTGCTAACGTAAAAGGTCAACTTGTAAAGCTTGATGTTACTGACCCTGGTATGGGTTATTATGCACCACCAACGATTACAATCAAGGGTGGTAATGGTTCTGGTGCACAGGCAGAACCAAGAATGACTTCAATCAAACTTGAAAATTCTTTCGTCGCCAATTTCCCAAGTGATGTAAATCTCACAACAAATGAGATTACATTTGAGACCGATCACAAATTCTTAGATGGTGAAAGTGTAATCTATGAACCAAGAAATACATCTGGTATTGTTGGACTGAATACTGGTGGTGAGTATTTTGTATTTGTAACTGGCCAAAAGAGTATTCAACTTCATACCACAAAAGGAGATGTATTTGCAGGTATCAACACTGTTGATTTAGCAGGTTATGGTGATGGTGTGCAATATCTTGTTGCAAAAGAACTTAAGCAGGTTGTATCAAGTGTTGTAGTTACTAATCCTGGTGTAGGTTACGAAAACAAAAAGAGAACTATTTCAACAGCTGGTATCAATACAGTATCAGATAGAGTTGAAATTTTAAATCACGGTTATAAATCGAAAGAAGTTGTAAGATATACAAGAGGAACTCCAAGAGTTGAGGGTCTGAGTGAAGATAAAGATTATTTTGTTAAAAAGATTAATGATGATGCATTTGCACTGACAGAAGTTGGTACTGGATCTGTAGAAAGAGACTATTATTATGATAGAGGAATCTGTATTAACTTCACAAAACAGGGCGTAGGTTCATTTAACTATCCACCAATCACTGTTGAAGTAGAAGGTGCAGCAGCATCGTTCGATAAGACCTTTGTCGAGGACTTCCAAGAACTTTATATTATTGAATCACCAATTGAAGAGAATATTATCACTCCTGTATCAGTACTTGCATGGACTGATACTGAAGCAGAGATCACAAATCCATACTATGTTTTGGTTAGTGCTGATGCAAACTGGTTGATTAGTGATGATCCATTCATCGGTAATATTCTTCTTTATGAAGCAAAACTACAACCTGTCTTTAGAGGAGAGATCTTAAGTATTGACTTGACCAATGGTGGTGTTGGTTATGGTGCATCAACTATTGTTGATTTTAGAAGACAACCCGAAATCACCTTTGAGTCTGGTTCAAAAGCAAAACTAACACCAATTATCAACAATGGTAAGATTGTTGAGGTTATTGTAAACTCAGGTGGTTCTGGTTACAATGCACCACCTGATCTCAACATTGTAAGTGAGACAGGTAATTTTGCAATCTTAGTGCCAATCATTAATAATGGTGAGATAGAAAGTGTCTATGTTCAAAAAGGTGGTGCAGGATATGTTACTGGTAAGACCACAATTGATGTAATACCTGCTGGATCTGGTGCAAAAACTCAGGCAAATATTAGAGGATGGAATATCAACCTATTTGAAAGAAACTTTTCCAACTTTAAAGATGATGACTGCATTATTGAGGAGAACATTTCAAACAAGTCACTTCAGTATGCAGCAGTTTATGCACCTAGACCATTAAGAGAGTCACTAAACTCATTAAATGGTTTTGGGGAGGACAATATCAAATATGGTATTTTTGACTTAACTTTAAGTGTTGGTGGAGAAGAAATTGATAGTTTGTATCACTCACCAATCGTAGGTTGGGCGTACGATGGTAATCCAATCTATGGTCCATACGGTTTCGATAATATCGATGGAACTGGTAACATTCGTAGAATGGTTACAAGTTACAAACTCAAGAATACTCCTGTCAATAGACCTTCATACAATGCATTCCCTAACGGATTCTTTGTAGATGACTATATCTATGCTGGTGACGGTGATCTTGATGAACACAATGGTCGTTTCTGTGTAACACCAGATTATCCAAACGGTGTATATGCATACTTCTGTACTATCTCTGATACTGTAGATTCTTCTGGTCCATTTAATAACTACAGAAGACCATTGTTCCCATATGTAATTGGAAACGATTATAATTCCTTACCAATTCCATTCAACTTCAAGTCAGCGTCTAATCAAACTCATTACAATATTGTGGGAGATGGGTGGTTTAGAAATACTAAGAACTATTTCACAAATGGCGGAAATAGTCAATATGATTACATTTACAATTCAGACAAACTTAGAAATCAGTCTTTAGACATTACTGCAACATCATCAGGTAGTGTTGATGGTATGGCTATTTTGGATCCAGGTGATGGATACAAGATTGGTGATAGGGTTGAACTCAATTCAACTAATACTGGCGGTAGAAATGCAAACTTTAGAGTATCTCAACTTAAGGGTAAGAATGTAAACAGTGTAAGTCTTGCCACTACATCTTATGAAAATGTGGAGTTTACAAGTACAGGAAGTGCTAATGGGTTTGTTGGTATTACTTCAGCTCCACACAACTTCTTACCATTAGATACAATTTTCATTGATGGGTTATCTTCATACTACAAAGGATTCGCTGGGTCGTATTCGGTCGGTGTATCAAGTGAAAGATGGTATGTATCACTAGGAATAGGAACTGATACTGTCACTGGTATTGTGACCTACGTTTATATGAATGGTCCTTTCGGTGAGGATTCGATTAGAGCAAATGATATTCTCAGAATTGAAAGAGAAAAATTAAAAGTTCTCAACATTGATGAAAAATCTGGTAGAGTCAGAGTTCTTAGAGGTGTTGATGGAACACTTGCAGTTGCCCACTCTGCAGGTACTATTGTTAGAGATGATCCTAGAAAACTCAGATTCCTCTCAACAGGTATCAATACTCAGAGAAA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Genome Context

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