Protein

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Genbank accession
YP_009779933.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MAQNTNLNVSPYYDDFDKDKNFYRVLFRPGFPIQARELTTMQSILQNQVKSVGAHLFKDGAMVIPGQVGYDLNVDAIMLQESFLGASVEQYRTQLTGKIIEGLTSGIKAKVLYSISESDSEKGYITLYVKYIESGGEGNAQTTFTNNEQLITNAEITFGSSLIEVGSPFSQLLPTNSIQTGSVAYVQTGVYFIRGFFVDVPYQYILLDQYGSSPQYRIGLDILESIVTPEDDVSLNDNAAGTSNYAAPGSHRFKIGTRLIKKLLNDDADKDFIELLRINGNRVENLVDRSAYSELERSLATRTYEESGDYVVRDFQITIRENLDDGFNNGVYQLNEITSSGNASRESLYSVELGPGAAYVRGYRVKTLSPTYVDLEKPRDTKAAQNAIVPFELGNFSILNNIYGFPNVSGTSLGNAYQTLEIRDRFTATPGIAAGNIIGYARAASMEFYQNPDGTYGNTDDEYKINIFDVQLFTVIELASNATISAGSIVKGVSSGASGLVVDAESADDHIQLYHVSGYFESGEMVTVDGINLDTIEKVYDYAYSDARQFLTRDENTNAIEFTGDVVLQDELQLQGLSFTYQNLDGNVTGTSLDVAGTGYISGTNITATGGDGTGLTVDITASSGTISSAVVNTAGSGYSVGNSVTVANSRSTGVNTLGTIATAGTGYTATTGLATTSAGSGTGLIVDITADASGAVQTVAVNSSSLSDGSGYANSEVITITNVNASGIATIDTIGAADASRTAGTYTIGASDYTTDSASGTGAEFSIVVDGTGAATVTITTDGLTYVVDDTFTVQDAQLGGGGGAALTFDVASLHGNGCTVPVSAIHGNGQTLQITAIGNSSIVGLNSNFAADLRPGDRIFFSKTEYVDVDFVSTNNLTGTGPEYIFDYSAQRVNITPPSANFPTAGDYNTLIRYRAQLSGNEENSDLLTRMPKGYIKSISDESMTVRRTFDSQTVSANSVSITLPENEQFSAISEVNYSFTVLASTNGSYPVGAQIPIDTTNSGNLGYTIFTSSDRTTIQINNLTSITSIKVTATISKNVTQRKTKSSQKMFVLKVTRTIQDLDKQNYNLAYLNIYGTRIEDQEISLGLKDAFNLHAVYESLDDNDPVIPSVTLVEPKFFEVGSIVTGKTSKARAKVVEFASGSLQLSVVYLSGQFVLGETVTGFDSNGDILTGIINDADGSVVVGSKVVTDRYFLQPGQTGFMYDCSRVIRKKGTPTPIRKLKVVLDYYSHSATGDYFGGQSYLDTVYEDIPDFEDKYLADYLDFRPGIKNLFNGTGTVSSPAFVNCSTFDFKSRVFNVSGTPTATVFDIPKLNSDFRCDYDWYLARVDKLYLDENGDFQVVKGKSAEVPNEPDDLQNAMLLAILRHQPYGFNPEKDVAIEKSDNRRYTMRDIGKIENRLNQVEYYTSLNMLESDTMNLSITDANGNNRLKNGFFVDDFTNQSMSAMNLEDFGASLDFVEGTCHPSHYTTNIALVVNDNLSSGTQTTGPIITLPYTESLIIDQPYASRVENVNPFNVFTYIGRIDLTPSSDDWIDTTRVPALVTNVEGNFESTLVAQGAGNDGFAPVQWGSWRTTWRRRRRRTRTVNTRRRSNWGRGRATDRITRVTTTRRQTREGIRTQVVPRIDNVSQGDSIIAQTSIPFIRSRNIDVNIARMKPRTSFYAFFDGKNIDDYIVPKILEVVKDSSVDARTNATPFVVGETVTGLTSGIQFRVSAPNDHYVFNPYDDADMPSSYASTTNFINVDSLALAAQAQGEYYGNVQVGEVLQGASGATAVVANRRIISDRLGQFRGSLFIPDPSVDSNPRWQTGARTLRFTTNENDSRLAGAVASSAEVEYEASGTLNTLRENVLAVRNADIVRDTVTQRRTLRTTRTNRRQVGWWDPLAQSFLIEEQGGVFVTSVEVYFNAKDDNIPISMQIRTMENGYPTTTILPFSDVTITPVDIQTSETGAIATKFVFRAPVYIPESIEHCFVLFSDSNEYQVWISRMGELDISGDRTISEQPYAGVLFKSQNATTWTADQYEDLKFSLYKAAFDTTTQSTIVLNNAELNIGNAGRLRLPVDPVQTFQPELQLVTNSTSINYTIGARIYQKTTLAEGTIIKFTESAGGNIVTINDISGSWQQGSDTGGAILNRIVSSKTLATMIVAGASGDFEVGETITGNSATAPTAEVVSWDSGTNTLTLKYVSTVFTVSTETISGGNTTVTATVDSITYSGDATSGSPLAVNDAFVSTSPTYTTGQRKVRVRHRNHGMHDVDNNVEIINVQSEVSETYLTSSISNSDTTISVNDALAFHQRINGGSVGTSNPGFIKIENEIISYSAISGDGKTITVYERGVGSTTAAAHADESIVECYNLDGIPLTEINKTHIGISSPTLDSYDVTTTSISSRGINAGGINVVATQNIQYEILAPQLQTLVMPNTSLNARVNTVSGSSINDGETSTQNSFVNDGLFNDILLEDDNYFDAPQIICSKANEDAELGGAKSFRMDVAMASENPNLSPVFDTDRMSATLISSRINSPANANSALLPTGDEHDAVYISKIAALTNPSTSIKLMFSGYRPPNTFIKPLYRVLPKGSTESIENLGFQYFPTTEATIPSTEEEEVYRDYEYEVTGLDYTQYQIKILLISSNQAYTPIIKDLRGIALAV
Physico‐chemical
properties
protein length:2645 AA
molecular weight: 287054,65160 Da
isoelectric point:4,63888
aromaticity:0,08885
hydropathy:-0,22866

Domains

Domains [InterPro]
IPR032096
STR
12–66
IPR032096 DC_0414 IPR032096
IPR032096
STR
180–389
IPR032096 DC_0414
DC_0082
RBD
1540–2645
DC_0082
YP_009779933.1
1 2645
Architecture
STR
STR
RBD
STR 12-66 | STR 80-1551 | RBD 1552-2645
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014b
[NCBI] 		1493508 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Nereusvirus > Nereusvirus tusconc4
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009779933.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_047719.1 [NCBI]
CDS location
range 80779 -> 88716
strand +
CDS
ATGGCACAAAATACCAATCTTAACGTCTCCCCTTATTACGACGACTTCGATAAGGATAAGAATTTTTATCGAGTCTTGTTCCGTCCTGGATTTCCGATTCAGGCAAGAGAACTTACTACGATGCAAAGCATCTTGCAGAATCAGGTAAAGAGCGTCGGCGCTCACCTGTTCAAAGATGGTGCAATGGTCATTCCAGGTCAAGTAGGTTATGATCTGAATGTTGATGCTATCATGCTTCAGGAATCCTTCCTGGGTGCAAGTGTTGAGCAGTATAGAACTCAGTTGACAGGTAAGATTATTGAAGGTCTTACTTCTGGTATTAAAGCAAAAGTATTATATAGTATCTCCGAAAGTGATTCTGAGAAAGGTTATATCACATTATATGTGAAATATATTGAGTCTGGTGGAGAGGGTAATGCACAGACTACGTTCACAAATAATGAGCAGTTAATTACCAATGCAGAAATTACCTTCGGTAGTTCGCTGATTGAAGTTGGTTCTCCTTTTTCACAACTTCTTCCTACCAACTCTATCCAAACTGGTTCTGTTGCATATGTTCAGACTGGTGTTTATTTCATTAGAGGATTCTTTGTAGACGTTCCATATCAGTATATCCTTCTGGATCAATATGGTAGTTCTCCTCAATATAGGATTGGTCTCGATATTCTTGAGTCTATTGTTACTCCTGAGGATGATGTATCACTCAATGATAACGCTGCAGGAACATCTAACTATGCTGCTCCTGGTTCGCATAGATTTAAAATTGGTACAAGATTAATCAAAAAACTGCTCAATGATGATGCAGATAAAGACTTTATCGAACTACTTCGTATCAATGGTAATAGGGTAGAAAACCTTGTCGATAGAAGTGCATATAGCGAATTAGAAAGATCTTTAGCAACTAGAACTTACGAAGAGTCTGGTGACTACGTAGTTAGAGATTTCCAAATCACCATAAGAGAAAATCTTGATGATGGTTTTAACAATGGTGTATATCAACTTAATGAGATTACTAGTAGCGGCAATGCATCTAGAGAATCTCTGTATTCAGTAGAACTTGGTCCTGGTGCTGCATATGTTAGAGGATATCGTGTTAAGACACTCTCCCCAACATATGTCGATTTAGAAAAACCAAGAGATACCAAGGCAGCACAAAATGCTATTGTTCCCTTTGAATTAGGAAACTTTAGTATTCTTAATAATATCTATGGATTCCCCAACGTCTCAGGAACATCTCTTGGAAATGCATACCAAACTTTAGAGATTCGAGATAGATTTACAGCAACACCTGGTATTGCTGCGGGTAATATTATTGGTTATGCCAGAGCGGCATCAATGGAGTTCTATCAGAATCCTGATGGTACATACGGCAATACAGATGATGAGTATAAGATAAACATCTTTGATGTCCAATTATTCACCGTTATTGAATTGGCATCAAATGCAACTATTTCTGCTGGTTCTATCGTAAAAGGAGTATCTTCTGGTGCAAGTGGTTTAGTTGTTGATGCTGAATCAGCAGACGATCACATTCAACTGTATCATGTTTCAGGTTATTTTGAATCTGGTGAAATGGTGACAGTTGATGGTATTAATTTAGATACTATTGAAAAAGTATATGATTATGCTTATTCGGATGCAAGACAATTCCTTACTAGAGACGAAAATACTAATGCTATTGAGTTTACTGGTGATGTAGTTTTACAAGATGAACTACAACTTCAAGGTCTATCGTTTACATATCAAAATCTCGACGGTAATGTAACTGGCACATCTTTAGATGTTGCGGGTACAGGATATATTAGCGGTACTAATATTACTGCCACTGGTGGTGACGGTACTGGGTTGACGGTTGATATTACTGCGAGCAGTGGCACGATTTCATCTGCAGTCGTTAATACTGCGGGTTCTGGATATTCAGTTGGCAATTCTGTTACTGTTGCAAACTCTAGAAGCACTGGTGTTAATACATTAGGTACTATTGCTACTGCAGGCACTGGATATACTGCTACTACTGGACTTGCAACAACTTCAGCTGGTTCTGGTACTGGTCTTATTGTTGATATTACTGCGGATGCTAGTGGTGCCGTTCAAACAGTAGCAGTCAATTCTTCATCATTGTCAGATGGTAGTGGATATGCAAATAGCGAAGTGATTACGATCACAAACGTTAATGCAAGTGGTATTGCTACTATTGACACCATTGGTGCTGCAGATGCTTCAAGAACTGCTGGTACATATACAATCGGTGCTTCCGATTACACCACAGATTCTGCTTCTGGTACTGGAGCAGAATTCTCAATTGTTGTTGATGGTACAGGTGCTGCAACAGTTACTATCACCACTGATGGTTTGACTTATGTTGTAGATGATACTTTTACTGTACAAGATGCTCAACTTGGTGGCGGCGGTGGTGCTGCTCTGACCTTTGATGTTGCATCTCTGCATGGTAATGGATGTACAGTTCCTGTATCTGCGATTCATGGCAATGGACAGACTCTACAAATTACTGCAATCGGAAATTCCAGTATCGTCGGTCTCAATTCAAATTTTGCTGCAGATCTTCGTCCTGGTGATAGAATTTTCTTTAGTAAAACTGAATATGTGGATGTTGATTTTGTTTCTACTAATAATCTTACTGGAACTGGACCAGAGTATATCTTCGACTACTCTGCACAAAGAGTAAACATTACTCCCCCTTCTGCAAACTTTCCTACTGCTGGAGATTACAATACATTAATTCGTTATAGAGCACAACTTTCTGGAAATGAAGAAAACTCAGATCTTCTGACCAGAATGCCTAAGGGATATATCAAATCAATTTCTGACGAGTCTATGACAGTTAGAAGAACTTTTGATTCTCAAACTGTCTCTGCGAACTCAGTATCTATTACTCTACCAGAAAATGAACAATTCTCTGCGATCTCTGAGGTAAATTATTCATTCACGGTTCTTGCATCAACTAATGGTTCGTATCCAGTAGGTGCTCAAATTCCTATTGATACTACCAATAGCGGAAATTTAGGATATACTATCTTCACTTCTTCTGATAGAACTACCATTCAGATTAATAATCTGACTAGTATCACATCAATTAAAGTTACTGCTACCATTTCTAAAAATGTTACTCAGAGAAAGACAAAATCTTCTCAGAAAATGTTTGTCTTGAAAGTTACAAGAACTATTCAAGACTTAGATAAGCAAAATTATAACCTTGCTTATCTTAATATTTACGGTACTAGAATTGAAGACCAAGAAATATCTTTAGGTCTTAAGGATGCATTTAATTTGCATGCTGTTTATGAGTCTTTGGACGATAATGATCCCGTAATTCCATCAGTAACCTTAGTAGAACCCAAGTTCTTTGAGGTAGGTTCAATTGTTACTGGTAAAACTTCTAAAGCTAGAGCAAAAGTAGTTGAATTTGCATCTGGTTCTTTACAACTTTCTGTTGTATATCTTAGTGGTCAATTTGTTTTGGGAGAAACTGTCACTGGTTTTGATAGTAACGGTGATATCCTTACAGGTATTATTAACGATGCTGATGGTTCTGTAGTTGTAGGTTCTAAAGTAGTTACTGATAGATATTTCTTACAACCAGGACAGACTGGATTTATGTATGATTGTTCTAGAGTCATCCGTAAGAAAGGAACTCCCACTCCTATTAGAAAATTAAAAGTAGTTTTAGATTATTACAGTCACTCTGCTACTGGAGATTATTTCGGTGGTCAGTCTTACTTAGACACTGTATATGAAGACATTCCTGATTTTGAAGATAAGTATCTTGCAGATTACTTGGATTTCCGTCCTGGTATTAAAAACTTATTTAATGGTACTGGCACTGTTTCATCTCCAGCATTTGTAAACTGTTCTACGTTTGACTTTAAATCAAGAGTGTTTAACGTAAGTGGCACTCCTACAGCAACTGTATTTGATATTCCTAAGTTGAATAGCGACTTCCGTTGCGATTATGATTGGTATCTTGCTAGGGTTGATAAATTATATCTTGACGAGAATGGTGATTTCCAAGTAGTTAAAGGTAAGTCTGCAGAAGTTCCTAATGAACCAGATGATCTTCAGAATGCAATGCTACTTGCAATTCTTCGTCACCAACCATATGGATTTAATCCAGAAAAAGATGTTGCCATTGAAAAGTCTGATAATAGACGTTATACAATGCGAGACATTGGTAAAATTGAGAATAGATTGAATCAAGTTGAGTATTATACATCACTTAACATGTTGGAAAGTGATACAATGAATCTTAGCATCACCGATGCTAATGGTAATAATCGCCTTAAGAATGGATTCTTTGTAGATGACTTTACAAATCAGTCTATGTCAGCAATGAATCTAGAAGACTTTGGTGCTTCTCTAGATTTTGTTGAAGGGACATGTCATCCTTCACATTACACAACCAATATTGCATTAGTTGTAAATGATAATTTAAGTTCTGGGACGCAGACAACTGGTCCTATCATTACTTTACCATACACAGAGTCGTTGATTATTGATCAACCCTATGCGTCTCGTGTAGAGAATGTCAACCCATTCAACGTCTTCACATATATTGGTCGTATTGATTTAACACCATCTTCAGATGATTGGATTGATACAACTAGAGTTCCTGCTTTAGTTACTAATGTTGAAGGAAACTTTGAATCTACGCTCGTGGCACAAGGAGCAGGCAACGATGGGTTTGCACCTGTTCAATGGGGTTCTTGGAGAACAACTTGGAGACGTAGAAGACGTAGAACCAGGACAGTTAACACTAGACGCCGTTCTAACTGGGGAAGAGGAAGAGCAACTGATAGAATTACAAGAGTTACGACTACCAGAAGACAAACTAGAGAGGGTATTAGAACTCAAGTTGTACCTAGAATTGATAATGTTTCTCAGGGTGATAGTATCATCGCACAGACATCGATTCCTTTCATTCGTTCTAGGAATATCGATGTAAATATTGCCAGAATGAAACCAAGAACTTCGTTCTATGCATT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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
240ec535ecda5fdfce6aee8e4b578c0cfec3b9675914c72adc8949a7044af1bf
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7533
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank