Protein

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Genbank accession
QPB08294.1 [GenBank]
Protein name
strucutural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,84
Protein sequence
MPAINVAKSDTFETQRQKINQIGSQIFNISAGGSDLSTGLLKLGDGTRVAPSLAFTNDQTLGMYRSDTSTLGFVSNQKKIVDFSSTAFYSYKDLIFRQNKLFTEGTSVITSGSNYDAGSYTEIPILGGTGENATVDLDVLAYEVTDVSSGSGYISGTFFAVDLEGGSGTGAQVDVIVDAVAGLITNAGSGYVPGNYDSVPLTGGTGSGAEADILVEGDITITGSVTSAGSGYILGNYFPEALNTPTQIFVVTANGTTNYIIDGNAQPTLSLTRGNTYRFDVSDSSNATHALAFEGPGSIALDPTHYYILSKGTEGTAGAFIDLVIKPTAPDTSIAYICSNHSGMGGTINLSNGTLGSYGSGTTFDLSIGDAGTVTGATISFAGTGYQANDVLTVDVNDVGGTGSGFEYTVSGVVYTGTVTNVTITDSGTNYQLNDNLSANDSDLGGGGGSNFAFRVNTSPSEVSSITFIERGTGYQIGDQLVLPNGVTNISSTLNGEIIGLASTLGSNTTVTVSSTANIIEGMDVSNGAGDVGLLDVNTTVVSIDSPTTITISAAPIAPGSANLNFISQNLDYVTVSDSSGIFVGYLVSQTSGNGTLAPDTVVSAIIDGTTIQVSNIPTTSGSAVLDFSPAYGNVSSQFTTEVTSVGVIDSVSISDGGNGYFEGDELTVNAEDLTQPIVFDVVTLTVEIVTLQGTVSSSNFSIGDFIKTPDGEVLLASPSTSTQLTGESSASYSNVSTTTNSANGSGATLDISRDFDGNVSTVDVNVAGSRYEIGDVLTVLGADVGGSTPADNITIEVSDVSTSTPAEIFDISSTGGNLDYLVVSTAGFADLDTVVNTNDLNTTYTINGLPTQEKRFSIDGQYTPNLTLYSGSTYSFDLTDSSNDNVELNFSQFRDGRNSPSIVDNITATLDNTSTQITVSSATGILAGMEVVVLSGDGTLPLGTTVVSVDNNTTLTLSSTAVDSGSATLQFVGTEYTDGVTKTVDNVSIKVTDNTPSPLYIFSSTDENIYGNDDNESSLTIDLNNPKTFGSGLLLRATEIESNDVMSGDIETGTFTVQDLEVASINSNAITNATNIASTSVTTPTLNVTEIVAETANVGLSATSFNINSDVSVNSLLTVDSATGDLVSQGEIKAIGSVNVNDQLSIIGNEIFSSSGLPIALQPSLNQLVEIYANTALGIPVGNTAQRPNPPAGSGDGYIRFNSETNQYEGYSNTNQQWSSLGGVRDLDGNTTILAELTVGANDNTLWFINDNINTVKFTPQYQEFVNVKKVKSTNVSAPSYVEWTANTPVSLGDYLKYRNNIYEVTTAGTTATSGSEPTHTSGAESNGTAELTWYISAVAPLTFEEMSEFRIDPLGFTDLVVNNQLRLSNNVFSSTDADIVISPSSGKKVKVDSLTTLVIPVGDSNTKGNFETGSIRFNTDDTQFEGYNGSQWGSLGGVQDADQDTQIKAETSSGSDEDILYFFNANANTLRVTETRLEFDTIDTINSVTSNALNVDASTITFDNLATTLDNTDALTTFLFTTKDNLDLGLSVGLNTDPLLRLSDSGDVLFNIGFGTGTPNLVTVFDSNLEEFELADYKIATNSLDLEKGTLNSGNTTIYNTATQNSSKVFVTAFNSTTGDKEIIEFFVTHSGSNVIFTDTNNIKTGQNIFDTVFDLDPSNNVRLSFTLSSDLTTGDDVNIKIVSHIFKR
Physico‐chemical
properties
protein length:1691 AA
molecular weight: 176619,48000 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,07510
hydropathy:-0,06659

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-H9-2
[NCBI] 		2783669 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Yushanluvirus > Yushanluvirus satich
Host Synechococcus sp. WH 8102
[NCBI] 		84588 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QPB08294.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW147367 [NCBI]
CDS location
range 26492 -> 31567
strand +
CDS
ATGCCAGCAATTAACGTCGCTAAATCAGACACCTTTGAAACTCAAAGGCAAAAAATTAACCAGATTGGGTCGCAGATTTTTAACATCTCTGCTGGTGGAAGTGATCTGTCAACTGGTCTTTTAAAATTAGGAGATGGAACTAGAGTTGCTCCATCATTAGCTTTTACTAATGATCAAACTCTTGGTATGTATCGATCAGATACATCTACGTTAGGATTTGTTTCCAATCAGAAAAAAATTGTTGATTTTTCTTCAACAGCATTTTATTCCTATAAAGATTTAATTTTTAGGCAGAACAAATTATTTACAGAAGGAACTTCTGTTATAACTTCTGGATCTAATTATGACGCTGGTTCTTATACCGAGATTCCTATACTTGGTGGAACTGGAGAAAATGCTACTGTAGATCTTGATGTACTTGCATACGAAGTAACTGATGTATCTTCTGGGAGTGGATACATCAGTGGAACATTTTTTGCTGTTGATTTAGAAGGTGGTAGTGGAACTGGTGCTCAAGTTGATGTTATTGTAGATGCAGTTGCAGGTTTAATTACAAATGCTGGATCTGGATATGTTCCAGGAAATTATGATAGTGTTCCATTGACAGGTGGAACTGGATCTGGAGCAGAAGCAGATATTTTAGTTGAAGGCGATATTACTATTACTGGTTCAGTAACAAGTGCTGGATCTGGTTATATACTTGGAAATTATTTTCCTGAAGCTTTAAACACTCCCACACAAATATTTGTTGTTACAGCGAATGGCACTACTAATTACATTATTGATGGTAATGCTCAACCAACATTAAGTTTGACAAGGGGAAATACATATCGTTTTGATGTGTCAGATAGCAGTAATGCTACTCATGCTCTTGCTTTTGAAGGACCTGGATCAATAGCATTAGATCCTACACATTATTATATTTTGAGTAAAGGAACAGAAGGAACAGCAGGAGCATTTATTGACTTAGTAATTAAACCTACTGCTCCTGATACTAGTATTGCATATATTTGCTCAAATCACTCTGGCATGGGTGGTACGATTAACTTGAGTAATGGAACATTAGGATCTTATGGTTCAGGAACTACATTTGATCTCAGTATTGGTGATGCAGGAACGGTTACAGGTGCTACTATTAGTTTCGCTGGTACTGGATATCAAGCAAATGATGTTTTAACAGTTGATGTTAATGATGTTGGTGGAACTGGATCTGGTTTTGAATATACTGTAAGTGGTGTTGTATATACAGGAACAGTTACTAATGTAACTATTACTGACAGTGGAACTAATTATCAATTAAATGATAACCTTTCAGCAAATGATTCTGATCTAGGAGGAGGTGGAGGATCTAATTTTGCTTTTCGAGTAAATACTTCTCCAAGTGAAGTCTCTTCAATTACTTTTATTGAGAGGGGAACTGGTTATCAGATTGGTGATCAATTAGTTCTTCCCAATGGTGTTACTAATATTTCTTCAACTTTGAATGGAGAGATTATTGGTCTTGCATCTACATTAGGATCTAATACTACTGTAACAGTTTCATCAACTGCTAATATTATTGAAGGAATGGATGTTAGCAATGGTGCTGGAGATGTTGGTTTATTAGATGTAAATACAACTGTTGTATCCATTGATAGTCCTACAACCATTACAATCTCTGCTGCTCCAATTGCTCCAGGATCAGCAAATCTAAACTTCATATCACAGAATTTAGATTATGTTACTGTATCAGATTCTTCTGGAATTTTTGTAGGTTATCTTGTTTCTCAAACTTCTGGTAATGGTACTTTAGCGCCAGATACTGTTGTTTCTGCTATTATTGATGGAACAACTATTCAAGTTTCTAATATTCCTACAACATCTGGAAGTGCTGTCTTAGATTTTTCTCCTGCATATGGCAATGTATCTTCACAATTTACCACAGAAGTCACAAGTGTAGGTGTTATTGATTCTGTAAGTATTAGTGATGGCGGAAATGGATACTTTGAAGGAGATGAACTTACTGTAAATGCTGAAGATCTGACACAACCTATAGTCTTTGATGTAGTTACTTTAACTGTAGAGATTGTAACTCTACAAGGTACTGTATCTTCTTCTAATTTTTCAATTGGAGATTTTATTAAAACTCCTGATGGAGAAGTTCTTTTAGCATCACCATCAACCAGCACACAACTTACTGGTGAAAGTAGTGCTTCATACTCGAACGTTTCAACTACAACAAACAGTGCCAATGGTTCTGGAGCAACACTAGATATTTCTAGAGATTTTGATGGAAATGTATCTACGGTTGATGTCAATGTGGCAGGTAGTAGATATGAAATTGGAGATGTTCTAACAGTATTAGGAGCAGATGTTGGAGGTTCCACACCTGCAGATAATATTACTATTGAAGTTTCTGATGTTAGCACATCAACGCCAGCAGAAATTTTTGATATTTCTTCGACAGGAGGTAATCTCGATTACCTAGTTGTTTCTACTGCAGGATTTGCTGATTTAGATACTGTTGTCAACACAAATGATTTAAATACTACTTACACTATTAATGGTTTACCAACTCAAGAAAAAAGATTTTCAATTGATGGTCAGTATACTCCCAATCTAACTCTTTATTCAGGTAGTACGTATTCTTTTGATCTAACTGACAGTTCTAATGATAACGTAGAACTTAACTTTAGTCAATTTAGAGATGGAAGAAATTCTCCAAGTATAGTTGATAATATTACAGCGACTTTAGATAATACCAGTACACAAATAACTGTGTCAAGTGCCACTGGCATTTTAGCTGGCATGGAGGTTGTTGTGTTGTCTGGCGACGGAACTTTACCATTAGGAACAACAGTAGTATCAGTAGATAATAATACCACTCTCACACTATCTTCAACTGCTGTAGACTCTGGGTCGGCAACATTACAATTTGTAGGTACTGAATATACTGATGGTGTAACTAAGACTGTGGATAATGTTTCTATTAAAGTAACAGATAACACGCCATCACCTCTATACATCTTCAGTTCTACTGATGAAAACATCTATGGAAATGATGACAATGAAAGTTCTTTGACTATTGATTTAAACAATCCAAAGACATTTGGTTCTGGATTATTATTAAGAGCTACAGAAATCGAATCCAATGACGTTATGTCAGGTGATATTGAAACTGGAACATTTACTGTACAAGATCTAGAAGTAGCATCTATTAATTCAAATGCTATTACAAATGCTACTAATATAGCATCAACTAGTGTAACTACCCCCACACTAAACGTAACAGAAATCGTTGCAGAGACTGCAAACGTTGGTCTCTCAGCAACATCATTCAATATCAATTCTGATGTTAGTGTCAATTCTTTATTAACTGTAGATTCTGCTACTGGAGACTTAGTTTCTCAAGGAGAAATTAAAGCTATTGGTTCAGTAAATGTAAATGATCAATTGTCTATCATTGGCAACGAAATTTTTTCTTCTAGTGGATTGCCCATTGCTTTACAACCATCACTCAATCAATTGGTAGAAATTTATGCAAATACTGCTTTGGGTATTCCTGTAGGAAATACTGCACAAAGACCAAACCCACCAGCAGGATCTGGAGATGGATACATTCGTTTTAATAGCGAAACAAATCAATATGAAGGATATAGTAATACTAATCAACAATGGTCATCTCTTGGTGGAGTTAGAGATCTGGATGGAAATACTACAATTCTAGCAGAATTAACTGTAGGTGCTAATGACAACACTCTATGGTTTATTAATGATAATATCAACACGGTCAAGTTTACACCACAATATCAAGAATTTGTAAATGTTAAAAAGGTAAAATCTACAAATGTTTCTGCTCCTAGTTATGTAGAATGGACTGCTAATACTCCAGTTTCACTTGGTGATTATTTAAAATACAGAAATAACATTTATGAAGTAACAACAGCAGGAACTACTGCTACTTCTGGAAGTGAACCTACGCATACTTCTGGTGCTGAGTCAAATGGTACAGCAGAATTAACTTGGTATATTTCTGCTGTTGCTCCACTGACATTTGAAGAAATGTCAGAATTTCGTATTGATCCATTAGGTTTTACTGATTTAGTTGTCAACAATCAATTACGTCTTTCAAATAATGTATTTTCTTCAACCGATGCTGATATTGTAATTAGTCCAAGTTCTGGAAAAAAAGTAAAAGTTGATTCTTTGACTACTCTCGTAATTCCTGTTGGTGATTCTAATACCAAAGGAAATTTTGAAACAGGATCTATTAGATTCAATACAGATGACACTCAGTTTGAAGGATATAATGGATCACAATGGGGATCTTTAGGTGGCGTTCAAGATGCCGATCAAGATACTCAAATTAAAGCAGAAACATCTTCAGGATCTGACGAAGACATTCTATATTTCTTTAATGCTAACGCTAATACATTAAGAGTCACAGAAACTCGACTAGAATTTGATACTATTGATACGATTAATTCTGTAACCAGTAATGCATTGAATGTGGATGCATCTACCATTACATTTGATAATTTAGCAACTACATTAGATAATACAGATGCTCTCACAACATTCTTATTCACAACAAAAGATAATTTAGATTTGGGATTATCGGTTGGATTGAATACTGATCCTCTACTAAGACTATCAGATTCTGGAGATGTTTTGTTTAACATCGGATTTGGAACAGGAACTCCAAATCTCGTCACAGTTTTTGATAGTAATTTAGAAGAATTTGAATTGGCAGATTATAAAATTGCAACAAACTCACTTGATTTAGAGAAAGGGACACTTAATTCTGGTAATACTACCATCTACAATACTGCTACACAAAACTCCAGTAAAGTTTTTGTCACGGCATTCAATTCTACTACTGGAGACAAAGAGATAATTGAATTCTTTGTAACACACTCTGGATCTAATGTTATTTTCACTGATACGAATAACATTAAAACAGGTCAAAATATTTTTGATACTGTATTTGATTTAGATCCATCTAACAACGTAAGATTGTCATTTACATTGTCTTCCGATTTAACAACTGGTGATGATGTAAATATCAAAATCGTTTCCCATATTTTCAAGAGGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
cde72143881e24b6c21b4ac7aea68e860b653e0a25a6f36dcef1ee32d5efb4c2
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8077
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Isolation and Genome Sequence of a Novel Cyanophage S-H9-2 from the Yellow Sea, China Jiang,T. and Luo,L. 2019-04-04 — GenBank