UniProt accession
E3SQX9 [UniProt]
Protein name
Structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,60
Protein sequence
MDINKVSHVSSYQTPQFIESEYPLFNKFIEYYYQSQEKTGLGQNIINNFLQYLDIDKLDIGILDGVTKVVDPVNVTDTTITVETVDPFLEKNGSILIGDEVIYYEETVSSPNIALTPGISYTQVQLKWVLLANNISLFDGVRRVFPLVSQDNPIGPSSPQHLIVKVYGKTLTPVVDYTVSGTNIVYTIAPRTATAADDISTTSVTYLNGFSENTIVQIDDISSAFGDNKTTFELTVNSEKYEPIADEFLLAVYDDRLLVPKVDYFIDGSIFIFNVAPLNGRSLSLYSIEAPIPSFGSGAVGYSRVNDLGNISSVIPSTNGFGYRFDYPPKVSVNSSVGSGASVKTLVDGIKSVSLLSGGAGYSESNPPTVKVQFPTKEGYVEPTLKATVTNGAVSAIDIISSGSGYTFTPRITFEQPGGAVLAPPTIVGGSVSGAITITNGGQGYTTPPLVYIDEPTGLDGIKASFTTTLTDGEITAVNILNAGQGYETVPRISVIDPVGAQVLETVVDGDGRVISVELLFGGSGYTDVPSVYIVDNRQNDVGTYIGGTGATAVAAIFNGQITDINITNFGTGYSADNPPQIVIQKPVDAKASATVGLQEITGFSVLKAGKEYTKAQFLGCARAASGITDYTQDGNAVFSNSTTAAEASTDTSVKCLDALFIKRLLDKYTEQFLPDVPTLDYSKIDVRTSIKTIKDFYSAKGTSFSIAYLFKLLYGETVTVSYPKDQIIKPSAATWSVDTVLRATLVSGLPENIQDGLLEQVADISDPNILAATALIENFISIQTAQDTIYELALSEETIEGTFVVPYKTKLAEPLNTTEGIITVDSTIGWPERNGEFVISSGVGSEVVQYKEKSLNQFIECTRSVNGVVEDWDSATQVSSNFNVFINRGTAQEVVLNIVGIVDAQQTTLTDTGSYYLPGDKLLISKLGGTGTGPELTTWLYNVKKLIEVESIAFGGINNQSATVTCSNPHGLLVGDQVTIYGANPIIYNGSFLVTSRDSTTVFQYQLPQPANVVPQGNILVSIDLNKGKSDSSAVNNAISPYTTNVQNTFFNTTNTYIASTGIPNYNIGPFPGSALLPGNQRKLNRFPITPVTISTKNLIVPGPIGTWVNGVSIWSYKSDVTKIFGAVTSIAINNAGNGYDAAFPPAITISGGGGTGAAATATVNGSISEVTVTEGGSGYTSSPLVSIVGGGGSGASATAIITKGVVSSILVNSGGTGYTSQPSITVVGGGGSGAEGTAAVRGPIQSVAITNGGASYTSNPSIILSSGAGAVAQAIINDGRIISIAIISAGSGYTTAPEVTIQGDGFGAVARATIDVDGENAGKVTGIEIVNRGIGYSQGTTIINLNSVGQGASFLANVFQWTYNLQETTTVDSAKGSVFEGFNNQYGGEYAHLSNPQRLRYILGDNLFANVNDQILEQDDQLGHSPIIGWAFDGNPIYGPYGYSDPTNQSSSISRLRTSYRLKANLVYDEVTNPTPVRTDGPLLSEEIAGKFVEDYEYSFSLGDLDQYNGRFCKTPEYPTGRYCYFVTIDATEQGNPVFPYILGPSFNSVVDTWNLSTTAVQQNIPIGVVRYRDPYENVDIDVERAPNASTNGLTLENGDILTFDVEDENRDGVISAEETADPDQIFEESPLQLFDYFPTVKLDSKVDIEVETITKFEDASITGFVVENAGINYQVDDRLIFDNTDTGGDGASARISRIKGETVSAYTFENVSGNNFGVLTTSVPHNLQVTDTVFVDYTPIMDNTNKTFVVRQFKGIENITIAQSGSGYNEDIPPTLVIDGDGVSGKLEAVVTSVGSIDTVNILNSGSGYTSNPRVIISHPQVFKKAEYIVSKIENNENVKVNDIFVNNNKEIFICGKTLDSSGNSVAFVSKLSTTGVKEWEKTLELSTGTNYAEFQKLYVDGDDIWVVGVNRPNILVLDAYNPDIILVKYTQSDNGLSASLQFQKGYSGISGATRADNITCIKKYSDTRYVIGGFTNTNSGSPFDAFIALIDTAGSFAIKRKIASVNDSEKLTDIVVDEGNIYFTLETSNTNTDNNVNVAFGKATVGTNSIQVEYVNEYSNAGYSFLDSSLAIDEFKELYINATLRAKSDNVTRDSVWVGKVDTAGEFVWNYRYLAPGRDVNAVGKCAIDIFGDLNIAFNRVDNTTGLKTVDTVKIGYDGVLKNHTTNEFNEYRIEGITAHSIDVDNSGDVYVFGQTSWNRNEFLLEFTGGATTDTFGNYTPTFVGADATQSLHLDGGVAKIYGRDVATPANWENAYIEFPNSTLGNTLNENWTLEFMLYQNSASTDTHSQDQQTLVAIGDATDATGGLWLYYDRTAAGPSGYLELIVTNNTTSINSAGGAVQSSLTTMFADDTWQFIGLKKEDNLFTVYVNGISVITATVADTSFTSKKLYIGNIAGRNGTTGNWRSDEQGQYFVDNLKLRNRAITPTVPSDVSALPTSSAFGLSYSWTDTSWFDTYNNLHDYIDYSGWGVKVDKNADATRIGDQGIQLNTQLGYVRTAVTPVTGSALTIGSTGFALGSLGLQSLDFDDATTTMSEDTETLTYTKDIWSSRTATIPSPGSQKLIINAVVKDRYYFKVTDTVKIDNIQILTINQAFRFTVGTKLVLNDDSGSFINSGYITKVDNDNNKVYLAINNNSWTNDLNTGQLSTSQFDEQSTYGIVGPIPLDINQIDSYTFAEVDNTTPGTFTIDLDKYNLDGTYNAAGSQNLDSFAKFKPYSDDDYSVRIDEISGSSTFIVGSVVTINGGDISYNAAYSTATITNLTGVLKITLVANLTKILRVTAVSNSDEVYVITDTRHYLTPGSMLNVDGNPSETVNTVVYDEYDGSFPVDTVISPLEFTYKLPQAAITSPATSASNVSIYIKSPVLKMYYGHQYLFDLSHSSMVGGNLSFSKDPLYKLEYSFNSIERVGTPGVTGEGATTPTVKFKVDEDVVTNISYYFDPSRVGDNDSPIIQGSYLDVVSSPYRGTFQVSGVAGATITRGADQIKFPLQNEPEGNADVSRASYSTSSRRAVGSIDSIRIVNPGGFYTRLPIVDSIQSTRQIERVTINEPGTEYAVGQYTGVPIAGDGEGGFVTITVADGTDAEGGAIPGQVQSVIVTSPGKGYTTATVDIDSVPGILGAGLTGSGAEVTVVIPPFGTAASIFTVGSSVGKIKKLKNNNFGYDYPHDYTLRPEITFPINAQLTSTSILDSVTVTDPGSGYSQAPAVIITGGGGTGAIAQSTIKNGRLDRIEVKDPGLGYSSTPTVELKSSFNYVVNLDLGLLQFSFPHGIAQGSAITLAVVDTGDGAEFPIAAGAVGRLNGVTTYYAISGAANSLEDDQLKFAITPANAALGDALSFTNAGTGRQQVLTTSFGGAATANVITSTFLEGEQVYQGSSFENATAFGFVSTNNGWQVGPRIVKIVDYTGEFNIGESVTGVISKSSGTISSLNIATGVLDVGSITETSGQFIDDVGKPSEIIQKIQDSYYYQDFSYAVKSAVSINDWKDILIKNVHPASFKVFGELNLNEYGFVPNKETFFQLTKSVELARQATVPNIQSFALVEPVYSAFDNTEVLFRQKRLTSSENILTSVVQRLDDISNLFDGERISFPLQIDGSNVVANANQLMIILNGVVQTPDTSFEVQNDSIVFAEPPQPPASVKYVNVTIQPIQVYRFTVTNNSGIFPSTNNTVLGTQSGSRLTVTSVVGDDIFGFVAEGNVGIVTALDNATLTSGAGYTDGTYTEVATTSSGVGTGLTLNITVASGVVTQVSINSAGVGYASSEVITIAGGTTSATIAVSTISGFNINELISVGATGFTATLTQITPIVNLNLFSFNEQIKNLTGKIAVVEEVNLETGDSVPLADLRYTVGAGTSSIELIDSDALTDTAVPASTFTVGANYQLGSEIVTVSAITVGPNSTTLTVTRGQLGTTATSHQEDLPLYGTDISVTNELALSKTVGTYQSKPGLFDIQLDDVIIGSQSGVVARITSTSAYQDPTTNEFIEQVNISDGSSFFGLLFNRLTSASYPNIILDNIAESQVNIVDFTDNTTNFDSKFPGTEFISNLVIPYDNTTGTFQENEIIRNYKLGYGNVTGVFNSSEDMVTKKLAFDSRVGSGFFQLGQVIRTQDTKGEVIGYNQALSTIYLGKVGRTLSTGEDYHKVTFNNNAQLDTDQSHYGLSSLLLDGTGDYLSIPTSTEFGFGTGAFTIECWIRPSSVTGTQQIFDFRTTAVEVSSELLLVGTNLNYRVNNSTTITGTATLAVDTWYHVAISRNASTTKLFVNGTQDGGDYSDGSNYGTTKPIIIGASYAFGDGFAGHIDEFRVSNTSRYQTTFTAPTGIFQGDANTKLLLHFEGDDTQTYIEDWSGGESFTDNEDFNNDAILKNWNENSTNLPAGFAGKSQRYYDAANLIESNKNFVAKEAVYLLTQQYPSLVIPGGNVNCEDDIRDILTAMIEDLRNGCNSHIWDASALYVDRTANPITISHVDTEVTETVWVYDKVKDILQYIINNTLWSVSGSHGVRQITDTTITDSSTSSFTTLQPSAISYNAATGDMVMTSNGHGLTTSNTIAIAAESLTFTCTSDGNERELVHPRVSDTRAYNQVLAITAADTNTFTVNVGASPAEQQYVHTFVSATSGAVTVLDYTTGDCADVYSTIGNLLDILTDTLEQANLGTPVDHLATITKVTTEYEFVGATVNAYLEVPFSTTYHSAASDILYTNRIDVAGRGRFRDASNLINANASVIVDKAAFDMLARYPDLAVDMPRNADGSSTDGTLRCKTDLGLILGAIAKDIYDGGNFFTVQAAKFYIGENDELRHIRLQVWQSVYAHDRLAYYAKQAVTGDLTYDNTDNIIVGDWGITNDAGNCANVQSAIDTLVTTINDIIAPTSEDFNIAGDRLYFNREYIAEEITGLTAAYLTYQVDNTNQVAYTYDVAKCERDIKLLITAIISDLQTGGNNSTVDNMNLYLTANGELNYIEEELLPTVFAFEQIRSLGEKAIRNLLYDSGSTVSGQQYAAIFSDNTAYRD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Physico‐chemical
properties
protein length:6376 AA
molecular weight: 683724,39540 Da
isoelectric point:4,34730
aromaticity:0,09834
hydropathy:-0,08885

Domains

Domains [InterPro]
PF13385
LEC
4162–4305
DC_0069
STR
4168–4639
IPR006558
LEC
4181–4308
E3SQX9
1 6376
Architecture
ATT
ATT
STR
STR
ATT
STR
STR
RBD
STR
RBD
ATT 1-547 | ATT 708-1522 | STR 1523-1534 | STR 1626-2937 | ATT 3118-3690 | STR 3779-4066 | STR 4137-4639 | RBD 4640-4998 | STR 5044-5514 | RBD 5579-6375 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Prochlorococcus phage Syn33
[NCBI]
444878 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Brizovirus > Brizovirus syn33
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI]
32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO99691.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071108 [NCBI]
CDS location
range 53719 -> 72849
strand +
CDS
ATGGATATCAATAAGGTTTCACACGTCTCCTCTTATCAAACTCCTCAGTTTATAGAGAGTGAGTATCCCCTATTCAATAAATTTATTGAATACTATTATCAGTCCCAAGAAAAGACTGGATTGGGTCAAAATATCATTAATAATTTTCTTCAATATCTTGATATTGATAAATTGGATATTGGTATTCTTGACGGTGTTACTAAAGTTGTTGATCCTGTTAATGTAACTGATACCACAATCACTGTTGAGACTGTAGACCCCTTTCTTGAGAAAAATGGTTCTATTCTAATTGGTGATGAAGTAATTTATTATGAAGAGACTGTATCTTCTCCAAATATTGCATTAACTCCTGGTATTTCTTATACTCAGGTTCAACTTAAGTGGGTTCTGCTTGCCAACAATATTAGTCTCTTTGACGGTGTACGAAGAGTCTTTCCCTTAGTTTCTCAAGATAATCCTATCGGACCTTCTTCACCACAACACCTTATTGTTAAAGTTTATGGAAAAACTTTAACTCCAGTAGTAGATTACACTGTTAGTGGAACTAACATTGTTTATACAATTGCTCCTAGAACGGCGACAGCGGCTGATGATATTAGTACTACTAGTGTTACATACTTAAATGGTTTTAGTGAGAATACCATTGTACAAATTGATGATATTTCTAGTGCTTTTGGTGATAATAAAACTACTTTTGAACTGACTGTTAATAGTGAGAAGTATGAACCTATTGCAGATGAGTTTTTACTTGCTGTTTATGATGATAGACTACTTGTTCCTAAGGTAGATTATTTTATTGACGGATCTATCTTTATATTCAATGTAGCACCATTGAATGGTAGATCTCTGTCCTTATATTCCATTGAAGCACCTATTCCATCTTTTGGTTCTGGTGCCGTTGGATATTCCAGAGTAAATGATCTTGGAAATATTAGTTCTGTAATTCCAAGTACAAACGGTTTTGGGTATAGATTTGATTATCCTCCCAAGGTTAGTGTAAATTCTAGTGTAGGTTCTGGTGCTTCTGTAAAGACCCTAGTAGATGGAATCAAGTCAGTTTCATTACTTAGTGGCGGTGCTGGATATAGCGAAAGTAATCCCCCTACTGTAAAAGTACAATTTCCTACAAAAGAAGGATATGTAGAACCTACTTTAAAGGCAACAGTAACTAATGGTGCAGTTAGTGCTATTGACATCATTAGTTCGGGTAGTGGATATACATTTACTCCTAGAATCACTTTTGAACAACCTGGAGGCGCTGTGCTTGCTCCCCCAACCATTGTTGGAGGATCGGTTAGTGGTGCTATTACTATTACTAATGGTGGTCAAGGATATACTACTCCTCCTTTGGTATACATTGATGAACCCACTGGACTTGATGGTATTAAAGCATCATTTACAACTACCTTGACAGATGGTGAAATTACTGCTGTTAATATTTTAAATGCTGGTCAGGGTTATGAAACAGTCCCTAGAATTTCTGTTATTGATCCTGTTGGAGCACAAGTTCTTGAAACTGTAGTTGATGGAGATGGTAGAGTTATTTCTGTCGAACTTCTGTTTGGTGGCAGCGGTTACACAGACGTTCCATCTGTTTATATTGTAGATAATCGTCAGAATGATGTTGGTACTTATATTGGAGGAACGGGTGCTACTGCAGTAGCAGCAATCTTTAATGGACAAATCACTGATATTAACATTACTAACTTTGGTACTGGTTATAGTGCAGATAATCCTCCTCAAATTGTAATCCAAAAACCTGTTGATGCTAAAGCATCTGCAACAGTTGGTTTGCAGGAAATTACAGGTTTTTCTGTTCTTAAAGCAGGAAAGGAATATACTAAAGCACAATTCCTTGGTTGTGCCAGAGCTGCTTCGGGTATTACTGATTATACGCAAGATGGTAATGCAGTATTCTCTAACAGCACTACAGCAGCAGAGGCATCAACAGATACCTCTGTAAAGTGTCTGGATGCATTGTTTATTAAAAGACTACTCGATAAGTATACAGAGCAGTTCTTACCTGATGTTCCTACACTTGATTATAGTAAGATTGATGTTCGTACATCTATTAAGACTATTAAAGACTTCTATTCTGCAAAGGGTACATCTTTCAGTATTGCATATTTGTTTAAACTTCTTTATGGCGAAACTGTTACAGTTTCATATCCTAAAGATCAAATTATCAAACCATCTGCAGCAACCTGGTCTGTTGATACGGTTTTACGTGCAACATTAGTTAGTGGTCTTCCAGAAAATATTCAAGATGGTCTTCTTGAGCAAGTTGCTGATATTTCAGATCCAAATATTTTAGCAGCAACAGCATTGATTGAAAACTTTATTTCAATTCAAACTGCCCAAGATACAATATATGAACTAGCACTTTCAGAAGAAACAATTGAAGGTACATTTGTAGTTCCATACAAAACAAAACTTGCTGAACCTCTTAATACTACAGAAGGTATCATCACTGTTGACTCTACTATTGGATGGCCAGAAAGAAATGGTGAATTTGTAATTTCGTCAGGTGTTGGTTCTGAAGTTGTTCAGTACAAAGAAAAATCACTAAACCAGTTTATTGAGTGTACTCGTTCTGTTAATGGTGTTGTAGAAGATTGGGATTCTGCCACTCAGGTATCGTCTAATTTTAATGTATTCATTAATAGAGGAACTGCTCAAGAAGTAGTATTGAATATTGTTGGTATTGTTGATGCTCAACAAACAACACTCACCGATACAGGTTCTTATTACTTACCAGGAGATAAACTGTTAATCTCTAAACTGGGTGGTACTGGAACAGGTCCAGAACTCACAACTTGGTTGTATAATGTTAAAAAGTTGATTGAAGTTGAATCAATCGCTTTTGGTGGAATTAATAATCAATCTGCTACTGTAACTTGCAGCAATCCTCATGGTCTATTGGTCGGAGATCAAGTTACAATTTATGGTGCAAATCCAATCATCTACAACGGATCTTTCCTTGTAACCTCTAGAGACAGTACTACTGTATTTCAGTATCAACTTCCTCAACCTGCAAATGTAGTTCCTCAAGGAAATATCCTTGTTTCCATTGACTTGAACAAAGGTAAGTCGGATAGTTCTGCAGTTAATAATGCAATTAGTCCTTACACAACTAATGTTCAAAATACTTTCTTCAATACTACAAACACTTATATTGCGTCTACAGGTATTCCAAACTACAATATTGGACCTTTCCCTGGATCGGCATTATTACCTGGCAACCAACGTAAATTGAATAGGTTTCCAATCACTCCTGTTACAATCTCAACTAAAAATCTGATTGTACCTGGTCCTATTGGAACATGGGTAAATGGCGTCTCTATTTGGTCCTATAAGTCTGATGTCACTAAAATCTTTGGTGCCGTAACGTCAATTGCTATCAATAATGCAGGAAATGGATATGATGCTGCATTCCCACCAGCAATTACGATTAGTGGTGGTGGGGGAACTGGAGCAGCAGCAACTGCGACTGTTAATGGTTCTATTAGTGAGGTTACAGTAACTGAAGGCGGTTCTGGGTACACTTCTTCTCCATTGGTATCTATTGTTGGTGGAGGCGGTTCTGGAGCGTCAGCAACAGCAATTATTACAAAGGGTGTAGTTTCTAGTATTCTTGTCAATTCTGGAGGAACTGGATATACTTCCCAACCATCTATCACTGTTGTTGGTGGTGGAGGATCTGGTGCTGAAGGTACTGCAGCGGTTCGAGGGCCAATTCAATCAGTCGCCATCACTAATGGTGGGGCATCTTATACATCTAATCCTAGTATTATTCTTAGTTCTGGTGCTGGTGCTGTTGCACAGGCAATTATTAATGATGGACGTATTATTTCAATTGCTATCATTTCGGCAGGTTCTGGATATACTACAGCACCAGAGGTAACTATCCAGGGAGATGGTTTTGGTGCTGTTGCTAGAGCAACTATTGATGTTGATGGTGAAAATGCTGGTAAAGTTACTGGAATTGAAATTGTTAATAGAGGTATTGGATATAGTCAAGGTACGACTATTATTAACTTAAACTCTGTTGGTCAAGGTGCTTCTTTCTTAGCAAATGTATTCCAATGGACTTATAATTTGCAAGAGACAACAACCGTTGATAGTGCTAAGGGATCTGTATTTGAAGGATTTAATAATCAGTACGGTGGAGAATATGCACACCTTTCCAATCCTCAAAGACTTAGATACATTCTAGGCGACAATCTATTTGCTAATGTAAATGATCAAATTCTTGAACAGGATGATCAATTAGGACATTCTCCTATTATTGGATGGGCATTTGATGGCAATCCAATTTATGGTCCTTATGGATATTCAGACCCTACCAATCAGTCTTCTTCAATCTCTAGATTGAGAACTTCTTATAGATTAAAGGCAAATTTAGTTTATGATGAGGTTACTAATCCAACTCCTGTTAGAACTGATGGACCTCTGCTATCAGAGGAGATTGCAGGTAAGTTTGTAGAAGATTATGAGTATTCCTTCAGTTTAGGAGATCTTGATCAATATAATGGTAGGTTCTGTAAGACTCCAGAATATCCCACTGGTAGGTATTGCTATTTTGTAACTATTGATGCTACAGAGCAAGGTAATCCAGTATTTCCATATATTCTTGGACCAAGTTTTAACTCGGTTGTTGATACCTGGAATCTTTCTACGACTGCTGTTCAACAAAATATTCCTATTGGTGTTGTTCGTTATCGCGATCCTTATGAAAATGTAGATATTGATGTTGAAAGAGCACCAAATGCATCTACTAATGGATTGACATTGGAAAATGGAGATATTCTAACTTTCGATGTAGAAGATGAAAATAGAGATGGTGTTATTAGTGCAGAAGAAACTGCAGATCCAGATCAAATATTTGAAGAGTCTCCATTACAACTATTCGATTACTTCCCGACAGTAAAATTAGACTCTAAGGTTGATATTGAAGTAGAAACTATCACTAAATTTGAAGATGCTTCAATTACGGGATT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