Protein

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Genbank accession
WJJ55292.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,65
Protein sequence
MAFPVNPADQTEYIDSDGVIYTYYQSDNRWVRSGIKPTLPDATDSQKGVIQLTGDLAGSASDPELAKTGVTAGVYKLADVTVDEKGRITYAQNGQVNIQPKTISGLETNVDITADIAAIKNTFRTSEVDNSSKVRMNNMVVDVFNDSNGINQELSVGCELDTVNKQVISNIIYKSTGYTFVNVQPSSTYNDTTPTSKLTDGDNGDATLTSYVGQSASSGASLGVQFNLGTPKTVYFVTAYFGSLTNNGIYYPKQVQVYGSNDNSNWTQLGEQDSMLTDSPSNIQSGSITVKLNPAAPYQYYKVMYTSGGQWTFISEVQMQGISTLITTSDPAINPPLQALLDAEYSNGTVGSVSFDMSADGGNTWTSLTPDQLTEITSTAGNSVVVRATLTGDATLTSLGYIWYDINTIQYIDTSQEVQMLEQETMDLLRTNLTTAKANNTPRYTWNNIVVDSFVDASGIDNNLSSGYYLDTINKQVNVTNGNAVIVTTQVITNAQPDVVMIDSQYTGNVTFDVSIDGGTTWVQNLEVDSLIDISSLIGTKLRIRANMSSGAVLSGLAFAWFSGDTGGLSGVVDPGTRNLINNLQANLLKTNFKVSALQNASKYSMVNTVIDDYNDTTGIDASDSSGWSWDNVNKQIGVQAGVKTYSNASDWDSMTQSQVQVINDMVQLSNSRVGSFSTIVNGIPNETHMYIIVHSYNVAVDNNGIAHVVTASKRYNACYNIDYFTISPNGTVSSIIAVTTYTSSGADSYNPSIVIDLNGTAHIVCHSRGYTTNAYNILYATVSPSGVVTSLWITKNLSYSSTYPSIAVDSNGTCHIVFQSTNPSYYNIAYVTVSQSGTVSTVSWLTNATYTSAYPSIAIDSNGGKHVVFHSLVYNSGYTNIAYIYIDSNGNASNIVWLTTSTSFSSIYADIKVDSAGIAHVVFQSEGYSSSYQNIAYLTVSYNNGNPTISNVTWITQSASANSYYPHIAVDSNGTSYITFHSNIYFYNYNNTAYVTVSNSGSVSSINWLTNSTSTTYYYPVISLNSGYCYILYISSLSPSIYASVASWLYQSSGSITGIVDAGKEVAWNQIVPNVTLPTGTAISLSYQISNDGSTWSNSTTVISGQNLSGAYARYLQFTVTLSTTNTSVTPTLNSLQVTWENGQAIIVSTPDTAPSPPSQIIVSAEYNNGSSGSVSVDISIDGGQTWTTGIPFDTLTDIESNSGTSVVSRVTLTNDATISSIGYSWD
Physico‐chemical
properties
protein length:1228 AA
molecular weight: 131991,50000 Da
isoelectric point:4,31228
aromaticity:0,09935
hydropathy:-0,13485

Domains

Domains [InterPro]
IPR045571
RBD
40–81
IPR045571 G3DSA:2.60.120.260
IPR008979
STR
186–318
IPR008979
WJJ55292.1
1 1228
Architecture
RBD
STR
RBD 40-81 | STR 174-324 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Dabrowskivirus KKP3916
[NCBI] 		3428177 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Alicyclobacillus acidoterrestris
[NCBI] 		1450 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WJJ55292.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ846916 [NCBI]
CDS location
range 51301 -> 54987
strand +
CDS
ATGGCATTTCCAGTAAATCCAGCAGATCAAACTGAGTATATTGATAGTGATGGTGTAATTTACACCTATTACCAATCAGATAATAGGTGGGTGAGAAGCGGTATTAAGCCAACTCTTCCAGATGCTACAGATTCTCAAAAGGGTGTAATTCAATTGACAGGGGATCTAGCCGGAAGTGCGTCCGATCCTGAATTAGCGAAGACAGGAGTTACAGCAGGTGTATACAAATTAGCGGATGTGACTGTAGACGAAAAAGGGCGTATTACATACGCCCAAAACGGTCAAGTGAATATTCAGCCTAAGACCATTTCTGGTCTTGAGACTAATGTGGATATTACAGCAGATATAGCCGCGATTAAAAACACGTTCAGAACTTCTGAAGTGGATAATTCGAGTAAAGTAAGAATGAATAATATGGTTGTTGATGTATTCAATGATTCTAATGGTATCAACCAAGAGCTAAGCGTTGGATGTGAGTTAGATACCGTAAATAAACAAGTCATTTCCAATATAATTTACAAATCTACTGGATATACCTTTGTAAATGTCCAACCTTCAAGTACCTATAACGATACTACGCCAACTTCAAAATTGACGGACGGAGACAATGGAGATGCTACTCTTACCTCTTATGTAGGTCAATCTGCTTCATCTGGTGCGTCACTTGGAGTACAATTTAACTTAGGAACCCCTAAAACGGTATATTTTGTTACTGCATATTTTGGCTCATTAACAAATAACGGTATTTATTATCCGAAACAAGTACAAGTATATGGAAGTAATGACAATTCCAATTGGACTCAATTGGGTGAACAAGACTCTATGTTAACTGACTCTCCATCGAATATCCAAAGTGGTTCAATTACAGTTAAGTTAAATCCCGCCGCCCCATATCAGTATTACAAAGTAATGTATACCTCTGGAGGTCAATGGACATTTATTTCTGAAGTCCAAATGCAAGGAATATCAACCTTAATCACAACTTCCGACCCTGCGATAAACCCACCGTTGCAAGCGCTTCTTGACGCAGAGTATTCTAATGGCACAGTAGGTTCCGTATCATTTGACATGTCCGCAGATGGTGGCAATACATGGACTTCGTTAACTCCAGATCAACTCACTGAAATCACATCAACAGCAGGGAATTCAGTAGTGGTTAGGGCTACACTTACTGGGGACGCAACTTTAACGTCGCTAGGATATATATGGTATGACATTAACACTATCCAATATATTGATACGTCCCAAGAAGTTCAAATGCTTGAGCAGGAAACGATGGATTTACTAAGAACAAATTTAACTACAGCAAAGGCAAACAATACACCTAGATACACTTGGAATAATATAGTGGTCGATAGTTTTGTTGATGCTAGTGGGATTGATAATAACCTCAGTTCTGGATATTATCTGGACACCATTAATAAGCAAGTGAATGTAACTAATGGGAATGCCGTAATTGTTACCACACAAGTAATAACAAATGCTCAACCAGATGTGGTTATGATTGATTCTCAATACACAGGAAACGTTACGTTTGATGTTTCCATAGATGGCGGAACTACTTGGGTTCAAAATTTAGAGGTAGATTCTTTAATTGATATATCCTCTTTAATTGGGACTAAGTTGCGAATAAGAGCGAATATGTCATCGGGAGCAGTTCTTAGCGGTTTGGCATTTGCTTGGTTCTCTGGTGACACTGGAGGTCTAAGTGGAGTCGTAGACCCTGGAACTAGAAACTTAATTAATAACCTACAAGCCAATTTACTGAAGACTAACTTTAAGGTATCCGCCTTACAGAATGCATCAAAATATAGCATGGTTAATACTGTAATTGACGATTATAATGATACGACAGGAATTGATGCTAGCGATAGTAGTGGATGGTCATGGGATAATGTGAATAAACAGATTGGGGTTCAAGCTGGTGTAAAAACGTACAGCAACGCAAGTGATTGGGATAGTATGACGCAATCCCAAGTTCAAGTTATCAACGATATGGTACAATTATCTAATTCAAGAGTAGGTTCTTTTTCTACTATTGTGAATGGCATCCCTAATGAGACACATATGTATATAATTGTTCACTCTTATAATGTAGCAGTAGATAACAACGGAATAGCGCATGTAGTCACGGCGTCTAAGAGATATAATGCTTGTTATAACATTGATTATTTTACCATATCACCAAACGGCACCGTGTCATCTATAATCGCAGTCACAACATATACATCGTCAGGAGCGGATAGCTATAATCCGTCTATAGTTATTGATTTAAATGGAACGGCTCATATAGTATGTCATTCTCGCGGTTATACCACAAATGCATATAATATATTATATGCTACAGTCTCACCCTCAGGGGTGGTAACTTCTTTATGGATTACAAAAAATTTATCATATAGTAGTACATATCCTTCTATTGCTGTAGATTCTAACGGAACATGTCATATCGTATTCCAATCTACAAATCCTAGCTATTATAATATCGCTTATGTTACAGTTTCTCAATCTGGAACAGTATCTACGGTAAGTTGGCTAACGAATGCGACGTATACCTCTGCGTATCCTTCGATTGCTATAGATTCCAACGGCGGGAAACACGTTGTATTTCACTCTCTGGTATACAATAGTGGCTATACTAATATTGCTTACATTTATATAGATTCAAACGGGAACGCCTCTAATATAGTATGGTTAACAACATCAACATCATTTAGCAGTATATATGCAGATATAAAAGTGGATAGTGCTGGAATTGCTCACGTAGTTTTTCAATCTGAAGGTTACTCCAGCTCCTATCAAAATATAGCGTATCTTACGGTATCGTACAACAATGGGAATCCTACGATTTCGAACGTAACATGGATAACTCAGTCGGCATCAGCTAATAGCTATTATCCACACATAGCAGTGGATTCAAATGGAACAAGTTATATTACATTTCATTCTAATATCTATTTTTACAACTATAACAATACTGCATATGTAACGGTTTCTAATTCTGGATCTGTATCATCAATAAACTGGCTAACAAATAGTACAAGTACAACTTATTACTATCCTGTTATTTCACTGAATTCTGGATATTGCTATATATTGTATATTTCATCTCTTAGCCCTTCAATATACGCAAGCGTCGCCTCTTGGTTATATCAAAGTAGTGGTTCCATTACTGGCATTGTCGATGCGGGGAAAGAAGTAGCTTGGAATCAAATTGTACCTAACGTCACATTACCAACTGGAACTGCCATAAGCTTATCATATCAAATAAGCAATGATGGATCTACTTGGAGTAATTCAACAACTGTAATTAGTGGTCAAAATCTATCCGGTGCATACGCGAGATATTTACAGTTTACAGTCACTTTGTCAACAACTAACACTTCGGTAACACCAACATTGAATAGTCTACAGGTCACTTGGGAGAATGGGCAAGCTATCATAGTTTCAACACCAGATACTGCACCATCGCCTCCTTCTCAGATTATTGTTAGCGCAGAATATAACAATGGGAGTAGCGGATCGGTTTCTGTGGACATATCTATTGATGGAGGTCAAACTTGGACAACAGGAATCCCATTTGACACCTTGACAGATATAGAGTCCAACTCTGGAACTTCAGTTGTGTCAAGAGTAACACTTACTAATGATGCAACAATAAGTAGTATTGGATATAGTTGGGATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
67091ba1e4eaf60ee0d2e29e3acd0532f4d7550a7323853fb50d7a2e83b77d58
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2835
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Characterization and genome study of newly isolated Alicyclobacillus-specific phaga Shymialevich,D., Wojcicki,M., Srednicka,P. and Swider,O. 2023-06-20 — GenBank