Protein

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Genbank accession
WPJ67584.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,80
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTIFTKDDLGNIIDLGFAKGGQVDGNITQTGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHLNKAPIFTDLSSATSTSEYHPLIKQRYKDGTFSVGTLVNEGSFKIQYINESGDSKYWTFNRNGSFIVDNGSIEVRAGNISASGNINSATGFVSAPRVNTKNINLSSKKFIPNNDEGYDIVSLPTWIYNPPADGSDRDTNGLNYMRKMRASNTSSIFHEIVDCRKGKPQEISWWTGVGPSSFQWAFDTSGRITAGKSISVGLPDNGSNGRYPLDSAISIGIAIGDNDTGIKWVRDGVIDFMANGISSATILNNGINSTKKLMVGYSRDSGTTWDYPNNNQAMFTARTDVDGNNNGDGQTHIGYSSNAKMYHYFRGTGRMSVNMGDGLLVEPGILDIKTGSNSLNLRADGTIASVQTLKLNNGLYFNGDGTNASLVFKAASGIDGTKQIMWEGGTRPGQNKSYVTVKAWGNSFNATGDKSRETVFEVSDGQGWYFYTQRLAPTDSGTIGRVTTYFNGELRSKGNLISEGSLEVDGTSTLAGNVTMSNGLFVQGGSSITGQAKFGGTADALRIWNAEYGAIFRRSEASLHIIPTPKDAGESGGISNLRPLSISLNNGMVQMRHSVTLGDDGRGGNMVTVDNDNKLVVVTSNSRISPNYRMQIGQSAYIDVECTDSVRPAGAGSFASQNNENVRAPFYMNIDRTDNSTYVPILKQRYVQGNSCYSIGTLINGGNFRVHYHEGGDGSSSGAIIKDLGWEFTRSGDFISPKRVSAGGSVYLGTDGNITGGSGNFANLNTTLDRKVTTGWINYSVDSGWYKLATVTMPQGVATVQFKITGGSGFNVGTFRQATINEIVLRSGNNSPKGINGVLWQRETDAIKDIAYINTSGDEYDVYINCGTYLNRLTLEYSTSENASVVVHGLYGPTQSPVEELPVDTVKGRVFKLLNNSSGVFDAGSSNISTNATFVANTTIGFRHKSNGDESGSAAALFYNDGTTFHILLTDKNTDTDKTKASGSYNSLRPFSINIASGKVTISNSMSVSGVSEFYNGLNIKNNGSINFDKSGANPRNMRIFHAGDASRGNRIEIADETNYIAYFEKTPGGANRFVVNNATVDGVNQMNSFGININNALGGNSIAFGDNDTGIKQSGDGILDIITNAARRMRFQTGDTYSDMNINAPNVYIRSDIRLKSNFRPIENALEKVEQLDGLIYDKADYIGGEPVQTEAGIIAQTLQDVLPEAVREVEDIKGNKILTVSSQSQIALLVEAVKTLSARVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1321 AA
molecular weight: 142382,26800 Da
isoelectric point:6,31228
aromaticity:0,08781
hydropathy:-0,38812

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–1052
DC_0538 DC_1942
IPR030392
CHP
1223–1280
IPR030392 Coil
IPR030392
CHP
1223–1320
IPR030392
WPJ67584.1
1 1321
Architecture
STR
ATT
STR 1-1052 | ATT 1141-1320 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
WPJ67584.1
1 1321
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 310 310 0,1167
Central domain 311 509 200 0,3820
C-terminal 510 1321 811 0,6827
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-310
Central
311-509
C-terminal
510-1321

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage JoYop
[NCBI] 		3093947 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WPJ67584.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR769032 [NCBI]
CDS location
range 60920 -> 64885
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACAATTTTTACTAAAGACGATTTAGGAAATATCATTGATCTGGGTTTTGCTAAAGGCGGGCAGGTTGATGGAAATATCACTCAAACTGGTGATTATTTACAAAATGGAACATATAATCTTAATGGAAACCAGTTTGTTTATGCAGGAAAATATATTGAATTTTTACCTAAAACAGCTGGTAATGGCGCTTGGGCAAATCAACACCTAAATAAAGCCCCTATCTTTACAGATTTAAGTTCAGCTACTTCTACTTCAGAATACCATCCGCTAATTAAGCAGCGTTATAAAGATGGAACTTTTTCTGTTGGTACGTTAGTAAATGAAGGAAGTTTTAAAATTCAATATATCAATGAATCTGGTGATTCAAAATATTGGACTTTTAATCGAAACGGTAGTTTTATTGTAGATAATGGCAGTATTGAAGTCCGTGCAGGTAATATTTCGGCTTCAGGTAATATTAACTCGGCAACCGGATTTGTTTCTGCACCGCGCGTCAATACAAAAAATATTAACCTGAGTTCTAAAAAATTTATACCGAATAATGACGAGGGTTATGACATTGTTTCTTTACCTACTTGGATTTATAATCCACCAGCAGATGGTTCTGACCGTGATACAAACGGATTGAACTACATGCGTAAAATGCGGGCTTCAAATACTTCTAGCATTTTCCATGAAATTGTCGATTGCCGAAAAGGTAAGCCACAAGAAATTTCTTGGTGGACTGGTGTTGGGCCTTCTTCTTTCCAGTGGGCGTTTGATACCTCCGGGCGTATTACTGCAGGTAAATCAATTTCTGTAGGTCTTCCTGATAATGGTTCAAATGGACGTTATCCTTTAGATTCTGCCATTTCTATTGGTATTGCAATTGGTGATAACGACACCGGTATTAAATGGGTCCGCGACGGTGTTATTGATTTCATGGCTAACGGTATTTCATCCGCTACCATTTTGAATAACGGTATTAACAGCACTAAGAAATTGATGGTCGGTTATAGCCGCGATTCTGGTACTACTTGGGATTACCCAAATAACAACCAAGCAATGTTTACTGCGCGTACCGATGTTGATGGTAATAATAATGGCGATGGACAGACTCATATCGGTTATAGCAGCAACGCTAAGATGTATCACTATTTCCGTGGTACAGGTCGTATGTCCGTTAATATGGGCGATGGACTTCTTGTTGAGCCTGGCATTTTAGATATTAAAACCGGTTCAAATTCGTTAAATTTGCGCGCTGATGGTACCATTGCTTCTGTTCAAACATTAAAACTTAATAATGGATTATATTTTAATGGTGATGGAACTAATGCTTCTCTAGTTTTTAAAGCCGCTTCAGGTATTGATGGCACTAAGCAAATCATGTGGGAAGGCGGTACTCGACCAGGTCAGAATAAGAGTTATGTAACTGTTAAAGCATGGGGTAATTCATTTAACGCCACTGGCGATAAATCTCGTGAAACCGTATTTGAAGTCTCTGATGGACAAGGTTGGTATTTCTACACTCAACGCCTGGCTCCAACTGATTCTGGAACCATAGGTCGTGTTACAACTTACTTCAATGGTGAGCTTCGTTCTAAAGGAAACCTAATAAGCGAAGGAAGTCTTGAAGTTGATGGAACAAGCACACTAGCCGGTAATGTTACTATGTCTAACGGTTTGTTTGTTCAAGGTGGTTCTTCTATTACTGGACAAGCTAAATTTGGTGGAACGGCAGATGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATATGGTGCTATTTTCCGTCGTTCAGAAGCATCATTGCATATTATTCCGACCCCTAAAGATGCCGGTGAAAGCGGTGGAATAAGTAATCTCCGTCCACTTAGTATCAGCCTTAATAACGGTATGGTGCAAATGCGTCATTCTGTCACATTAGGTGATGATGGCAGAGGCGGAAATATGGTTACCGTAGACAACGATAATAAACTTGTTGTTGTTACTAGTAATAGTCGTATTTCTCCTAATTACCGTATGCAAATAGGTCAGTCAGCATATATTGATGTTGAATGCACTGACAGCGTTCGTCCAGCGGGTGCAGGTTCTTTTGCTTCCCAGAATAATGAAAACGTACGCGCACCATTCTATATGAATATTGACCGTACAGACAATAGCACTTATGTTCCAATTTTGAAGCAGAGATATGTACAAGGAAACAGCTGTTACTCTATTGGAACCTTAATTAATGGTGGTAACTTTAGAGTTCATTATCATGAAGGTGGAGACGGAAGCTCATCAGGCGCAATTATAAAAGATTTAGGATGGGAATTTACGCGTTCTGGCGATTTTATATCTCCTAAGCGTGTTTCTGCCGGGGGTTCAGTTTATTTAGGTACAGATGGTAACATTACTGGCGGTTCAGGAAACTTTGCTAACTTGAACACTACTTTAGACCGTAAAGTAACTACCGGCTGGATTAATTATTCTGTTGATAGCGGTTGGTATAAATTGGCAACAGTAACTATGCCTCAAGGTGTGGCTACAGTTCAATTTAAAATTACTGGTGGTTCTGGATTTAACGTTGGTACTTTTAGACAAGCAACAATTAATGAAATTGTATTGCGTTCAGGTAATAACAGCCCTAAAGGAATTAATGGTGTTTTATGGCAACGCGAAACAGATGCTATTAAAGATATTGCGTATATTAATACCTCAGGCGATGAGTATGATGTTTATATTAATTGTGGCACTTATTTAAATAGACTTACCTTAGAATATAGCACTTCAGAAAACGCTTCAGTAGTAGTTCATGGATTATATGGGCCTACACAATCACCAGTAGAAGAGCTTCCTGTAGATACTGTTAAAGGTCGTGTTTTTAAACTTCTTAATAATAGCTCAGGCGTTTTTGATGCAGGTAGTTCTAATATTTCTACAAATGCAACTTTTGTGGCAAATACTACTATAGGATTCCGTCACAAATCTAACGGCGACGAAAGTGGCTCTGCAGCTGCTCTGTTTTATAATGATGGTACTACGTTCCATATATTATTAACAGATAAAAATACCGATACTGATAAAACTAAAGCCTCTGGTTCTTATAATAGCTTGAGACCTTTTTCTATCAATATTGCTTCTGGTAAAGTAACTATTTCAAACTCTATGAGCGTTTCTGGGGTATCAGAGTTTTATAATGGACTTAACATCAAAAATAATGGAAGTATTAACTTTGATAAGTCTGGCGCTAACCCGAGAAATATGAGAATATTTCATGCTGGTGATGCTTCTCGCGGTAACCGTATTGAAATTGCTGATGAAACTAACTATATTGCTTACTTTGAAAAAACTCCAGGTGGAGCTAACCGCTTTGTAGTAAATAATGCTACTGTGGATGGTGTTAATCAAATGAATTCATTTGGTATTAATATCAATAACGCACTTGGTGGAAATAGTATAGCATTTGGTGATAATGATACTGGAATTAAACAATCTGGTGACGGAATTCTCGATATCATTACTAACGCCGCACGCCGAATGAGATTCCAAACAGGTGACACCTATTCTGACATGAATATAAACGCCCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTTGAAATCTAATTTCAGACCTATTGAAAATGCTCTTGAAAAGGTTGAACAGCTTGATGGTTTAATCTATGATAAAGCTGACTATATAGGCGGTGAACCTGTTCAAACAGAAGCAGGTATTATAGCTCAAACGTTGCAAGACGTTTTACCTGAAGCAGTTCGTGAAGTTGAAGATATTAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAATCCCAGATTGCTCTTCTGGTTGAAGCTGTGAAAACACTTTCTGCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
e6ff45bf70cdd8f83a34812467bd52697f50351542aad1f1f5256152d2a6f357
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6931
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Escherichia phage Carena and JoYop Addablah,A., Kakou Ngazoa,S., Adioumani,E., Gunathilake,D., Tremblay,D. and Moineau,S. 2024-03-12 — GenBank