Protein

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Genbank accession
QXV72337.1 [GenBank]
Protein name
long-tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,54
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,87
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYNVLDDGVNVEFFIDENTIQAYDETRGYKKGFAVIHDQRIWVAQRDIDAPAGTFVPGYWTATRTDPKWITVASPTRQLASGEYIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTIVIKDIGGRVGYNEIKLQSSSAPGGGNQKIVRFGNQFTETLITKPFSYNMIIFANRLWHFWEAANEERGIRVEPNTAQFQSQAGDNVLRRYTSGAVIKFTLPKYANQGDIIKTVDIDGLGSKFHLIVETFDASSSLGKPGQHSMEFRTSGDGFFVYNSTEKLWYVWDGDRQTRLRVIRDDVELLANESVIVFGPNNTTPQTINITLPTGVAQGDVVKIALNYLRKAQTVNIKAAVGDKIASSVQLLQFPKRSEYPPETEWVLNDVLTFNGNISYTPVIELSYIEDTTTGGKYWVVAQNVPTIERVDSKDDLTRARLGVIALASQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIATTAQVNQDTTFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEIATQVETNTGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYTSTVGTAPATARDTVGTNVYNKNVGNLVISPKALDQYKATQVQQGTVYLSNQSEVNAGQSASGFANSAVSPETLHARVALDTRTGLIEIATQQETDTGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLTGIARIATQVEFDAGTLDNVISTPLKIKTRFNDTARTSVSAASGLVESGTLWNHYTLDIREANETQRGTARLATQTEVNVGTDDKTIITPLKLHSKKSTESSEGIIRVATNTETTAGTSKVLAVSPSGLKYVVQTETTWEATALRRGFVKLTEGALTHSGNKVTGSGVKFNSGTGLYENDDTVLNAANYPKTGYAVSSYEMNKTLQNFLPINATAVNSEKLDGLDSLQFIRRDVDQTVNGSLTLTKQLNLAAPLVSSSTANITGNTILGSLEVTGNSTFKNDVSVSSGKSIKFVGPQSGAGTWNSQGDTLAPIFAEINSTPDAKFHPIVKQRLGQGTFSLGTVNDGTRDFKIHYLPSPGSLESFYWTFNTTGDFAVNSGSISISKNANITGITTSNGVSTTTLNASALSSLQNVTTSGTIVSTGQVSANNGLVAQKYVRSVGVKPTLASQAPTAETVGFWSVDINDSATFNLFPGYWTMKTKRQVNIDTVQTKPAGVSDEIWNASGWLTETGAFSSPAIRYRNEDGSFGDEVLSTTGQKLRGTWFDYSVRDKEVKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKNAWTTFSMVYTADNPPSAEEVGALPADNATMGNITILDWLRIGNVRIIPDPVTKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1349 AA
molecular weight: 146367,30340 Da
isoelectric point:5,65886
aromaticity:0,08154
hydropathy:-0,33462

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
11–126
DC_1986 DC_1209
IPR048391
ATT
1143–1176
IPR048391 IPR048391
QXV72337.1
1 1349
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 11-126 | STR 349-1142 | ATT 1143-1176 | STR 1177-1234 | ATT 1235-1297 | STR 1298-1330 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage PSD9
[NCBI] 		2861000 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Shigella dysenteriae
[NCBI] 		622 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QXV72337.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ561532 [NCBI]
CDS location
range 33815 -> 37864
strand +
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCTGCCTTCCGTGCTACATCCGGACTCGATGCTGCAGGCGAGAAAGTTATCAATGTTGCCAAAGCCGATTACAATGTATTAGACGACGGCGTCAACGTTGAATTCTTTATAGATGAGAACACCATCCAGGCGTACGACGAGACGCGCGGATATAAGAAAGGGTTTGCCGTAATCCATGACCAACGTATCTGGGTTGCTCAACGTGATATCGATGCTCCAGCAGGAACCTTTGTACCGGGTTATTGGACTGCAACTCGTACTGACCCTAAATGGATTACCGTAGCATCTCCTACACGCCAGCTGGCTTCCGGTGAATATATTGCTGTGGATTCTGCTGCTAGCTTTACTACATTTACCCTGCCTCCGAACCCTACTGATGGTGATACCATCGTAATCAAGGATATTGGTGGCCGTGTAGGTTATAATGAAATTAAGCTCCAGTCTAGTTCTGCTCCAGGTGGTGGTAATCAGAAAATTGTCCGTTTCGGTAACCAGTTCACTGAGACCTTAATTACGAAGCCTTTTTCCTATAATATGATTATCTTTGCCAACCGTTTATGGCATTTCTGGGAAGCAGCTAATGAAGAACGTGGTATTCGTGTAGAACCGAACACTGCCCAGTTCCAATCACAAGCGGGTGATAACGTTTTACGTCGTTATACTTCAGGTGCAGTAATTAAGTTTACTCTTCCTAAGTATGCGAACCAAGGTGATATTATTAAAACCGTTGATATCGATGGTTTAGGAAGTAAATTCCACTTAATCGTTGAAACATTTGATGCGTCATCTTCATTAGGTAAGCCTGGCCAGCATAGCATGGAATTCCGTACTTCAGGTGATGGATTCTTTGTTTATAACTCTACCGAAAAATTATGGTATGTTTGGGACGGCGACCGACAAACTCGTTTACGTGTAATTCGTGACGATGTTGAACTCTTGGCTAACGAAAGTGTTATTGTTTTTGGTCCTAATAACACGACACCCCAGACAATTAATATCACATTACCTACCGGTGTGGCCCAGGGTGATGTCGTTAAGATTGCTCTGAACTATCTCCGTAAAGCTCAGACGGTAAATATTAAGGCTGCCGTAGGAGATAAGATTGCTTCATCCGTCCAGTTGCTTCAATTCCCTAAACGTTCAGAATATCCACCAGAAACCGAATGGGTATTGAATGACGTACTGACCTTTAATGGCAATATAAGTTATACTCCGGTTATTGAACTGAGTTATATCGAAGACACCACTACAGGTGGCAAATATTGGGTTGTTGCTCAGAACGTTCCTACTATAGAACGTGTGGATTCTAAAGATGATTTAACTCGTGCTCGTCTCGGTGTTATTGCCCTTGCGTCGCAGACTCAGGCAAACGTTGACCATGAAAATAACCCTGAGAAAGAACTTGCAATTACTCCACAGACTTTAGCTAATCGTGTAGCGACTGAATCTCGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCTACTACTGCTCAGGTGAACCAGGACACAACCTTCGCATTCCAGGACGATTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTAAACGAACGTACTGCAACCGAAACTCGCCGTGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAAACTAACACGGGTACAGATGATACTACAATCATCACTCCTAAGAAGCTACAAGCGCGCCAGGGTTCGGAAAGTCTTTCAGGTATTGTAACATATACCTCTACTGTAGGAACCGCTCCTGCGACTGCTAGGGACACCGTAGGTACTAACGTTTATAATAAGAACGTAGGCAATTTGGTTATTTCTCCTAAAGCTCTTGACCAGTATAAAGCTACCCAAGTTCAACAGGGTACGGTATATCTTTCTAACCAATCTGAAGTTAACGCAGGCCAATCGGCAAGTGGATTTGCCAACAGTGCTGTTTCTCCGGAAACATTACATGCTCGTGTGGCTCTTGATACTCGTACAGGGTTAATTGAAATTGCTACGCAACAGGAAACTGATACTGGAACAGATTATACTCGTGCGGTAACACCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTGACTGGTATTGCTAGAATTGCAACACAGGTAGAATTTGATGCAGGTACGTTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAATTAAAACAAGATTTAATGATACTGCTAGAACTTCTGTCTCAGCAGCCAGTGGTTTGGTTGAATCAGGAACCTTATGGAACCATTATACACTAGATATTAGAGAAGCAAATGAGACACAACGTGGTACTGCTCGCCTGGCAACCCAGACCGAAGTCAACGTTGGTACTGATGACAAAACCATCATCACTCCTTTGAAATTACACTCTAAAAAATCTACTGAAAGTTCTGAAGGTATTATTCGTGTTGCAACCAATACCGAAACAACCGCAGGAACTTCTAAAGTTTTGGCTGTAAGCCCTTCTGGTTTAAAATATGTAGTACAGACCGAAACTACTTGGGAAGCTACTGCACTTCGTCGTGGATTTGTTAAACTAACCGAAGGTGCTTTAACCCATTCAGGAAATAAAGTTACTGGTTCTGGTGTTAAATTTAACTCAGGTACAGGCCTTTACGAGAACGATGATACTGTTCTGAATGCAGCGAACTATCCTAAAACAGGTTATGCTGTTTCATCTTACGAGATGAATAAAACTTTACAGAACTTTTTACCTATAAATGCTACGGCTGTGAACTCCGAGAAATTGGATGGCCTAGATTCACTTCAGTTCATTCGTAGAGACGTTGACCAAACGGTTAATGGTTCTTTAACGTTGACAAAACAATTGAACCTGGCAGCTCCTCTAGTGTCTTCTAGTACTGCTAATATTACCGGCAATACTATTTTAGGTTCTCTGGAAGTAACCGGAAATTCTACTTTTAAAAATGATGTATCTGTTAGCTCAGGTAAATCTATTAAATTTGTAGGCCCTCAGTCAGGCGCTGGTACTTGGAACTCTCAAGGTGATACTTTAGCTCCGATTTTTGCCGAGATAAATTCGACCCCAGATGCCAAGTTCCATCCTATTGTTAAACAACGTTTAGGGCAAGGTACGTTCTCTTTAGGCACTGTAAATGATGGAACTCGTGATTTTAAAATACATTATCTTCCATCGCCGGGTTCTTTAGAATCTTTCTACTGGACCTTTAATACGACTGGTGACTTTGCTGTTAATAGTGGTTCCATTAGTATTTCTAAGAATGCTAATATCACAGGTATAACCACTTCTAACGGTGTTTCTACAACTACATTAAATGCTTCTGCTCTGTCTTCATTACAAAACGTAACTACTTCAGGTACTATCGTTTCCACCGGACAGGTATCGGCAAATAATGGTTTGGTTGCTCAAAAATACGTCCGCTCTGTTGGTGTTAAACCTACATTAGCATCGCAGGCCCCTACTGCAGAAACAGTTGGCTTCTGGTCTGTCGATATCAATGATTCGGCTACATTTAACCTATTCCCAGGTTATTGGACGATGAAAACTAAACGTCAGGTTAATATTGATACGGTCCAAACTAAACCTGCCGGTGTTTCTGATGAGATATGGAATGCTTCTGGTTGGTTGACGGAAACGGGTGCATTTAGTTCTCCGGCTATTCGTTATCGTAACGAAGACGGTAGTTTTGGTGACGAAGTTCTCAGTACGACGGGTCAGAAATTACGTGGTACTTGGTTTGATTATTCTGTTCGTGATAAGGAAGTTAAATATCCTGGTACGTTAACTCAGTTTGGTAATACATTGGATTCATGTTATCAGGATTGGGTGTGCTATCCTACAGGACTGAATGGTGGTACTATTCGTTATACACGTACCTGGCAGAAAAATAAAAACGCATGGACTACGTTCTCTATGGTCTATACGGCAGATAACCCTCCTTCTGCGGAAGAGGTTGGTGCATTGCCTGCTGATAACGCCACAATGGGTAACATTACAATCCTTGATTGGTTACGTATTGGTAACGTTCGTATTATTCCTGACCCGGTCACTAAATCCGTTAAGTTTGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
32fe9f4b5d066dd8bfbbf069418d001489fb42829f6221d1ba00180007637562
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7489
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50