Protein
View in Explore- Genbank accession
- AOO12679.1 [GenBank]
- Protein name
- short tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MPLTRLDNLYSSKTGKYLYVSPDDFNATDELDNRGNSPLRPFKTIQRAFIEVSRYSYLPGANNDRFDQFSIMLMPGNHYIDNRPGLVTETAVEARYFDAGNLLEGNRQEVIDRSVAQVSVQHPDFYYPGDPQTGAWSRFKDAYRLIQKNRDLLIDRATAQIPVDHEDFVYPGDPTVGEWSRYKDAYRLIQKNKDLIAQDAFDLMNANPPSPLPDGYASKCIRDIKILIDSLSLDVHEGGGNKYTRKYIQTYFLDDGTDWVNGSLRGEETQSLVAFAEAARLMKLAITNNYTSTSSPGNEYQDLTVVIGAPNYETDSANDVPNTDPTACSDVQTFIDNLYAIVNTTFSDSDLAANNGNFDLTNVLPAETVSDKISAGHAKCKRDTGFVLDALSLDVHEGGGNRYTRKLLQNYFDSTGNNWVVNGLQGETAESLTAFGQLFTEMKRALTNQLYFKDLTITPGDAIFGNTNSPQENLPSGNPAACADIQTQIDTLGAIVTQIINDENLTNLPDETLSDVISAGLAKCKRDAGIITDGIINDLRTEGNANTITNAKAYFDRFGNPIANGLLGEESESITAFNGIATFAKQAVTNQLFFKDLTISPGPAYANANTPEIPNLASGNAATCVDVQATIDTLIKILTDVIEVGNLDELAAIKVTGVLPSFNYNRALEEWQDNSIVDLANPDNVLYKFNAADGGCIVPRGCSLIGYDLRRTVVRPLYVPDPADTSQPRTSIFNLTGGCYIWQFTIKDGDLSAQSPLYDASAGVGKVYYKKGSTDLAIPEYSHHKICIMEYADSKDLDNYYEKVGKSFQQFQPTIDDGGLEALVQENRIVGPLSDSRTIESIRIDDSATFTGNASNSTILNNVTNAESLEVGYEITSPDVSVVISPNTRIESISGTSVTLNQSISGSGNVSFLASFGYANITIQTKIDHGYFEGQYVAIINSGLSDEINGTWKVTKIDGVNPKIFEYEVYNNTAASLGLVSGQTYLSGEVGGVSTNAVVLAEIDSVESASPYVFNCSIRSTWGQCGMWADGSKATGFKSMVVAQYTGVSLQKDDRAFIRYDALTNTWNQASLTDAFATVPYHTKGDAYWKDDWRNFHIRASDDSFVQCVSVFAVGFFDHFLMESGGDMSITNSNSNFGNTSLHSVGFKGFSFNQDKGGYITDIVPPEIVSTSNEVINQWYTLDVPASNSRTNHTRLYLAGDDIENPDDRPASSINGYRIGAKSGETLSVDLARYAIEPTGPIEFSQTLEPNGFKSFTVGIETLTPNSANVDNYAQDSANQIEDNKALIQAEGYQYIIAKYPELLTKPNITIGKCERDIGYFVDAVVNDLRIGGNINSIQAAEGYYIAGEVAYIAGELNETIDSLDYVKNIMIAAMRNFDYLVRDAETFSGSAIVNVPSTQGLMIGMRVVEYDPSDFTNGLLNIANTPIYTNIPQNAFIKNIISDTQIELGIPGAKLNQGSTRNATGSVSGAFLYFTLENPAWASISPAVDPTITQDAQLDGNGNPLPECQNIATTIEGYFNEIFLVLNTGYTALGGREVDAYNAIIDNKRFIAAEAVYRIANDAAYAGTKLGQGLLASTGETIQDACVDDVENVLSQIAYNVKFGGNNRIYDAAELYLTGAHVQGEEAESIAVFNLARDLAINAMRQETITVQGNHGLTQTINNQVLPEYDQNGQLVTPPCADVALTISTLTALVTTAINGGSIGNKTLPAFSAVTRVEPTSDLTGLSARATLFTLATGGFGGNPNPHDLETGTPVRLVPRPKVGTNPDKRVIRLPKGFDTNTKYYVIAPGRNLYPENFSISNSVITVTEAAGTSFSTANATRATVAGIYRSLVAQPKIDTDGTALARGTGLRYNLTVNADGSIEFGNAVNNLDGIANGGSRYEIGDIVVISDGQLGGSGAPDLEIEITAVSPAEYPGVFDGTETNKLMLATSPENAAAGIYMYSSETDSVDSEVEIVINRFVLDTKYDLHKYKSNVVGASEIETNVAHIFDVPAPNTTPQIVFVRLADDIQGSTLPQLSGSASSISTQTEYFVRYVSNKRVTLHLTAADAESGDRALTFVSGTGSNFYIYANKRPSPLRFDPTYSTASNQTGLWYLNVADESSNGTANYNRYSILSRFHGGNELANDFQTKTDPTLDTRYTRVEDKREKEERVYRMRYVVPSYLETVRDPLNGFVIKTRTDDKRRLIPQRVLLKPIAGNPNNVASFYNPVGANEQIGLNKDELIADQIRTIDPSVVDLLPEQQNLYDPYLAPKVVEFDSKIAATVQSARKVIPAGESDEFIELTLFDHTIVNQSVKNEIFTVVRTNFLQGGFLQPNATQSNENNKITWETVSGNAASSGSAYLQAWFNDVNTAQITLVLKDVQGDIYYDPAGNVTFTQSNGANVQLTDVPNSFGEISVSPRDKSLRDNYLYRVEGSNVYTICPGDTITDDTGQNTYYVHTIEDQGDFDDCFYIFDIDTLQKRIPNQQDGIYYLTCLRGNISPFPTGSGVGENFRNFKFSQPISQLYPINYKNDPLWFQVDGTTGVRDTSIVDVPQTFSAADNYVHGLVTVNDAKGSETKEMVEDIIRNTALDQYSYTNSTTDSSSGDIIDNRIQAQEGNATSGSEDRLIPISGDSQFPTERKLYIELRRPSIARSGNHTFEYLGFGPGNYSTGFPLRQEVVLTDKQDFYAQAKREDGGIVFYTGLNSNGDLYIGNKKVNAITGEETFLESAALVDSEDEDEDIGTLVTTFDSPVTFNSTITVAGKSTLNAPVEINVEANEGDALRVFSNIGAGDDPTLFNGSWRTQSDGDVVISKNQIKAAVFYLNARPKPGAQYGQSYTWRTNYLAGEPSNIVPWQETNYFYASQTVSYGGNDPEAGDIIYKGSSIGQSGSIGWILTNQFKSAETSVQTITADGTQNLTITWIATETNDSIGIKGNSTIRISNFSNPVVNGTWEIVGWDETTSPGQQTLKFRISTPIENGTIYNWADQNTGADLQFSVSNWKETGVLGAETLRTYTEQRGDFRLGINTVSRAAHSAVLTANVDDFTTPRATLDVVGTTFISGKTLVEYNAAGDVSDNRYDDNNLNSDQREGLNGAPLLTQGFIPQDNALLVGGDSNDLEQRATLRVATTDAATVDQGIGYQTGGRLGINTTLGLQARDELDRNLVVVGDGRITGNMLLEQDISVDGGDINTTSETFNLINNNANIINFAGDAQLIDMFSNTTNDQTITIGSNANFQTVRIGNNSGRSIFSVHALSANALVDIASVADDATNASQVFIGGAWANTDSKVALGSAQTLAAGNLEIGYKVAAGTGVSRIFTQTGKARLFDDDRTQVIEAFTKANDITIASLGGSTTIRNSLKVQASATVDSNIILDGGTTAGIIEIVRARFSTPLNLHNLGSLDVPNLDFYKYSTTGRFLDTEGNRFWGGSQDQSGGGRIGAFDNLQAAPDPLRVSGQYTFRFADGGTGSGAAFDVGVAFDGTVTVELVAAGSGYADNQTLTIRDNQLGGGGAPDITFDINGVTDASEVFILPITTPAASDFDIGDLILLDRGNAASPDEVTPAGGTSVINLRDQQYSEIMRVVGLDNLTNPNDPQGFRLSVTRAQEGTGDPATGDGWTNHPDGCVIAKLDKQPAASYITGKDVGSFADPNVPDGILDEPRAGIDGTSGNVRIGVAEFGGVLTTLDLLRIDQSEIVAIADVVSTDIQSLIVTDGGDPAVTNFKVESTTGNTVIAGNVGIGLGFNQFTIAGGSGNTNIAGTLTVEDTITLNGSTIPSTEFFTITNGGPSFEDDGVTVITPLRTTFQVDSATGNLLMNGGNINIFGVDGTTPRLTFNNSSGDFTTYGSFSALGDGMSSFGGPVTMAGDLTVNGGDLTVNQNGVEVFAVDDDGSLNIGGISNYFSSTGGRKWVVSNTNIINAEANVNYFVDISGTALFKLPANAQMGDMIRIIDIGGILSYDKSLVVRAPNLVRIQGSVSNTGTTVTGNTLGENFSLTHDGGELVVQTPNAAFGLVFAGTSDADGGPGANPNKAGWYLMDV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 4017 AA molecular weight: 432851,96140 Da isoelectric point: 4,43176 aromaticity: 0,08713 hydropathy: -0,25803
Domains
Domains [InterPro]
DC_0231
STR
1–324
STR
1–324
DC_0231
STR
318–583
STR
318–583
1
4017
Architecture
STR 1-583 | STR 807-4017
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Cyanophage S-RIM44 [NCBI] |
1278485 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Vellamovirus > Vellamovirus rhodeisland44 |
| Host |
Synechococcus [NCBI] |
1129 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae |
| Host |
Synechococcus sp. [NCBI] |
1131 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO12679.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349296.1
[NCBI]
CDS location
range 22255 -> 34308
strand +
strand +
CDS
ATGCCGCTAACAAGACTTGATAATCTGTATTCAAGTAAGACTGGTAAGTATCTTTACGTATCACCAGATGACTTTAATGCAACTGATGAACTAGACAATAGAGGTAACTCACCTTTACGTCCATTCAAGACAATCCAGAGGGCATTTATTGAAGTATCGAGATATTCATATCTCCCTGGTGCCAACAACGACAGATTCGACCAGTTCAGCATCATGCTGATGCCTGGTAATCACTATATTGATAACCGTCCTGGTCTTGTAACAGAGACTGCTGTTGAGGCACGTTATTTTGATGCTGGAAATCTTCTTGAGGGTAACCGTCAGGAAGTTATCGATCGTTCTGTAGCACAAGTATCTGTTCAGCATCCTGATTTCTATTATCCTGGTGATCCTCAGACTGGTGCATGGTCTCGCTTCAAAGATGCATACCGTCTGATTCAGAAGAACAGAGATCTTCTGATCGATAGAGCAACAGCACAGATTCCTGTTGATCATGAAGATTTCGTTTATCCTGGTGACCCAACTGTAGGTGAGTGGTCACGTTATAAGGATGCATATCGTCTAATCCAAAAAAATAAAGATCTTATTGCACAAGATGCGTTCGATTTGATGAACGCAAATCCACCATCTCCTCTACCTGATGGTTATGCTAGTAAGTGTATTCGTGACATCAAGATCCTGATTGATTCACTTTCTCTTGATGTTCATGAAGGTGGTGGTAACAAATATACTAGAAAGTATATCCAAACTTATTTCCTTGATGATGGCACAGATTGGGTAAATGGTAGTCTTCGTGGTGAAGAGACTCAATCTTTAGTTGCATTTGCTGAAGCAGCTAGATTAATGAAGTTGGCAATCACCAACAACTACACTTCCACATCTTCTCCTGGTAACGAGTATCAGGATCTGACAGTTGTTATCGGTGCTCCTAACTATGAGACCGATTCTGCAAACGACGTTCCTAACACCGATCCTACAGCATGTTCTGACGTTCAGACTTTCATTGATAACCTGTATGCAATCGTAAACACTACCTTTAGTGATTCTGACCTTGCTGCAAATAATGGTAACTTTGATCTAACTAATGTTCTCCCTGCTGAAACTGTATCTGATAAGATCTCTGCAGGTCATGCTAAGTGTAAGCGTGACACAGGATTTGTTCTAGATGCACTTTCACTAGACGTTCATGAAGGTGGTGGTAACCGCTACACCAGAAAACTACTCCAGAACTATTTCGACTCTACAGGTAACAACTGGGTAGTCAATGGTTTACAAGGAGAAACTGCAGAATCTCTAACTGCATTTGGTCAACTCTTCACTGAGATGAAGAGAGCACTTACAAACCAACTGTATTTTAAAGATTTAACAATCACCCCTGGTGATGCAATCTTTGGTAACACCAACAGTCCACAGGAGAATCTACCTTCTGGTAACCCTGCTGCGTGTGCTGACATTCAAACCCAGATTGATACTCTAGGTGCAATCGTTACGCAAATCATTAACGATGAGAACCTAACCAATTTGCCTGACGAAACTCTATCTGATGTTATCTCTGCTGGTCTTGCTAAGTGTAAGCGTGATGCTGGTATCATTACTGATGGCATCATCAATGACCTTCGCACAGAAGGTAATGCAAACACGATTACTAATGCAAAAGCATACTTCGATCGCTTCGGCAATCCTATTGCTAATGGTCTTCTGGGTGAAGAATCAGAATCTATCACTGCATTCAACGGCATTGCAACATTTGCTAAGCAAGCAGTTACTAACCAACTGTTCTTTAAGGATCTGACTATCTCTCCTGGTCCTGCATATGCCAATGCAAATACACCTGAGATTCCAAATCTAGCATCAGGTAATGCTGCTACTTGTGTAGATGTTCAGGCAACAATTGATACTCTCATCAAAATTCTGACTGATGTTATCGAAGTTGGTAATTTAGATGAATTAGCAGCAATCAAAGTTACGGGTGTTCTTCCTTCCTTTAACTACAATAGAGCACTAGAAGAGTGGCAGGATAACTCTATTGTTGATCTAGCAAACCCTGACAACGTTCTTTACAAATTCAATGCTGCTGATGGTGGTTGTATTGTTCCTAGAGGTTGTTCACTGATTGGTTACGACCTGAGAAGAACAGTTGTTCGTCCTCTGTATGTTCCTGATCCTGCTGATACTTCGCAACCAAGAACTTCTATCTTTAACCTGACTGGTGGTTGTTACATCTGGCAGTTCACTATTAAAGATGGTGACCTATCTGCACAATCTCCTCTATATGATGCCTCTGCTGGTGTTGGTAAAGTTTACTATAAGAAAGGTTCAACTGATCTTGCAATTCCTGAGTATTCTCACCACAAGATCTGCATCATGGAGTATGCAGATTCTAAAGATCTTGACAACTACTATGAAAAAGTAGGAAAATCATTCCAACAGTTCCAACCAACTATCGATGATGGTGGACTGGAAGCACTGGTTCAGGAAAACAGAATCGTTGGTCCTCTGTCTGACAGCAGAACTATCGAAAGTATCAGAATTGATGACTCTGCAACCTTCACTGGTAATGCATCTAACAGCACAATTCTGAATAATGTTACTAATGCTGAGAGTCTTGAAGTTGGATATGAGATTACATCACCTGATGTCAGTGTTGTTATCTCTCCAAACACTAGAATTGAGAGCATCTCTGGCACTTCAGTTACGCTGAACCAATCGATTTCAGGATCTGGTAATGTATCATTCCTTGCATCCTTTGGTTATGCTAACATCACAATTCAGACAAAAATTGATCATGGATACTTTGAAGGTCAGTATGTTGCTATCATCAACTCTGGACTATCTGATGAAATTAATGGAACCTGGAAGGTTACCAAGATTGATGGCGTAAATCCCAAAATCTTTGAGTATGAAGTATACAATAATACTGCAGCATCCCTTGGATTGGTATCTGGACAGACCTATCTGTCAGGTGAAGTCGGTGGAGTTAGCACAAACGCGGTAGTTCTTGCGGAAATTGACTCTGTTGAGTCCGCATCTCCGTATGTTTTCAACTGCTCGATTCGTTCTACCTGGGGTCAGTGCGGCATGTGGGCGGATGGATCCAAGGCCACTGGATTCAAGTCAATGGTCGTGGCTCAATATACTGGAGTTTCACTTCAGAAAGATGATAGAGCATTCATCCGTTATGATGCACTAACTAATACTTGGAACCAAGCATCACTTACTGACGCATTTGCTACTGTTCCTTATCATACCAAAGGTGATGCATACTGGAAAGATGACTGGAGAAACTTCCACATCCGTGCTTCGGATGACTCTTTCGTTCAGTGCGTCTCGGTCTTCGCTGTTGGTTTCTTCGATCACTTCCTGATGGAAAGTGGTGGAGATATGTCCATCACGAACTCCAACTCTAACTTCGGTAATACATCACTTCACTCTGTTGGTTTCAAAGGATTCTCCTTTAACCAAGATAAGGGTGGTTACATCACTGACATTGTTCCTCCCGAGATTGTATCTACAAGCAACGAAGTTATTAACCAATGGTATACTCTAGATGTTCCTGCATCTAACTCAAGAACTAACCACACCAGACTGTATCTTGCTGGTGATGATATTGAAAATCCAGATGATCGTCCAGCATCTTCTATCAATGGATACAGAATTGGTGCTAAGTCTGGTGAAACTCTATCTGTTGACCTTGCACGTTATGCAATTGAACCAACTGGTCCTATTGAGTTCTCTCAGACTTTGGAACCAAATGGATTCAAATCCTTTACAGTTGGTATCGAGACACTGACACCTAACAGTGCAAACGTTGACAACTATGCACAGGATTCTGCTAATCAGATTGAAGATAACAAGGCACTAATTCAAGCAGAAGGTTATCAGTATATCATTGCTAAGTATCCTGAGCTACTCACCAAACCAAACATCACGATTGGTAAGTGCGAAAGAGACATCGGATATTTTGTTGATGCTGTTGTCAATGACTTGAGAATTGGTGGTAACATCAACTCTATTCAAGCAGCAGAAGGTTATTACATCGCTGGCGAAGTTGCATACATTGCTGGTGAACTAAACGAAACGATTGATTCTCTTGATTATGTCAAGAACATCATGATCGCAGCAATGCGTAACTTTGATTATCTGGTTAGAGATGCTGAGACATTTAGCGGTTCTGCAATTGTCAATGTTCCCTCTACTCAGGGTCTGATGATTGGTATGAGAGTTGTTGAGTATGATCCTAGCGATTTTACCAACGGTCTTCTCAACATTGCCAACACACCAATCTACACCAACATTCCTCAGAATGCATTCATTAAGAACATCATTAGTGATACTCAGATTGAACTTGGTATCCCTGGTGCTAAACTAAATCAAGGTTCTACTAGAAACGCTACTGGTAGTGTTAGTGGTGCATTCCTCTACTTTACTCTAGAGAATCCTGCATGGGCAAGTATCTCACCTGCTGTTGATCCTACGATCACTCAGGATGCTCAACTTGATGGTAATGGTAATCCTTTACCTGAGTGTCAGAACATTGCAACCACAATCGAAGGTTACTTCAATGAAATCTTCCTGGTTCTGAACACTGGTTACACTGCACTTGGTGGTAGAGAAGTTGATGCATACAATGCTATCATCGATAACAAGCGTTTCATTGCTGCAGAAGCAGTTTACAGAATTGCTAACGATGCTGCATATGCTGGCACTAAACTGGGTCAAGGTCTACTAGCATCGACTGGTGAGACCATTCAGGATGCTTGTGTAGACGACGTTGAGAACGTTCTTAGTCAGATTGCTTACAACGTCAAGTTTGGCGGCAACAACAGAATCTACGACGCAGCAGAACTGTATCTGACTGGTGCTCATGTTCAAGGTGAAGAAGCAGAATCTATTGCTGTATTCAACTTGGCAAGAGACTTGGCAATCAATGCAATGCGCCAGGAAACAATTACAGTTCAAGGTAATCATGGTTTAACTCAGACAATTAATAATCAAGTTCT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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
007e344ec21005fdda6c3fab586157f4622af5ef557d16f0ba1bbacd35c2e2f5
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50