Protein

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Genbank accession
WGH49876.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,70
Protein sequence
MAYYLEIAGSDTHVAVDTAIVVPPVGTDGVLLSLDIQFNDLGTHQAILSSGTSNFIDIKNNGSSMELRSTSAVVVFTLSPPLVANQRYLLTVERTDRSLVVKNNGDVISNTGTQAVGRTFSVTRISGLSAGFRPGNFRLYALTFPLNNNDYNSSTSNGTGLTLIDTEGGNDGTLVNFPTDNSQWLWEEDTPLNTGESRVGSGWAPSIRDYSLLNDWKNAKKTEPTYQTALCRGYLGNPFFDIVAADFPAGALISGVVKYTGNNHDQLAHYARKFVINSTSQVIAEHLKITHSTGLQPTVGVQNTGGSIIRNSYVLNTGQAGANSGSAVLSGNGTLQNCVVHGTQPVNNLVLRPSNQAQVLNCIAIGGYTGLSMPWPDVVVDSTFIVNASNACIIGNVPTTNTATEDTTGEFTGYTTSAFVDFANGDYRIRVGSPLHKLGIGAFFQEDLLPELDYQEYYELSKPITAGLSLTTATEVIILPSEDVSIEFTFTLNQVPAFSEYYYLFGADSWDQNHNLRKINNTDYSIRLRGILDATFSTPVILLGQNEVNKIIVSRSAGELEVWINNHKVSAANISAQADTNFQLKHFFRYNTNTYTNAVTLGYFKIRRDDILTNYWVNAQSPTASEWVDVIGNNDASFSGSWPINYSHWKYISTSSNLVGESRVGTGWAPSIRDFNSLENWRDGITNTQKNYALCRGSILTRHISFGNSNTFPLGLEIIGDVKYKGNNLAELAHTNNFGMDIGGSPIRVHHLYLYTDNRYYVPAWIRYTTPSASDILSFNHCYIKHTNVDKLGQVTSGNGSSENDGWFNCIIDCDGRAYGYSVGYSQKVSLINNTYINYTTTGFNSPSFGNPSGRFYENNFCPENTGTDYNVQGFGSFINNASADTTGNITGYGKEQFVDFANGDYRIKASSPLHALGIGSFFEEAGTPTSSYYYSDVSNIQLNSVTSIDYIIDPANDPTAPNYVLFLNGADEYVQLNSPINITTPEFEIEFIGNGRAYDESVVYIFGNLGDANNRLWIGGVNYNELSLSNAAGQTINFTNMNFFVADENRLVISRDINNIVSVSINGVPHNQTFVLSGDITPSILGNSGGALPSGIARADEIEIDKLKVTVGGVVINHYEPTVTEGVGIILKDTESGNDGTIINFKSNLHHWKYYDGIVIDEQTEVRIGNGWASKVYVSSTTLGGFLDTYKSLTFTDEITCYAVGDCSYNEFFDKTGETLNFTNADFEQGLYVKGMIPFNGKNYDRLARLNNQITSNSQLFIDDFYIYSEQVGTSTLVADDNTYLYRCYVEHTGGASELGIVQMKNYSDLTNCVVRSLTPSPLGVSALETSFIGNTVVLGCDVNIKLSAPSGSYEYLFATQSTLSDFDDSGIYVFEYASGDNTGQYTGYTTAEFVDFANKDYRIKYSSDLHPLGIGAFFQEFVEGGISYFYGDSSVLTLNSEQSLYSKIANSYVSTFSIVGNGNGSHITVPNNQVSTISIDFNNELYASIHQGGTSEVGVDFIPNTSAVSQIIESSNVQVDDVQSLMVEISNSNLSNIDILFYANVSTHHNINNISELVIDDISNTNAVMTNNSLSNMHISNIDNTYIATNIFDYGDININSIDRHSVFSNISKISEFNFETVSKFNFRMNFFQDITMDIQTIDAHSGYANFNDVSQINIVSIDNVKINVGFSGVSVFDVSVLPNTYMSATVDNKSTFDISDVESFIAKFEIQDKSVFDIADISNAYISMTVDKSSSFDVSNIEAILAKFEVHDKSNFDVSDIASVLSEFQIQDRSTFDITDLSSNLIEHNIVDASTLFVDDVSAITLHASNHDKSTFNIWIDGDVFNSVSISDVFSISNFNLIMGEEYHIENNTNVVSSFNVHGLVNFHTEVNHADMSGISIITGDSYNINVTNNNVVDINVENITNTHMEMNQHEESLIEVDYLTASNVEFNEKTTSSINIDDVQSQYVVIRTSPVSELTVDLVPIYSVEFNAYTNSGFNLSYTGNPFIAAIIMDRSIIDLTIIDEIEYIIASPEFKYFDKSTLRIDGVDASTIFFNTSTVANNLVDFVPEFNTVTTIANGSMIDLVMSGNPILAIEYVSTSELTIDMVQSSEFVSLISNGSALDITTIQGQNFLVAVKDGSYNDLTIVESTNVAVAENTTSALNVSFSNQIQYASLYNDVSKFDVAFISEFFIVIDFDVYEYSERSISYIDVVPNYFVSHAEHSDSVFDIGTERGYNIEITDDTVGDIVVSIKTELDVRLFNNITIYIKPTDIGTPVVDTGKSWLDDSVFRTDMKTRTIITGKSMLDDLVISTAINRTTTIPLELSTRA
Physico‐chemical
properties
protein length:2313 AA
molecular weight: 254241,03800 Da
isoelectric point:4,40271
aromaticity:0,10852
hydropathy:-0,11556

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
WGH49876.1
1 2313
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 225 225 0,1198
Central domain 226 427 203 0,8298
C-terminal 428 2313 1885 0,2246
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-225
Central
226-427
C-terminal
428-2313

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Alishewanella phage vB_AspM_Slickus01
[NCBI] 		3038239 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Alishewanella sp. SMS8
[NCBI] 		2994676 Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Alteromonadales > Alteromonadaceae > Alishewanella >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WGH49876.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ508957 [NCBI]
CDS location
range 102379 -> 109320
strand -
CDS
ATGGCCTATTATTTAGAGATAGCTGGAAGTGACACTCACGTAGCTGTTGATACAGCAATAGTTGTACCACCTGTCGGGACTGATGGGGTATTACTTAGTCTTGATATACAATTTAATGACTTAGGCACTCACCAAGCTATTTTATCTAGCGGTACATCTAACTTTATTGATATAAAAAATAACGGCTCATCAATGGAGTTGAGATCCACGAGCGCTGTAGTAGTATTTACGCTGTCCCCTCCGCTTGTAGCTAACCAGCGTTACTTACTAACGGTAGAACGAACCGATAGATCGTTAGTAGTTAAAAATAATGGCGATGTTATTTCCAATACAGGCACTCAGGCCGTAGGAAGAACCTTTTCAGTAACTCGAATAAGCGGTTTATCTGCGGGCTTTAGGCCTGGGAATTTCAGGTTATATGCTTTAACTTTTCCATTGAATAATAATGATTACAACTCCTCAACATCAAACGGCACAGGCTTAACGTTAATTGATACAGAGGGCGGCAACGATGGTACGCTAGTTAACTTCCCAACCGACAACTCCCAATGGCTCTGGGAAGAAGATACCCCACTTAACACTGGCGAGTCTCGCGTAGGTTCTGGCTGGGCACCGAGCATTCGTGATTACAGTCTATTAAATGATTGGAAAAATGCAAAGAAAACAGAACCAACCTATCAGACGGCTTTGTGTAGAGGATACTTAGGTAACCCGTTCTTTGATATTGTGGCAGCAGACTTTCCAGCGGGAGCATTAATTAGTGGTGTCGTAAAGTACACTGGTAACAATCACGACCAGCTTGCGCATTATGCTCGTAAATTCGTAATTAATAGTACAAGTCAAGTCATAGCAGAGCATTTAAAAATAACACATAGTACTGGACTACAGCCTACTGTTGGAGTACAGAACACTGGCGGATCGATAATAAGAAACTCGTATGTCTTAAATACTGGACAGGCGGGTGCTAACTCTGGTAGTGCAGTTTTGAGTGGAAACGGTACGTTACAAAACTGCGTAGTACATGGTACACAGCCTGTAAATAACCTCGTGTTAAGACCAAGCAATCAAGCACAAGTGCTTAACTGTATTGCTATTGGTGGATACACTGGATTATCCATGCCTTGGCCAGATGTGGTGGTAGATAGTACCTTTATAGTAAATGCAAGCAACGCTTGTATTATAGGAAACGTTCCGACAACCAATACCGCAACGGAAGACACTACTGGTGAATTCACTGGGTACACTACATCTGCGTTTGTTGATTTTGCTAATGGTGATTATCGCATTCGAGTAGGTTCGCCACTGCACAAATTAGGCATTGGTGCATTCTTTCAAGAAGATCTACTTCCAGAGTTAGACTATCAAGAATACTATGAGCTATCTAAGCCTATAACTGCTGGACTATCTCTCACAACAGCAACAGAAGTAATAATATTACCTAGTGAAGATGTATCTATAGAATTTACTTTCACTCTAAACCAAGTCCCCGCTTTCAGTGAGTATTATTATTTATTTGGTGCGGATAGCTGGGATCAAAATCACAATTTAAGAAAAATAAACAATACTGACTATTCCATACGATTAAGAGGAATATTAGACGCAACATTTAGTACTCCAGTTATACTATTAGGACAAAATGAAGTAAACAAGATAATAGTTTCCAGATCCGCAGGGGAATTAGAAGTATGGATTAATAACCATAAAGTATCAGCAGCAAACATCAGCGCCCAAGCAGATACAAATTTTCAATTAAAACACTTTTTTAGATACAATACTAACACATACACAAATGCTGTAACGTTGGGTTACTTTAAGATCCGTAGAGATGACATACTGACCAATTATTGGGTAAATGCCCAATCGCCAACCGCATCAGAGTGGGTGGACGTTATTGGTAATAATGATGCATCATTTTCGGGTTCATGGCCTATTAATTACAGTCACTGGAAGTACATTTCAACTAGTTCTAATTTAGTGGGCGAGTCTCGTGTTGGTACTGGATGGGCACCGAGTATTCGGGACTTTAATAGCTTGGAAAACTGGCGTGATGGAATAACCAACACTCAGAAAAATTATGCACTATGTCGTGGGTCTATCTTAACGAGGCATATAAGCTTTGGTAACTCTAACACGTTTCCTCTTGGGTTAGAAATAATCGGGGATGTTAAGTATAAAGGTAATAATTTAGCAGAACTAGCACATACTAATAATTTTGGTATGGATATTGGAGGTAGCCCTATCAGAGTGCACCACCTCTATTTATACACTGATAATAGATATTATGTTCCAGCTTGGATAAGATATACCACACCAAGTGCTTCTGATATCTTATCCTTTAACCACTGCTATATCAAACATACAAATGTTGATAAGTTAGGACAAGTTACCTCTGGAAATGGTAGTTCAGAAAATGATGGCTGGTTTAACTGCATTATTGATTGTGATGGAAGAGCTTATGGGTACTCTGTAGGGTACTCTCAAAAAGTTAGTCTAATCAACAACACTTACATCAACTACACCACAACAGGGTTCAATTCACCCTCTTTCGGTAACCCTTCTGGTAGATTTTATGAGAATAATTTTTGTCCTGAAAATACTGGAACCGACTATAACGTACAAGGCTTCGGAAGCTTCATTAATAATGCGAGTGCTGATACTACAGGTAATATCACTGGTTATGGTAAAGAGCAGTTCGTCGATTTTGCTAATGGCGATTACCGCATTAAGGCAAGTTCACCACTACATGCTTTAGGTATTGGTTCATTCTTTGAAGAAGCAGGGACACCAACAAGTTCATACTATTATTCTGATGTTTCTAATATACAACTTAACTCAGTTACATCAATTGATTATATTATAGATCCTGCTAACGATCCAACAGCGCCTAATTATGTATTATTTTTAAATGGTGCTGATGAGTATGTACAACTAAACTCACCAATCAATATAACAACGCCAGAATTTGAAATTGAGTTTATAGGTAATGGTCGCGCCTATGATGAGTCTGTTGTTTATATTTTTGGTAATCTTGGTGATGCTAATAATAGATTATGGATCGGTGGTGTAAACTATAATGAACTATCACTATCAAACGCAGCTGGACAGACGATAAATTTCACCAATATGAATTTCTTTGTAGCTGATGAAAATCGGTTGGTGATAAGCAGAGATATTAATAACATTGTTAGCGTTTCTATTAATGGTGTACCACACAATCAAACATTCGTTCTAAGTGGTGACATCACTCCATCTATTTTAGGTAATTCTGGTGGCGCTTTGCCATCTGGTATAGCAAGGGCAGATGAGATAGAGATTGATAAGTTAAAGGTTACCGTTGGTGGTGTGGTTATTAATCATTATGAACCTACTGTGACTGAGGGTGTCGGTATCATTCTAAAAGACACCGAAAGTGGCAATGATGGCACCATAATTAACTTCAAATCTAATTTACACCATTGGAAGTATTATGATGGTATTGTTATAGATGAGCAAACTGAGGTTAGGATTGGTAATGGTTGGGCATCTAAGGTTTACGTATCATCCACAACTCTAGGTGGATTTTTGGATACCTATAAATCATTAACCTTTACCGATGAGATAACATGCTACGCAGTTGGTGATTGTTCTTATAATGAATTTTTCGATAAGACTGGAGAAACATTAAACTTTACTAATGCTGATTTTGAGCAAGGACTCTATGTTAAAGGGATGATACCGTTTAATGGTAAAAACTATGACAGGTTAGCGAGACTAAACAATCAGATTACATCAAATTCTCAATTATTCATTGATGATTTTTATATCTACTCTGAACAAGTAGGCACTTCGACGTTAGTAGCAGACGATAATACCTATTTATATAGATGCTACGTGGAGCATACAGGTGGAGCAAGTGAACTAGGTATAGTTCAGATGAAAAATTACTCAGATCTTACAAACTGTGTAGTCAGATCTTTGACTCCTTCACCGCTAGGGGTAAGTGCACTAGAAACCTCATTCATAGGTAATACTGTAGTTTTAGGTTGCGATGTAAACATCAAATTATCAGCACCTTCTGGCAGTTATGAGTATTTATTTGCAACTCAATCAACTTTATCAGATTTTGACGATAGTGGTATATATGTATTCGAATATGCTTCTGGTGATAATACTGGTCAATATACTGGCTACACTACTGCTGAGTTTGTAGATTTTGCTAACAAAGATTATAGGATAAAATACTCATCAGACTTACATCCATTAGGCATTGGTGCATTCTTTCAAGAATTTGTTGAAGGTGGAATATCTTATTTCTACGGTGACTCTTCGGTACTGACTCTGAACTCTGAACAGTCTCTCTACTCAAAGATAGCAAACTCTTATGTTAGTACTTTTTCGATAGTCGGTAATGGTAATGGTAGTCACATAACAGTACCAAATAACCAAGTGTCAACAATCTCTATCGATTTTAATAATGAACTTTACGCAAGCATTCATCAAGGTGGTACATCAGAGGTTGGTGTTGATTTTATACCAAACACGTCAGCAGTCTCCCAGATCATAGAATCATCAAATGTTCAGGTAGATGATGTTCAATCTTTGATGGTTGAAATATCAAACAGCAATTTATCTAACATTGACATTTTATTTTATGCGAATGTATCAACACATCACAACATAAACAACATATCAGAGTTAGTAATAGATGATATATCCAATACTAATGCAGTAATGACTAATAATAGTCTATCCAATATGCATATATCTAACATAGATAATACGTATATAGCAACTAATATATTTGATTATGGTGATATAAACATTAATAGTATCGATCGTCATTCAGTCTTTAGTAATATTTCTAAGATAAGTGAGTTCAATTTTGAGACAGTGAGTAAGTTTAATTTCAGAATGAACTTCTTCCAAGACATCACCATGGACATTCAGACCATTGATGCTCACTCTGGCTATGCAAACTTTAATGATGTCTCACAGATAAATATTGTTAGTATAGACAATGTAAAAATCAATGTTGGATTTTCTGGTGTGTCTGTGTTTGATGTGAGTGTATTACCGAATACTTATATGAGTGCCACGGTAGACAACAAATCAACATTTGACATTAGTGATGTTGAGTCATTCATAGCAAAATTCGAAATACAAGATAAATCGGTATTTGACATAGCAGATATTTCCAATGCATACATCAGTATGACCGTGGATAAGAGTTCTTCGTTCGATGTGTCTAACATTGAAGCTATACTTGCTAAATTTGAAGTTCATGATAAGTCAAACTTTGATGTATCAGATATTGCGTCTGTCTTGTCCGAGTTCCAAATACAAGACAGATCAACATTCGACATTACTGATCTATCTTCTAATCTGATAGAACACAATATCGTTGATGCGTCTACCTTGTTTGTTGATGATGTTAGCGCTATAACACTACATGCGTCAAACCATGATAAGTCTACATTCAACATCTGGATTGATGGAGATGTGTTTAACTCAGTATCTATTTCTGACGTATTTAGTATCTCTAATTTCAACCTGATAATGGGTGAAGAGTACCACATTGAGAATAACACTAATGTTGTTAGCTCATTCAATGTGCATGGTCTTGTAAACTTCCATACCGAAGTCAACCATGCTGATATGTCTGGTATCTCTATCATTACTGGTGACAGTTACAATATTAATGTGACAAATAATAACGTGGTCGATATCAATGTAGAAAACATCACAAACACTCATATGGAGATGAACCAGCATGAAGAATCATTGATTGAGGTTGATTATCTGACTGCGAGTAATGTAGAGTTTAATGAGAAGACAACCTCATCGATTAACATTGATGATGTGCAGAGTCAGTACGTGGTAATCAGAACCTCACCAGTATCGGAACTTACTGTAGACCTTGTACCAATATATTCTGTTGAATTCAATGCGTATACTAATAGTGGTTTTAATCTTAGCTATACTGGTAACCCATTCATAGCCGCGATTATCATGGATAGAAGCATTATAGATCTGACCATCATAGATGAGATTGAGTATATAATTGCCAGCCCAGAGTTTAAATATTTCGATAAGTCAACTTTGCGTATTGATGGCGTGGACGCATCAACCATATTCTTTAACACCTCAACCGTAGCAAATAATTTGGTAGATTTTGTTCCAGAGTTTAATACAGTCACCACAATCGCAAATGGATCGATGATTGATCTGGTTATGTCTGGTAATCCTATATTAGCCATTGAGTACGTTAGTACATCAGAGCTGACCATTGATATGGTTCAGAGTAGTGAGTTTGTTAGTCTTATTAGTAACGGTAGTGCTTTAGACATAACCACGATACAAGGACAAAATTTCCTTGTGGCTGTAAAAGATGGATCATACAATGATCTTACAATCGTTGAAAGTACAAATGTCGCTGTTGCTGAAAACACAACTAGCGCACTGAATGTATCGTTCTCTAATCAGATCCAATACGCATCACTGTATAATGACGTGAGTAAATTCGATGTTGCTTTCATAAGCGAGTTTTTCATTGTAATCGACTTTGATGTGTATGAGTACTCTGAGCGTTCTATTTCGTATATTGATGTTGTTCCAAACTACTTCGTTTCACATGCAGAACACAGTGATTCTGTTTTTGATATTGGCACAGAGCGCGGATATAACATTGAGATCACGGATGACACAGTTGGTGATATTGTTGTTTCAATAAAAACAGAGTTAGATGTCAGACTGTTCAACAATATTACTATCTATATTAAGCCTACTGATATCGGTACACCTGTTGTTGATACTGGTAAATCTTGGTTGGATGACAGTGTATTCAGAACTGACATGAAAACGAGAACCATCATAACTGGTAAATCGATGTTGGATGATTTAGTAATATCCACTGCTATAAATAGAACTACAACGATTCCTTTAGAATTAAGTACGAGGGCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
66f5e9d6f3347c7ff5fb0fe3ce5b503d24f1c7b8e37af0c94eaa2c6a72dbdb23
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2723
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecogenomics reveals distinctive viral-bacterial communities in the surface microlayer of a natural surface slick Rahlff,J., Wietz,M., Giebel,H.-A., Bayfield,O., Nilsson,E., Bergstrom,K., Kieft,K., Anantharaman,K., Ribas-Ribas,M., Schweitzer,H.D., Wurl,O., Hoetzinger,M., Antson,A. and Holmfeldt,K. 2023 — GenBank