Protein

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Genbank accession
ASV43935.1 [GenBank]
Protein name
central tail fiber J
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MTVVKTSTGVFVSGAGGGGGGSNDANTLFSTDAFEMVIGLSEGPIHGLEGETVKEQLANLFVNDVPVMSQAGTMNFQDSDFVIRYESGLPLTDQEDPERGQSPIRYMLGGQATPNNVSAELLPSVEIIRTIPNAITGQYDRVEVRLLINQLYKATKKGTKVDTLPMRLRWRYAGETSWKSIFQGYISGKTTVGGYVKAYSFAVDDKTRQVEISVTNTHSPNVDDEEHVHSVSWLNYETEKVITDENPEYHPNTAMLHVVGLIGNEITQLPIISGVWKGMVCSVPSNYDPITREYSENSPWDGEFATQKVWTDNPFWIAYELITNPNFGLYRYNPRIRVNRYSFYALAKDADELVEGSTGEFTPRYTFNALLADKQDGLDLINYILGSAQSRLIDGQNGELVLVSDRNTPAVATITPEQCLADENEVVFNYTHTDIKDRINEVVTSYIDENLSWERQTIGPFSDIESQNKYGVNTEEYDSIGCIYPDEVKRKAYLRLIGYQTETMSVTFRVPANSAVLQLFDIINIVDPDQNWGISGRVRSYDTHSLTLRDPLYFEEINNYRVVIPLKTGGEFEAYINIPSVGFHSELNLASYTLPEGGSTPSSFPEGLATHTPFSIQRSGSEPGLAKPFRILSVRASDENNSTFTITAIEVNRNKWAAADNLELVGSPQYSFKMPPIPEKPKNVTLLKQEFETVDEKTKINLWLGWDEPIETFLGHYYEVSLKRNAVDLGVVVKSSTNIVEIPELDFGDYEITVAMVFNGQKEYSDVFRWEVKYLSFLEGEYAPERLETSLEASYNGTDLYLTFGAWYSYNQGSTLSLSDIITNKEIKHAQIDIRTNVEGEPRRLLKTIETTQRDAVFTGKEHLEANPDGYVAELRLELTLIDLQGNPSPVFVKELMADNIPDVTGIVVDATYKAVSAAPLFDEMDTNQVDVEWYILEVPESGLGDVDFSSAILVETAPKLLDYIHVDNQKQYCIWAKSISEFWQSSLYPAANAPVADLVVFEVPIFPLEELAGEITDIGLAQLSEDAQTLIEDINNQVDRLRPDTEDNIPDVLARTVNELNLERQARTDIEQGVFDLSAEYTNWRQNYEQRQLGNERLIDAAVYIDPESGTIVNRAFAYTDEAFSEANVLIDGVNASIELQANRITGTNERLTQAESTLTVQAGQINQRATFTEMRTEIAGAIEALTPAYSWHFNHNTEGFSGDVAHNPQGFLVITGVANAAAITYEAEENPMLRLRVRKHADLPWLGNLYFGADEFLVNVLEPESENWETTQIDLTGIEGYTGTITALKIDLGHVDIDFIEIGKRGANDLALNDITTRATILENDIDAATGIMAQYATTTWVNELGYQTQSNVNAVIDSFNTTYQISATLQEFNDNGTLEKANNAQQFINGAEAYITSQITAFNAAENGVDAKFANVDQTLDAINGTISQSIVQVQGLELDLQDANLNDVIAEANQLLLGHDLAQQDVKVALAQSKLTAHTTEIESLASFTLDLQAWFNDSQAAFSELVTTVANDQQALVTVEQNLQAKITNDTNAALASAQEYTRTAVGYCVDAEGNITSEKDAIQCVTDGGSWVDGPLAEYISNLQISDGESTASIKELKQVFKKVNGELVARGGWVLDNNGRAVSVAGYNDGETGNLDLVADVIRQGVMVGNTFVPTSYIDNTDPANPVHTFKGRMVLGDGTAIENAADIQAQGGGRGGVYYVGTSTGAWSDSTANSAVPDNTPIKGDVVNIYKTSNPNVNTTKKYTGSAWESYALEVNGAIFATGSIDGNAFRAGTRIESPRIDLIGGAFMKVEYAAGFGPNNLWYWYGPKILNNGMPDLNLLTKSNATEWKDTTGNSYFGGSIVAGTYSTALTTTDLSADAFVEIGPFGSNGGVINIVCSIQLSSSAAGSSVNPAGRPSDPEYTIQLSELINDSWVVRQTQTYNGEGVIIRNDYDRETDKYYWLLTQSASGSFTYTDNKQTTADRTYKLAITSRSGVNIYGSWQNPSQRLSIISQED
Physico‐chemical
properties
protein length:2004 AA
molecular weight: 220757,10750 Da
isoelectric point:4,41727
aromaticity:0,09232
hydropathy:-0,29925

Domains

Domains [InterPro]
DC_0463
STR
2–1244
DC_0463
IPR053171
Unmapped
27–763
IPR053171 Coil DC_1333
IPR055385
ATT
113–236
IPR055385 IPR032876
ASV43935.1
1 2004
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 2-112 | ATT 113-236 | STR 237-378 | ATT 379-532 | STR 533-2002 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pseudoalteromonas phage KB12-38
[NCBI] 		2024350 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ASV43935.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MF098558.1 [NCBI]
CDS location
range 5699 -> 11713
strand -
CDS
ATGACAGTAGTGAAAACAAGCACCGGTGTGTTTGTCTCAGGAGCAGGTGGTGGCGGTGGTGGCAGCAATGATGCTAACACATTGTTTTCTACAGACGCCTTTGAAATGGTTATAGGTTTATCTGAAGGGCCTATACATGGCCTCGAAGGTGAAACTGTAAAAGAGCAGTTAGCCAATCTGTTTGTAAATGATGTTCCCGTTATGAGCCAAGCGGGAACAATGAACTTTCAAGACTCCGACTTTGTTATTCGCTATGAATCGGGCTTACCCCTTACAGATCAAGAAGACCCTGAAAGAGGACAGTCACCTATACGCTATATGTTAGGTGGCCAAGCTACGCCAAATAATGTGTCTGCGGAACTTCTACCCAGTGTAGAAATTATCCGCACTATTCCTAATGCAATCACTGGCCAGTATGACCGTGTAGAAGTTCGCTTATTAATCAACCAACTTTATAAAGCCACAAAAAAGGGAACTAAGGTAGACACCCTTCCTATGCGTTTACGTTGGCGTTATGCGGGCGAAACCTCGTGGAAATCTATTTTTCAGGGGTATATAAGCGGTAAAACTACGGTAGGGGGGTATGTAAAAGCATACTCATTCGCCGTAGATGATAAAACCCGTCAAGTTGAAATTTCCGTCACCAACACCCATTCACCTAATGTTGATGATGAAGAACACGTACATAGTGTGTCATGGTTGAACTACGAGACTGAAAAAGTCATTACGGATGAAAACCCTGAGTATCACCCTAATACGGCTATGCTGCACGTTGTGGGCCTAATCGGCAATGAAATCACTCAACTCCCCATTATATCCGGCGTATGGAAAGGTATGGTTTGTTCCGTGCCAAGTAACTATGACCCAATAACCCGAGAATATAGTGAAAACTCGCCTTGGGATGGTGAATTTGCTACGCAAAAGGTGTGGACAGATAACCCTTTTTGGATTGCTTACGAGCTTATAACTAACCCAAACTTTGGTTTATACCGTTATAACCCCCGTATCCGAGTTAACCGTTATTCATTCTATGCCTTAGCTAAAGATGCAGATGAATTAGTCGAAGGGAGTACAGGGGAGTTCACTCCGAGGTACACCTTTAACGCACTGCTAGCGGATAAACAGGATGGTCTTGACTTAATAAACTATATTCTTGGATCAGCTCAGTCGCGTCTAATTGATGGCCAGAACGGTGAGTTAGTACTAGTTTCGGATAGAAACACACCCGCTGTAGCGACAATTACCCCAGAGCAATGTCTAGCTGATGAAAACGAGGTGGTTTTCAACTACACCCATACGGATATAAAAGACCGTATCAATGAAGTGGTAACCTCTTATATAGACGAAAACCTAAGCTGGGAACGTCAAACAATTGGGCCTTTTTCGGATATTGAGTCACAGAACAAGTACGGTGTTAATACTGAAGAATACGACAGCATTGGTTGTATTTATCCTGATGAAGTAAAGCGTAAAGCCTACCTTCGTTTAATTGGGTACCAAACTGAAACAATGTCAGTTACGTTTAGAGTACCGGCTAATAGCGCTGTACTCCAACTATTCGATATTATTAACATTGTAGACCCTGATCAAAACTGGGGTATATCTGGTCGAGTACGTAGCTATGACACGCACTCACTAACACTCAGAGACCCATTATACTTTGAAGAAATAAATAACTACCGCGTTGTTATCCCGCTTAAAACGGGTGGTGAGTTTGAAGCTTATATAAATATTCCAAGTGTTGGCTTTCATAGTGAACTAAACCTTGCTTCATATACATTACCTGAGGGTGGGAGTACTCCCTCAAGCTTTCCTGAAGGACTAGCCACACACACACCATTTTCTATTCAGCGCTCGGGTAGTGAGCCAGGGCTGGCCAAACCTTTTCGTATACTATCGGTCAGAGCCAGTGACGAAAATAATTCAACATTCACTATTACCGCTATTGAAGTTAACCGTAATAAGTGGGCCGCAGCAGATAACTTAGAACTCGTAGGTTCACCACAGTACAGCTTTAAAATGCCGCCTATACCGGAGAAACCTAAGAACGTTACGTTATTAAAGCAAGAGTTTGAAACTGTTGACGAGAAAACAAAAATAAATCTTTGGCTAGGCTGGGATGAACCTATAGAAACGTTCCTTGGGCACTACTATGAAGTATCCCTAAAGCGTAATGCTGTAGACCTTGGCGTTGTGGTCAAAAGCTCAACTAATATTGTTGAAATCCCTGAGTTAGATTTCGGAGATTATGAAATTACTGTGGCCATGGTATTTAACGGCCAAAAGGAATACTCAGACGTATTTCGTTGGGAGGTCAAATACCTTTCATTTCTTGAGGGTGAGTACGCCCCTGAGCGTTTAGAAACCAGCTTAGAAGCGAGTTACAACGGTACGGATTTATATTTAACGTTTGGCGCTTGGTATTCATACAACCAAGGCTCAACGCTGTCCTTGTCCGACATAATCACCAACAAAGAAATTAAACATGCCCAGATAGACATACGTACTAATGTTGAAGGTGAACCCCGTCGGTTACTTAAAACGATTGAGACAACCCAGCGTGATGCAGTATTTACCGGTAAGGAACACTTAGAGGCCAACCCAGATGGGTATGTGGCCGAGCTTAGACTTGAGCTTACGTTAATTGATTTACAAGGCAATCCCTCACCTGTATTCGTCAAAGAGTTAATGGCCGACAACATACCCGATGTTACGGGGATTGTCGTTGACGCAACTTACAAGGCAGTCTCAGCAGCACCATTATTTGATGAAATGGACACAAATCAAGTCGATGTGGAATGGTATATTTTAGAAGTCCCTGAGTCTGGGTTAGGTGATGTAGATTTTAGTAGCGCCATTTTAGTTGAGACCGCCCCCAAGTTGCTTGACTACATACATGTAGATAACCAGAAGCAATACTGTATCTGGGCTAAGTCTATTAGTGAGTTTTGGCAATCAAGCCTTTACCCAGCAGCGAATGCCCCCGTTGCAGACCTTGTTGTTTTTGAAGTCCCTATTTTCCCGCTAGAAGAACTGGCGGGTGAAATTACAGATATTGGCTTAGCACAACTAAGCGAAGATGCACAAACCCTAATCGAAGATATAAACAACCAAGTAGACCGCTTACGCCCTGATACAGAGGATAACATTCCCGACGTACTGGCCCGCACCGTAAACGAGCTAAATTTAGAGCGCCAAGCCCGCACCGACATTGAGCAAGGCGTATTTGATTTATCAGCCGAGTACACCAACTGGCGTCAAAACTACGAGCAACGCCAATTAGGTAACGAGCGCTTAATTGATGCGGCCGTGTATATCGACCCTGAAAGCGGCACCATTGTAAACCGTGCGTTTGCTTACACAGACGAGGCTTTTAGCGAGGCTAACGTATTAATTGATGGTGTAAATGCAAGTATTGAGCTACAAGCAAACCGCATAACGGGCACTAATGAGCGATTAACGCAAGCCGAGTCAACATTAACGGTTCAGGCGGGGCAAATAAACCAACGCGCCACCTTTACCGAAATGCGCACCGAAATTGCGGGCGCGATTGAAGCGCTAACCCCTGCTTATAGCTGGCACTTTAATCACAACACCGAGGGCTTTAGCGGTGATGTAGCTCACAACCCGCAAGGCTTTTTAGTGATTACGGGCGTGGCCAACGCCGCTGCAATTACCTATGAAGCCGAAGAAAACCCAATGTTACGCCTACGTGTGCGTAAGCATGCTGATCTGCCATGGTTAGGTAATCTTTACTTTGGTGCCGATGAATTTTTAGTTAACGTTTTAGAGCCAGAAAGCGAAAACTGGGAAACCACGCAAATTGATTTAACAGGCATTGAGGGTTACACCGGCACCATTACGGCGCTAAAAATTGACCTAGGCCACGTTGATATTGATTTTATAGAAATAGGCAAACGCGGCGCAAATGACCTGGCATTAAATGACATAACTACCCGCGCCACCATTTTAGAAAATGATATTGATGCCGCCACAGGCATTATGGCGCAATATGCCACAACAACGTGGGTAAACGAGTTAGGTTATCAAACCCAATCAAACGTCAATGCCGTTATTGATAGCTTTAATACGACATATCAAATTAGCGCCACCCTGCAGGAATTTAACGACAACGGTACGCTAGAAAAAGCCAATAATGCACAGCAGTTTATTAATGGTGCTGAGGCTTATATAACAAGCCAGATCACAGCCTTTAATGCGGCTGAAAATGGCGTAGATGCTAAGTTTGCCAATGTAGACCAAACACTCGATGCGATAAACGGCACGATTAGCCAAAGCATAGTGCAAGTACAAGGTTTAGAGCTTGACTTGCAAGACGCAAATTTAAACGATGTTATCGCTGAGGCTAATCAGTTATTACTGGGTCACGATTTAGCACAGCAAGACGTAAAAGTGGCACTTGCACAAAGTAAACTGACAGCACACACAACAGAAATAGAATCCCTAGCGAGTTTTACATTAGACTTACAGGCTTGGTTTAATGATAGTCAGGCGGCATTTTCAGAGCTTGTAACTACTGTAGCTAATGACCAGCAAGCCTTGGTAACAGTAGAACAAAACTTACAAGCTAAAATCACAAACGACACAAACGCAGCCCTTGCCAGCGCTCAAGAATACACCCGCACGGCGGTAGGCTACTGTGTTGATGCTGAGGGCAATATAACCAGCGAAAAGGACGCCATACAATGTGTAACGGATGGTGGTTCATGGGTAGATGGCCCTTTAGCGGAGTACATTTCTAATTTACAAATAAGTGATGGCGAAAGTACCGCCAGTATTAAAGAACTTAAGCAAGTCTTTAAAAAGGTAAACGGTGAGTTAGTGGCCCGTGGCGGCTGGGTGCTTGATAACAACGGCCGCGCCGTAAGCGTGGCTGGTTATAACGATGGCGAAACGGGCAACTTAGACTTAGTGGCCGATGTGATCCGCCAAGGCGTTATGGTAGGTAATACCTTTGTGCCCACCTCGTATATTGATAA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
516dda5fabf85a313cd21042a6962286674353dbb7fdea164433731009441c30
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6642
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genomic characterization of an active prophage infecting a marine Pseudoalteromonas isolated from a marine flatworm Zablocki,O.D.J., van Zyl,L.J. and Trindade,M.I. 2014-12 — GenBank