Protein

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Genbank accession
QPD96066.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,54
Protein sequence
MIHVLDFNDKIIDFLSTDDPSLVRAIHKRNVNDNSEMLELLISSERAEKFRERHRVIIRDSNKQWREFIINWVQDTMDGYTEIECIASYLADITTAKPYAPGKFEKKTTSEALKDVLSDTGWEVSEQTEYDGIRTTSWTSYQTRYEVLKQLCTTYKMVLDFYIELSSNTVKGRYVVLKKKNSLFKGKEIEYGKDLVGLTRKIDMSEIKTALIAVGPENDKGKRLELVVTDDEAQSQFNLPTRYIWGIYEPQSDDQNMNETRLRSLAKTELNKRKSAVMSYEITSIDLEATYPHEIISIGDTVREKHRDFNPPLYVEAEVIAEEYNMISENSTYTFGQPKEFKESELREEFNKRLNIIHQKLNDNISNINTIVKDVVDGELEYFERKIHKSDTPPENPVNDMLWYDTSNPDVAVLRRYWNGRWIEATPNDVEKLGGITREKALFSELNNTFINLSIQHARLLSEATELLNSEYLVDNDLKADLQASLDAVIDVYNQIKTNLESMTPETATIGRLVDTQALFLEYRKKLQDVYTDVEDVKIAISDRFKLLQSQYTDEKYKEALETIATKFGLTVNEDLQLVGEPNVVKSAIEAARESTKEQLRDYVKASDYKTDKDGIVERLNTAEAERITLKGEIKDKVTLNEYQSGLAENKKYTDEIASQEANNAFNNVKNYTDGVSQNTDRKLRQMKSSIEQNGRDINLKVSQYEFNKSNETLSKVIADITVNTMEGITLRYDENGAISSHIVDHQGIKINGNKVDIRANKEFNVVANSINNKVGKNDIVNSLNLSTEGLDINVNRIGIKGGDTNRYVQIQNDFIELGGIVQRTWRGKRSTDDIFTRLKDGHLRFRNNTAGGSLYMSHFGISTYIDGEGEDGGSSGTIQWWDKTYSDSGMNGITINSYGGVVALSSDYNRVVIDSYASANIQSKQAPVYLYPNTEKVPGLNRFAFTLSNADNAYSSDGYIMFGSDENYDYGAGIRFSKERNKGLVQIVNGRYATGGDTTIEAGYGKFNMLKRRDGNRYIHIQSTDLLSVGSDDAGDRIASNSIYRRTYSAAANLHITSAGTIGRSTSARKYKLSIENQYNDSDEQLEHSKAILNLPIRTWFDKAESEILAKELREDRKLSDDTYKLDRYVGLIAEEVENLGLKEFVTYDDKGEIEGIAYDRLWIHLIPVIKEQQLRIKKLEESKNAEQ
Physico‐chemical
properties
protein length:1189 AA
molecular weight: 135482,65940 Da
isoelectric point:5,17436
aromaticity:0,08579
hydropathy:-0,63659

Domains

Domains [InterPro]
DC_1956
STR
1–575
DC_1956 DC_0536
IPR007119
Unmapped
25–336
IPR007119 IPR030392
IPR010572
ENZ
93–332
IPR010572
QPD96066.1
1 1189
Architecture
STR
STR
STR 1-575 | STR 580-1188 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage B_UFSM5
[NCBI] 		2785452 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Staphylococcus aureus
[NCBI] 		1280 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QPD96066.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW192778 [NCBI]
CDS location
range 23150 -> 26719
strand -
CDS
GTGATACATGTTTTAGATTTTAACGACAAGATTATAGATTTCCTTTCTACTGATGACCCTTCCTTAGTTAGAGCGATTCATAAACGTAATGTTAATGACAATTCAGAAATGCTTGAACTGCTCATATCATCAGAAAGAGCTGAAAAGTTCCGTGAACGACATCGTGTTATTATAAGGGATTCAAACAAACAATGGCGTGAATTTATTATTAACTGGGTTCAAGATACGATGGACGGCTACACAGAGATAGAATGTATAGCGTCTTATCTTGCTGATATAACAACAGCTAAACCATACGCACCAGGTAAATTTGAGAAAAAGACAACATCAGAAGCATTGAAAGACGTGTTAAGTGATACAGGTTGGGAAGTCTCAGAACAAACTGAATATGATGGTATACGTACTACATCGTGGACTTCTTACCAAACGAGATACGAGGTATTAAAACAACTTTGTACGACTTATAAAATGGTGCTAGATTTTTATATTGAGCTTAGCTCTAATACCGTCAAAGGTAGATACGTGGTACTCAAAAAGAAAAATAGCTTATTCAAAGGTAAAGAGATTGAATATGGTAAAGATTTAGTCGGGTTAACTAGAAAGATTGATATGTCAGAAATTAAAACAGCATTAATTGCTGTGGGACCCGAAAATGACAAAGGGAAGCGTTTAGAGTTGGTTGTGACAGATGACGAAGCACAAAGTCAATTCAACTTACCTACGCGTTATATTTGGGGGATATACGAACCACAATCAGACGATCAAAATATGAATGAAACGCGATTACGTTCTTTAGCCAAAACTGAGTTAAATAAACGTAAGTCAGCAGTCATGTCATATGAGATTACTTCTATTGATTTAGAAGCTACGTATCCGCATGAAATTATCTCAATTGGTGATACGGTTAGAGAAAAACACAGAGATTTTAACCCGCCACTGTATGTAGAGGCAGAAGTTATAGCTGAAGAATATAATATGATTTCAGAAAATAGCACCTATACATTCGGTCAACCTAAAGAGTTCAAAGAATCTGAATTAAGAGAAGAGTTTAACAAACGATTGAACATAATACACCAAAAGTTAAACGACAATATCAGCAATATCAACACTATAGTAAAAGATGTTGTAGATGGTGAGTTAGAATACTTTGAACGCAAAATACACAAAAGTGATACACCACCAGAAAATCCAGTGAATGATATGCTTTGGTATGATACAAGTAACCCCGATGTCGCTGTCTTGCGTAGATATTGGAATGGTCGATGGATTGAAGCAACGCCAAATGATGTTGAAAAATTAGGTGGTATAACAAGAGAGAAAGCACTATTTAGTGAATTAAACAATACATTTATTAATTTATCTATACAACACGCTAGGCTTTTGTCAGAAGCTACAGAGTTACTGAATAGTGAGTACTTAGTAGACAATGATTTGAAAGCGGACTTACAAGCAAGTTTAGACGCTGTGATTGATGTTTATAATCAAATTAAAACGAATTTAGAATCAATGACACCCGAAACTGCAACGATTGGTCGGTTGGTAGATACGCAAGCTTTATTTCTTGAGTATAGAAAGAAATTACAAGATGTTTATACAGATGTAGAAGATGTCAAAATCGCCATTTCAGATAGATTTAAATTATTACAGTCACAATACACTGACGAAAAATATAAAGAAGCGTTGGAAACAATAGCAACAAAATTTGGTTTAACGGTGAATGAAGATTTGCAGTTAGTCGGAGAACCTAATGTTGTTAAATCAGCTATTGAAGCAGCTAGAGAGTCTACAAAAGAACAATTACGTGACTACGTTAAAGCTTCGGACTACAAAACTGATAAAGATGGTATTGTTGAACGTTTGAATACTGCTGAAGCTGAGAGGATAACTTTAAAAGGTGAAATCAAAGATAAAGTTACTTTGAACGAATATCAAAGCGGATTAGCTGAGAATAAAAAGTATACTGATGAAATTGCATCACAGGAAGCAAACAATGCATTTAATAATGTGAAGAATTATACTGATGGCGTTAGTCAAAATACAGATAGAAAACTAAGACAGATGAAAAGTTCTATTGAACAAAATGGTAGAGACATTAATTTAAAAGTATCGCAATATGAGTTTAACAAATCAAATGAAACATTATCTAAAGTCATAGCGGATATCACTGTAAACACTATGGAAGGTATTACGCTAAGATACGATGAGAACGGAGCTATAAGCTCACATATTGTAGATCATCAAGGTATTAAAATCAATGGTAATAAAGTTGATATCAGAGCAAATAAAGAATTCAATGTCGTAGCTAATAGTATTAATAACAAAGTTGGTAAAAACGACATCGTCAATAGTTTAAACTTATCAACAGAGGGTTTGGATATAAATGTTAATAGAATCGGAATTAAAGGCGGTGACACTAACAGGTATGTTCAAATACAGAATGATTTTATTGAACTAGGTGGTATTGTACAACGTACTTGGAGAGGTAAACGTTCAACAGATGATATTTTTACACGTCTTAAAGATGGTCACCTGAGATTTAGGAATAATACTGCTGGCGGTTCACTTTATATGTCGCACTTTGGTATTTCGACTTATATCGATGGTGAAGGTGAAGACGGTGGTTCATCTGGTACGATTCAATGGTGGGATAAAACGTATAGCGATAGTGGTATGAATGGTATCACTATCAATTCTTACGGTGGAGTAGTAGCACTTAGTTCAGATTACAACCGTGTTGTCATCGACTCTTACGCATCGGCTAACATTCAAAGTAAACAAGCACCTGTTTATTTGTATCCAAACACTGAAAAAGTGCCAGGATTAAACCGTTTTGCATTTACATTATCTAACGCAGATAACGCTTATTCGAGTGACGGTTATATTATGTTCGGGTCTGATGAAAATTATGATTACGGCGCAGGTATCAGATTTTCTAAGGAAAGAAATAAAGGACTTGTTCAAATTGTTAATGGTCGATACGCGACAGGTGGAGATACAACCATCGAAGCAGGGTACGGTAAATTTAATATGCTCAAAAGACGAGACGGTAATAGGTATATTCATATACAGAGTACCGACCTATTATCTGTCGGTTCAGATGATGCAGGGGATAGGATAGCTTCTAACTCGATCTATAGACGTACTTATTCAGCTGCAGCTAATTTGCATATTACTTCTGCTGGTACAATTGGACGTTCAACATCAGCTCGTAAATATAAGCTATCTATCGAAAATCAATATAACGATAGTGATGAACAGTTGGAACATTCAAAAGCTATTCTTAACTTACCTATTAGAACATGGTTTGATAAAGCTGAGTCTGAAATTTTAGCTAAAGAGCTGAGAGAGGATAGAAAATTATCGGATGACACCTATAAACTTGATAGATATGTAGGTTTGATTGCTGAAGAAGTGGAGAATTTGGGTTTAAAAGAGTTTGTCACATATGATGACAAAGGAGAAATTGAAGGTATAGCGTATGATCGTTTATGGATTCATCTTATTCCTGTTATCAAAGAGCAACAACTAAGAATCAAGAAATTGGAGGAGTCAAAGAATGCAGAACAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
1d775f72e4a28e699ff92b19f2ddd46e61ddded012e4b242388be5161544bb75
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,3339
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50