Protein

Genbank accession
QBQ72452.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,85
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MAGYSRQSVADIIANAVIKAAPVNAEYNAIRDAFAFSGGHKHDGSSTEGAYVPLIADTDALNKVVVDTANNRIGIFTEVSSAAVEQIRIQDGAIVPVTDNDIDLGTSSLKYKNIYVNGIASIGSITLSGGTIDNTVIGGTTPAAADFTTMDASGNATVGGTLGVTGNTTIGGTLGVTGVTTLGTANITSVDIGSGAMDGTTIGATTAAAGTFTNLTATGTTTLTTVDINGGAIDGTAIGATSASTGAFTTLSATGTSTLSTVDINAGNIDGTIIGASSAAAGSFTTVSTSGQATLATADINGGTIDGAVIGATTPAAITGTTVTATSFVGPVTGNITGNVTGNVTGNVTGDVTGNVTASSGTSTFNNVTVNGTLNMDAGTTATITNLTSPTNTNDAATKGYVDTSVANLVDSAPGTLDTLNELAAALGDDPNFSTTITNSIATKLPLAGGTMTGAIAMGTNKITGLGDPTAAQDAATQNYVTTNFLGLTGGTMTGAIDMGSAKITTTYTPTNAADLTTKTYVDGILGSATAAAASATAAATSETNAATSETNAANSATAAASSATSAAASYDSFDDRYLGAKASAPALDNDGDALVLGALYFNTTTDIMYVYGSSGWQAAGSSVNGTAERNTYTATSGQTTFSATYDPGYVDVYLNGVKLLANTDFTATSGTSIVLTTGAATGDIVDIVAYGTFVVADTYTKSQSDARYVEVAGDTMTGTLNGTSAVFSGNLTVDTNTLHVDSTNNRVGVGTTSPSRQLHLSGSTPIIRLTDTDTNAYGEISSSSSDGNLMFYADQGNTQANTTIRFYVDTSERMRIDSSGNVGIGTSSFANLLNLHQSDASSNSYLHVTHVDSGTGASNGLSIGLESNGIDAAFRNRESGSVKLYTGNSERMRIDSSGNLLVGTTVTPVNLLTATSGGGMGFDPTDNYLVVAREGTNSSKPVIRLNQTGVDGSIAEFRKDGTTVGSIDTHGGVIQFGQGNVNLAFENGADVIYPANDNGTNNNGDIDLGTSSARFKGLYLSGGVVENTTTVTYASSIALTYNNGSIQTVTLTGNVTFTNSLADGEAIVYRMHPQTLIFM
Physico‐chemical
properties
protein length:1080 AA
molecular weight: 108354,92610 Da
isoelectric point:4,19258
aromaticity:0,05648
hydropathy:0,00731

Domains

Domains [InterPro]
IPR051934
373–500
IPR051934
QBQ72452.1
1 1080
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Roseobacter phage CRP-1
[NCBI] 		2559280 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBQ72452.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK613343 [NCBI]
CDS location
range 33886 -> 37128
strand -
CDS
ATGGCAGGTTATAGCAGACAATCAGTAGCAGATATTATCGCTAATGCGGTTATCAAAGCTGCACCAGTAAACGCAGAATACAACGCTATTCGTGATGCGTTTGCTTTCTCAGGCGGTCACAAACACGATGGTAGCTCTACTGAAGGTGCTTACGTACCTTTGATTGCTGACACTGATGCATTAAACAAAGTTGTAGTAGATACAGCTAACAACCGCATAGGTATCTTTACTGAGGTATCTAGTGCTGCAGTAGAACAGATACGTATTCAAGACGGTGCTATTGTTCCTGTAACAGACAACGACATTGACCTTGGTACTTCATCACTAAAATATAAAAACATTTATGTAAACGGTATTGCAAGCATTGGCTCCATCACACTGTCAGGTGGTACAATAGACAATACTGTTATTGGTGGTACTACTCCTGCCGCTGCTGACTTTACTACAATGGATGCATCAGGTAATGCTACTGTCGGTGGTACTCTTGGTGTCACAGGTAACACAACAATAGGTGGCACACTAGGTGTAACAGGTGTAACTACACTAGGCACTGCTAACATTACCTCTGTAGACATTGGCTCTGGTGCAATGGATGGAACTACTATTGGTGCCACAACTGCTGCAGCAGGTACATTTACTAACCTGACTGCTACAGGTACAACTACTCTTACAACAGTAGATATTAACGGTGGTGCTATTGATGGCACTGCTATCGGTGCAACTAGTGCATCTACTGGTGCTTTTACTACTCTGTCTGCCACAGGTACATCTACACTAAGCACAGTAGACATTAACGCAGGTAATATAGATGGTACTATTATTGGTGCTAGCAGTGCTGCTGCTGGTAGTTTTACAACTGTATCGACATCTGGACAAGCTACCTTGGCGACTGCTGACATTAATGGTGGCACTATTGACGGTGCTGTTATTGGTGCAACAACTCCAGCAGCTATCACAGGCACGACAGTTACAGCAACTTCTTTTGTTGGGCCAGTCACAGGTAACATCACAGGAAACGTTACAGGCAATGTAACTGGTAATGTCACAGGTGATGTAACAGGTAACGTTACTGCTTCAAGTGGTACATCTACATTTAACAACGTTACTGTTAATGGTACGTTGAACATGGATGCAGGTACAACTGCTACCATTACTAACCTAACAAGTCCAACTAACACAAATGATGCTGCCACTAAGGGGTATGTAGATACCTCTGTAGCTAACCTTGTAGACTCAGCCCCAGGTACACTAGACACACTAAACGAACTAGCTGCTGCTCTAGGTGATGACCCTAACTTCTCAACTACTATTACTAACAGCATAGCAACCAAGCTACCACTAGCAGGTGGTACGATGACTGGTGCTATTGCTATGGGTACAAACAAGATTACTGGCTTGGGTGATCCTACTGCAGCACAGGATGCAGCTACACAAAACTATGTAACAACTAACTTCTTAGGCTTAACAGGTGGCACTATGACAGGTGCTATCGACATGGGTAGTGCTAAGATTACAACTACCTATACACCTACTAACGCTGCTGATTTGACTACTAAAACATATGTAGACGGTATTCTAGGTAGTGCTACAGCCGCTGCTGCTAGTGCAACTGCTGCTGCTACATCGGAGACTAATGCAGCAACAAGTGAAACTAATGCGGCTAACTCAGCCACTGCTGCTGCAAGTTCAGCAACCAGTGCTGCAGCATCATATGATTCATTTGATGATCGTTACTTAGGTGCTAAAGCTTCTGCTCCTGCCCTAGATAATGACGGTGATGCTCTTGTACTTGGTGCATTGTACTTCAATACTACTACAGACATTATGTATGTCTATGGTAGCTCTGGGTGGCAAGCTGCAGGTTCATCTGTAAACGGTACAGCAGAACGTAATACTTACACAGCCACATCTGGTCAGACAACATTCAGTGCTACTTATGATCCAGGCTATGTAGATGTATATTTGAATGGTGTTAAGTTACTAGCTAATACAGACTTCACTGCTACATCAGGTACATCTATTGTACTAACTACAGGCGCAGCTACAGGTGACATCGTTGATATTGTAGCTTATGGTACATTCGTTGTAGCTGATACTTATACTAAGTCACAGTCTGATGCTCGTTATGTTGAAGTAGCTGGCGATACTATGACTGGTACACTTAACGGTACATCAGCAGTATTCAGTGGCAATCTGACAGTAGATACAAACACACTACACGTTGATAGCACAAATAATCGTGTTGGGGTTGGGACAACTTCGCCTAGCAGACAGCTTCATCTTTCTGGTTCTACACCAATCATTAGGCTGACCGACACAGATACAAACGCATATGGGGAAATTAGTAGTTCATCTTCGGATGGGAACTTAATGTTCTATGCTGACCAAGGCAACACACAAGCAAATACAACAATACGGTTTTATGTTGATACTTCAGAACGCATGCGCATCGACAGTTCTGGTAATGTTGGGATCGGGACGAGTTCGTTCGCCAACCTTTTAAATCTCCACCAGTCGGATGCATCCTCAAACTCTTATCTTCATGTAACTCATGTTGATAGTGGAACTGGTGCATCAAATGGTTTGTCTATTGGGCTAGAAAGTAACGGTATAGACGCAGCATTTAGAAACCGTGAAAGCGGCAGTGTTAAACTGTATACTGGTAACTCAGAACGCATGCGCATCGACAGCAGCGGTAACTTGCTGGTGGGGACTACTGTTACACCTGTTAACTTGCTAACTGCAACAAGCGGCGGTGGCATGGGGTTTGATCCAACTGATAATTACTTGGTCGTTGCGAGAGAGGGAACTAACAGCTCAAAACCTGTTATTCGATTAAATCAAACAGGCGTTGATGGGTCTATTGCAGAGTTCCGCAAAGACGGCACCACTGTGGGGAGTATTGATACCCACGGCGGTGTTATTCAGTTTGGTCAGGGTAATGTAAACCTAGCATTCGAAAATGGTGCAGATGTAATCTATCCCGCAAACGATAATGGCACCAACAATAATGGAGATATAGATTTAGGTACGTCAAGTGCTCGCTTCAAAGGCCTCTACCTCTCTGGGGGCGTAGTAGAAAACACAACCACAGTTACATACGCATCATCTATTGCTCTTACCTACAACAATGGTTCTATCCAAACAGTCACACTTACAGGCAACGTCACATTTACTAACAGCTTGGCAGACGGTGAAGCCATTGTGTATCGGATGCATCCTCAAACTCTTATCTTCATGTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
4f1e798988fbd9cd2d0671323d8a55636f9eca547a048d5a85e255162910ebe6
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2554
Evidence 0,2554
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Diverse, abundant and novel viruses infecting the marine abundant Roseobacter RCA lineage Zhang,Z.F., Chen,F., Chu,X., Zhang,H., Luo,H.W., Zhai,Z.Q., Yang,M.Y. and Zhao,Y.L. 2019 — GenBank