Protein
View in Explore- UniProt accession
- I7K3B9 [UniProt]
- Protein name
- Phage long tail fiber proximal subunit
- RBP type
-
TFTSPTF
- Protein sequence
-
MADLIKASFRATNGLDAAGEKVINVATADKTKLTDGVNVDFFFKENTIQLYDTTRGYDSGFAIIYNNRLWVSNRIIPEPAGAFQETFWTAIRTDPKWTYVDVGPVTMQSGDYISANTSVNDLVLTLPNTPNDGETIFVRDVGGNLGYKSLKINTSNQRINFRNSQITSFTATRPYSQLMFVFSNRLWQLYVGENESIGTIITPSTGMFRSQAGDIIIRRYTTSAPCQIGLPKNAVTGDIIRTIDLDGLSPQNHLIVTTFDNTSSIGTIGTHSAEFRTAGDGFLVYDASDSIWRVYDADLRTRISVVTETTDLSPNQSVIVFGDNNATSKDITLNLPTDVAFGDTVEICLSYIRHGQTVTIKANAPDLIASTKLLLQFPRRSDYPPDVSWYTSEELIFNGYDDYAPTLELAFLQDPITLDKYWVVSENIPTIERVDATNNTTRKRLGVIALASQEQANVDLENNPEKSLAITPELLANRTSTESRRGIARLASTAEVNQDSTSTFLDTVIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQAETNTGTDDTTIVTPKKFAARKATTSMNGIITLVSSGAIAASDRDNPGTLVYNYNDTVKAITPATLHEARATKTTLGQLYQATETEVISAPIENPLVPLAVSPEMLHKKTATTTRIGFTQTATQAEVNAGTDNFKYVTPNTLNGRNASEILTGIAKISTQNEFDAGLLDNVISTPLKIAAHFSDVNRTEVISSSGLTQSGNLWNHYTLNILEATNVQRGTARLATQSEVDAGVEAKSIVTAATLSSKKATETTEGIIRVATQAESVAGTSSILAISPKNLKYIAQTESTWESTPLRRGFVKMTEGALTWVGNNTVGNTQDVELYAKNGYAISPYELNLTLSHYLPIEATAVNSTKFDNLASTQFIRRDINQTVDGILTLTKQLNTSAPVLSSSTGTFVDVVGTNTVNAGNSLGTASISILGKANNWKFNAVADGTTLLINDVLTLNQNGNASVKQTFNIGNRADSVNGYSVGGVVVLQNNALTTEVGNIVRPLVLKSPDASNIIADDGTQYKVLTEKNAVSLIGTSFVKKIGDTMTGRLTVNSAITVQLSEASISVIPTETTRGMWTAEVTTPAQYNLLPGYAVPVFGTNQDGSDNAIIVSYNLIKGPGTLAQFGVGTNYSYQVWNPRPTAIVPNHFARTQWIRNFNPLINGWDEWARVFTSQTPPTASDIGAVSSTGSAFNNMTVRDWLQIGNVRITPNVATRTVEFDWID
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1245 AA molecular weight: 134999,41690 Da isoelectric point: 5,17845 aromaticity: 0,07470 hydropathy: -0,18956
Domains
Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
37–139
ATT
37–139
IPR048391
ATT
1091–1193
ATT
1091–1193
1
1245
Architecture
ATT 37-139 | STR 343-1090 | ATT 1091-1193 | STR 1194-1229 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Tail Spike Domain Segmentation
Tail Spike Domain Segmentation
This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.
Domain Layout
1
1245
| Domain | Start | End | Length (AA) | Confidence |
|---|---|---|---|---|
| N-terminal | 1 | 979 | 979 | 0,8816 |
| Central domain | 980 | 1178 | 200 | 0,1533 |
| C-terminal | 1179 | 1245 | 66 | 0,2843 |
Note: Constraints were applied during segmentation.
Fixed 23 C-terminal predictions appearing before Central domain
Fixed 23 C-terminal predictions appearing before Central domain
Legend:
N-terminal
Central domain
C-terminal
3D Structure with Domain Coloring
The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).
Domain Coloring
N-terminal
1-979
1-979
Central
980-1178
980-1178
C-terminal
1179-1245
1179-1245
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Yersinia phage phiR1-RT [NCBI] |
1206558 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Tevenvirinae > Tegunavirus |
| Host |
Yersinia enterocolitica [NCBI] |
630 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CCI88821.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
HE956709
[NCBI]
CDS location
range 155079 -> 158816
strand +
strand +
CDS
ATGGCTGATTTGATAAAAGCCAGTTTTCGAGCTACAAATGGTCTCGATGCAGCTGGTGAAAAAGTAATTAACGTGGCAACAGCCGATAAGACCAAATTAACTGATGGCGTTAACGTTGATTTCTTCTTTAAAGAAAATACTATTCAACTTTATGATACAACTCGTGGATATGATTCAGGATTTGCTATCATTTATAATAACCGTTTATGGGTTTCTAACCGTATTATTCCTGAACCTGCTGGTGCCTTCCAGGAAACTTTTTGGACTGCTATAAGAACAGACCCAAAATGGACTTATGTTGATGTAGGTCCTGTTACAATGCAATCGGGTGATTATATTAGTGCAAATACCTCAGTTAATGATTTAGTATTAACTTTGCCTAATACGCCAAATGATGGGGAAACAATTTTTGTTCGAGATGTTGGCGGTAATTTAGGATATAAATCACTAAAAATTAATACATCTAACCAACGAATCAATTTCCGTAATAGCCAAATAACATCATTTACCGCAACTCGCCCTTATTCACAATTGATGTTTGTTTTCAGTAATAGATTATGGCAGCTTTATGTCGGTGAAAATGAATCGATTGGAACAATTATCACTCCTTCAACAGGCATGTTTCGTTCTCAAGCCGGTGATATAATTATTCGTCGTTACACAACGAGTGCGCCATGTCAGATAGGTTTGCCAAAGAATGCTGTAACAGGTGATATAATTCGTACAATAGATTTAGATGGATTAAGCCCTCAAAACCATTTAATTGTTACTACATTTGACAATACATCATCTATAGGAACAATTGGAACTCATAGCGCTGAATTCAGAACAGCCGGCGACGGTTTCTTAGTATATGATGCTTCTGATTCTATCTGGCGTGTATATGATGCAGATTTAAGAACACGCATCAGTGTAGTAACTGAAACTACCGATTTATCTCCGAACCAATCAGTTATAGTTTTTGGCGATAATAATGCTACATCTAAAGATATAACATTAAATCTTCCAACTGATGTTGCATTTGGCGATACAGTTGAAATTTGTTTAAGTTATATTCGCCATGGCCAAACTGTTACTATTAAGGCTAATGCTCCTGATTTAATAGCTTCTACTAAATTATTACTTCAGTTCCCACGTCGTTCAGATTATCCACCAGATGTTAGTTGGTATACTTCTGAAGAATTGATATTCAATGGGTATGATGATTATGCTCCGACTTTAGAATTAGCTTTCTTACAAGACCCTATTACTTTAGATAAGTATTGGGTAGTTTCAGAAAATATTCCTACAATTGAACGTGTTGATGCTACTAATAATACAACACGTAAACGTTTAGGTGTTATTGCACTAGCTTCTCAAGAACAAGCAAACGTTGATTTGGAAAATAACCCAGAAAAATCTTTGGCTATTACACCTGAATTGTTAGCTAATAGAACTTCGACTGAATCTCGACGTGGTATTGCTCGTTTAGCATCTACCGCTGAAGTTAACCAAGATTCTACTTCTACTTTCTTAGATACAGTTATTGTTACGCCTAAGAAATTAAATGAAAGAACCGCAACTGAAACACGTCGTGGTTTGGCTGAAATCGCTACCCAAGCAGAAACAAATACTGGAACTGACGATACAACAATTGTAACTCCTAAGAAATTTGCTGCTCGTAAAGCGACAACTTCTATGAATGGTATTATTACGTTAGTTAGTTCAGGCGCTATTGCTGCTTCTGATCGTGATAATCCAGGTACATTAGTTTATAATTATAACGATACTGTTAAAGCTATTACTCCAGCTACGCTTCACGAAGCGCGTGCAACGAAAACTACTTTAGGCCAATTGTATCAAGCAACTGAAACTGAAGTTATAAGTGCTCCAATAGAGAATCCACTAGTTCCATTAGCGGTTTCTCCTGAAATGCTTCATAAGAAAACTGCAACTACAACTCGTATTGGTTTTACTCAAACCGCTACTCAAGCTGAAGTTAATGCAGGAACTGATAATTTTAAGTATGTTACTCCAAATACTTTGAATGGCCGAAATGCCTCAGAGATATTAACCGGTATTGCTAAAATTTCTACACAGAATGAATTTGATGCAGGTTTATTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAATTGCTGCGCATTTCTCAGATGTTAACCGTACTGAAGTAATATCATCTTCCGGCCTGACCCAAAGTGGAAATCTCTGGAACCATTATACACTGAATATTCTTGAAGCAACAAATGTTCAACGTGGCACGGCAAGATTAGCTACACAATCAGAAGTTGACGCAGGCGTAGAAGCTAAATCTATTGTAACAGCAGCTACTTTGTCAAGTAAAAAAGCGACTGAAACCACCGAAGGTATAATTCGTGTGGCAACACAAGCTGAATCGGTTGCAGGCACTTCAAGTATATTAGCGATTTCTCCTAAGAACTTGAAATATATTGCTCAAACAGAATCTACTTGGGAATCAACTCCACTTCGTCGCGGTTTTGTTAAAATGACTGAAGGCGCTTTAACATGGGTTGGTAATAATACTGTAGGTAATACTCAAGATGTAGAATTATATGCAAAAAATGGTTACGCTATTTCACCGTATGAATTGAACTTGACTTTATCTCATTATTTACCTATTGAAGCTACAGCTGTCAATAGTACTAAATTTGATAACCTAGCCTCCACTCAGTTCATACGTAGGGACATTAATCAAACGGTTGATGGAATACTAACCCTTACTAAACAATTGAATACGAGTGCTCCTGTGCTCTCCAGTTCAACTGGTACTTTTGTTGATGTTGTTGGAACTAACACAGTTAATGCTGGTAATTCTTTAGGCACTGCTTCTATTTCTATTCTCGGCAAAGCCAATAATTGGAAATTTAATGCTGTTGCCGATGGCACAACTTTATTGATCAATGACGTATTAACTTTGAATCAAAATGGTAATGCTTCTGTCAAGCAAACATTTAATATTGGCAACCGTGCAGATTCAGTTAATGGCTATTCTGTTGGTGGTGTTGTTGTCTTGCAGAATAATGCTTTAACTACTGAAGTTGGTAACATTGTTCGTCCATTAGTATTGAAATCTCCCGATGCAAGTAATATTATAGCTGACGACGGAACTCAATATAAAGTATTAACAGAAAAAAATGCTGTTTCATTAATTGGCACTTCATTTGTTAAAAAAATTGGCGATACTATGACAGGACGTTTAACTGTTAATAGTGCAATAACTGTTCAGTTATCAGAAGCTTCTATAAGTGTTATTCCTACTGAAACCACACGAGGTATGTGGACTGCTGAAGTTACTACGCCGGCACAATATAATTTACTTCCTGGCTATGCTGTTCCGGTATTTGGAACCAATCAAGATGGCAGCGATAATGCTATTATTGTAAGTTATAATCTGATTAAAGGCCCTGGTACATTAGCACAGTTTGGTGTTGGAACTAATTATTCATACCAAGTATGGAACCCACGTCCAACTGCCATTGTTCCTAACCACTTTGCTCGTACTCAATGGATAAGAAACTTTAACCCGTTGATTAATGGCTGGGATGAATGGGCCCGTGTATTTACAAGTCAAACACCTCCTACTGCTTCTGATATTGGTGCTGTATCTTCTACAGGTTCTGCATTTAACAACATGACAGTTAGAGATTGGCTACAGATTGGTAATGTTCGTATTACTCCTAATGTAGCAACGCGTACTGTTGAATTTGATTGGATTGATTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
6fa2925d73f829f5e7cfb6d0d7fa03ab56ff92288338aec78997483e8116e69f
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50