Protein
- Genbank accession
- ALO80452.1 [GenBank]
- Protein name
- structural protein
- RBP type
-
TSPTSP
- Protein sequence
-
MEYFVDGNITSSGDGLTELNAFKTIQEGIDAAYAGDTVWVKAAKYVGGENSTTRSGTSSNPIKIIGYLNTVGDIVSTQGPTYTKAMFDADSSIIDGGITVLDSSDMPLIEGIRVNEDPDDARAFTINHSFIQFENLKIQYYQMGFIAPSGNSYDGLLFKNIIMNELGNWDASNPGWDLPFSAAPPAGNLSGQGFYLIDTNNTIILNSSVYDAGAAAYFPIRADNLLIDYCEAYSTRTGNASDYLFDFVTVTNSTLSNYYAYREDLDTSKMHLSRAVMLQLQSNDNTIMNGTHVNLRTQLEVQSSRNVLKNINVIGNGQANQGNIQISGESNDNIFLDWTIDGTEGIQFLGANDTRQPGVSHVYSGNNNYFINFVITNVPVGTGNAIFSYHRLGFSDPDDGGTNYVIGLTADNCITLVNTNRTGTLHIYNSTFSNITNYDTFSTSGTATDELVNLNFYNCNFYNNGFVTPTNNVERTLVNTTALNPMFNPDYTLQEASPLRDIGMDASTINSLAATDYIGTARPQNGSYDIGAYEYSIATGIPNTDGTGSVDDTISLQAWLDSGSTTKPLGNEIYLVSGTLDIDQSGAQEVDFNGATIIVSSYADRYAIDIDKPDRSLTTLKNLTIDGKDLQRNGVRVDSPIYAENVNLLDFYSPTQSIVGWLLDINLTNYGDFTWKNCDVTKMYSEYNSIIGDGLGSARAYDIQVNAMPPDTFTVLIEDFVWDGFYGDDGGPIRVDDNTSENMSVTNNSVTLRNGSVTAFTRRGIKMAMDNITIDNVFYKSITTSNPYYQYAEPAGLIGARPLDTDPNGLLDNIVIKNCTFDGSGNYPWALIDKANTKWSNNTFINGAGIRIGNNSNSEVGDVVICGSNFGTGSKIHQQLDTVSNAPGTNIIIDSNNIADANYLEFTTLSYTVQEVLDCLGNVIIPIPLLANRNQNLIYWRI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 942 AA molecular weight: 102817,17490 Da isoelectric point: 4,20162 aromaticity: 0,10191 hydropathy: -0,24862
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Cellulophaga phage phi17:2_18 [NCBI] |
1747283 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ALO80452.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KT962247
[NCBI]
CDS location
range 55210 -> 58038
strand -
strand -
CDS
ATGGAATACTTTGTAGATGGAAATATTACTTCTTCTGGGGATGGTCTAACAGAACTTAACGCATTTAAAACTATCCAAGAAGGTATTGATGCTGCATATGCAGGAGATACTGTTTGGGTAAAGGCAGCTAAATATGTTGGTGGAGAAAACTCAACAACTAGGAGTGGGACATCTTCAAATCCAATTAAAATTATTGGGTATTTGAATACTGTTGGAGATATAGTAAGTACTCAAGGACCTACATATACTAAAGCTATGTTCGATGCTGATAGCTCTATAATAGATGGAGGCATAACTGTTTTAGATAGCTCAGACATGCCACTAATAGAAGGTATTAGGGTTAATGAAGATCCTGATGATGCCAGAGCTTTTACAATAAATCATAGTTTCATTCAGTTTGAGAATCTTAAAATACAATACTATCAAATGGGATTTATTGCTCCATCTGGAAATAGTTATGATGGACTATTATTCAAGAACATTATAATGAATGAACTTGGTAATTGGGATGCTAGTAATCCTGGATGGGACTTACCTTTCTCAGCAGCTCCTCCAGCAGGTAACTTATCAGGTCAAGGTTTTTATTTAATTGACACTAACAATACAATTATACTAAACTCATCTGTGTATGACGCAGGAGCAGCAGCTTATTTCCCTATAAGGGCTGATAATTTATTAATAGATTACTGTGAGGCTTATAGTACAAGAACAGGGAATGCTTCTGATTATTTATTTGATTTTGTTACAGTTACTAACTCTACATTAAGTAATTACTACGCATACAGAGAAGATTTAGATACATCTAAAATGCATTTATCTAGAGCTGTAATGTTGCAGTTGCAGTCTAACGATAACACTATAATGAACGGTACTCATGTCAATTTGAGAACTCAATTAGAAGTACAATCAAGTAGGAATGTTTTAAAGAATATAAATGTAATTGGTAACGGACAAGCTAATCAGGGCAATATACAGATCAGCGGAGAATCTAATGATAACATATTTTTAGATTGGACTATAGATGGTACAGAAGGCATACAGTTTTTAGGAGCTAATGATACTAGGCAACCAGGAGTTAGCCATGTGTATTCAGGTAATAATAACTATTTTATAAATTTTGTTATAACTAATGTACCTGTGGGTACAGGTAATGCTATATTTTCATACCATAGATTAGGGTTTTCTGATCCTGATGATGGTGGAACAAATTACGTTATAGGTTTAACGGCTGATAATTGTATTACATTAGTAAACACAAATAGAACTGGAACATTGCATATTTATAATAGTACATTTAGTAATATCACTAACTATGATACTTTTAGTACAAGTGGTACGGCAACAGATGAACTAGTTAATTTAAACTTCTATAACTGTAATTTTTACAATAATGGATTTGTAACACCTACTAATAATGTAGAAAGAACTCTAGTTAACACTACAGCTTTAAATCCTATGTTTAACCCTGACTACACTTTGCAAGAAGCTAGTCCATTAAGGGATATAGGAATGGACGCTAGTACTATAAATTCTTTAGCTGCTACTGATTATATAGGTACCGCTAGACCTCAAAATGGAAGTTATGATATAGGAGCTTACGAATACTCTATTGCCACAGGTATACCAAACACTGATGGTACTGGAAGTGTAGATGATACAATCTCACTGCAAGCATGGTTAGATAGTGGCAGCACAACTAAACCTTTAGGTAATGAGATATATTTAGTTTCAGGGACTTTAGATATAGATCAAAGTGGAGCGCAAGAAGTGGATTTTAATGGAGCCACTATAATAGTAAGTTCTTATGCAGATAGGTATGCAATTGATATAGACAAGCCAGATAGAAGTTTAACCACTCTTAAGAACTTAACAATAGATGGAAAAGATCTACAAAGAAATGGTGTTAGAGTTGATTCTCCTATTTATGCAGAAAATGTAAATTTACTAGATTTTTATTCTCCAACTCAAAGTATTGTAGGTTGGTTATTAGATATAAATCTAACTAACTATGGAGACTTTACATGGAAGAACTGTGATGTAACTAAAATGTATAGTGAGTATAATTCAATTATAGGAGACGGACTAGGATCTGCTAGAGCTTACGATATTCAAGTTAACGCCATGCCTCCAGATACTTTTACCGTATTAATAGAGGATTTTGTATGGGATGGTTTTTATGGCGATGATGGAGGACCTATTAGAGTAGACGATAATACAAGCGAGAATATGTCTGTTACAAATAACTCAGTGACATTAAGAAACGGAAGTGTAACAGCTTTTACTAGAAGAGGTATTAAAATGGCAATGGATAATATAACTATTGACAACGTTTTTTATAAATCAATTACAACATCAAATCCTTATTATCAGTATGCCGAACCAGCTGGCTTAATTGGAGCTAGGCCACTTGACACTGATCCAAATGGGCTTCTTGATAATATAGTTATTAAAAACTGTACATTTGATGGAAGCGGAAATTATCCTTGGGCTTTAATTGATAAAGCAAATACTAAATGGAGCAACAATACTTTTATAAACGGGGCAGGAATAAGGATTGGAAATAATAGCAACTCAGAAGTTGGTGATGTAGTTATTTGTGGAAGTAATTTTGGAACAGGATCTAAAATACATCAACAATTAGATACAGTTTCTAATGCTCCTGGAACTAACATAATTATAGATAGCAATAACATTGCTGATGCTAATTATTTAGAATTTACAACACTTTCTTATACAGTACAAGAAGTTTTAGATTGCTTAGGTAATGTGATTATTCCAATACCTTTATTGGCAAACAGAAATCAGAATTTAATATACTGGAGAATATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
8c6b9dc24a05822cfaf67b5e02dbdc48cb59c1d809f430f7c12d57473ad020c0
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Large-scale maps of variable infection efficiencies in aquatic Bacteriodetes phage-host model systems | Holmfeldt,K., Solonenko,N., Howard-Varona,C., Moreno,M., Malmstrom,R.R., Blow,M.J. and Sullivan,M.B. | 2016-06-27 | — | GenBank |