Protein

Genbank accession
YP_010356983.1 [GenBank]
Protein name
pectate lyase
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MKKTLLILAILATALVSAQKDTTKLVIPTPSNVKDYFNTQTGEDRIDGTAIKNIVADSIKTGTLSEDRLPTTALKTSNVIDNLTSTTIDAPLSANAGKTLKDNLDLKASNEDVEARVKPITLAEYNAMDAATKLNNIGRQIIDPTGVPNSVTLADGSVSTTKIANSAVSEAKLDAAVLTKLDKADTALQEVVNGSITDAKINTDTYRKLYYAVPDGYISPRDYGAVMDGVTDDRDAFAATLAEANTLSKRVYVDSDMFLDVEETGTKSIFIADNTWIEGRDKDVNIITNNNLSPAFQIALTENITIKNITFLHDNTYDATTNTADLTINKTANIAQLKSYLETNKDIVFGSNSPRWSGPTAYRAYFLFSGGNNVLFDNVTIKAKGETADTFVVWAVKFKEEFSENQTVVDDNSPSSIPKDIRFNNLTLDGVLMGIQGIVNDFSANETKSYRYSDMQTLAGTHIGGNVGDNTYFFAPPHLFYLTKDNSSQYDCDNIKITNTIDYGVYVGSENVRATSSGYCNSLKLVGVSSNIYVDNYSSFRRDGLGDIGEVSNSVFKNIYAEGYSDIFDPSFAFNSFRFTGTLNNVLFENVIVKDLADIAEIYPMDYAIGDYVTYNNVNMHVNDLNTANDGTFSIWGSNNTIKNSELNIKNHLSTTTFKGVVFSNTRSTDANNNYNLTINGWRTIDANPTGLISRMLFSSGSNTNKNYAKIIDTNNNAIIEQVNEINTETWTRSEIVDLTSQSGSSILINTRVISGYGIKSAKVVVLSSLDSGVTATLYSGALSEHTLVSNISNSANSINVSNFDPISDEEAVDSRVYLKTSTANFANTGSVKVTLELYRKTLN
Physico‐chemical
properties
protein length:844 AA
molecular weight: 92060,12870 Da
isoelectric point:4,73835
aromaticity:0,08531
hydropathy:-0,25782

Domains

Domains [InterPro]
IPR012334
211–433
IPR012334
IPR011050
216–434
IPR011050
YP_010356983.1
1 844
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cellulophaga phage Ingeline_1
[NCBI] 		2745674 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010356983.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_062749 [NCBI]
CDS location
range 25701 -> 28235
strand +
CDS
ATGAAAAAAACACTTTTAATATTAGCAATTTTAGCAACAGCATTAGTATCAGCACAAAAAGATACTACAAAACTAGTAATCCCTACACCTAGTAATGTAAAGGATTATTTTAACACGCAAACAGGTGAAGATAGAATAGATGGTACTGCTATAAAAAACATTGTAGCAGATAGTATAAAAACAGGTACTTTATCAGAAGATAGACTACCAACAACAGCTTTAAAAACATCTAATGTAATAGACAACTTAACATCTACAACAATAGATGCACCATTAAGTGCTAATGCAGGTAAAACCTTAAAAGACAACTTAGATTTAAAAGCTAGTAATGAAGATGTAGAAGCGAGGGTTAAGCCTATAACATTAGCGGAATACAACGCAATGGATGCAGCTACTAAGTTAAATAATATAGGACGTCAAATTATAGACCCTACAGGCGTTCCAAATTCTGTAACATTAGCAGATGGTAGTGTTAGTACTACTAAAATTGCTAATAGTGCTGTGAGTGAAGCTAAGTTAGATGCAGCTGTACTTACTAAACTAGATAAAGCAGATACCGCATTGCAAGAGGTGGTTAATGGTAGTATAACAGATGCAAAAATAAATACGGATACATACAGAAAACTATATTACGCTGTACCTGATGGTTATATTTCACCTAGAGATTATGGCGCTGTAATGGATGGTGTAACGGATGATAGGGATGCTTTTGCGGCTACCTTAGCCGAAGCAAATACTTTAAGCAAGCGTGTTTATGTTGATAGTGATATGTTTTTAGATGTAGAAGAAACAGGAACTAAATCGATATTTATAGCAGATAATACATGGATAGAAGGACGTGATAAAGATGTTAATATTATAACTAATAACAACCTTTCTCCAGCTTTTCAAATAGCATTGACGGAAAACATAACAATAAAAAACATTACTTTTTTACATGACAATACTTACGATGCTACAACTAATACTGCTGATTTAACCATAAATAAAACTGCAAACATTGCACAGTTAAAAAGTTATTTAGAAACTAATAAAGATATTGTTTTTGGTTCAAATTCACCTAGATGGAGTGGACCAACAGCATATAGAGCTTATTTTTTATTTTCAGGAGGTAATAATGTTCTGTTTGATAATGTTACTATAAAAGCAAAAGGAGAAACCGCAGATACTTTTGTTGTTTGGGCTGTAAAATTTAAAGAAGAGTTTTCTGAAAATCAAACAGTAGTAGACGATAACAGTCCATCATCAATACCTAAAGATATAAGATTTAATAATTTAACTTTAGATGGGGTATTAATGGGTATTCAAGGCATTGTTAATGATTTTTCAGCAAATGAAACAAAGTCTTACCGATATTCTGATATGCAAACTTTAGCAGGTACACACATAGGTGGAAATGTAGGAGATAATACATATTTCTTTGCACCGCCACACTTGTTTTACCTAACAAAAGATAACTCATCACAGTATGATTGTGATAATATAAAAATAACAAATACAATTGATTACGGAGTTTATGTAGGAAGTGAAAATGTAAGAGCTACGTCTAGTGGATATTGTAATAGTTTAAAATTGGTAGGAGTTTCCAGTAATATTTATGTAGATAATTATTCTAGCTTTAGAAGGGATGGTTTAGGAGATATTGGTGAAGTGAGTAATAGTGTATTTAAAAACATTTACGCAGAGGGTTATTCTGATATATTCGACCCATCTTTTGCATTTAACTCTTTTAGATTTACAGGCACACTTAACAATGTTTTATTTGAAAATGTAATTGTTAAAGATTTAGCAGATATCGCTGAAATATATCCTATGGATTATGCTATTGGTGATTATGTTACTTATAATAATGTTAATATGCACGTTAACGACTTAAACACAGCTAATGATGGTACTTTTTCTATTTGGGGTTCTAATAATACAATTAAAAATTCAGAATTAAATATAAAAAACCACTTATCAACAACAACATTTAAGGGTGTTGTTTTTTCAAATACTAGGTCTACGGATGCTAACAATAATTATAATTTAACCATCAATGGATGGCGGACAATAGACGCTAATCCAACAGGTTTAATTTCAAGAATGTTGTTTTCTTCAGGAAGTAATACAAATAAAAATTACGCAAAAATAATTGACACAAACAACAATGCTATAATAGAGCAAGTAAACGAAATAAATACAGAAACTTGGACTAGAAGCGAAATTGTTGATTTAACATCTCAATCGGGTTCTAGCATATTAATAAATACTAGGGTTATATCTGGATATGGTATTAAATCTGCTAAAGTTGTAGTACTATCTTCTTTAGACTCAGGCGTAACAGCTACTTTATATAGTGGAGCTTTAAGTGAGCATACCCTTGTAAGCAATATAAGTAATTCAGCAAACAGTATTAATGTAAGTAATTTCGACCCTATCTCAGATGAAGAGGCTGTTGATTCAAGGGTTTATCTTAAAACAAGTACAGCAAATTTCGCTAATACAGGAAGTGTTAAGGTGACACTAGAATTATACAGAAAAACTTTAAATTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
bc0bb603ad2ca727c73a9d25c6203a57ec95ee5dabbc6d73a47756e5e7ffea27
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2609
Evidence 0,2609
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Highly diverse flavobacterial phages as mortality factor during North Sea spring blooms Bartlau,N., Wichels,A., Krohne,G., Adriaenssens,E.M., Heins,A., Fuchs,B.M., Amann,R. and Moraru,C. 2021 — GenBank