Phage RBP Database

Genbank accession

AJA73002.1 [GenBank]

Protein name

host specificity protein J

RBP type

TF

Evidence RBPdetect2

Probability 0,94

Protein sequence

MGLFSRKRKNHTPKEAPETGRSKQIVNIVELLCEGEIEGLVDGFKSIYLDGTQIQNDDGSYNFNNVSGQLNVGTQDQNVLDGYDSSQNEVSVGVEVKKKSGAIVRTVTDERISRLRLTLGVRSLFHQNNQGDTNTTNVDLKITIGTRQYSHSFNGKYSSQYLESVVFDNLPPVPFNISVERVTKDSNSQRLQNGTIWSSYTEIIDTEFTYPNSAVAGISFDSEYFNNIPTRNYLIKAKKVKVPSNYDPVKRTYTGFWDGTFKIAWTNNPAWEIYDLAPILSKMLGVEISFDKWALYDVARYCDQLVPDGMGGMEPRFTCNVWLTEVKTAYDLLNDFCSVFRAIPIWTGTEVSVIIDRPRDPVWTYTNANVVGGFERSYSARKSRHNAVQVTYSDKTNGYESAIEYVSDDEEIKKHGLNLSQVTAFGCTSRGQAYRTGKWILETEKREKETITFTVGREGLMHLPGDIIRVADSHYAGTEIGGRVLAINGRKVTLDREISIDNASYFTYINGEATHSSIKIQSVNGKEITLDSNPTGLEVYGVWSLSTQQITSGLYRSISIVENADGTNTITALQHEPQKEAIVDNAAHFVETARTLYKAPQINAVEVSTGYDGKLYISSDISSGDGKLTYDIKITKDGNLYQFKKGLADPNIELSDLPNGDYSVIIYGKNAKGQIVTEKTQTFTIDRPPAPTGVVVTGGLGQITLEWDWVNEVTQTEIFAAETDNFALAKKIAKVTARTYAHTVRGNKVVRYYWLRHTRGINVGPFYQQQGVRGESAVDLDARLTELNTQLSRNIVDEIFDVAAPARGLELVKTVANLNDKRTKLASSQVYNQADGKLYTWNGTAYSATVAAEDVTGKLSKSKIDTSLISQLTGADNTANLARRLAETAQSNINQEITNRQDAVTAEANNRTKAIQAESANLTKKIQAEATARGAAVTQLQNVDAQQSQLISAVTAKADNALSGLEAEKTARANADKAESQAREALTARMSDAESNIATIQRTVATNAQSISEVSQNLNAKIDNINIGGRNLLRDSEFNAYNKWGNPQIDFTENANRRTIKVTSTGTNGPVGIVSSNRHSTSYFQQGETYTLSLFARGSKALDYLYLMRQDGNNVRLPVINVASETEFNHYKLTFKAPFTTQQGYVLIGFRQTSTEQFVEFHSVKLEKGNVATDWTPAPEDVDSAVSAVSADLTSYKQTQAATDSAQAQQLNQLSVNLTKAETNFNAKITEEKKARVDADKANAERLTDITSRVANAESTITNFQSTKANKSEVASLAQSSLQAVWKADTQSAIGELAVGGRNLLLKSNATNLINFVRSSQDVLDNTDFKTPVVRINCIQDSWFGRKTAITSGKLLAGKYTLSFKYRTNATINNTFIGYGGNQRRRLITSNVVGNETWQTCKLTFETTEDYPDIFIIIGGYGKADVSYIEFAELKLEKGAIATDWTPAPEDVESSVSAVSAKVDSVQQTLANADSALSSRIDTVNASVGSNSSKITQVSNAVASVDGKLSATHTIKTETIAGGRKAIAGIAFGATADNRNAESSVIVMADKFEVVKNAQDGTPVRLFGVVENKVAINGNLIATGSISGDHINANSVRTAVLTAGAIKTEHLAAGQISADKLAIGLGGNLLVNPIFATPDLSIAPFGWNYWRGEVGDRLNIDTRNIFNRNEQDNYGLKNGGLPNELVFSMRYSTTEETSDTGRIGWLSQDINVVPNKKYIASVWLACHRGQAKLVIENIEKPGGAYLGWIGDSEVITGYSANQGEFKNMKRVKVVFTAPTSGCIRFALRLDNIQGKANPFLFARRPMLEEASDNVTDITQPSPWQNAGVTAIHGGSIATNTVTAQQIAANTITANQIAVGTIAARNMAVDSIEARHIVGSSITADKLNVNNLAAISANLGAITAGSININNRFKVSNAGVVEMRANSGNVGMVMNNDSIIVYDEQGRVRVKMGKL

Physico‐chemical properties

protein length:	1954 AA
molecular weight:	213272,75760 Da
isoelectric point:	6,34064
aromaticity:	0,07574
hydropathy:	-0,34806

Domains [InterPro]

InterPro ID	Start	End	Source	Name
IPR053171	9	1011	InterPro	Viral Tip Attachment Protein
IPR055385	87	206	InterPro	Tip attachment protein J, HDII-ins2 domain
IPR032876	325	487	InterPro	Tip attachment protein J
Coil	983	1003	Coils	None
G3DSA:2.60.120.260	1028	1171	Gene3D	None
IPR008979	1029	1168	InterPro	Galactose-binding-like domain superfamily
G3DSA:2.60.120.260	1346	1469	Gene3D	None
IPR015406	1494	1612	InterPro	Tip attachment protein J, central straight fiber domain
G3DSA:2.60.120.260	1627	1797	Gene3D	None

	Name	Taxonomy ID	Lineage
Phage	Mannheimia phage vB_MhS_587AP2 [NCBI]	1572745	Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host	Mannheimia haemolytica [NCBI]	75985	Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Pasteurellales > Pasteurellaceae > Mannheimia

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession

AJA73002.1 [NCBI]

Genbank nucleotide accession

KP137435 [NCBI]

CDS location

range 17474 -> 23338
strand +

CDS

ATGGGATTATTTAGTCGTAAGAGAAAAAATCATACTCCTAAAGAAGCACCGGAAACCGGTCGCTCTAAACAGATTGTAAATATTGTGGAATTGCTGTGCGAGGGCGAAATCGAGGGCTTGGTTGATGGCTTTAAATCGATTTACTTAGACGGCACGCAGATCCAAAACGATGACGGCAGCTATAACTTTAATAATGTGAGTGGTCAGTTAAATGTCGGTACGCAAGACCAAAATGTGTTAGACGGTTACGACAGCTCACAAAATGAAGTGAGTGTGGGTGTAGAAGTCAAGAAAAAAAGCGGTGCAATCGTCCGCACCGTTACTGATGAACGCATCAGCCGTTTGCGTTTAACGTTGGGCGTGCGGTCACTATTCCATCAAAATAATCAAGGCGATACCAATACCACCAATGTTGATTTAAAAATCACGATTGGCACACGGCAATATTCGCATAGCTTTAACGGCAAATACAGCTCGCAATACCTTGAATCTGTGGTGTTTGATAACCTGCCTCCTGTACCGTTTAATATCTCGGTTGAACGTGTAACAAAGGATAGCAATTCTCAACGACTACAAAACGGTACAATTTGGAGCAGCTATACCGAAATTATCGACACCGAATTTACTTACCCTAATTCAGCGGTTGCCGGTATCAGTTTTGATTCGGAGTATTTTAATAATATCCCGACCCGAAACTACCTAATTAAAGCGAAAAAAGTCAAAGTGCCAAGCAATTATGATCCAGTTAAACGCACTTACACCGGCTTTTGGGACGGCACATTTAAAATTGCGTGGACGAACAACCCTGCTTGGGAAATTTACGATTTAGCTCCGATTTTAAGCAAAATGCTTGGGGTTGAAATCAGTTTTGACAAATGGGCGTTGTATGATGTTGCTCGCTATTGCGATCAACTTGTGCCGGACGGTATGGGTGGAATGGAGCCTCGTTTCACCTGTAACGTATGGCTCACGGAAGTTAAAACTGCCTATGACTTGTTGAATGATTTCTGCTCGGTATTCCGTGCGATTCCGATTTGGACCGGAACAGAAGTATCGGTCATTATCGACCGTCCGCGTGATCCGGTTTGGACTTACACAAATGCTAATGTAGTTGGTGGATTTGAACGATCCTACTCTGCTCGCAAATCACGCCATAATGCAGTGCAAGTTACTTATTCGGATAAAACAAATGGCTATGAAAGTGCGATTGAATATGTCTCTGATGACGAGGAAATCAAAAAGCACGGCTTAAATTTAAGCCAAGTAACTGCCTTTGGCTGTACATCTCGTGGGCAAGCATACCGTACCGGCAAATGGATTTTAGAAACCGAAAAACGTGAAAAAGAAACCATCACTTTTACCGTGGGGCGTGAAGGCTTAATGCACTTGCCGGGCGATATTATTCGTGTGGCAGACAGCCATTATGCCGGTACGGAAATTGGCGGACGTGTACTGGCGATTAATGGGCGAAAAGTCACGTTAGATCGTGAAATTAGCATTGATAACGCCAGTTATTTTACCTATATCAACGGTGAGGCAACGCACTCTAGCATTAAAATCCAATCGGTAAACGGTAAAGAAATCACGCTAGACAGTAATCCAACAGGACTAGAAGTTTATGGGGTGTGGTCGTTATCTACCCAACAAATTACCTCAGGTTTATATCGCTCTATCTCGATTGTTGAAAATGCGGACGGTACGAATACGATTACGGCATTGCAACACGAACCGCAGAAAGAGGCGATTGTAGATAACGCTGCTCACTTTGTGGAAACGGCGAGAACGCTTTACAAAGCCCCGCAAATTAACGCAGTAGAAGTCTCGACTGGTTATGACGGCAAGCTCTATATCTCCAGTGATATTAGTTCTGGCGACGGCAAGCTGACCTATGATATTAAAATCACCAAAGATGGCAATTTGTATCAATTCAAGAAAGGATTAGCCGACCCAAATATTGAGTTGAGCGATTTACCGAATGGCGATTACAGCGTGATTATTTACGGTAAAAATGCCAAAGGGCAAATCGTCACCGAAAAAACACAAACCTTTACTATTGATCGACCTCCAGCTCCGACCGGTGTAGTAGTAACAGGTGGATTAGGGCAAATTACCCTCGAATGGGATTGGGTAAATGAGGTTACGCAAACCGAGATTTTCGCAGCGGAAACTGATAATTTCGCCCTTGCAAAAAAAATCGCAAAAGTGACCGCTAGAACCTACGCTCACACGGTAAGAGGTAATAAGGTTGTACGCTATTATTGGCTACGTCATACCAGAGGGATTAATGTCGGCCCGTTTTACCAACAACAGGGGGTAAGAGGCGAAAGTGCGGTTGATTTGGATGCTCGATTAACCGAATTAAACACTCAGCTATCACGCAATATTGTTGATGAGATTTTTGATGTTGCTGCACCGGCACGAGGTTTAGAGCTGGTCAAAACTGTGGCAAACTTGAACGATAAGCGGACGAAACTGGCGTCATCTCAAGTTTACAATCAGGCTGACGGCAAGCTCTATACTTGGAACGGTACAGCATACTCAGCTACAGTGGCTGCGGAAGATGTTACCGGCAAATTATCAAAATCTAAAATTGATACGTCCCTTATTTCGCAATTAACAGGTGCAGATAACACCGCAAATTTGGCAAGAAGATTAGCGGAAACAGCTCAAAGCAACATTAACCAAGAGATTACTAACCGACAAGATGCCGTTACTGCCGAAGCAAATAACCGTACTAAAGCCATTCAAGCTGAAAGTGCGAATTTAACGAAAAAAATTCAAGCTGAAGCAACCGCTCGTGGGGCTGCTGTTACACAGTTACAAAATGTTGATGCTCAACAATCACAACTGATTTCTGCTGTCACAGCAAAAGCTGATAATGCCTTATCCGGTTTGGAAGCAGAAAAAACAGCTCGAGCAAATGCTGATAAAGCTGAATCACAAGCCCGTGAAGCATTAACAGCAAGAATGAGTGATGCGGAAAGCAATATTGCAACTATTCAACGTACGGTAGCAACTAATGCCCAAAGCATTAGTGAAGTCAGTCAGAATTTAAATGCTAAGATTGATAATATTAATATCGGAGGTCGGAATTTATTAAGAGACAGCGAGTTCAATGCGTACAATAAATGGGGTAATCCACAGATTGATTTTACAGAAAATGCAAATCGTCGAACTATCAAAGTAACCTCAACAGGTACTAACGGTCCTGTTGGTATTGTTTCATCTAATCGCCATTCCACATCTTATTTCCAACAAGGAGAAACTTATACACTCTCATTATTTGCTCGAGGAAGTAAGGCACTAGACTATCTCTATCTAATGCGTCAAGATGGGAATAACGTTAGATTACCAGTGATTAACGTTGCCTCTGAAACTGAGTTTAATCATTACAAACTCACGTTCAAGGCTCCTTTTACCACGCAACAAGGTTATGTCTTAATCGGTTTTCGGCAAACCAGCACAGAGCAGTTTGTTGAGTTTCACAGCGTCAAACTTGAAAAAGGCAACGTAGCCACAGACTGGACGCCAGCACCTGAAGATGTGGACAGTGCGGTTAGTGCTGTTTCGGCTGATTTAACGAGTTATAAACAAACTCAAGCGGCTACCGATTCAGCACAAGCACAGCAACTTAATCAGTTATCTGTGAACTTGACCAAAGCAGAGACTAATTTCAACGCCAAAATCACGGAAGAAAAAAAAGCTCGTGTTGATGCAGATAAAGCGAATGCAGAGAGGCTCACAGACATAACAAGCCGTGTTGCAAATGCGGAATCAACTATTACCAATTTCCAATCAACCAAAGCGAATAAAAGTGAGGTTGCGAGCCTTGCACAAAGTTCGTTGCAGGCAGTTTGGAAGGCAGATACACAATCAGCGATTGGCGAGTTGGCTGTCGGTGGAAGAAATTTATTATTAAAATCCAACGCAACAAACTTAATCAATTTTGTCAGATCATCTCAAGATGTATTAGATAACACTGATTTCAAAACTCCAGTAGTACGAATCAACTGTATACAAGATAGTTGGTTTGGTCGAAAAACAGCGATTACATCGGGAAAATTGCTTGCTGGTAAATACACTCTATCGTTTAAGTATCGCACCAACGCTACAATTAATAATACTTTTATTGGTTATGGAGGCAATCAGCGCAGACGGCTTATCACATCAAATGTTGTCGGTAATGAGACATGGCAAACTTGCAAGCTCACATTTGAGACAACCGAGGATTACCCTGATATATTTATCATTATTGGTGGTTATGGTAAGGCGGATGTAAGTTATATTGAATTTGCCGAGCTGAAACTAGAGAAAGGCGCTATCGCTACAGATTGGACACCAGCACCGGAAGATGTGGAAAGTTCTGTAAGTGCAGTATCTGCAAAAGTAGATTCGGTTCAACAAACGCTGGCAAATGCAGATTCAGCACTAAGCTCTCGCATTGATACGGTCAATGCCTCAGTCGGATCAAACTCATCTAAAATTACCCAAGTCAGCAATGCGGTAGCAAGTGTGGACGGCAAATTATCTGCTACCCATACCATCAAAACCGAAACCATTGCCGGTGGACGCAAAGCGATTGCCGGTATTGCATTTGGTGCAACGGCAGATAACCGTAATGCGGAATCTTCTGTGATTGTGATGGCAGATAAATTTGAGGTCGTGAAAAACGCCCAAGACGGCACGCCAGTAAGACTATTTGGCGTGGTAGAAAATAAAGTAGCGATTAATGGGAATTTAATCGCAACAGGCTCGATTTCAGGAGACCACATCAATGCAAATTCCGTCAGAACTGCTGTATTGACTGCAGGAGCGATTAAAACGGAGCATTTGGCAGCAGGGCAAATATCGGCGGATAAGTTAGCGATTGGGCTAGGTGGGAATTTGCTGGTTAATCCTATTTTTGCAACACCCGATTTGTCAATAGCTCCGTTTGGCTGGAACTACTGGCGAGGAGAAGTTGGTGATCGGCTAAATATTGACACCCGTAATATTTTCAATAGGAATGAACAAGATAATTACGGACTAAAAAATGGAGGACTACCAAATGAGTTAGTATTTTCGATGCGGTATAGCACTACAGAGGAAACCTCTGATACTGGGCGAATTGGGTGGTTATCTCAGGATATTAATGTTGTGCCTAATAAAAAATATATTGCCTCCGTATGGTTAGCTTGTCATCGTGGGCAAGCTAAATTAGTCATTGAGAATATCGAAAAACCTGGTGGTGCTTACTTAGGTTGGATAGGCGACAGCGAGGTAATTACTGGCTATAGTGCTAATCAAGGCGAATTTAAAAATATGAAACGGGTTAAGGTTGTATTTACTGCACCTACTTCAGGCTGTATTCGTTTCGCATTACGATTAGATAATATTCAAGGTAAAGCTAATCCATTTTTATTTGCTCGTAGACCAATGCTTGAGGAGGCTAGTGATAATGTTACAGATATCACTCAGCCTAGCCCTTGGCAAAATGCCGGTGTAACCGCTATTCACGGTGGCTCAATAGCTACTAATACCGTTACTGCTCAACAAATTGCAGCAAATACCATTACCGCCAACCAAATCGCAGTCGGCACGATTGCTGCACGCAATATGGCGGTAGATTCGATTGAGGCTCGTCATATTGTGGGGAGTTCGATCACTGCGGATAAGCTAAATGTAAACAATTTAGCAGCAATATCGGCAAATCTCGGAGCTATTACAGCTGGTTCTATTAACATCAATAATAGATTCAAGGTAAGTAATGCTGGAGTAGTCGAAATGCGAGCCAATAGTGGAAATGTTGGTATGGTAATGAATAACGATAGTATTATTGTTTATGATGAACAAGGTAGGGTTAGAGTAAAAATGGGGAAATTATGA

No Gene Ontology terms available.

No enzymatic activity data available.

No literature entries available.

Protein

Domains

Domains [InterPro]

Domains [InterPro]

Taxonomy

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)

Gene Ontology

Enzymatic activity

Tertiary structure

Literature