Protein

View in Explore
Genbank accession
WNO25371.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MSNTLPLLDNISIYEGDDATLTFSCLSDITGYKVELSVELGNDSPYTILKAVGYVNTTDPTKYVISIRRSDTTGKGRTEPYPYSIKLTSPTGSVCTDRYGTLTIIPNAGGDGDSSSTSGDYRDIIETDGLTDNAILKWDASTKMLKASGVTSEEQGDLTTATNSVNIGVHDVGSAGRNIAITNRVDKRTFNPIFQEVGIDDANTTTAYQREHEAMSELEVNTVTPPNNYVVLTNPTWNFSTAFNETVFGIQLHPVTNMVDVIYTIKENGVPIYTANIGNFRSANPPSFAFFETPFSLYANKAYTVSLTCKDGSDAMFYGNLVGKPHYTVKLRKFDFKELASKDYVDSKRVTPTMASHFVGIFDDLQGLHDAVPTPTQGLQAIVINPSEYYYHYVGSAWAQLAPVGSFHPTYLGAYDTVQDLQTANPSPTKDALAIVGVDTKAFYFYDVLSWKMVTHTDIPALDRRVSDVETKSTDNANRINTAEGHLQTLQADATSQDNKISALEVGQKTLQSNIDQKLDGLHIEDTSGNAFDDVVGLTFEGATVADDGSDHIHVTVAPKITVANGQAPDSTSESGNALIFDGSTITVDPHDANVIHVDIPTSTNNGISVGDGATASRQVHRLLFNGHEVHGSGDTAEVHLEFVHFKTLTERDTWSTRYGTHLDYDVIALVDADENGFVQFYKFNATTKAWMEYNAQGVVMSDSGGAIPKNIKTVVFGPGFAIQQAGSEEDAALVTYTPTGDTHTHEAALSVGQAWGDYHQVTKVDTIDTRYPLEVHTGKQNPNDPEEGTAVLVIKPDAFEPMQAPSFLANTSDIRSIKAGKDTVIFCDNPITPYGMFFSVDNKLEGLRVQDDISGDDPNLGGQLTELLGSVEFETKAPSKGNIKLWFMYHQNGAYIPTGYVTGTDGNPLIVEKTFNTGDDLKMVIAGAYYAKGQETITLHVEHSFSGEQLTMVPEKTMLCVNQFEQGASSSLARIEFMRRLGTQITPVIYKFTKPFVRLSDTVLNLNKPESAVGAGEGEEFLAQFGINNLTTCKASIANGVISISDNNLDILDFYMDYLVDNTRTSMMRGKEFKVSVRCSSIDTAYNLSLFAWTGKADEMTKIYNGRNNDALTLNDGWKEVKKTFIAEQPNGSDGNYDLTVTIPEEASNLAFVIYPTAAQNPINFTISEFSIEPANEFSGYTELESYSLHEVHLRESDDFIEFGQNSEGFASLRYTLNYKPIQGLPLPVGIPLKGNAPFTLDPSKNTVAGSSAKGGEGALKATKDGQVSLSCDYLLWNEKDTDSVVTLWWELETIDGTTSKITGSEIEFTVPKSSTTHGILKTQPAFVFEVEAGQWFYLRGSANKPDGAYLQSTKLTDYMVRPVIDFKELLGSYDDSDLVSIGLDKKLVVDRRVHTFTNNTSQNIVISGLNIPSDVTLASVTAEKDLPNGFTSIETVQHAYNPTTSELTVHVGSVNSGKIFLEFWG
Physico‐chemical
properties
protein length:1467 AA
molecular weight: 160227,31260 Da
isoelectric point:4,70891
aromaticity:0,09339
hydropathy:-0,28971

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Vibrio phage vB_VpaP-MS02
[NCBI] 		3075130 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Vibrio parahaemolyticus
[NCBI] 		670 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Vibrionales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WNO25371.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR102882.1 [NCBI]
CDS location
range 40665 -> 45068
strand +
CDS
ATGTCTAACACATTGCCTTTATTAGATAATATCTCTATCTATGAAGGGGATGACGCTACCCTAACGTTTTCCTGCTTATCAGACATCACTGGATATAAAGTAGAGCTGAGTGTAGAGTTGGGTAATGACTCTCCTTACACAATTTTAAAAGCGGTTGGTTATGTAAATACTACTGACCCTACTAAATACGTTATTTCTATTAGACGTTCAGATACTACCGGTAAAGGTAGAACTGAACCTTACCCTTATTCTATTAAACTAACTTCACCTACTGGTTCAGTATGTACAGATAGATATGGTACTTTGACTATCATCCCTAATGCAGGTGGTGATGGGGATTCATCTAGTACATCTGGTGATTATAGAGACATTATTGAAACTGATGGTCTAACTGACAATGCTATCCTTAAGTGGGATGCATCAACCAAAATGCTTAAAGCGTCGGGTGTAACTTCTGAAGAACAGGGTGACCTTACTACTGCAACTAACTCAGTAAACATCGGTGTTCATGATGTTGGTTCTGCCGGTAGAAATATCGCTATTACTAACAGAGTAGATAAGAGAACCTTTAATCCTATCTTCCAAGAAGTTGGTATTGATGATGCAAATACAACTACAGCATATCAACGTGAACATGAAGCAATGTCTGAGTTGGAAGTTAATACAGTAACTCCTCCAAATAATTATGTTGTTCTAACCAATCCAACTTGGAATTTTAGCACTGCATTTAATGAGACAGTATTTGGGATTCAATTGCATCCAGTAACCAATATGGTAGATGTGATTTACACTATTAAAGAAAATGGTGTGCCTATCTATACAGCAAATATTGGTAACTTTAGAAGTGCTAATCCTCCTAGTTTTGCATTCTTTGAAACCCCGTTCTCTTTATATGCTAATAAAGCTTATACAGTTAGCCTTACTTGTAAGGATGGTTCAGATGCAATGTTCTACGGAAATCTTGTAGGTAAACCACACTATACAGTTAAACTTAGAAAGTTTGATTTTAAAGAATTAGCTAGTAAGGATTATGTAGATAGTAAAAGAGTTACCCCTACAATGGCTTCACATTTTGTAGGTATCTTTGATGATTTACAGGGATTACACGATGCAGTTCCTACCCCTACTCAGGGATTACAGGCAATTGTTATTAATCCTAGTGAGTACTACTACCATTACGTTGGTTCAGCATGGGCACAGCTTGCACCTGTAGGCTCATTCCACCCTACTTACCTAGGTGCTTACGATACTGTTCAAGATTTACAAACAGCTAATCCTTCACCTACTAAAGATGCACTAGCTATTGTAGGTGTAGATACCAAAGCATTTTACTTCTACGATGTTCTATCATGGAAGATGGTAACTCATACCGATATTCCTGCACTAGATAGAAGAGTATCGGATGTTGAAACTAAATCTACTGATAATGCTAATCGTATTAATACCGCAGAAGGTCATTTACAAACTTTACAGGCTGATGCTACTTCTCAGGATAATAAGATTTCAGCATTAGAAGTTGGACAGAAAACCTTACAATCCAATATTGACCAAAAGCTTGATGGGCTACATATCGAAGATACTTCTGGTAATGCTTTTGATGATGTCGTTGGTTTAACTTTTGAAGGTGCAACTGTAGCTGATGACGGTTCAGACCATATCCATGTAACGGTAGCTCCTAAAATTACTGTAGCTAATGGTCAAGCCCCTGATAGCACATCTGAATCAGGTAACGCGCTAATCTTTGATGGTTCTACCATTACAGTAGACCCACATGATGCTAATGTAATCCATGTAGATATTCCTACATCTACTAATAATGGTATTTCTGTAGGTGATGGTGCTACAGCTAGTAGACAGGTACATAGACTACTGTTTAATGGGCACGAGGTTCATGGTTCAGGGGATACAGCAGAAGTTCATTTAGAATTTGTGCATTTTAAAACCTTAACTGAAAGGGATACTTGGTCTACTAGATATGGTACTCACCTAGATTATGATGTAATCGCTTTAGTAGATGCCGATGAAAATGGTTTTGTACAGTTTTATAAATTTAATGCAACCACTAAAGCGTGGATGGAATACAACGCTCAAGGTGTAGTTATGTCTGATTCAGGCGGTGCTATTCCTAAAAATATTAAGACAGTTGTGTTTGGTCCCGGCTTTGCTATTCAACAAGCAGGAAGTGAAGAAGATGCTGCATTAGTTACATATACCCCTACAGGTGATACTCATACACATGAAGCTGCTTTAAGTGTGGGACAAGCTTGGGGTGATTATCACCAAGTAACTAAAGTGGATACTATTGATACCAGATACCCTTTAGAAGTTCATACAGGTAAGCAAAATCCTAATGACCCTGAAGAAGGTACAGCGGTATTAGTAATTAAGCCTGATGCATTTGAACCAATGCAGGCTCCGAGTTTCTTAGCTAATACTTCAGATATCCGCTCTATTAAGGCAGGTAAAGATACTGTTATCTTTTGTGACAACCCAATCACACCTTATGGAATGTTCTTTTCTGTAGATAACAAGTTAGAAGGTTTAAGAGTACAGGACGATATCTCAGGTGATGACCCTAACTTAGGGGGCCAACTTACTGAACTGCTTGGTTCAGTTGAGTTTGAAACTAAAGCGCCAAGCAAAGGTAATATTAAACTTTGGTTCATGTACCACCAGAATGGTGCATATATCCCTACAGGTTATGTAACCGGTACAGATGGTAATCCTTTAATTGTAGAGAAGACTTTTAATACCGGTGATGATTTAAAAATGGTCATTGCAGGAGCTTACTACGCTAAAGGACAAGAAACCATTACTTTACACGTTGAACATTCATTTTCCGGTGAACAGTTAACTATGGTTCCTGAGAAGACAATGTTATGTGTAAACCAATTTGAGCAAGGGGCTAGTTCATCTTTAGCGCGTATTGAGTTTATGCGTAGATTAGGTACTCAGATTACCCCTGTTATCTACAAGTTTACTAAACCTTTTGTAAGATTAAGTGATACTGTTCTTAACCTTAATAAGCCTGAATCTGCTGTAGGAGCTGGAGAGGGTGAAGAGTTCTTAGCACAATTTGGTATTAATAACCTAACTACGTGTAAAGCTAGTATTGCTAATGGTGTAATTAGTATCTCAGATAACAATTTAGATATTCTAGACTTCTATATGGATTACCTAGTGGATAACACTAGAACGTCTATGATGAGGGGTAAAGAGTTTAAAGTATCTGTTAGATGTAGCTCCATTGATACCGCATACAATCTATCTCTATTTGCTTGGACAGGTAAAGCAGACGAGATGACTAAGATTTATAATGGTAGAAATAATGACGCTCTTACTTTAAATGACGGTTGGAAAGAAGTTAAGAAAACATTTATTGCTGAACAACCTAATGGTAGTGATGGTAATTATGATTTAACTGTAACCATTCCAGAAGAAGCATCTAATTTAGCTTTTGTTATTTATCCTACTGCTGCACAGAATCCTATTAACTTCACTATTAGCGAGTTCTCTATTGAACCCGCTAATGAGTTTAGTGGTTATACAGAATTGGAGAGCTACAGCTTACATGAAGTGCATTTGAGAGAATCTGATGACTTTATTGAGTTTGGGCAGAATTCTGAAGGATTTGCGAGTTTAAGATACACCTTAAACTACAAACCAATCCAAGGTTTACCATTACCTGTAGGCATCCCTTTGAAAGGTAATGCTCCCTTTACCCTAGACCCATCTAAAAATACTGTTGCTGGTTCTAGTGCTAAAGGTGGTGAGGGTGCTTTAAAAGCAACTAAAGATGGTCAAGTGTCTCTATCATGTGATTACCTTCTTTGGAACGAAAAGGATACAGACTCTGTTGTAACTCTATGGTGGGAGCTTGAAACTATTGACGGCACTACCTCAAAAATTACTGGAAGTGAAATTGAGTTTACAGTTCCTAAGAGTTCAACAACTCACGGTATTCTAAAGACCCAACCAGCATTTGTATTTGAAGTGGAGGCAGGACAATGGTTCTACCTACGAGGCTCAGCTAACAAACCTGACGGCGCTTACCTACAATCAACTAAACTTACTGATTACATGGTTCGCCCTGTAATTGACTTTAAAGAACTATTGGGTAGTTATGATGATTCCGATTTAGTATCTATTGGTTTAGATAAGAAGTTGGTGGTTGACCGTAGAGTACATACTTTCACTAATAATACTTCCCAGAATATTGTTATTTCTGGTTTGAATATTCCTAGTGATGTAACATTGGCAAGCGTTACTGCTGAGAAGGATTTACCTAATGGGTTTACTTCTATTGAGACAGTACAACACGCTTATAATCCAACTACTTCCGAATTGACAGTTCATGTTGGCTCAGTCAATTCAGGTAAAATCTTTTTAGAGTTTTGGGGATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
fbb0aff8fa96d181f86c6880b6a521a1df6c18273a55905f04cf00d78c763932
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4571
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Identification and characterization of three novel bacteriophages infecting fish pathogenic Vibrio spp. Moon,K., Song,S.H., Lee,J.-C., Lee,N., Ryu,S., Lee,S.M., Kim,Y.J., Chun,S.W. and Joo,J.-H. 2025-05-31 — GenBank